Imported Disease Annotations - OMIMObject Symbol | Species | Term | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | Timmdc1 | Rat | nuclear type mitochondrial complex I deficiency 31 | | ISO | TIMMDC1 (Homo sapiens) | 7240710 | | OMIM | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Imported Disease Annotations - OMIMObject Symbol | Species | Term | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | Timmdc1 | Rat | nuclear type mitochondrial complex I deficiency 31 | | ISO | TIMMDC1 (Homo sapiens) | 7240710 | | OMIM | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| # | Reference Title | Reference Citation |
| 1. | Identification and expression analysis of C3orf1, a novel human gene homologous to the Drosophila RP140-upstream gene. | Escarceller M, etal., DNA Seq 2000;11(3-4):335-8. |
| 2. | Phylogenetic-based propagation of functional annotations within the Gene Ontology consortium. | Gaudet P, etal., Brief Bioinform. 2011 Sep;12(5):449-62. doi: 10.1093/bib/bbr042. Epub 2011 Aug 27. |
| 3. | Rat ISS GO annotations from MGI mouse gene data--August 2006 | MGD data from the GO Consortium |
| 4. | GOA pipeline | RGD automated data pipeline |
| 5. | Data Import for Chemical-Gene Interactions | RGD automated import pipeline for gene-chemical interactions |
| 6. | Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences. | Strausberg RL, etal., Proc Natl Acad Sci U S A. 2002 Dec 24;99(26):16899-903. Epub 2002 Dec 11. |
| Timmdc1 (Rattus norvegicus - Norway rat) |
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| TIMMDC1 (Homo sapiens - human) |
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| Timmdc1 (Mus musculus - house mouse) |
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| Timmdc1 (Chinchilla lanigera - long-tailed chinchilla) |
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| TIMMDC1 (Pan paniscus - bonobo/pygmy chimpanzee) |
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| TIMMDC1 (Canis lupus familiaris - dog) |
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| Timmdc1 (Ictidomys tridecemlineatus - thirteen-lined ground squirrel) |
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| TIMMDC1 (Sus scrofa - pig) |
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| TIMMDC1 (Chlorocebus sabaeus - green monkey) |
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| Timmdc1 (Heterocephalus glaber - naked mole-rat) |
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| Timmdc1 (Rattus rattus - black rat) |
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Variants in Timmdc1
184 total Variants
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| The detailed report is available here: | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer |
miRNA Target Status data imported from miRGate (http://mirgate.bioinfo.cnio.es/). For more information about miRGate, see PMID:25858286 or access the full paper here. |
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| The following QTLs overlap with this region. | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer | ![]() | Gviewer |
| RH141128 |
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alimentary part of gastrointestinal system
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appendage
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circulatory system
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ectoderm
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endocrine system
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endoderm
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exocrine system
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hemolymphoid system
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hepatobiliary system
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integumental system
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mesenchyme
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mesoderm
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musculoskeletal system
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nervous system
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renal system
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reproductive system
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respiratory system
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sensory system
|
visual system
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|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 16 | 12 | 67 | 164 | 91 | 90 | 59 | 92 | 59 | 6 | 356 | 192 | 11 | 143 | 81 | 92 | 31 | 17 | 17 |
| RefSeq Transcripts | NM_001007676 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
| GenBank Nucleotide | AC140752 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
| BC079140 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| CH473967 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| FQ215140 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| JAXUCZ010000011 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOT00000004023 ⟹ ENSRNOP00000004023 | ||||||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||||||
| Position: |
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| Ensembl Acc Id: | ENSRNOT00000138257 ⟹ ENSRNOP00000111867 | ||||||||
| Type: | CODING | ||||||||
| Position: |
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| RefSeq Acc Id: | NM_001007676 ⟹ NP_001007677 | ||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq Status: | PROVISIONAL | ||||||||||||||||||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||||||||||||||||||
| Position: |
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| Sequence: |
| Protein RefSeqs | NP_001007677 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
| GenBank Protein | AAH79140 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
| EDM11214 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| Ensembl Protein | ENSRNOP00000004023 | ||
| GenBank Protein | Q6AY94 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
| RefSeq Acc Id: | NP_001007677 ⟸ NM_001007676 |
| - UniProtKB: | Q6AY94 (UniProtKB/Swiss-Prot), A6IR61 (UniProtKB/TrEMBL), A0A8L2Q1B5 (UniProtKB/TrEMBL) |
| - Sequence: |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOP00000004023 ⟸ ENSRNOT00000004023 |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOP00000111867 ⟸ ENSRNOT00000138257 |
| Name | Modeler | Protein Id | AA Range | Protein Structure |
| AF-Q6AY94-F1-model_v2 | AlphaFold | Q6AY94 | 1-285 | view protein structure |
| eQTL | View at Phenogen | |
| WGCNA | View at Phenogen | |
| Tissue/Strain Expression | View at Phenogen |
| RGD ID: | 13698165 | ||||||||
| Promoter ID: | EPDNEW_R8689 | ||||||||
| Type: | initiation region | ||||||||
| Name: | Timmdc1_1 | ||||||||
| Description: | translocase of inner mitochondrial membrane domain containing1 | ||||||||
| SO ACC ID: | SO:0000170 | ||||||||
| Source: | EPDNEW (Eukaryotic Promoter Database, http://epd.vital-it.ch/) | ||||||||
| Experiment Methods: | Single-end sequencing. | ||||||||
| Position: |
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| Database | Acc Id | Source(s) |
| AGR Gene | RGD:1359380 | AgrOrtholog |
| BioCyc Gene | G2FUF-21276 | BioCyc |
| Ensembl Genes | ENSRNOG00000002999 | Ensembl, ENTREZGENE |
| Ensembl Transcript | ENSRNOT00000004023 | ENTREZGENE |
| IMAGE_CLONE | IMAGE:7127856 | IMAGE-MGC_LOAD |
| InterPro | TIMMDC1 | UniProtKB/Swiss-Prot |
| KEGG Report | rno:303922 | UniProtKB/Swiss-Prot |
| MGC_CLONE | MGC:94152 | IMAGE-MGC_LOAD |
| NCBI Gene | 303922 | ENTREZGENE |
| PANTHER | C3ORF1 PROTEIN-RELATED | UniProtKB/Swiss-Prot |
| COMPLEX I ASSEMBLY FACTOR TIMMDC1, MITOCHONDRIAL | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| Pfam | Tim17 | UniProtKB/Swiss-Prot |
| PhenoGen | Timmdc1 | PhenoGen |
| RatGTEx | ENSRNOG00000002999 | RatGTEx |
| UniProt | A0A8L2Q1B5 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
| A0ABK0M7M6_RAT | UniProtKB/TrEMBL | |
| A6IR61 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL | |
| Q6AY94 | ENTREZGENE, UniProtKB/Swiss-Prot |
| Date | Current Symbol | Current Name | Previous Symbol | Previous Name | Description | Reference | Status |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2013-05-24 | Timmdc1 | translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1 | LOC100360223 | transmembrane protein C3orf1 homolog-like | Data merged from RGD:2322527 | 1643240 | APPROVED |
| 2011-08-01 | Timmdc1 | translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1 | RGD1359380 | similar to hypothetical protein MGC7537 | Nomenclature updated to reflect human and mouse nomenclature | 1299863 | APPROVED |
| 2010-05-06 | LOC100360223 | transmembrane protein C3orf1 homolog-like | Symbol and Name status set to provisional | 70820 | PROVISIONAL | ||
| 2006-03-30 | RGD1359380 | similar to hypothetical protein MGC7537 | MGC94152 | Symbol updated | 1299863 | APPROVED | |
| 2005-07-29 | MGC94152 | similar to hypothetical protein MGC7537 | Symbol and Name status set to provisional | 70820 | PROVISIONAL |