Imported Disease Annotations - OMIMObject Symbol | Species | Term | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | Lipt1 | Rat | Lipoyltransferase 1 Deficiency | | ISO | LIPT1 (Homo sapiens) | 7240710 | | OMIM | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Imported Disease Annotations - OMIMObject Symbol | Species | Term | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | Lipt1 | Rat | Lipoyltransferase 1 Deficiency | | ISO | LIPT1 (Homo sapiens) | 7240710 | | OMIM | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| # | Reference Title | Reference Citation |
| 1. | Phylogenetic-based propagation of functional annotations within the Gene Ontology consortium. | Gaudet P, etal., Brief Bioinform. 2011 Sep;12(5):449-62. doi: 10.1093/bib/bbr042. Epub 2011 Aug 27. |
| 2. | KEGG Annotation Import Pipeline | Pipeline to import KEGG annotations from KEGG into RGD |
| 3. | Data Import for Chemical-Gene Interactions | RGD automated import pipeline for gene-chemical interactions |
| Lipt1 (Rattus norvegicus - Norway rat) |
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| LIPT1 (Homo sapiens - human) |
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| Lipt1 (Mus musculus - house mouse) |
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| Lipt1 (Chinchilla lanigera - long-tailed chinchilla) |
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| LIPT1 (Pan paniscus - bonobo/pygmy chimpanzee) |
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| C10H2orf15 (Canis lupus familiaris - dog) |
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| Lipt1 (Ictidomys tridecemlineatus - thirteen-lined ground squirrel) |
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| LIPT1 (Sus scrofa - pig) |
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| LIPT1 (Chlorocebus sabaeus - green monkey) |
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| Lipt1 (Heterocephalus glaber - naked mole-rat) |
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| Lipt1 (Rattus rattus - black rat) |
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Variants in Lipt1
63 total Variants
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| The detailed report is available here: | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer |
miRNA Target Status data imported from miRGate (http://mirgate.bioinfo.cnio.es/). For more information about miRGate, see PMID:25858286 or access the full paper here. |
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| The following QTLs overlap with this region. | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer | ![]() | Gviewer |
| AI410495 |
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| RH141476 |
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alimentary part of gastrointestinal system
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appendage
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circulatory system
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ectoderm
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endocrine system
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endoderm
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exocrine system
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hemolymphoid system
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hepatobiliary system
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integumental system
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mesenchyme
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mesoderm
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musculoskeletal system
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nervous system
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renal system
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reproductive system
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respiratory system
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sensory system
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visual system
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|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 16 | 12 | 67 | 163 | 91 | 90 | 59 | 90 | 59 | 6 | 354 | 190 | 11 | 142 | 81 | 92 | 31 | 17 | 17 |
| RefSeq Transcripts | NM_001108212 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
| NM_001432402 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| NM_001432403 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| NM_001432404 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| XM_006244815 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| XM_006244817 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| XM_006244818 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| XM_008767029 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| XM_063267157 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| GenBank Nucleotide | CH473965 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
| JAXUCZ010000009 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOT00000024896 ⟹ ENSRNOP00000024896 | ||||||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||||||
| Position: |
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| Type: | CODING | ||||||||||||
| Position: |
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| Ensembl Acc Id: | ENSRNOT00000099932 ⟹ ENSRNOP00000076981 | ||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||
| Position: |
|
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOT00000113384 ⟹ ENSRNOP00000092198 | ||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||
| Position: |
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| Type: | CODING | ||||||||
| Position: |
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| Ensembl Acc Id: | ENSRNOT00000137061 ⟹ ENSRNOP00000099793 | ||||||||
| Type: | CODING | ||||||||
| Position: |
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| Ensembl Acc Id: | ENSRNOT00000153120 ⟹ ENSRNOP00000112399 | ||||||||
| Type: | CODING | ||||||||
| Position: |
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| RefSeq Acc Id: | NM_001108212 ⟹ NP_001101682 | ||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq Status: | VALIDATED | ||||||||||||||||||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||||||||||||||||||
| Position: |
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| Sequence: |
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| Type: | CODING | ||||||||||||||||||||
| Position: |
|
||||||||||||||||||||
| Sequence: |
| RefSeq Acc Id: | XM_006244817 ⟹ XP_006244879 | ||||||||||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||||||||||
| Position: |
|
||||||||||||||||||||
| Sequence: |
| RefSeq Acc Id: | XM_006244818 ⟹ XP_006244880 | ||||||||||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||||||||||
| Position: |
|
||||||||||||||||||||
| Sequence: |
| RefSeq Acc Id: | XM_063267157 ⟹ XP_063123227 | ||||||||
| Type: | CODING | ||||||||
| Position: |
|
| Protein RefSeqs | NP_001101682 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
| NP_001419331 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| NP_001419332 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| NP_001419333 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
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| XP_006244879 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| XP_006244880 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| XP_063123227 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| GenBank Protein | EDL99226 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
| Ensembl Protein | ENSRNOP00000024896.3 | ||
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| ENSRNOP00000080751.1 | |||
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| ENSRNOP00000112399.1 |
| RefSeq Acc Id: | NP_001101682 ⟸ NM_001108212 |
| - UniProtKB: | D3Z7Z4 (UniProtKB/TrEMBL), A6INI4 (UniProtKB/TrEMBL) |
| - Sequence: |
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| - Peptide Label: | isoform X3 |
| - Sequence: |
| RefSeq Acc Id: | XP_006244877 ⟸ XM_006244815 |
| - Peptide Label: | isoform X1 |
| - UniProtKB: | A0A8I5ZRJ8 (UniProtKB/TrEMBL) |
| - Sequence: |
| RefSeq Acc Id: | XP_006244879 ⟸ XM_006244817 |
| - Peptide Label: | isoform X3 |
| - Sequence: |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOP00000024896 ⟸ ENSRNOT00000024896 |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOP00000076981 ⟸ ENSRNOT00000099932 |
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| Ensembl Acc Id: | ENSRNOP00000092198 ⟸ ENSRNOT00000113384 |
| RefSeq Acc Id: | XP_063123227 ⟸ XM_063267157 |
| - Peptide Label: | isoform X2 |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOP00000099793 ⟸ ENSRNOT00000137061 |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOP00000110622 ⟸ ENSRNOT00000128349 |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOP00000112399 ⟸ ENSRNOT00000153120 |
| Name | Modeler | Protein Id | AA Range | Protein Structure |
| AF-D3Z7Z4-F1-model_v2 | AlphaFold | D3Z7Z4 | 1-371 | view protein structure |
| eQTL | View at Phenogen | |
| WGCNA | View at Phenogen | |
| Tissue/Strain Expression | View at Phenogen |
| Database | Acc Id | Source(s) |
| AGR Gene | RGD:1310276 | AgrOrtholog |
| BioCyc Gene | G2FUF-27778 | BioCyc |
| BioCyc Pathway | PWY0-501 [lipoate biosynthesis and incorporation I] | BioCyc |
| BioCyc Pathway Image | PWY0-501 | BioCyc |
| Ensembl Genes | ENSRNOG00000018464 | Ensembl, ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
| Ensembl Transcript | ENSRNOT00000024896.6 | UniProtKB/TrEMBL |
| ENSRNOT00000098250 | ENTREZGENE | |
| ENSRNOT00000098250.2 | UniProtKB/TrEMBL | |
| ENSRNOT00000099932.2 | UniProtKB/TrEMBL | |
| ENSRNOT00000113384.2 | UniProtKB/TrEMBL | |
| ENSRNOT00000128349 | ENTREZGENE | |
| ENSRNOT00000128349.1 | UniProtKB/TrEMBL | |
| ENSRNOT00000137061.1 | UniProtKB/TrEMBL | |
| ENSRNOT00000153120 | ENTREZGENE | |
| ENSRNOT00000153120.1 | UniProtKB/TrEMBL | |
| Gene3D-CATH | Bira Bifunctional Protein, Domain 2 | UniProtKB/TrEMBL |
| CO dehydrogenase flavoprotein, C-terminal domain | UniProtKB/TrEMBL | |
| InterPro | aa-tRNA-synth_II/BPL/LPL | UniProtKB/TrEMBL |
| BPL_LipA_LipB | UniProtKB/TrEMBL | |
| LipoylTrfase_LipoateP_Ligase | UniProtKB/TrEMBL | |
| KEGG Report | rno:316342 | UniProtKB/TrEMBL |
| NCBI Gene | 316342 | ENTREZGENE |
| PANTHER | LIPOYLTRANSFERASE 1, MITOCHONDRIAL | UniProtKB/TrEMBL |
| PTHR12561 | UniProtKB/TrEMBL | |
| Pfam | LplA-B_cat | UniProtKB/TrEMBL |
| PhenoGen | Lipt1 | PhenoGen |
| PROSITE | BPL_LPL_CATALYTIC | UniProtKB/TrEMBL |
| RatGTEx | ENSRNOG00000018464 | RatGTEx |
| Superfamily-SCOP | SSF55681 | UniProtKB/TrEMBL |
| UniProt | A0A8I5ZRJ8 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
| A0A8I6AHD8_RAT | UniProtKB/TrEMBL | |
| A6INI4 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL | |
| D3Z7Z4 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
| Date | Current Symbol | Current Name | Previous Symbol | Previous Name | Description | Reference | Status |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2008-04-30 | Lipt1 | lipoyltransferase 1 | Lipt1_predicted | lipoyltransferase 1 (predicted) | 'predicted' is removed | 2292626 | APPROVED |
| 2005-01-12 | Lipt1_predicted | lipoyltransferase 1 (predicted) | Symbol and Name status set to approved | 70820 | APPROVED |