Imported Disease Annotations - CTDObject Symbol | Species | Term | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | Dapp1 | Rat | osteoarthritis | | ISO | DAPP1 (Homo sapiens) | 11554173 | CTD Direct Evidence: marker/mechanism | CTD | PMID:18784066 | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Imported Disease Annotations - CTDObject Symbol | Species | Term | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | Dapp1 | Rat | osteoarthritis | | ISO | DAPP1 (Homo sapiens) | 11554173 | CTD Direct Evidence: marker/mechanism | CTD | PMID:18784066 | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| # | Reference Title | Reference Citation |
| 1. | Phylogenetic-based propagation of functional annotations within the Gene Ontology consortium. | Gaudet P, etal., Brief Bioinform. 2011 Sep;12(5):449-62. doi: 10.1093/bib/bbr042. Epub 2011 Aug 27. |
| 2. | Rat ISS GO annotations from MGI mouse gene data--August 2006 | MGD data from the GO Consortium |
| 3. | KEGG Annotation Import Pipeline | Pipeline to import KEGG annotations from KEGG into RGD |
| 4. | PID Annotation Import Pipeline | Pipeline to import Pathway Interaction Database annotations from NCI into RGD |
| 5. | ClinVar Automated Import and Annotation Pipeline | RGD automated import pipeline for ClinVar variants, variant-to-disease annotations and gene-to-disease annotations |
| 6. | Data Import for Chemical-Gene Interactions | RGD automated import pipeline for gene-chemical interactions |
| Dapp1 (Rattus norvegicus - Norway rat) |
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| DAPP1 (Homo sapiens - human) |
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| Dapp1 (Mus musculus - house mouse) |
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| Dapp1 (Chinchilla lanigera - long-tailed chinchilla) |
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| DAPP1 (Pan paniscus - bonobo/pygmy chimpanzee) |
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| DAPP1 (Canis lupus familiaris - dog) |
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| Dapp1 (Ictidomys tridecemlineatus - thirteen-lined ground squirrel) |
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| DAPP1 (Sus scrofa - pig) |
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| DAPP1 (Chlorocebus sabaeus - green monkey) |
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| Dapp1 (Heterocephalus glaber - naked mole-rat) |
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| Dapp1 (Rattus rattus - black rat) |
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Variants in Dapp1
442 total Variants
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| The detailed report is available here: | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer |
miRNA Target Status data imported from miRGate (http://mirgate.bioinfo.cnio.es/). For more information about miRGate, see PMID:25858286 or access the full paper here. |
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| The following QTLs overlap with this region. | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer | ![]() | Gviewer |
| RH127587 |
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alimentary part of gastrointestinal system
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appendage
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circulatory system
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ectoderm
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endocrine system
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endoderm
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exocrine system
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hemolymphoid system
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hepatobiliary system
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integumental system
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mesenchyme
|
mesoderm
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musculoskeletal system
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nervous system
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renal system
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reproductive system
|
respiratory system
|
sensory system
|
visual system
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|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 20 | 13 | 84 | 214 | 91 | 90 | 59 | 158 | 59 | 6 | 479 | 285 | 22 | 188 | 107 | 124 | 31 | 31 | 31 |
| RefSeq Transcripts | NM_001108568 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
| XM_039102724 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| GenBank Nucleotide | AC113908 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
| CH473952 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| JAXUCZ010000002 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOT00000014139 ⟹ ENSRNOP00000014139 | ||||||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||||||
| Position: |
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| Ensembl Acc Id: | ENSRNOT00000115021 ⟹ ENSRNOP00000088868 | ||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||
| Position: |
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| Ensembl Acc Id: | ENSRNOT00000116150 ⟹ ENSRNOP00000094432 | ||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||
| Position: |
|
| RefSeq Acc Id: | NM_001108568 ⟹ NP_001102038 | ||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq Status: | PROVISIONAL | ||||||||||||||||||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||||||||||||||||||
| Position: |
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||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence: |
| RefSeq Acc Id: | XM_039102724 ⟹ XP_038958652 | ||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||
| Position: |
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| Protein RefSeqs | NP_001102038 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
| XP_038958652 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| GenBank Protein | EDL82303 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
| Ensembl Protein | ENSRNOP00000014139 | ||
| ENSRNOP00000014139.5 | |||
| ENSRNOP00000088868.1 | |||
| ENSRNOP00000094432.2 |
| RefSeq Acc Id: | NP_001102038 ⟸ NM_001108568 |
| - UniProtKB: | D4ACC1 (UniProtKB/TrEMBL), A6HW17 (UniProtKB/TrEMBL), A0A8I6AM49 (UniProtKB/TrEMBL) |
| - Sequence: |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOP00000014139 ⟸ ENSRNOT00000014139 |
| RefSeq Acc Id: | XP_038958652 ⟸ XM_039102724 |
| - Peptide Label: | isoform X1 |
| - UniProtKB: | A0A8I6AM49 (UniProtKB/TrEMBL) |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOP00000094432 ⟸ ENSRNOT00000116150 |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOP00000088868 ⟸ ENSRNOT00000115021 |
| Name | Modeler | Protein Id | AA Range | Protein Structure |
| AF-D4ACC1-F1-model_v2 | AlphaFold | D4ACC1 | 1-279 | view protein structure |
| eQTL | View at Phenogen | |
| WGCNA | View at Phenogen | |
| Tissue/Strain Expression | View at Phenogen |
| RGD ID: | 13691780 | ||||||||
| Promoter ID: | EPDNEW_R2305 | ||||||||
| Type: | initiation region | ||||||||
| Name: | Dapp1_1 | ||||||||
| Description: | dual adaptor of phosphotyrosine and 3-phosphoinositides 1 | ||||||||
| SO ACC ID: | SO:0000170 | ||||||||
| Source: | EPDNEW (Eukaryotic Promoter Database, http://epd.vital-it.ch/) | ||||||||
| Experiment Methods: | Single-end sequencing. | ||||||||
| Position: |
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| Database | Acc Id | Source(s) |
| AGR Gene | RGD:1310189 | AgrOrtholog |
| BioCyc Gene | G2FUF-51103 | BioCyc |
| Ensembl Genes | ENSRNOG00000010575 | Ensembl, ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
| Ensembl Transcript | ENSRNOT00000014139 | ENTREZGENE |
| ENSRNOT00000014139.7 | UniProtKB/TrEMBL | |
| ENSRNOT00000115021.2 | UniProtKB/TrEMBL | |
| ENSRNOT00000116150.2 | UniProtKB/TrEMBL | |
| Gene3D-CATH | 2.30.29.30 | UniProtKB/TrEMBL |
| 3.30.505.10 | UniProtKB/TrEMBL | |
| InterPro | DAPP1_SH2 | UniProtKB/TrEMBL |
| PH_type | UniProtKB/TrEMBL | |
| PI-Interact_SigTrans_Reg | UniProtKB/TrEMBL | |
| Pleckstrin_homology | UniProtKB/TrEMBL | |
| SH2 | UniProtKB/TrEMBL | |
| SH2_dom_sf | UniProtKB/TrEMBL | |
| KEGG Report | rno:362046 | UniProtKB/TrEMBL |
| NCBI Gene | 362046 | ENTREZGENE |
| PANTHER | DUAL ADAPTER FOR PHOSPHOTYROSINE AND 3-PHOSPHOTYROSINE AND 3-PHOSPHOINOSITIDE | UniProtKB/TrEMBL |
| TANDEM PH DOMAIN CONTAINING PROTEIN | UniProtKB/TrEMBL | |
| Pfam | PF00169 | UniProtKB/TrEMBL |
| SH2 | UniProtKB/TrEMBL | |
| PhenoGen | Dapp1 | PhenoGen |
| PRINTS | PI3KINASEP85 | UniProtKB/TrEMBL |
| SH2DOMAIN | UniProtKB/TrEMBL | |
| PROSITE | PH_DOMAIN | UniProtKB/TrEMBL |
| SH2 | UniProtKB/TrEMBL | |
| RatGTEx | ENSRNOG00000010575 | RatGTEx |
| SMART | SH2 | UniProtKB/TrEMBL |
| SM00233 | UniProtKB/TrEMBL | |
| Superfamily-SCOP | PH domain-like | UniProtKB/TrEMBL |
| SSF55550 | UniProtKB/TrEMBL | |
| UniProt | A0A8I6AM49 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
| A0A8I6GHI5_RAT | UniProtKB/TrEMBL | |
| A6HW17 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL | |
| D4ACC1 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
| Date | Current Symbol | Current Name | Previous Symbol | Previous Name | Description | Reference | Status |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2016-06-01 | Dapp1 | dual adaptor of phosphotyrosine and 3-phosphoinositides 1 | Dapp1 | dual adaptor of phosphotyrosine and 3-phosphoinositides | Nomenclature updated to reflect human and mouse nomenclature | 1299863 | APPROVED |
| 2008-09-25 | Dapp1 | dual adaptor of phosphotyrosine and 3-phosphoinositides | Dapp1 | dual adaptor for phosphotyrosine and 3-phosphoinositides 1 | Nomenclature updated to reflect human and mouse nomenclature | 1299863 | APPROVED |
| 2008-04-30 | Dapp1 | dual adaptor for phosphotyrosine and 3-phosphoinositides 1 | Dapp1_predicted | dual adaptor for phosphotyrosine and 3-phosphoinositides 1 (predicted) | 'predicted' is removed | 2292626 | APPROVED |
| 2005-01-12 | Dapp1_predicted | dual adaptor for phosphotyrosine and 3-phosphoinositides 1 (predicted) | Symbol and Name status set to approved | 70820 | APPROVED |