Imported Disease Annotations - OMIMObject Symbol | Species | Term | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | Get3 | Rat | Dilated Cardiomyopathy 2H | | ISO | GET3 (Homo sapiens) | 7240710 | | OMIM | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Imported Disease Annotations - OMIMObject Symbol | Species | Term | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | Get3 | Rat | Dilated Cardiomyopathy 2H | | ISO | GET3 (Homo sapiens) | 7240710 | | OMIM | | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| # | Reference Title | Reference Citation |
| 1. | Tail-anchored Protein Insertion in Mammals: FUNCTION AND RECIPROCAL INTERACTIONS OF THE TWO SUBUNITS OF THE TRC40 RECEPTOR. | Colombo SF, etal., J Biol Chem. 2016 Jul 15;291(29):15292-306. doi: 10.1074/jbc.M115.707752. Epub 2016 May 23. |
| 2. | Phylogenetic-based propagation of functional annotations within the Gene Ontology consortium. | Gaudet P, etal., Brief Bioinform. 2011 Sep;12(5):449-62. doi: 10.1093/bib/bbr042. Epub 2011 Aug 27. |
| 3. | Rat ISS GO annotations from GOA human gene data--August 2006 | GOA data from the GO Consortium |
| 4. | GOA pipeline | RGD automated data pipeline |
| 5. | ClinVar Automated Import and Annotation Pipeline | RGD automated import pipeline for ClinVar variants, variant-to-disease annotations and gene-to-disease annotations |
| 6. | Data Import for Chemical-Gene Interactions | RGD automated import pipeline for gene-chemical interactions |
| 7. | Molecular machinery for insertion of tail-anchored membrane proteins into the endoplasmic reticulum membrane in mammalian cells. | Yamamoto Y and Sakisaka T, Mol Cell. 2012 Nov 9;48(3):387-97. doi: 10.1016/j.molcel.2012.08.028. Epub 2012 Oct 4. |
| PMID:8889548 | PMID:12477932 | PMID:19056867 | PMID:23376485 | PMID:25535373 |
| Get3 (Rattus norvegicus - Norway rat) |
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| GET3 (Homo sapiens - human) |
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| Get3 (Mus musculus - house mouse) |
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| Get3 (Chinchilla lanigera - long-tailed chinchilla) |
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| GET3 (Pan paniscus - bonobo/pygmy chimpanzee) |
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| GET3 (Canis lupus familiaris - dog) |
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| Get3 (Ictidomys tridecemlineatus - thirteen-lined ground squirrel) |
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| GET3 (Sus scrofa - pig) |
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| GET3 (Chlorocebus sabaeus - green monkey) |
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| Get3 (Heterocephalus glaber - naked mole-rat) |
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| Get3 (Rattus rattus - black rat) |
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Variants in Get3
93 total Variants
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| The detailed report is available here: | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer |
miRNA Target Status data imported from miRGate (http://mirgate.bioinfo.cnio.es/). For more information about miRGate, see PMID:25858286 or access the full paper here. |
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| The following QTLs overlap with this region. | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer | ![]() | Gviewer |
| RH129284 |
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alimentary part of gastrointestinal system
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appendage
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circulatory system
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ectoderm
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endocrine system
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endoderm
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exocrine system
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hemolymphoid system
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hepatobiliary system
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integumental system
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mesenchyme
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mesoderm
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musculoskeletal system
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nervous system
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renal system
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reproductive system
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respiratory system
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sensory system
|
visual system
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|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 16 | 12 | 67 | 163 | 91 | 90 | 59 | 92 | 59 | 6 | 356 | 192 | 11 | 142 | 81 | 92 | 31 | 17 | 17 |
| RefSeq Transcripts | NM_001100505 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
| XM_008772367 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| XM_008772368 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| XM_008772369 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| XM_063277831 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| GenBank Nucleotide | AA997032 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
| BC098819 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| CB700861 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| CH473972 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles | |
| JAXUCZ010000019 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | Search GEO for Microarray Profiles |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOT00000067518 ⟹ ENSRNOP00000059647 | ||||||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||||||
| Position: |
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| Ensembl Acc Id: | ENSRNOT00000157672 ⟹ ENSRNOP00000100532 | ||||||||
| Type: | CODING | ||||||||
| Position: |
|
| RefSeq Acc Id: | NM_001100505 ⟹ NP_001093975 | ||||||||||||||||||||||||||||
| RefSeq Status: | VALIDATED | ||||||||||||||||||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||||||||||||||||||
| Position: |
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||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence: |
| RefSeq Acc Id: | XM_063277831 ⟹ XP_063133901 | ||||||||
| Type: | CODING | ||||||||
| Position: |
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| Protein RefSeqs | NP_001093975 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
| XP_063133901 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| GenBank Protein | AAH98819 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
| EDL92167 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer | |
| Ensembl Protein | ENSRNOP00000059647 | ||
| ENSRNOP00000059647.1 | |||
| GenBank Protein | G3V9T7 | (Get FASTA) | NCBI Sequence Viewer |
| RefSeq Acc Id: | NP_001093975 ⟸ NM_001100505 |
| - UniProtKB: | G3V9T7 (UniProtKB/TrEMBL), Q4G022 (UniProtKB/TrEMBL) |
| - Sequence: |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOP00000059647 ⟸ ENSRNOT00000067518 |
| RefSeq Acc Id: | XP_063133901 ⟸ XM_063277831 |
| - Peptide Label: | isoform X1 |
| - UniProtKB: | G3V9T7 (UniProtKB/Swiss-Prot), Q4G022 (UniProtKB/TrEMBL) |
| Ensembl Acc Id: | ENSRNOP00000100532 ⟸ ENSRNOT00000157672 |
| Name | Modeler | Protein Id | AA Range | Protein Structure |
| AF-G3V9T7-F1-model_v2 | AlphaFold | G3V9T7 | 1-348 | view protein structure |
| eQTL | View at Phenogen | |
| WGCNA | View at Phenogen | |
| Tissue/Strain Expression | View at Phenogen |
| RGD ID: | 13701036 | ||||||||
| Promoter ID: | EPDNEW_R11559 | ||||||||
| Type: | multiple initiation site | ||||||||
| Name: | Asna1_1 | ||||||||
| Description: | arsA arsenite transporter, ATP-binding, homolog 1 | ||||||||
| SO ACC ID: | SO:0000170 | ||||||||
| Source: | EPDNEW (Eukaryotic Promoter Database, http://epd.vital-it.ch/) | ||||||||
| Experiment Methods: | Single-end sequencing. | ||||||||
| Position: |
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| Database | Acc Id | Source(s) |
| AGR Gene | RGD:1307906 | AgrOrtholog |
| BioCyc Gene | G2FUF-6139 | BioCyc |
| Ensembl Genes | ENSRNOG00000003747 | Ensembl, ENTREZGENE, UniProtKB/Swiss-Prot |
| Ensembl Transcript | ENSRNOT00000067518 | ENTREZGENE |
| ENSRNOT00000067518.2 | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| Gene3D-CATH | 3.40.50.300 | UniProtKB/Swiss-Prot |
| IMAGE_CLONE | IMAGE:7377305 | IMAGE-MGC_LOAD |
| InterPro | Anion-transp_ATPase-like_dom | UniProtKB/Swiss-Prot |
| ATPase_ArsA/GET3 | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| ATPase_ArsA/GET3_euk | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| P-loop_NTPase | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| KEGG Report | rno:288919 | UniProtKB/Swiss-Prot |
| MGC_CLONE | MGC:112864 | IMAGE-MGC_LOAD |
| NCBI Gene | 288919 | ENTREZGENE |
| PANTHER | ATPASE GET3 | UniProtKB/Swiss-Prot |
| PTHR10803 | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| Pfam | ArsA_ATPase | UniProtKB/Swiss-Prot |
| PhenoGen | Get3 | PhenoGen |
| RatGTEx | ENSRNOG00000003747 | RatGTEx |
| Superfamily-SCOP | SSF52540 | UniProtKB/Swiss-Prot |
| UniProt | A0ABK0LGC1_RAT | UniProtKB/TrEMBL |
| G3V9T7 | ENTREZGENE, UniProtKB/Swiss-Prot | |
| Q4G022 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
| Date | Current Symbol | Current Name | Previous Symbol | Previous Name | Description | Reference | Status |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2019-07-01 | Get3 | guided entry of tail-anchored proteins factor 3, ATPase | Asna1 | arsA arsenite transporter, ATP-binding, homolog 1 (bacterial) | Nomenclature updated to reflect human and mouse nomenclature | 1299863 | APPROVED |
| 2005-12-06 | Asna1 | arsA arsenite transporter, ATP-binding, homolog 1 (bacterial) | Asna1_predicted | arsA arsenite transporter, ATP-binding, homolog 1 (bacterial) (predicted) | Symbol and Name updated | 1559027 | APPROVED |
| 2005-01-12 | Asna1_predicted | arsA arsenite transporter, ATP-binding, homolog 1 (bacterial) (predicted) | Symbol and Name status set to approved | 70820 | APPROVED |