ACP Polymorphism Percentage Table 2.
For the purposes of this table, a marker is considered polymorphic betweentwo strains if the size difference between the two strains is greater than 2 base pairs.
| ACI | AVN/Orl | BB/DP | BB/DR | BC/Cpbu | BDIX/Han | BDVII/Cub | BN/Cub-lx | BN/SsNHsd | BP/Cub | BUF/Pit | COP/OlaHsd | DA/Pit | DONRYU/Melb | F344/Pit | FHH/Eur | GH/Omr | GK | IS/Kyo | LE/Mol | LEW/Pit | LH/Mav | LOU/CHan | LN/Mav | M520/N | MHS/Gib | MNR/N | MNRA/N | MNS/Gib | MR/Pit | NEDH/K | NP9 | ODU/N | OKA/Wsl | OM/Han | P5C | PVG/Pit | SD/Rij | SHR/OlaHsd | SHRSP/Riv | SR/Jr | SS/Jr | WAG/RijKyo | WF/Pit | WIST/Nhg | WKY/OlsHsd | WN/N | WTC/Kyo | |
| ACI | - | 43 | 49 | 49 | 47 | 40 | 42 | 60 | 60 | 45 | 45 | 28 | 20 | 44 | 44 | 52 | 46 | 51 | 63 | 50 | 47 | 45 | 45 | 45 | 42 | 47 | 47 | 45 | 48 | 47 | 49 | 49 | 54 | 55 | 50 | 49 | 43 | 47 | 56 | 56 | 44 | 45 | 45 | 45 | 45 | 54 | 48 | 53 |
| AVN/Orl | - | - | 42 | 42 | 44 | 42 | 43 | 54 | 54 | 47 | 42 | 44 | 42 | 43 | 43 | 48 | 43 | 49 | 61 | 47 | 32 | 45 | 40 | 45 | 46 | 41 | 41 | 42 | 41 | 43 | 45 | 41 | 53 | 54 | 48 | 41 | 43 | 45 | 54 | 53 | 44 | 43 | 40 | 41 | 43 | 52 | 42 | 52 |
| BB/DP | - | - | - | 12 | 48 | 46 | 46 | 55 | 55 | 49 | 41 | 50 | 46 | 44 | 44 | 48 | 43 | 49 | 62 | 46 | 32 | 43 | 41 | 44 | 44 | 35 | 43 | 40 | 35 | 42 | 44 | 27 | 52 | 54 | 47 | 27 | 43 | 41 | 54 | 53 | 43 | 41 | 38 | 36 | 43 | 52 | 39 | 52 |
| BB/DR | - | - | - | - | 50 | 47 | 46 | 54 | 54 | 49 | 41 | 50 | 46 | 44 | 45 | 48 | 43 | 48 | 62 | 46 | 32 | 43 | 41 | 44 | 45 | 33 | 42 | 40 | 35 | 41 | 44 | 28 | 52 | 54 | 47 | 26 | 45 | 41 | 54 | 53 | 44 | 42 | 39 | 36 | 43 | 52 | 40 | 52 |
| BC/Cpbu | - | - | - | - | - | 43 | 44 | 59 | 59 | 46 | 47 | 48 | 46 | 47 | 47 | 50 | 45 | 53 | 63 | 50 | 47 | 48 | 45 | 48 | 49 | 49 | 48 | 46 | 50 | 48 | 48 | 49 | 57 | 56 | 50 | 49 | 46 | 49 | 55 | 55 | 48 | 47 | 46 | 46 | 47 | 57 | 47 | 55 |
| BDIX/Han | - | - | - | - | - | - | 29 | 58 | 58 | 42 | 45 | 41 | 42 | 45 | 45 | 52 | 42 | 50 | 62 | 47 | 44 | 45 | 43 | 45 | 45 | 46 | 45 | 44 | 47 | 45 | 48 | 47 | 54 | 54 | 51 | 47 | 43 | 47 | 54 | 55 | 45 | 44 | 44 | 46 | 45 | 53 | 46 | 53 |
| BDVII/Cub | - | - | - | - | - | - | - | 56 | 57 | 43 | 44 | 43 | 42 | 46 | 46 | 50 | 41 | 52 | 61 | 48 | 44 | 46 | 42 | 45 | 45 | 45 | 45 | 44 | 46 | 46 | 46 | 47 | 53 | 54 | 50 | 46 | 44 | 45 | 54 | 53 | 45 | 43 | 42 | 45 | 45 | 53 | 45 | 52 |
| BN/Cub-lx | - | - | - | - | - | - | - | - | 4 | 59 | 56 | 60 | 57 | 56 | 57 | 58 | 58 | 60 | 66 | 59 | 49 | 58 | 54 | 56 | 56 | 54 | 57 | 55 | 55 | 57 | 56 | 54 | 65 | 67 | 59 | 56 | 58 | 55 | 65 | 65 | 58 | 57 | 53 | 54 | 57 | 63 | 57 | 63 |
| BN/SsNHsd | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 59 | 56 | 60 | 57 | 56 | 57 | 59 | 58 | 61 | 67 | 59 | 49 | 58 | 55 | 57 | 56 | 54 | 57 | 55 | 55 | 57 | 56 | 54 | 65 | 67 | 59 | 56 | 58 | 56 | 66 | 66 | 59 | 57 | 53 | 54 | 58 | 63 | 56 | 64 |
| BP/Cub | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 49 | 43 | 46 | 48 | 49 | 54 | 46 | 53 | 63 | 51 | 48 | 48 | 47 | 48 | 47 | 49 | 47 | 48 | 50 | 48 | 50 | 50 | 55 | 57 | 53 | 51 | 47 | 49 | 56 | 56 | 48 | 48 | 49 | 50 | 47 | 55 | 50 | 54 |
| BUF/Pit | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 49 | 42 | 38 | 38 | 48 | 41 | 49 | 61 | 44 | 38 | 40 | 41 | 40 | 37 | 42 | 43 | 41 | 43 | 43 | 46 | 42 | 53 | 55 | 45 | 42 | 41 | 42 | 53 | 53 | 39 | 39 | 41 | 40 | 44 | 53 | 42 | 53 |
| COP/OlaHsd | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 34 | 47 | 47 | 52 | 46 | 51 | 60 | 51 | 47 | 47 | 47 | 47 | 47 | 48 | 46 | 45 | 49 | 46 | 50 | 50 | 53 | 53 | 51 | 50 | 45 | 49 | 53 | 53 | 46 | 47 | 47 | 47 | 47 | 53 | 49 | 52 |
| DA/Pit | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 41 | 41 | 50 | 43 | 50 | 62 | 47 | 43 | 44 | 43 | 43 | 42 | 45 | 44 | 42 | 45 | 44 | 46 | 46 | 52 | 55 | 50 | 46 | 44 | 47 | 54 | 54 | 43 | 43 | 42 | 44 | 44 | 52 | 46 | 51 |
| DONRYU/Melb | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 2 | 47 | 41 | 51 | 62 | 45 | 41 | 39 | 40 | 39 | 32 | 43 | 42 | 42 | 44 | 42 | 45 | 45 | 53 | 55 | 45 | 43 | 39 | 45 | 55 | 54 | 40 | 40 | 41 | 42 | 43 | 54 | 41 | 53 |
| F344/Pit | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 47 | 41 | 51 | 62 | 45 | 41 | 39 | 40 | 40 | 32 | 43 | 43 | 42 | 44 | 43 | 45 | 44 | 53 | 55 | 46 | 43 | 39 | 45 | 55 | 54 | 40 | 40 | 41 | 42 | 43 | 54 | 41 | 53 |
| FHH/Eur | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 45 | 55 | 64 | 45 | 44 | 47 | 44 | 46 | 47 | 45 | 48 | 47 | 45 | 47 | 49 | 47 | 57 | 58 | 50 | 48 | 48 | 48 | 57 | 57 | 47 | 46 | 44 | 46 | 48 | 57 | 47 | 56 |
| GH/Omr | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 51 | 62 | 47 | 39 | 40 | 36 | 40 | 43 | 42 | 40 | 40 | 44 | 41 | 42 | 44 | 52 | 54 | 46 | 43 | 40 | 45 | 54 | 53 | 42 | 41 | 36 | 42 | 43 | 51 | 42 | 51 |
| GK | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 55 | 54 | 46 | 51 | 50 | 51 | 51 | 48 | 50 | 49 | 48 | 49 | 52 | 49 | 41 | 44 | 53 | 49 | 49 | 50 | 43 | 43 | 50 | 51 | 48 | 49 | 49 | 41 | 51 | 40 |
| IS/Kyo | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 63 | 62 | 62 | 61 | 62 | 63 | 62 | 62 | 61 | 63 | 61 | 63 | 63 | 55 | 54 | 63 | 62 | 61 | 63 | 54 | 55 | 63 | 62 | 60 | 64 | 61 | 54 | 63 | 54 |
| LE/Mol | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 43 | 44 | 42 | 45 | 43 | 43 | 46 | 46 | 43 | 46 | 48 | 46 | 56 | 57 | 48 | 44 | 44 | 46 | 56 | 56 | 43 | 43 | 43 | 44 | 47 | 54 | 43 | 55 |
| LEW/Pit | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 39 | 37 | 39 | 41 | 31 | 38 | 38 | 32 | 38 | 41 | 33 | 49 | 53 | 46 | 32 | 40 | 39 | 52 | 51 | 40 | 39 | 33 | 31 | 39 | 49 | 36 | 49 |
| LH/Mav | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 40 | 15 | 39 | 41 | 43 | 43 | 41 | 43 | 41 | 43 | 55 | 54 | 42 | 41 | 43 | 41 | 55 | 52 | 19 | 21 | 42 | 41 | 44 | 53 | 41 | 54 |
| LOU/CHan | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 40 | 39 | 37 | 37 | 36 | 39 | 38 | 42 | 41 | 53 | 53 | 45 | 38 | 38 | 41 | 52 | 51 | 40 | 39 | 29 | 38 | 41 | 51 | 41 | 51 |
| LN/Mav | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 40 | 41 | 43 | 42 | 42 | 44 | 42 | 46 | 55 | 55 | 43 | 43 | 42 | 43 | 55 | 53 | 21 | 22 | 41 | 42 | 43 | 54 | 42 | 54 |
| M520/N | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 42 | 43 | 43 | 44 | 43 | 45 | 46 | 54 | 54 | 46 | 44 | 42 | 44 | 54 | 54 | 40 | 40 | 43 | 42 | 45 | 53 | 42 | 53 |
| MHS/Gib | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 40 | 40 | 29 | 40 | 44 | 35 | 52 | 54 | 45 | 34 | 42 | 39 | 53 | 53 | 41 | 39 | 36 | 34 | 42 | 52 | 37 | 52 |
| MNR/N | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 19 | 41 | 12 | 45 | 43 | 53 | 53 | 47 | 42 | 39 | 43 | 53 | 53 | 42 | 42 | 37 | 41 | 38 | 52 | 42 | 52 |
| MNRA/N | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 41 | 15 | 44 | 43 | 52 | 53 | 47 | 42 | 40 | 42 | 53 | 52 | 43 | 42 | 34 | 38 | 38 | 51 | 42 | 51 |
| MNS/Gib | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 41 | 45 | 34 | 52 | 53 | 44 | 33 | 43 | 39 | 54 | 52 | 41 | 39 | 37 | 35 | 41 | 51 | 38 | 51 |
| MR/Pit | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 45 | 42 | 52 | 53 | 48 | 42 | 40 | 42 | 52 | 52 | 43 | 42 | 36 | 40 | 39 | 52 | 43 | 51 |
| NEDH/K | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 47 | 55 | 56 | 49 | 46 | 45 | 44 | 55 | 54 | 41 | 40 | 41 | 42 | 46 | 54 | 46 | 53 |
| NP9 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 52 | 54 | 47 | 23 | 45 | 40 | 55 | 54 | 43 | 41 | 38 | 35 | 43 | 53 | 38 | 54 |
| ODU/N | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 33 | 56 | 52 | 53 | 54 | 33 | 34 | 56 | 55 | 51 | 52 | 53 | 20 | 54 | 20 |
| OKA/Wsl | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 56 | 53 | 55 | 56 | 14 | 8 | 55 | 55 | 54 | 53 | 54 | 36 | 56 | 35 |
| OM/Han | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 45 | 46 | 48 | 56 | 56 | 44 | 43 | 46 | 44 | 49 | 57 | 45 | 57 |
| P5C | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 44 | 39 | 54 | 52 | 42 | 41 | 38 | 35 | 42 | 51 | 38 | 52 |
| PVG/Pit | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 45 | 53 | 54 | 42 | 41 | 38 | 41 | 40 | 53 | 44 | 53 |
| SD/Rij | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 55 | 55 | 40 | 40 | 41 | 40 | 45 | 53 | 42 | 53 |
| SHR/OlaHsd | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 13 | 55 | 55 | 52 | 54 | 55 | 35 | 56 | 34 |
| SHRSP/Riv | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 53 | 53 | 52 | 52 | 53 | 36 | 55 | 35 |
| SR/Jr | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 19 | 40 | 41 | 43 | 54 | 42 | 54 |
| SS/Jr | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 40 | 37 | 42 | 53 | 42 | 53 |
| WAG/RijKyo | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 35 | 38 | 50 | 39 | 50 |
| WF/Pit | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 41 | 53 | 39 | 52 |
| WIST/Nhg | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 52 | 45 | 52 |
| WKY/OlsHsd | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 54 | 16 |
| WN/N | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | 54 |
| WTC/Kyo | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - |


