For the purposes of this table, a marker is considered polymorphic between
two strains if the size difference between the two strains is 1 or more base
pairs.
|
ACI
|
AVN/Orl
|
BB/DP
|
BB/DR
|
BC/Cpbu
|
BDIX/Han
|
BDVII/Cub
|
BN/Cub-lx
|
BN/SsNHsd
|
BP/Cub
|
BUF/Pit
|
COP/OlaHsd
|
DA/Pit
|
DONRYU/Melb
|
F344/Pit
|
FHH/Eur
|
GH/Omr
|
GK
|
IS/Kyo
|
LE/Mol
|
LEW/Pit
|
LH/Mav
|
LOU/CHan
|
LN/Mav
|
M520/N
|
MHS/Gib
|
MNR/N
|
MNRA/N
|
MNS/Gib
|
MR/Pit
|
NEDH/K
|
NP9
|
ODU/N
|
OKA/Wsl
|
OM/Han
|
P5C
|
PVG/Pit
|
SD/Rij
|
SHR/OlaHsd
|
SHRSP/Riv
|
SR/Jr
|
SS/Jr
|
WAG/RijKyo
|
WF/Pit
|
WIST/Nhg
|
WKY/OlsHsd
|
WN/N
|
WTC/Kyo
|
|
| ACI |
-
|
56
|
62
|
62
|
60
|
54
|
55
|
75
|
74
|
59
|
58
|
41
|
32
|
58
|
57
|
67
|
60
|
67
|
79
|
65
|
61
|
60
|
60
|
60
|
57
|
61
|
61
|
59
|
62
|
61
|
63
|
63
|
69
|
70
|
65
|
63
|
58
|
62
|
71
|
70
|
59
|
59
|
59
|
60
|
60
|
69
|
62
|
69
|
| AVN/Orl |
-
|
-
|
54
|
55
|
57
|
56
|
57
|
68
|
68
|
61
|
55
|
58
|
56
|
56
|
56
|
63
|
57
|
64
|
78
|
61
|
44
|
59
|
54
|
59
|
60
|
54
|
55
|
56
|
54
|
57
|
59
|
56
|
69
|
70
|
63
|
55
|
56
|
59
|
69
|
69
|
58
|
57
|
54
|
55
|
57
|
67
|
56
|
67
|
| BB/DP |
-
|
-
|
-
|
18
|
62
|
60
|
60
|
69
|
69
|
62
|
54
|
64
|
61
|
57
|
57
|
62
|
56
|
63
|
78
|
61
|
45
|
56
|
55
|
57
|
58
|
47
|
56
|
54
|
47
|
55
|
59
|
39
|
67
|
69
|
61
|
38
|
58
|
55
|
70
|
68
|
56
|
55
|
52
|
49
|
57
|
67
|
52
|
67
|
| BB/DR |
-
|
-
|
-
|
-
|
62
|
60
|
60
|
68
|
68
|
63
|
53
|
64
|
60
|
57
|
58
|
62
|
56
|
63
|
78
|
59
|
44
|
56
|
55
|
57
|
58
|
45
|
55
|
53
|
46
|
54
|
57
|
40
|
67
|
70
|
60
|
38
|
58
|
53
|
70
|
68
|
57
|
56
|
51
|
48
|
56
|
67
|
53
|
67
|
| BC/Cpbu |
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
56
|
57
|
74
|
74
|
60
|
60
|
61
|
59
|
61
|
61
|
65
|
58
|
67
|
79
|
64
|
61
|
62
|
60
|
62
|
62
|
63
|
61
|
60
|
64
|
62
|
62
|
63
|
71
|
72
|
65
|
63
|
60
|
63
|
70
|
70
|
62
|
61
|
60
|
60
|
61
|
71
|
62
|
71
|
| BDIX/Han |
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
39
|
73
|
74
|
55
|
58
|
54
|
55
|
59
|
59
|
67
|
55
|
64
|
78
|
62
|
58
|
59
|
58
|
59
|
58
|
61
|
59
|
59
|
61
|
59
|
62
|
62
|
70
|
70
|
65
|
61
|
57
|
62
|
69
|
70
|
59
|
58
|
59
|
60
|
59
|
69
|
60
|
69
|
| BDVII/Cub |
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
72
|
73
|
56
|
58
|
56
|
56
|
58
|
58
|
65
|
54
|
67
|
77
|
63
|
58
|
59
|
56
|
59
|
57
|
60
|
60
|
59
|
60
|
60
|
61
|
62
|
69
|
70
|
65
|
61
|
58
|
59
|
69
|
69
|
59
|
58
|
57
|
59
|
58
|
69
|
60
|
68
|
| BN/Cub-lx |
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
8
|
74
|
71
|
75
|
71
|
71
|
72
|
74
|
72
|
76
|
84
|
74
|
62
|
73
|
70
|
71
|
72
|
68
|
70
|
70
|
69
|
71
|
70
|
68
|
80
|
83
|
74
|
70
|
73
|
69
|
81
|
82
|
73
|
72
|
67
|
68
|
72
|
78
|
71
|
79
|
| BN/SsNHsd |
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
74
|
71
|
75
|
71
|
71
|
72
|
74
|
72
|
76
|
83
|
75
|
62
|
73
|
70
|
72
|
72
|
68
|
71
|
70
|
69
|
71
|
71
|
68
|
80
|
83
|
75
|
70
|
73
|
70
|
81
|
82
|
73
|
72
|
68
|
68
|
72
|
78
|
72
|
79
|
| BP/Cub |
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
63
|
57
|
60
|
63
|
63
|
69
|
59
|
68
|
79
|
66
|
61
|
62
|
62
|
62
|
61
|
63
|
63
|
63
|
63
|
63
|
65
|
64
|
70
|
72
|
67
|
64
|
61
|
63
|
71
|
71
|
63
|
62
|
64
|
64
|
62
|
71
|
64
|
70
|
| BUF/Pit |
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
63
|
55
|
49
|
49
|
62
|
53
|
63
|
78
|
58
|
50
|
53
|
53
|
53
|
50
|
55
|
55
|
55
|
56
|
56
|
59
|
55
|
68
|
70
|
60
|
55
|
55
|
56
|
68
|
69
|
53
|
52
|
54
|
53
|
57
|
68
|
56
|
68
|
| COP/OlaHsd |
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
46
|
61
|
61
|
67
|
60
|
66
|
76
|
65
|
61
|
61
|
61
|
62
|
61
|
63
|
61
|
61
|
63
|
61
|
64
|
64
|
68
|
68
|
66
|
64
|
60
|
63
|
68
|
68
|
60
|
61
|
62
|
61
|
61
|
68
|
63
|
67
|
| DA/Pit |
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
54
|
54
|
65
|
56
|
65
|
78
|
61
|
55
|
57
|
56
|
57
|
55
|
58
|
58
|
57
|
59
|
58
|
60
|
60
|
67
|
70
|
64
|
59
|
58
|
60
|
68
|
69
|
57
|
57
|
56
|
57
|
57
|
67
|
59
|
67
|
| DONRYU/Melb |
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
6
|
61
|
53
|
65
|
78
|
59
|
53
|
51
|
52
|
51
|
43
|
55
|
55
|
55
|
56
|
55
|
58
|
58
|
67
|
69
|
59
|
55
|
52
|
57
|
69
|
68
|
53
|
52
|
54
|
55
|
56
|
68
|
54
|
67
|
| F344/Pit |
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
61
|
52
|
66
|
79
|
59
|
54
|
51
|
52
|
52
|
43
|
56
|
55
|
55
|
57
|
56
|
58
|
58
|
67
|
69
|
60
|
56
|
53
|
58
|
70
|
69
|
53
|
53
|
55
|
55
|
57
|
68
|
54
|
67
|
| FHH/Eur |
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
59
|
71
|
80
|
60
|
57
|
61
|
58
|
60
|
63
|
60
|
62
|
62
|
59
|
62
|
63
|
62
|
73
|
74
|
65
|
62
|
63
|
63
|
74
|
73
|
61
|
60
|
59
|
60
|
64
|
73
|
60
|
72
|
| GH/Omr |
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
66
|
78
|
60
|
52
|
52
|
49
|
53
|
55
|
55
|
53
|
53
|
57
|
54
|
54
|
58
|
67
|
69
|
59
|
56
|
53
|
58
|
68
|
68
|
55
|
54
|
49
|
55
|
56
|
66
|
55
|
66
|
| GK |
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
71
|
69
|
60
|
65
|
66
|
66
|
67
|
63
|
65
|
64
|
61
|
64
|
66
|
63
|
56
|
58
|
69
|
63
|
64
|
65
|
57
|
57
|
65
|
66
|
63
|
63
|
64
|
56
|
66
|
55
|
| IS/Kyo |
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
80
|
78
|
79
|
78
|
79
|
79
|
78
|
78
|
78
|
78
|
78
|
79
|
79
|
71
|
69
|
81
|
78
|
77
|
79
|
69
|
71
|
79
|
78
|
78
|
79
|
77
|
70
|
81
|
70
|
| LE/Mol |
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
56
|
58
|
57
|
60
|
57
|
58
|
61
|
61
|
57
|
60
|
62
|
60
|
72
|
73
|
63
|
58
|
59
|
60
|
72
|
71
|
59
|
59
|
57
|
58
|
61
|
70
|
57
|
71
|
| LEW/Pit |
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
51
|
48
|
52
|
54
|
42
|
50
|
50
|
43
|
50
|
54
|
44
|
64
|
68
|
59
|
43
|
53
|
52
|
67
|
67
|
53
|
53
|
45
|
43
|
52
|
63
|
48
|
63
|
| LH/Mav |
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
53
|
24
|
52
|
53
|
55
|
55
|
53
|
55
|
54
|
56
|
69
|
69
|
55
|
53
|
56
|
54
|
69
|
67
|
29
|
31
|
54
|
54
|
58
|
68
|
54
|
69
|
| LOU/CHan |
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
52
|
52
|
49
|
50
|
48
|
52
|
50
|
54
|
54
|
68
|
68
|
59
|
52
|
51
|
54
|
68
|
67
|
53
|
52
|
41
|
50
|
55
|
67
|
53
|
66
|
| LN/Mav |
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
53
|
54
|
56
|
55
|
54
|
56
|
55
|
59
|
70
|
70
|
57
|
56
|
56
|
56
|
70
|
68
|
30
|
33
|
54
|
55
|
56
|
68
|
55
|
68
|
| M520/N |
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
56
|
57
|
57
|
57
|
57
|
59
|
60
|
69
|
69
|
60
|
57
|
56
|
58
|
69
|
70
|
54
|
53
|
56
|
56
|
58
|
68
|
55
|
68
|
| MHS/Gib |
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
53
|
52
|
38
|
52
|
57
|
46
|
67
|
69
|
58
|
45
|
55
|
52
|
68
|
67
|
54
|
51
|
48
|
46
|
54
|
67
|
50
|
66
|
| MNR/N |
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
27
|
54
|
18
|
57
|
55
|
67
|
68
|
62
|
54
|
53
|
56
|
67
|
67
|
56
|
55
|
49
|
54
|
52
|
67
|
55
|
66
|
| MNRA/N |
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
53
|
21
|
57
|
55
|
67
|
68
|
61
|
55
|
53
|
55
|
68
|
68
|
56
|
55
|
46
|
51
|
51
|
67
|
55
|
67
|
| MNS/Gib |
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
53
|
57
|
45
|
66
|
68
|
58
|
44
|
56
|
51
|
68
|
67
|
53
|
51
|
49
|
45
|
53
|
66
|
50
|
66
|
| MR/Pit |
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
58
|
55
|
67
|
68
|
61
|
55
|
53
|
55
|
67
|
67
|
55
|
55
|
48
|
53
|
51
|
67
|
56
|
66
|
| NEDH/K |
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
59
|
69
|
70
|
62
|
58
|
59
|
56
|
69
|
68
|
54
|
53
|
55
|
56
|
59
|
68
|
59
|
68
|
| NP9 |
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
67
|
70
|
60
|
31
|
58
|
52
|
70
|
69
|
56
|
54
|
50
|
47
|
56
|
67
|
51
|
69
|
| ODU/N |
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
44
|
71
|
66
|
68
|
69
|
45
|
46
|
70
|
69
|
65
|
66
|
67
|
31
|
69
|
31
|
| OKA/Wsl |
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
71
|
69
|
69
|
71
|
21
|
14
|
70
|
70
|
69
|
68
|
69
|
48
|
72
|
47
|
| OM/Han |
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
58
|
60
|
60
|
71
|
71
|
57
|
56
|
59
|
57
|
62
|
72
|
59
|
71
|
| P5C |
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
57
|
50
|
69
|
68
|
54
|
53
|
50
|
46
|
54
|
66
|
51
|
66
|
| PVG/Pit |
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
59
|
68
|
68
|
55
|
54
|
51
|
55
|
53
|
68
|
57
|
69
|
| SD/Rij |
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
70
|
70
|
53
|
52
|
53
|
52
|
58
|
68
|
56
|
67
|
| SHR/OlaHsd |
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
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-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
19
|
70
|
69
|
67
|
68
|
69
|
47
|
72
|
47
|
| SHRSP/Riv |
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
68
|
68
|
67
|
67
|
68
|
48
|
70
|
47
|
| SR/Jr |
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
28
|
53
|
53
|
56
|
68
|
55
|
69
|
| SS/Jr |
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
52
|
48
|
54
|
68
|
55
|
68
|
| WAG/RijKyo |
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
46
|
50
|
64
|
52
|
64
|
| WF/Pit |
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
53
|
66
|
52
|
65
|
| WIST/Nhg |
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
66
|
58
|
67
|
| WKY/OlsHsd |
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
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-
|
-
|
-
|
-
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-
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-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
-
|
69
|
23
|
| WN/N |
-
|
-
|
-
|
-
|
-
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