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Gene Ontology AnnotationsGene Ontology Annotations
Gene Ontology AnnotationsBiological Process Term | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | cellular protein complex assembly | | IDA | | 1299425 | | RGD | | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene-Chemical Interaction Annotations
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Gene Ontology Annotations
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References - curated| 1. |
RGD automated import pipeline for gene-chemical interactions |
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Verde I, etal., J Biol Chem 2001 Apr 6;276(14):11189-98. Epub 2000 Dec 27. |
References - uncurated| PubMed | 21569246 |
Comparative Map Data| Pde4dip (Rattus norvegicus) |
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| PDE4DIP (Homo sapiens) |
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| Pde4dip (Mus musculus) |
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Position Markers| D13Rat53 |
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| BE112181 |
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| RH138621 |
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| RH127540 |
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| RH129474 |
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| RH135416 |
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| RH141783 |
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| BF420231 |
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| MARC_23709-23710:1030738086:1 |
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QTLs in Region (RGSC Genome Assembly v3.4)| The following QTLs overlap with this region. |  | Full Report | | CSV | | TAB | | Printer | | Gviewer |
Nucleotide Sequences| RefSeq Acc Id: | NM_022382 | ||||||||||||||||||||
| RefSeq Status: | PROVISIONAL | ||||||||||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||||||||||
| Protein Acc Id: | NP_071777 | ||||||||||||||||||||
| Position: |
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Protein Sequences| Protein RefSeqs | NP_071777 | (Get FASTA) |
| GenBank Protein | AAD29427 | (Get FASTA) |
| Q9WUJ3 | (Get FASTA) |
Strain Sequence Variants
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External Database Links| Database | Acc Id | Source(s) |
| Ensembl Genes | ENSRNOG00000018220 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
| Ensembl Protein | ENSRNOP00000024900 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
| Ensembl Transcript | ENSRNOT00000024900 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
| Entrez Gene | 64183 | ENTREZGENE |
| HomoloGene Group ID | 66961 | ENTREZGENE |
| InterPro | NBPF_rpt | UniProtKB/Swiss-Prot |
| Spindle_assoc | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| IPI | IPI00204081 | UniProtKB/Swiss-Prot |
| KEGG Report | rno:64183 | ENTREZGENE, UniProtKB/Swiss-Prot |
| Pfam | DUF1220 | UniProtKB/Swiss-Prot |
| Microtub_assoc | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| PROSITE | NBPF | UniProtKB/Swiss-Prot |
| UniGene | Rn.48693 | ENTREZGENE |
| UniProt | F1M7R5_RAT | UniProtKB/TrEMBL |
| MYOME_RAT | UniProtKB/Swiss-Prot |
Nomenclature History| Date | Current Symbol | Current Name | Previous Symbol | Previous Name | Description | Reference | Status |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2008-08-29 | Pde4dip | phosphodiesterase 4D interacting protein | Pde4dip | phosphodiesterase 4D interacting protein (myomegalin) | Nomenclature updated to reflect human and mouse nomenclature | 10779 | APPROVED |
| 2005-07-08 | Pde4dip | phosphodiesterase 4D interacting protein (myomegalin) | LOC64183 | myomegalin | Symbol and Name updated | 10779 | APPROVED |
| More on Pde4dip | |
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Entrez Gene |
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Ensembl Gene |
| Genome Browser |
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NCBI Map Viewer |
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Vista |
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Vista + UCSC |
| RGD Object Information | |
| RGD ID: | 708410 |
| Created: | 2003-09-23 |
| Species: | Rattus norvegicus |
| Last Modified: | 2013-04-16 |
| Status: | ACTIVE |
© Bioinformatics Program, HMGC at the Medical College of Wisconsin
RGD is funded by grant HL64541 from the National Heart, Lung, and Blood Institute on behalf of the NIH.