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Gene Ontology Annotations
Gene Ontology AnnotationsBiological Process Term | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | brain development | | IEP | | 632437 | | RGD | | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene-Chemical Interaction Annotations
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Gene Ontology Annotations
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References - curated| 1. |
Ohoka Y and Takai Y, Genes Cells 1998 Sep;3(9):603-12. |
| 2. |
RGD automated import pipeline for gene-chemical interactions |
References - uncurated
RGD Disease Portals
Comparative Map Data| Cttnbp2 (Rattus norvegicus) |
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| CTTNBP2 (Homo sapiens) |
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| Cttnbp2 (Mus musculus) |
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Position Markers| RH144522 |
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| BF401529 |
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| AI045527 |
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| BF413676 |
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| REN62252 |
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| REN62251 |
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QTLs in Region (RGSC Genome Assembly v3.4)| The following QTLs overlap with this region. | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer | ![]() | Gviewer |
Nucleotide Sequences| RefSeq Acc Id: | NM_001114401 | ||||||||||||||||||||
| RefSeq Status: | PROVISIONAL | ||||||||||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||||||||||
| Protein Acc Id: | NP_001107873 | ||||||||||||||||||||
| Position: |
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Protein Sequences| Protein RefSeqs | NP_001107873 | (Get FASTA) |
| GenBank Protein | AAC35911 | (Get FASTA) |
| AAR16316 | (Get FASTA) | |
| EDM15128 | (Get FASTA) |
Strain Sequence Variants
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External Database Links| Database | Acc Id | Source(s) |
| Ensembl Genes | ENSRNOG00000008440 | ENTREZGENE, UniProtKB/Swiss-Prot |
| Ensembl Protein | ENSRNOP00000011135 | ENTREZGENE, UniProtKB/Swiss-Prot |
| Ensembl Transcript | ENSRNOT00000011135 | ENTREZGENE, UniProtKB/Swiss-Prot |
| Entrez Gene | 282587 | ENTREZGENE |
| Gene3D-CATH | 0.20 | UniProtKB/Swiss-Prot |
| HomoloGene Group ID | 14125 | ENTREZGENE |
| InterPro | Ankyrin_rpt | UniProtKB/Swiss-Prot |
| Ankyrin_rpt-contain_dom | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| Cortactin-binding_p2_N | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| IPI | IPI00370652 | UniProtKB/Swiss-Prot |
| KEGG Report | rno:282587 | ENTREZGENE, UniProtKB/Swiss-Prot |
| Pfam | Ank | UniProtKB/Swiss-Prot |
| Ank_2 | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| CortBP2 | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| PROSITE | ANK_REP_REGION | UniProtKB/Swiss-Prot |
| ANK_REPEAT | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| SMART | ANK | UniProtKB/Swiss-Prot |
| Superfamily-SCOP | ANK | UniProtKB/Swiss-Prot |
| UniGene | Rn.16244 | ENTREZGENE |
| UniProt | CTTB2_RAT | UniProtKB/Swiss-Prot |
Nomenclature History| Date | Current Symbol | Current Name | Previous Symbol | Previous Name | Description | Reference | Status |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2005-01-20 | Cttnbp2 | cortactin binding protein 2 | Cbp90 | brain specific cortactin-binding protein CBP90 | Symbol and Name updated | 10779 | APPROVED |
| 2003-02-27 | Cbp90 | brain specific cortactin-binding protein CBP90 | Symbol and Name status set to provisional | 1724 | PROVISIONAL |
RGD Curation Notes| Note Type | Note | Reference |
|---|---|---|
| gene_expression | expressed in brain only | 632437 |
| gene_physical_interaction | able to bind to all cortactin isoforms | 632437 |
| gene_protein | predicted protein masses 90 kDa | 632437 |
| More on Cttnbp2 | |
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Vista + UCSC |
| RGD Object Information | |
| RGD ID: | 628691 |
| Created: | 2003-02-27 |
| Species: | Rattus norvegicus |
| Last Modified: | 2013-04-16 |
| Status: | ACTIVE |
© Bioinformatics Program, HMGC at the Medical College of Wisconsin
RGD is funded by grant HL64541 from the National Heart, Lung, and Blood Institute on behalf of the NIH.




