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Gene Ontology AnnotationsMolecular Pathway AnnotationsPhenotype AnnotationsDisease Annotations
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Gene-Chemical Interaction AnnotationsGene Ontology Annotations
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Molecular Pathway Annotations
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| External Database Links | |
| KEGG Pathway | Arrhythmogenic right ventricular cardiomyopathy (ARVC) |
| Dilated cardiomyopathy | |
| ECM-receptor interaction | |
| Focal adhesion | |
| Hematopoietic cell lineage | |
| Hypertrophic cardiomyopathy (HCM) | |
| Osteoclast differentiation | |
| Phagosome | |
| PI3K-Akt signaling pathway | |
| Regulation of actin cytoskeleton | |
| Pathway Interaction Database | Arf6 signaling events (PID:200073) |
| Beta3 integrin cell surface interactions (PID:200043) | |
| Ephrin B reverse signaling (PID:200204) | |
| IL4-mediated signaling events (PID:200022) | |
| Integrin family cell surface interactions (PID:200039) | |
| Integrins in angiogenesis (PID:200128) | |
| Nectin adhesion pathway (PID:200065) | |
| Osteopontin-mediated events (PID:200053) | |
| PDGFR-beta signaling pathway (PID:200149) | |
| S1P1 pathway (PID:200085) | |
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| Signaling events mediated by PTP1B (PID:200042) | |
| Signaling events mediated by VEGFR1 and VEGFR2 (PID:200188) | |
| Urokinase-type plasminogen activator (uPA) and uPAR-mediated signaling (PID:200139) | |
Phenotype Annotations
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Pipeline to import KEGG annotations from KEGG into RGD Pathway Ontology |
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RGD automated import pipeline for gene-chemical interactions |
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RGD Automated Pipelines |
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| 20739877 | |
| 20802378 | |
| 20819594 | |
| 20826760 | |
| 20828133 | |
| 20837477 | |
| 20857483 | |
| 20873239 | |
| 20929856 | |
| 20945385 | |
| 20978323 | |
| 21034162 | |
| 21039385 | |
| 21044892 | |
| 21054877 | |
| 21071690 | |
| 21080081 | |
| 21091771 | |
| 21102624 | |
| 21109038 | |
| 21122545 | |
| 21135163 | |
| 21143381 | |
| 21156831 | |
| 21182210 | |
| 21190668 | |
| 21241403 | |
| 21283814 | |
| 21325030 | |
| 21344378 | |
| 21353223 | |
| 2138612 | |
| 2145280 | |
| 21508388 | |
| 21529934 | |
| 21570717 | |
| 21590707 | |
| 21622897 | |
| 21626402 | |
| 21645227 | |
| 21645497 | |
| 21678053 | |
| 21764795 | |
| 21813062 | |
| 21832081 | |
| 21917754 | |
| 21935711 | |
| 21951552 | |
| 21966982 | |
| 21978494 | |
| 22002573 | |
| 22015616 | |
| 22015659 | |
| 2202737 | |
| 22028352 | |
| 22078565 | |
| 22094875 | |
| 22095620 | |
| 22102273 | |
| 22116617 | |
| 22132110 | |
| 22136613 | |
| 22171266 | |
| 22174124 | |
| 22174684 | |
| 22190468 | |
| 22207115 | |
| 22268819 | |
| 22308022 | |
| 22328516 | |
| 22362758 | |
| 22407444 | |
| 22422622 | |
| 22448399 | |
| 22452684 | |
| 22456341 | |
| 22457811 | |
| 22461623 | |
| 22466811 | |
| 22484027 | |
| 22528484 | |
| 22531012 | |
| 22581054 | |
| 22613710 | |
| 22641344 | |
| 22669259 | |
| 22698642 | |
| 22730538 | |
| 22879933 | |
| 22948415 | |
| 23022044 | |
| 23022222 | |
| 23119061 | |
| 23125415 | |
| 23150579 | |
| 23161541 | |
| 23204516 | |
| 23234019 | |
| 23243278 | |
| 23243309 | |
| 23289212 | |
| 2341395 | |
| 2345548 | |
| 2392682 | |
| 2452834 | |
| 2454952 | |
| 2478219 | |
| 2565345 | |
| 2787511 | |
| 3165296 | |
| 3494014 | |
| 3607284 | |
| 3801670 | |
| 3828395 | |
| 7505120 | |
| 7532190 | |
| 7539135 | |
| 7592818 | |
| 7593198 | |
| 7682219 | |
| 7690138 | |
| 7694683 | |
| 7878622 | |
| 8093349 | |
| 8132570 | |
| 8132607 | |
| 8198553 | |
| 8244378 | |
| 8298129 | |
| 8387021 | |
| 8400294 | |
| 8467233 | |
| 8631894 | |
| 8649427 | |
| 8663236 | |
| 8757599 | |
| 8781422 | |
| 8798654 | |
| 8831898 | |
| 8837777 | |
| 9030514 | |
| 9169439 | |
| 9195946 | |
| 9215749 | |
| 9256940 | |
| 9376589 | |
| 9517988 | |
| 9684783 | |
| 9686320 | |
| 9790984 | |
| 9916748 |
RGD Disease Portals| ITGB3 has been annotated in the following RGD Disease Portals. |
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 |
| ||||||
 |
| ||||||
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| ||||||
 |
| ||||||
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| ||||||
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| ||||||
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Candidate Gene StatusComparative Map Data| ITGB3 (Homo sapiens) |
|
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| Itgb3 (Mus musculus) |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Itgb3 (Rattus norvegicus) |
|
Position Markers| STS-M35999 |
|
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| D17S1991 |
|
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| GDB:187323 |
|
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| SHGC-144857 |
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| STS-S70348 |
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| STS-R30939 |
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| STS-AA037229 |
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| RH47114 |
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| G10641 |
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| SHGC-35279 |
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| D16S325 |
|
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| D17S660 |
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| Itgb3 |
|
QTLs in Region (Human Genome Assembly GRCh37)| The following QTLs overlap with this region. |  | Full Report | | CSV | | TAB | | Printer | | Gviewer |
Nucleotide Sequences| Nucleotide RefSeqs | NG_008332 | (Get FASTA) | Search GEO for Microarray Profiles |
| NM_000212 | (Get FASTA) | Search GEO for Microarray Profiles | |
| GenBank Nucleotide | ABBA01041118 | (Get FASTA) | Search GEO for Microarray Profiles |
| AC068234 | (Get FASTA) | Search GEO for Microarray Profiles | |
| AMYH01008446 | (Get FASTA) | Search GEO for Microarray Profiles | |
| AY826979 | (Get FASTA) | Search GEO for Microarray Profiles | |
| BC127666 | (Get FASTA) | Search GEO for Microarray Profiles | |
| BC127667 | (Get FASTA) | Search GEO for Microarray Profiles | |
| BE389074 | (Get FASTA) | Search GEO for Microarray Profiles | |
| BE893993 | (Get FASTA) | Search GEO for Microarray Profiles | |
| BG170864 | (Get FASTA) | Search GEO for Microarray Profiles | |
| BQ437000 | (Get FASTA) | Search GEO for Microarray Profiles | |
| CH471231 | (Get FASTA) | Search GEO for Microarray Profiles | |
| DQ454156 | (Get FASTA) | Search GEO for Microarray Profiles | |
| J02703 | (Get FASTA) | Search GEO for Microarray Profiles | |
| L28832 | (Get FASTA) | Search GEO for Microarray Profiles | |
| M20311 | (Get FASTA) | Search GEO for Microarray Profiles | |
| M25108 | (Get FASTA) | Search GEO for Microarray Profiles | |
| M32686 | (Get FASTA) | Search GEO for Microarray Profiles | |
| M35999 | (Get FASTA) | Search GEO for Microarray Profiles | |
| M57494 | (Get FASTA) | Search GEO for Microarray Profiles | |
| S49379 | (Get FASTA) | Search GEO for Microarray Profiles | |
| S70348 | (Get FASTA) | Search GEO for Microarray Profiles | |
| U03881 | (Get FASTA) | Search GEO for Microarray Profiles | |
| U95204 | (Get FASTA) | Search GEO for Microarray Profiles |
| RefSeq Acc Id: | NM_000212 | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq Status: | REVIEWED | |||||||||||||||||||||||||
| Type: | CODING | |||||||||||||||||||||||||
| Protein Acc Id: | NP_000203 | |||||||||||||||||||||||||
| Peptide Label: | precursor | |||||||||||||||||||||||||
| Position: |
|
Protein Sequences| Protein RefSeqs | NP_000203 | (Get FASTA) |
| GenBank Protein | AAA16076 | (Get FASTA) |
| AAA20880 | (Get FASTA) | |
| AAA35927 | (Get FASTA) | |
| AAA36121 | (Get FASTA) | |
| AAA52589 | (Get FASTA) | |
| AAA52600 | (Get FASTA) | |
| AAA60122 | (Get FASTA) | |
| AAA67537 | (Get FASTA) | |
| AAB23689 | (Get FASTA) | |
| AAB30847 | (Get FASTA) | |
| AAB71380 | (Get FASTA) | |
| AAI27667 | (Get FASTA) | |
| AAI27668 | (Get FASTA) | |
| AAX33645 | (Get FASTA) | |
| ABE67092 | (Get FASTA) | |
| EAW57679 | (Get FASTA) | |
| EAW57680 | (Get FASTA) | |
| EAW57681 | (Get FASTA) | |
| EAW57682 | (Get FASTA) | |
| P05106 | (Get FASTA) |
Promoters| RGD ID: | 6794229 | ||||||||||
| Promoter ID: | HG_KWN:26444 | ||||||||||
| Type: | CpG-Island | ||||||||||
| SO ACC ID: | SO:0000170 | ||||||||||
| Source: | MPROMDB | ||||||||||
| Tissues & Cell Lines: | K562, Lymphoblastoid | ||||||||||
| Transcripts: | NM_000212, UC002ILI.1 | ||||||||||
| Position: |
|
External Database Links| Database | Acc Id | Source(s) |
| COSMIC | ITGB3 | COSMIC |
| Ensembl Genes | ENSG00000259207 | ENTREZGENE |
| Ensembl Protein | ENSP00000452786 | ENTREZGENE |
| Ensembl Transcript | ENST00000559488 | ENTREZGENE |
| Entrez Gene | 3690 | ENTREZGENE |
| Gene3D-CATH | Integrin_bsu_cyt | UniProtKB/Swiss-Prot |
| Germonline | ENSG00000056345 | |
| HGNC ID | 6156 | ENTREZGENE |
| HomoloGene Group ID | 55444 | ENTREZGENE |
| HPRD ID | 01428 | ENTREZGENE |
| InterPro | Integrin_beta-3 | UniProtKB/Swiss-Prot |
| Integrin_bsu | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| Integrin_bsu_cyt | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| Integrin_bsu_N | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| Integrin_bsu_tail | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| Plexin-like | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| Plexin-like_fold | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| VWF_A | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| IPI | IPI00220350 | UniProtKB/Swiss-Prot |
| IPI00220351 | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| IPI00303283 | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| IPI00786871 | UniProtKB/TrEMBL | |
| IPI01015923 | UniProtKB/TrEMBL | |
| KEGG Report | hsa:3690 | ENTREZGENE, UniProtKB/Swiss-Prot |
| OMIM | 173470 | OMIM |
| 187800 | OMIM | |
| 273800 | OMIM | |
| 608446 | OMIM | |
| PANTHER | Integrin_beta_C | UniProtKB/Swiss-Prot |
| PTHR10082:SF25 | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| Pfam | Integrin_b_cyt | UniProtKB/Swiss-Prot |
| Integrin_B_tail | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| Integrin_beta | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| PharmGKB | ITGB3 | RGD, PharmGKB |
| PIRSF | Integrin_B | UniProtKB/Swiss-Prot |
| PRINTS | INTEGRINB | UniProtKB/Swiss-Prot |
| PROSITE | EGF_1; UNKNOWN_2 | UniProtKB/Swiss-Prot |
| EGF_2; UNKNOWN_1 | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| INTEGRIN_BETA | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| VWFA; FALSE_NEG | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| SMART | INB | UniProtKB/Swiss-Prot |
| PSI | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| VWA | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| Superfamily-SCOP | Integrin_bsu_tail | UniProtKB/Swiss-Prot |
| Plexin-like_fold | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| UniGene | Hs.218040 | ENTREZGENE |
| UniProt | B4DTY9_HUMAN | UniProtKB/TrEMBL |
| I3L4X8_HUMAN | UniProtKB/TrEMBL | |
| ITB3_HUMAN | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| Q16157_HUMAN | UniProtKB/TrEMBL |
Nomenclature History| Date | Current Symbol | Current Name | Previous Symbol | Previous Name | Description | Reference | Status |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2011-08-16 | ITGB3 | integrin, beta 3 (platelet glycoprotein IIIa, antigen CD61) | ITGB3 | integrin, beta 3 (platelet glycoprotein IIIa, antigen CD61) | Symbol and/or name change | 39860 | APPROVED |
| More on ITGB3 | |||
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Entrez Gene | ||
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Ensembl Gene | ||
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HGNC Report | ||
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NCBI Map Viewer | ||
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Vista | ||
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Vista + UCSC | ||
| RGD Object Information | |
| RGD ID: | 1345363 |
| Created: | 2005-03-08 |
| Species: | Homo sapiens |
| Last Modified: | 2013-05-14 |
| Status: | ACTIVE |
© Bioinformatics Program, HMGC at the Medical College of Wisconsin
RGD is funded by grant HL64541 from the National Heart, Lung, and Blood Institute on behalf of the NIH.