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Gene Ontology Annotations
Gene Ontology AnnotationsBiological Process Term | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | cell cycle | | IEA | UniProtKB-KW:KW-0131 | 2290271 | GO_REF:0000037 | UniProtKB | GO_REF:0000037 | embryo development | | NAS | | 2290271 | PMID:16378762 | UniProtKB | PMID:16378762 | histone deubiquitination | | IDA | | 2290271 | PMID:18206972 | UniProtKB | PMID:18206972 | histone deubiquitination | | IDA | | 2290271 | PMID:18206973 | UniProtKB | PMID:18206973 | histone H4 acetylation | | IDA | | 2290271 | PMID:18206973 | GOC | PMID:18206973 | histone ubiquitination | | IDA | | 2290271 | PMID:18469533 | UniProtKB | PMID:18469533 | positive regulation of mitotic cell cycle | | IMP | | 2290271 | PMID:18206973 | UniProtKB | PMID:18206973 | positive regulation of transcription, DNA-dependent | | IMP | | 2290271 | PMID:18206973 | UniProtKB | PMID:18206973 | protein deubiquitination | | IEA | Ensembl:ENSMUSP00000041263 | 2290271 | GO_REF:0000019 | ENSEMBL | GO_REF:0000019 | protein deubiquitination | | IDA | | 2290271 | PMID:16378762 | UniProtKB | PMID:16378762 | transcription, DNA-dependent | | IEA | UniProtKB-KW:KW-0804 | 2290271 | GO_REF:0000037 | UniProtKB | GO_REF:0000037 | ubiquitin-dependent protein catabolic process | | IEA | InterPro:IPR001394|InterPro:IPR018200 | 2290271 | GO_REF:0000002 | InterPro | GO_REF:0000002 | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene-Chemical Interaction Annotations
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Gene Ontology Annotations
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References - curated| 1. |
GOA_HUMAN data from the GO Consortium |
| 2. |
RGD automated import pipeline for gene-chemical interactions |
References - uncurated| PubMed | 10470851 |
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| 23382074 |
RGD Disease Portals
Comparative Map Data| USP22 (Homo sapiens) |
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| Usp22 (Mus musculus) |
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| Usp22 (Rattus norvegicus) |
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Position Markers| D17S689 |
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| G43517 |
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| G59516 |
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| SHGC-133091 |
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| SHGC-64270 |
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| D8S2279 |
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QTLs in Region (Human Genome Assembly GRCh37)| The following QTLs overlap with this region. | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer | ![]() | Gviewer |
Nucleotide Sequences| Nucleotide RefSeqs | NM_015276 | (Get FASTA) | Search GEO for Microarray Profiles |
| GenBank Nucleotide | AB028986 | (Get FASTA) | Search GEO for Microarray Profiles |
| ABBA01050453 | (Get FASTA) | Search GEO for Microarray Profiles | |
| AC087393 | (Get FASTA) | Search GEO for Microarray Profiles | |
| AK025331 | (Get FASTA) | Search GEO for Microarray Profiles | |
| AK130677 | (Get FASTA) | Search GEO for Microarray Profiles | |
| AL049258 | (Get FASTA) | Search GEO for Microarray Profiles | |
| AL110213 | (Get FASTA) | Search GEO for Microarray Profiles | |
| AMYH01008267 | (Get FASTA) | Search GEO for Microarray Profiles | |
| BC007196 | (Get FASTA) | Search GEO for Microarray Profiles | |
| BC013364 | (Get FASTA) | Search GEO for Microarray Profiles | |
| BC025317 | (Get FASTA) | Search GEO for Microarray Profiles | |
| BC050994 | (Get FASTA) | Search GEO for Microarray Profiles | |
| BC084550 | (Get FASTA) | Search GEO for Microarray Profiles | |
| BC110499 | (Get FASTA) | Search GEO for Microarray Profiles | |
| BC126898 | (Get FASTA) | Search GEO for Microarray Profiles | |
| BX640815 | (Get FASTA) | Search GEO for Microarray Profiles |
| RefSeq Acc Id: | NM_015276 | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq Status: | VALIDATED | |||||||||||||||||||||||||
| Type: | CODING | |||||||||||||||||||||||||
| Protein Acc Id: | NP_056091 | |||||||||||||||||||||||||
| Position: |
|
Protein Sequences| Protein RefSeqs | NP_056091 | (Get FASTA) |
| GenBank Protein | AAH07196 | (Get FASTA) |
| AAH25317 | (Get FASTA) | |
| AAI10500 | (Get FASTA) | |
| AAI26899 | (Get FASTA) | |
| BAA83015 | (Get FASTA) | |
| CAE45893 | (Get FASTA) | |
| Q9UPT9 | (Get FASTA) |
Promoters| RGD ID: | 6794720 | ||||||||||
| Promoter ID: | HG_KWN:25450 | ||||||||||
| Type: | Non-CpG | ||||||||||
| SO ACC ID: | SO:0000170 | ||||||||||
| Source: | MPROMDB | ||||||||||
| Tissues & Cell Lines: | HeLa_S3, Lymphoblastoid | ||||||||||
| Transcripts: | OTTHUMT00000257759 | ||||||||||
| Position: |
|
| RGD ID: | 6794718 | ||||||||||
| Promoter ID: | HG_KWN:25451 | ||||||||||
| Type: | CpG-Island | ||||||||||
| SO ACC ID: | SO:0000170 | ||||||||||
| Source: | MPROMDB | ||||||||||
| Tissues & Cell Lines: | Lymphoblastoid | ||||||||||
| Transcripts: | OTTHUMT00000257757 | ||||||||||
| Position: |
|
| RGD ID: | 6794719 | ||||||||||
| Promoter ID: | HG_KWN:25452 | ||||||||||
| Type: | CpG-Island | ||||||||||
| SO ACC ID: | SO:0000170 | ||||||||||
| Source: | MPROMDB | ||||||||||
| Tissues & Cell Lines: | CD4+TCell, CD4+TCell_12Hour, HeLa_S3, Jurkat, K562, Lymphoblastoid, NB4 | ||||||||||
| Transcripts: | OTTHUMT00000257756, OTTHUMT00000257758, UC002GYL.2, UC002GYN.2 | ||||||||||
| Position: |
|
External Database Links| Database | Acc Id | Source(s) |
| COSMIC | USP22 | COSMIC |
| Ensembl Genes | ENSG00000124422 | ENTREZGENE |
| Ensembl Protein | ENSP00000261497 | ENTREZGENE |
| Ensembl Transcript | ENST00000261497 | ENTREZGENE |
| Entrez Gene | 23326 | ENTREZGENE |
| Gene3D-CATH | Znf_RING/FYVE/PHD | UniProtKB/Swiss-Prot |
| Germonline | ENSG00000124422 | |
| HGNC ID | 12621 | ENTREZGENE |
| HomoloGene Group ID | 52664 | ENTREZGENE |
| InterPro | Pept_C19ubi-hydrolase_C_CS | UniProtKB/Swiss-Prot |
| Peptidase_C19 | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| Znf_RING/FYVE/PHD | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| Znf_UBP | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| IPI | IPI00852960 | UniProtKB/Swiss-Prot |
| IPI00923593 | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| KEGG Report | hsa:23326 | ENTREZGENE, UniProtKB/Swiss-Prot |
| OMIM | 612116 | OMIM |
| Pfam | UCH | UniProtKB/Swiss-Prot |
| zf-UBP | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| PharmGKB | PA37247 | PharmGKB |
| PROSITE | UCH_2_1 | UniProtKB/Swiss-Prot |
| UCH_2_2 | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| UCH_2_3 | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| ZF_UBP | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| UniGene | Hs.462492 | ENTREZGENE |
| UniProt | J3QRV6_HUMAN | UniProtKB/TrEMBL |
| J3QS30_HUMAN | UniProtKB/TrEMBL | |
| K7ERX6_HUMAN | UniProtKB/TrEMBL | |
| K7ESK0_HUMAN | UniProtKB/TrEMBL | |
| UBP22_HUMAN | UniProtKB/Swiss-Prot |
| More on USP22 | |||
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| RGD Object Information | |
| RGD ID: | 1321210 |
| Created: | 2005-01-12 |
| Species: | Homo sapiens |
| Last Modified: | 2013-03-06 |
| Status: | ACTIVE |
© Bioinformatics Program, HMGC at the Medical College of Wisconsin
RGD is funded by grant HL64541 from the National Heart, Lung, and Blood Institute on behalf of the NIH.




