Annotation (Toggle Detail/Summary View) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene-Chemical Interaction Annotations
Gene-Chemical Interaction AnnotationsTerm | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | (S)-nicotine | multiple interactions | ISO | RGD:1314934 | 6480464 | Mecamylamine inhibits the reaction [Nicotine results in decreased expression of UBE3A mRNA]; more ... | CTD | PMID:12588870 | (S)-nicotine | decreases expression | ISO | RGD:1314934 | 6480464 | Nicotine results in decreased expression of UBE3A mRNA | CTD | PMID:12588870 | 2,3,7,8-tetrachlorodibenzodioxine | decreases expression | EXP | | 6480464 | Tetrachlorodibenzodioxin results in decreased expression of UBE3A mRNA | CTD | PMID:19770486 | 2,3,7,8-tetrachlorodibenzodioxine | affects expression | EXP | | 6480464 | Tetrachlorodibenzodioxin affects the expression of UBE3A mRNA | CTD | PMID:21570461 | 4-hydroxyphenyl retinamide | increases expression | ISO | RGD:1314934 | 6480464 | Fenretinide results in increased expression of UBE3A mRNA | CTD | PMID:16570282 | all-trans-retinoic acid | decreases expression | ISO | RGD:1314934 | 6480464 | Tretinoin results in decreased expression of UBE3A mRNA | CTD | PMID:16140955 | benzo[a]pyrene | multiple interactions | EXP | | 6480464 | [Benzo(a)pyrene co-treated with XPA gene mutant form co-treated with TRP53 gene mutant form] results in decreased expression of UBE3A mRNA | CTD | PMID:21715664 | benzo[a]pyrene | decreases expression | EXP | | 6480464 | Benzo(a)pyrene results in decreased expression of UBE3A mRNA | CTD | PMID:22228805 | benzo[a]pyrene | increases expression | EXP | | 6480464 | Benzo(a)pyrene results in increased expression of UBE3A mRNA | CTD | PMID:22228805 | bis(2-chloroethyl) sulfide | increases expression | EXP | | 6480464 | Mustard Gas results in increased expression of UBE3A mRNA | CTD | PMID:15674844 | cadmium sulfate | multiple interactions | EXP | | 6480464 | cadmium sulfate affects the reaction [MTF1 affects the expression of UBE3A mRNA] | CTD | PMID:16221973 | chloroprene | increases expression | ISO | RGD:1306361 | 6480464 | Chloroprene results in increased expression of UBE3A mRNA | CTD | PMID:23125180 | cisplatin | increases phosphorylation | EXP | | 6480464 | Cisplatin results in increased phosphorylation of UBE3A protein | CTD | PMID:22006019 | cobalt dichloride | increases expression | EXP | | 6480464 | cobaltous chloride results in increased expression of UBE3A mRNA | CTD | PMID:21139344 | cobalt dichloride | increases expression | ISO | RGD:1314934 | 6480464 | cobaltous chloride results in increased expression of UBE3A mRNA | CTD | PMID:19376846 | diarsenic trioxide | increases expression | ISO | RGD:1314934 | 6480464 | arsenic trioxide results in increased expression of UBE3A mRNA | CTD | PMID:20458559 | fenofibrate | increases expression | EXP | | 6480464 | Fenofibrate results in increased expression of UBE3A mRNA | CTD | PMID:21318169 | fenofibrate | multiple interactions | EXP | | 6480464 | PPARA protein affects the reaction [Fenofibrate results in increased expression of UBE3A mRNA] | CTD | PMID:21318169 | paracetamol | affects expression | EXP | | 6480464 | Acetaminophen affects the expression of UBE3A mRNA | CTD | PMID:17562736 | phenobarbital | decreases expression | EXP | | 6480464 | Phenobarbital results in decreased expression of UBE3A mRNA | CTD | PMID:23091169 | pirinixic acid | decreases expression | EXP | | 6480464 | pirinixic acid results in decreased expression of UBE3A mRNA | CTD | PMID:18445702 | trichloroethene | increases expression | EXP | | 6480464 | Trichloroethylene results in increased expression of UBE3A mRNA | CTD | PMID:19448997 | tubocurarine | increases expression | ISO | RGD:1314934 | 6480464 | Tubocurarine results in increased expression of UBE3A mRNA | CTD | PMID:12588870 | tubocurarine | multiple interactions | ISO | RGD:1314934 | 6480464 | Tubocurarine inhibits the reaction [Nicotine results in decreased expression of UBE3A mRNA] | CTD | PMID:12588870 | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology Annotations
Molecular Pathway Annotations| External Database Links | |
| KEGG Pathway | Ubiquitin mediated proteolysis |
| Viral carcinogenesis | |
| Pathway Interaction Database | Coregulation of Androgen receptor activity (PID:200049) |
| Regulation of Telomerase (PID:200086) | |
Phenotype Annotations
Disease Annotations
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Gene-Chemical Interaction Annotations
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Gene Ontology Annotations
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Molecular Pathway Annotations
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| External Database Links | |
| KEGG Pathway | Ubiquitin mediated proteolysis |
| Viral carcinogenesis | |
| Pathway Interaction Database | Coregulation of Androgen receptor activity (PID:200049) |
| Regulation of Telomerase (PID:200086) | |
Phenotype Annotations
|
|
|
References - curated| 1. |
Huang L, etal., Science 1999 Nov 12;286(5443):1321-6. |
| 2. |
Kawai J, etal., Nature 2001 Feb 8;409(6821):685-90. |
| 3. |
Kishino T, etal., Nat Genet 1997 Jan;15(1):70-3. |
| 4. |
MGD data from the GO Consortium |
| 5. |
Okazaki Y, etal., Nature 2002 Dec 5;420(6915):563-73. |
| 6. |
Pipeline to import KEGG annotations from KEGG into RGD Pathway Ontology |
| 7. |
RGD automated import pipeline |
| 8. |
RGD automated import pipeline for gene-chemical interactions |
| 9. |
RGD Automated Pipelines |
References - uncurated| PubMed | 10349636 |
| 10400982 | |
| 10624951 | |
| 10767319 | |
| 10922068 | |
| 11042159 | |
| 11074018 | |
| 11076861 | |
| 11350123 | |
| 11668390 | |
| 11707329 | |
| 11756548 | |
| 11895368 | |
| 12477932 | |
| 12520002 | |
| 12627233 | |
| 12668607 | |
| 12828934 | |
| 14610273 | |
| 15163367 | |
| 15226413 | |
| 15263005 | |
| 15590147 | |
| 15615769 | |
| 15620220 | |
| 15655249 | |
| 15782199 | |
| 15921919 | |
| 16027444 | |
| 16141072 | |
| 16141073 | |
| 16254014 | |
| 16602821 | |
| 16754645 | |
| 16905559 | |
| 17085449 | |
| 17130828 | |
| 17259980 | |
| 17901046 | |
| 17936729 | |
| 17940072 | |
| 18166085 | |
| 18201976 | |
| 18329113 | |
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| 18799693 | |
| 19325566 | |
| 19430469 | |
| 19563863 | |
| 19591933 | |
| 19782683 | |
| 20211139 | |
| 20212164 | |
| 20351251 | |
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| 20571502 | |
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| 20826237 | |
| 21029865 | |
| 21233130 | |
| 21493713 | |
| 21677750 | |
| 21927031 | |
| 21974935 | |
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| 22190039 | |
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| 22493002 | |
| 22560727 | |
| 22681684 | |
| 22689861 | |
| 22778257 | |
| 22787151 | |
| 22916201 | |
| 23143301 | |
| 23283345 | |
| 23424281 | |
| 23447592 | |
| 7708685 | |
| 8601494 | |
| 8889548 | |
| 9060416 | |
| 9110176 | |
| 9182527 | |
| 9195990 | |
| 9288101 | |
| 9613204 | |
| 9808466 |
RGD Disease Portals| Ube3a has been annotated in the following RGD Disease Portals. |
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Comparative Map Data| Ube3a (Mus musculus) |
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| UBE3A (Homo sapiens) |
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| Ube3a (Rattus norvegicus) |
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Position Markers| AU017677 |
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| D10Mit157.2 |
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| G67875 |
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| Ube3a |
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| Ube3a |
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| Ube3a |
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| Ube3a |
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QTLs in Region (Mouse Genome Assembly Build 37)| The following QTLs overlap with this region. | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer | ![]() | Gviewer |
Nucleotide Sequences| Nucleotide RefSeqs | NM_001033962 | (Get FASTA) | Search GEO for Microarray Profiles |
| NM_011668 | (Get FASTA) | Search GEO for Microarray Profiles | |
| NM_173010 | (Get FASTA) | Search GEO for Microarray Profiles | |
| GenBank Nucleotide | AC167971 | (Get FASTA) | Search GEO for Microarray Profiles |
| AK006957 | (Get FASTA) | Search GEO for Microarray Profiles | |
| AK018028 | (Get FASTA) | Search GEO for Microarray Profiles | |
| AK018443 | (Get FASTA) | Search GEO for Microarray Profiles | |
| AK029133 | (Get FASTA) | Search GEO for Microarray Profiles | |
| AK038208 | (Get FASTA) | Search GEO for Microarray Profiles | |
| AK080807 | (Get FASTA) | Search GEO for Microarray Profiles | |
| AK083795 | (Get FASTA) | Search GEO for Microarray Profiles | |
| AK192185 | (Get FASTA) | Search GEO for Microarray Profiles | |
| AK206004 | (Get FASTA) | Search GEO for Microarray Profiles | |
| AK209440 | (Get FASTA) | Search GEO for Microarray Profiles | |
| AK209747 | (Get FASTA) | Search GEO for Microarray Profiles | |
| AK210579 | (Get FASTA) | Search GEO for Microarray Profiles | |
| AK213506 | (Get FASTA) | Search GEO for Microarray Profiles | |
| AK219059 | (Get FASTA) | Search GEO for Microarray Profiles | |
| AK220549 | (Get FASTA) | Search GEO for Microarray Profiles | |
| BC131658 | (Get FASTA) | Search GEO for Microarray Profiles | |
| BC131659 | (Get FASTA) | Search GEO for Microarray Profiles | |
| BY301312 | (Get FASTA) | Search GEO for Microarray Profiles | |
| CD352481 | (Get FASTA) | Search GEO for Microarray Profiles | |
| U82122 | (Get FASTA) | Search GEO for Microarray Profiles | |
| U96636 | (Get FASTA) | Search GEO for Microarray Profiles |
| RefSeq Acc Id: | NM_173010 | ||||||||||||||||||||
| RefSeq Status: | PROVISIONAL | ||||||||||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||||||||||
| Protein Acc Id: | NP_766598 | ||||||||||||||||||||
| Peptide Label: | isoform 1 | ||||||||||||||||||||
| Position: |
|
| RefSeq Acc Id: | NM_011668 | ||||||||||||||||||||
| RefSeq Status: | VALIDATED | ||||||||||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||||||||||
| Protein Acc Id: | NP_035798 | ||||||||||||||||||||
| Peptide Label: | isoform 2 | ||||||||||||||||||||
| Position: |
|
| RefSeq Acc Id: | NM_001033962 | ||||||||||||||||||||
| RefSeq Status: | VALIDATED | ||||||||||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||||||||||
| Protein Acc Id: | NP_001029134 | ||||||||||||||||||||
| Peptide Label: | isoform 3 | ||||||||||||||||||||
| Position: |
|
Protein Sequences| Protein RefSeqs | NP_001029134 | (Get FASTA) |
| NP_035798 | (Get FASTA) | |
| NP_766598 | (Get FASTA) | |
| GenBank Protein | AAB47756 | (Get FASTA) |
| AAB63361 | (Get FASTA) | |
| AAI31659 | (Get FASTA) | |
| AAI31660 | (Get FASTA) | |
| BAC26314 | (Get FASTA) | |
| BAC38028 | (Get FASTA) | |
| BAD90321 | (Get FASTA) | |
| O08759 | (Get FASTA) |
Promoters| RGD ID: | 6841565 | ||||||||||
| Promoter ID: | MM_KWN:50678 | ||||||||||
| Type: | CpG-Island | ||||||||||
| SO ACC ID: | SO:0000170 | ||||||||||
| Source: | MPROMDB | ||||||||||
| Tissues & Cell Lines: | 3T3L1_Day0, 3T3L1_Day1, 3T3L1_Day2, 3T3L1_Day3, 3T3L1_Day4, 3T3L1_Day6, BoneMarrow_0Hour, BoneMarrow_2Hour, BoneMarrow_4Hour, Brain, ES_Cell, Kidney, Liver, Lung, MEF_B4, MEF_B6, Spleen | ||||||||||
| Transcripts: | NM_173010, UC009HEG.1, UC009HEI.1, UC009HEJ.1 | ||||||||||
| Position: |
|
| RGD ID: | 6881126 | ||||||||||
| Promoter ID: | EPDNEW_M4014 | ||||||||||
| Type: | preliminary | ||||||||||
| Name: | Ube3a_1 | ||||||||||
| Description: | ubiquitin protein ligase E3A | ||||||||||
| SO ACC ID: | SO:0000170 | ||||||||||
| Source: | EPDNEW (Eukaryotic Promoter Database, http://epd.vital-it.ch/) | ||||||||||
| Position: |
|
External Database Links| Database | Acc Id | Source(s) |
| Ensembl Genes | ENSMUSG00000025326 | ENTREZGENE |
| Ensembl Protein | ENSMUSP00000103161 | ENTREZGENE |
| Ensembl Transcript | ENSMUST00000107537 | ENTREZGENE |
| Entrez Gene | 22215 | ENTREZGENE |
| HomoloGene Group ID | 7988 | ENTREZGENE |
| InterPro | HECT | UniProtKB/Swiss-Prot |
| Ubiquitin-protein_ligase_E6-AP | UniProtKB/Swiss-Prot | |
| KEGG Report | mmu:22215 | ENTREZGENE, UniProtKB/TrEMBL |
| MGD | MGI:105098 | ENTREZGENE |
| Pfam | HECT | UniProtKB/Swiss-Prot |
| PIRSF | Ubiquitin-protein_ligase_E6-AP | UniProtKB/Swiss-Prot |
| PROSITE | HECT | UniProtKB/Swiss-Prot |
| SMART | HECTc | UniProtKB/Swiss-Prot |
| Superfamily-SCOP | HECT | UniProtKB/Swiss-Prot |
| UniGene | Mm.9002 | ENTREZGENE |
| UniProt | E9QKT1_MOUSE | UniProtKB/TrEMBL |
| Q3TPQ9_MOUSE | UniProtKB/TrEMBL | |
| Q5DTH1_MOUSE | UniProtKB/TrEMBL | |
| Q8BNS1_MOUSE | UniProtKB/TrEMBL | |
| Q8CE29_MOUSE | UniProtKB/TrEMBL | |
| UBE3A_MOUSE | UniProtKB/Swiss-Prot |
| More on Ube3a | |
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Vista + UCSC |
| RGD Object Information | |
| RGD ID: | 1314935 |
| Created: | 2005-01-12 |
| Species: | Mus musculus |
| Last Modified: | 2013-06-04 |
| Status: | ACTIVE |
© Bioinformatics Program, HMGC at the Medical College of Wisconsin
RGD is funded by grant HL64541 from the National Heart, Lung, and Blood Institute on behalf of the NIH.




