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Gene Ontology AnnotationsGene Ontology Annotations
Gene Ontology AnnotationsBiological Process Term | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | carbohydrate metabolic process | | IEA | InterPro:IPR013781 | 1600115 | GO_REF:0000002 | InterPro | GO_REF:0000002 | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Pathway Annotations| External Database Links | |
| KEGG Pathway | Glycosaminoglycan degradation |
| Metabolic pathways | |
Disease Annotations
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Gene Ontology Annotations
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Molecular Pathway Annotations
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| External Database Links | |
| KEGG Pathway | Glycosaminoglycan degradation |
| Metabolic pathways | |
References - curated| 1. |
Pipeline to import KEGG annotations from KEGG into RGD Pathway Ontology |
| 2. |
RGD Automated Pipelines |
RGD Disease Portals| Hpse2 has been annotated in the following RGD Disease Portals. |
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Comparative Map Data| Hpse2 (Rattus norvegicus) |
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| HPSE2 (Homo sapiens) |
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| Hpse2 (Mus musculus) |
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Position Markers| D1Mgh32 |
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| D1Rat145 |
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| BE116307 |
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QTLs in Region (RGSC Genome Assembly v3.4)| The following QTLs overlap with this region. |  | Full Report | | CSV | | TAB | | Printer | | Gviewer |
Nucleotide Sequences| RefSeq Acc Id: | NM_001135762 | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq Status: | PROVISIONAL | |||||||||||||||||||||||||
| Type: | CODING | |||||||||||||||||||||||||
| Protein Acc Id: | NP_001129234 | |||||||||||||||||||||||||
| Peptide Label: | precursor | |||||||||||||||||||||||||
| Position: |
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Protein Sequences| Protein RefSeqs | NP_001129234 | (Get FASTA) |
| GenBank Protein | EDL94247 | (Get FASTA) |
Strain Sequence Variants
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External Database Links| Database | Acc Id | Source(s) |
| Ensembl Genes | ENSRNOG00000043120 | UniProtKB/TrEMBL |
| Ensembl Protein | ENSRNOP00000059796 | UniProtKB/TrEMBL |
| Ensembl Transcript | ENSRNOT00000067274 | UniProtKB/TrEMBL |
| Entrez Gene | 368128 | ENTREZGENE |
| Gene3D-CATH | Glyco_hydro_cat | UniProtKB/TrEMBL |
| HomoloGene Group ID | 19680 | ENTREZGENE |
| InterPro | Glyco_hydro_79 | UniProtKB/TrEMBL |
| Glyco_hydro_subgr_catalytic | UniProtKB/TrEMBL | |
| Glycoside_hydrolase_SF | UniProtKB/TrEMBL | |
| IPI | IPI00370762 | UniProtKB/TrEMBL |
| KEGG Report | rno:368128 | ENTREZGENE |
| PANTHER | Glyco_hydro_79_N | UniProtKB/TrEMBL |
| Pfam | Glyco_hydro_79n | UniProtKB/TrEMBL |
| Superfamily-SCOP | Glyco_hydro_cat | UniProtKB/TrEMBL |
| UniGene | Rn.221883 | ENTREZGENE |
| UniProt | F1M0J5_RAT | UniProtKB/TrEMBL |
Nomenclature History| Date | Current Symbol | Current Name | Previous Symbol | Previous Name | Description | Reference | Status |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2009-01-20 | Hpse2 | heparanase 2 | LOC368128 | similar to Heparanase-2 (Hpa2) | Data Merged | 9333 | APPROVED |
| 2008-04-30 | Hpse2 | heparanase 2 | Hpse2_predicted | heparanase 2 (predicted) | 'predicted' is removed | 24709 | APPROVED |
| 2006-11-20 | LOC368128 | similar to Heparanase-2 (Hpa2) | Symbol and Name status set to provisional | 1724 | PROVISIONAL | ||
| 2005-01-12 | Hpse2_predicted | heparanase 2 (predicted) | Symbol and Name status set to approved | 1724 | APPROVED |
| More on Hpse2 | |
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Entrez Gene |
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Ensembl Gene |
| Genome Browser |
|
NCBI Map Viewer |
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Vista |
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Vista + UCSC |
| RGD Object Information | |
| RGD ID: | 1307959 |
| Created: | 2005-01-12 |
| Species: | Rattus norvegicus |
| Last Modified: | 2013-04-16 |
| Status: | ACTIVE |
© Bioinformatics Program, HMGC at the Medical College of Wisconsin
RGD is funded by grant HL64541 from the National Heart, Lung, and Blood Institute on behalf of the NIH.