Annotation (Toggle Detail/Summary View) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology Annotations
Gene Ontology AnnotationsBiological Process Term | Qualifier | Evidence | With | Reference | Notes | Source | Original Reference(s) | cellular iron ion homeostasis | | ISO | RGD:1315212 | 1624291 | MGI:MGI:3833042|PMID:19154717 | RGD | MGI:MGI:3833042 PMID:19154717 | cellular response to heat | | ISO | RGD:1315212 | 1624291 | MGI:MGI:3821682|PMID:18755693 | RGD | MGI:MGI:3821682 PMID:18755693 | endocytosis | | ISO | RGD:1315212 | 1624291 | MGI:MGI:3833042|PMID:19154717 | RGD | MGI:MGI:3833042 PMID:19154717 | iron ion transmembrane transport | | ISO | RGD:1315212 | 1624291 | MGI:MGI:3833042|PMID:19154717 | RGD | MGI:MGI:3833042 PMID:19154717 | protein homotrimerization | | ISO | RGD:1315212 | 1624291 | UniProtKB:Q8K299 | RGD | MGI:MGI:3663190 PMID:16407294 | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene-Chemical Interaction Annotations
|
|
|
Gene Ontology Annotations
|
|
|
|
|
|
References - curated
Comparative Map Data| Scara5 (Rattus norvegicus) |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
| SCARA5 (Homo sapiens) |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Scara5 (Mus musculus) |
|
Position Markers| D15Rat120 |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| D15Rat143 |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| D15Got47 |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 30.MMHAP14FRB12.seq |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RH139634 |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| RH138852 |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| UniSTS:478958 |
|
QTLs in Region (RGSC Genome Assembly v3.4)| The following QTLs overlap with this region. | ![]() | Full Report | ![]() | CSV | ![]() | TAB | ![]() | Printer | ![]() | Gviewer |
Nucleotide Sequences| RefSeq Acc Id: | NM_001135855 | ||||||||||||||||||||
| RefSeq Status: | INFERRED | ||||||||||||||||||||
| Type: | CODING | ||||||||||||||||||||
| Protein Acc Id: | NP_001129327 | ||||||||||||||||||||
| Position: |
|
Protein Sequences| Protein RefSeqs | NP_001129327 | (Get FASTA) |
| GenBank Protein | EDL85362 | (Get FASTA) |
Strain Sequence Variants
|
||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||
External Database Links| Database | Acc Id | Source(s) |
| Ensembl Genes | ENSRNOG00000014398 | UniProtKB/TrEMBL |
| Ensembl Protein | ENSRNOP00000019487 | UniProtKB/TrEMBL |
| Ensembl Transcript | ENSRNOT00000019487 | UniProtKB/TrEMBL |
| Entrez Gene | 305974 | ENTREZGENE |
| HomoloGene Group ID | 12556 | ENTREZGENE |
| InterPro | Collagen | UniProtKB/TrEMBL |
| Srcr_rcpt | UniProtKB/TrEMBL | |
| Srcr_rcpt-rel | UniProtKB/TrEMBL | |
| KEGG Report | rno:305974 | ENTREZGENE |
| Pfam | Collagen | UniProtKB/TrEMBL |
| SRCR | UniProtKB/TrEMBL | |
| PRINTS | SPERACTRCPTR | UniProtKB/TrEMBL |
| PROSITE | SRCR_1 | UniProtKB/TrEMBL |
| SRCR_2 | UniProtKB/TrEMBL | |
| SMART | SM00202 | UniProtKB/TrEMBL |
| Superfamily-SCOP | Srcr_receptor | UniProtKB/TrEMBL |
| UniGene | Rn.163284 | ENTREZGENE |
| UniProt | D4A213_RAT | UniProtKB/TrEMBL |
Nomenclature History| Date | Current Symbol | Current Name | Previous Symbol | Previous Name | Description | Reference | Status |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2008-04-30 | Scara5 | scavenger receptor class A, member 5 (putative) | Scara5_predicted | scavenger receptor class A, member 5 (putative) (predicted) | 'predicted' is removed | 24709 | APPROVED |
| 2006-03-30 | Scara5_predicted | scavenger receptor class A, member 5 (putative) (predicted) | RGD1306539_predicted | similar to RIKEN cDNA 4933425F03 (predicted) | Symbol and Name updated | 10779 | APPROVED |
| 2005-01-20 | RGD1306539_predicted | similar to RIKEN cDNA 4933425F03 (predicted) | LOC305974_predicted | Symbol and Name status set to approved | 12407 | APPROVED | |
| 2005-01-12 | LOC305974_predicted | similar to RIKEN cDNA 4933425F03 (predicted) | Symbol and Name status set to provisional | 1724 | PROVISIONAL |
| More on Scara5 | |
![]() |
Entrez Gene |
![]() |
Ensembl Gene |
![]() | Genome Browser |
![]() |
NCBI Map Viewer |
![]() |
Vista |
![]() |
Vista + UCSC |
| RGD Object Information | |
| RGD ID: | 1306539 |
| Created: | 2005-01-12 |
| Species: | Rattus norvegicus |
| Last Modified: | 2013-05-28 |
| Status: | ACTIVE |
© Bioinformatics Program, HMGC at the Medical College of Wisconsin
RGD is funded by grant HL64541 from the National Heart, Lung, and Blood Institute on behalf of the NIH.




