Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 140,416 (bp)   Positions: 380
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.263
.021
.017
.054
.367
.018
--
--
--
--
.043
.043
--
.006
.434
--
.918
.097
.024
--
--
.256
.759
.689
.435
.002
.43
.539
.463
.592
.249
.887
.178
.531
.162
.431
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.141
--
.038
.003
.002
--
.025
--
--
--
--
--
--
--
.214
.182
.477
.011
--
.001
.01
.098
.003
.004
.001
.015
.009
.712
.236
.397
.082
.08
.011
.024
.191
.469
--
--
.0
.124
.004
.141
.011
.08
.005
.229
.452
.002
.154
.079
.059
.734
.053
.0
.003
.709
.034
--
--
--
.017
.015
.009
.0
.016
--
.002
.014
.356
.665
.324
.311
.135
.022
.072
--
.074
.414
.309
.209
.138
--
.678
.164
--
.064
.229
.159
.011
--
.007
.04
.809
.836
.823
.03
.021
.431
.145
.018
.014
.015
.0
.008
.012
.012
.879
.026
--
--
--
.242
.044
.047
.003
.043
.002
--
--
.125
.087
.117
.486
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.985
.084
.014
.003
.715
--
--
.007
.004
.107
.332
.073
.003
.062
.037
.029
.009
.276
.134
.023
.271
.039
.702
.011
--
--
--
.01
.014
.043
--
--
--
--
--
--
--
--
.007
.746
.196
.146
.126
.067
.96
.167
.029
.191
.052
.005
.152
.108
.0
.17
.006
.017
.001
.034
.696
.065
.514
.281
.589
.034
.679
--
.014
.095
.075
.404
.001
.0
.002
.009
.079
--
.048
.031
.016
.006
.146
.005
.048
.969
1.0
1.0
.001
.055
.028
.007
.007
.004
.747
.001
.022
.111
.026
.023
.005
.047
.001
.037
.325
.355
.005
.005
.004
.023
.01
.065
.042
.013
.004
.135
--
.247
.071
.55
.099
.324
.006
.007
.003
.038
.03
.019
.14
.062
--
--
.088
.0
.004
.809
.024
.276
.146
.991
.012
.0
.061
.01
.0
--
--
.064
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.119
.03
.372
.002
.042
.136
.271
.033
.102
.999
.784
.837
.0
.001
.0
.002
.001
.0
.001
.002
.001
.0
.0
.045
.0
.003
.986
Tfdp2
Tfdp2
Tfdp2
Tfdp2
Tfdp2
Tfdp2
Tfdp2
Tfdp2
Tfdp2
Tfdp2
Tfdp2
Tfdp2
Tfdp2
Tfdp2
Tfdp2
Tfdp2
Tfdp2
Tfdp2
Tfdp2
Tfdp2
Tfdp2
Tfdp2
Tfdp2
Tfdp2
Tfdp2
Tfdp2
Tfdp2
Tfdp2
Tfdp2
Tfdp2
Tfdp2
Tfdp2
Tfdp2
Tfdp2
Tfdp2
Tfdp2
Tfdp2
Tfdp2
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Atp5pb-ps1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
LOC102550734
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
C
T
A
C
T
A
C
T
2
T
T
A
T
G
C
G
C
C
T
C
T
T
G
2
8
A
C
A
C
A
G
G
C
T
T
C
A
2
T
G
G
C
2
A
G
A
C
2
T
C
A
C
T
T
T
A
A
A
C
C
4
C
C
T
C
C
7
C
C
7
14
G
6
T
T
T
A
G
A
T
G
A
C
G
C
T
T
A
4
A
C
A
A
T
C
T
T
C
14
C
G
C
C
C
8
T
C
G
T
4
A
G
A
G
A
T
A
C
C
C
18
34
G
A
C
C
A
4
C
C
C
A
A
C
T
T
6
9
T
T
C
T
T
G
G
G
A
7
A
A
G
G
3
T
T
T
8
6
T
G
G
T
A
G
12
T
C
G
G
5
2
A
C
T
A
C
C
A
A
T
G
T
4
C
C
2
C
3
T
C
G
G
T
G
C
G
C
G
G
G
G
G
T
T
C
A
A
T
A
A
C
T
A
G
C
T
C
A
C
12
G
A
C
C
T
C
C
G
2
C
A
G
G
T
T
G
A
C
A
G
T
C
T
C
C
3
A
C
C
A
G
C
C
A
A
T
A
A
C
G
A
A
A
C
G
T
T
T
T
G
C
A
15
2
A
C
G
T
2
4
C
G
A
6
9
G
G
G
A
C
G
G
A
A
G
T
C
A
C
G
G
G
A
A
C
A
G
C
T
7
T
T
T
C
C
C
28
G
T
G
T
G
T
A
C
T
7
T
A
T
C
A
G
A
A
G
T
A
G
15
T
93
G
C
C
G
T
20
T
T
18
C
C
C
G
C
12
C
A
C
A
G
G
A
C
T
G
C
A
G
A
G
G
C
C
T
G
G
G
4
  103,491,303
  103,491,766
  103,491,768
  103,492,246
  103,492,277
  103,492,519
  103,493,089
  103,493,102
  103,493,107
  103,493,113
  103,494,866
  103,495,215
  103,495,862
  103,496,227
  103,496,770
  103,497,000
  103,497,517
  103,497,688
  103,497,737
  103,499,405
  103,499,451
  103,500,225
  103,500,690
  103,500,701
  103,501,009
  103,501,148
  103,502,070
  103,502,125
  103,502,273
  103,502,287
  103,503,109
  103,503,912
  103,504,241
  103,505,352
  103,505,617
  103,506,178
  103,506,428
  103,506,496
  103,506,678
  103,507,268
  103,508,171
  103,509,657
  103,509,663
  103,509,681
  103,509,687
  103,509,688
  103,511,097
  103,511,331
  103,511,542
  103,511,683
  103,512,343
  103,512,783
  103,513,120
  103,513,310
  103,513,894
  103,514,184
  103,514,209
  103,514,242
  103,514,388
  103,514,918
  103,516,057
  103,516,159
  103,516,349
  103,517,303
  103,517,456
  103,517,632
  103,517,681
  103,518,689
  103,519,323
  103,519,341
  103,519,398
  103,519,399
  103,520,351
  103,520,359
  103,520,362
  103,520,654
  103,520,902
  103,521,251
  103,521,460
  103,521,470
  103,521,680
  103,522,024
  103,522,051
  103,522,149
  103,522,174
  103,522,748
  103,524,457
  103,524,500
  103,525,126
  103,525,366
  103,525,391
  103,525,506
  103,525,860
  103,526,248
  103,526,445
  103,526,483
  103,526,778
  103,526,848
  103,527,321
  103,527,336
  103,527,705
  103,528,274
  103,528,277
  103,528,297
  103,528,526
  103,528,787
  103,529,001
  103,529,061
  103,529,218
  103,530,509
  103,530,614
  103,531,102
  103,531,104
  103,531,582
  103,532,531
  103,532,681
  103,532,775
  103,533,785
  103,533,847
  103,534,475
  103,534,680
  103,535,005
  103,535,149
  103,538,147
  103,538,568
  103,539,275
  103,539,417
  103,539,454
  103,541,415
  103,542,583
  103,542,658
  103,543,464
  103,544,407
  103,544,853
  103,545,531
  103,545,724
  103,546,261
  103,547,467
  103,547,713
  103,548,683
  103,548,966
  103,549,021
  103,549,036
  103,549,938
  103,550,108
  103,550,887
  103,551,428
  103,551,430
  103,551,791
  103,552,555
  103,552,872
  103,553,747
  103,555,195
  103,555,304
  103,555,305
  103,556,429
  103,558,036
  103,558,038
  103,558,062
  103,558,847
  103,559,312
  103,560,641
  103,560,774
  103,560,797
  103,561,798
  103,562,001
  103,562,002
  103,562,179
  103,562,829
  103,562,974
  103,563,124
  103,563,396
  103,563,643
  103,564,142
  103,564,513
  103,565,297
  103,566,688
  103,567,057
  103,567,784
  103,567,968
  103,568,034
  103,568,443
  103,568,580
  103,568,609
  103,568,613
  103,568,635
  103,568,637
  103,570,906
  103,570,908
  103,571,011
  103,571,035
  103,571,432
  103,571,602
  103,572,928
  103,573,531
  103,579,026
  103,579,101
  103,579,217
  103,579,361
  103,580,332
  103,581,099
  103,582,144
  103,582,531
  103,584,173
  103,584,493
  103,584,534
  103,584,568
  103,584,631
  103,584,895
  103,584,902
  103,584,950
  103,585,075
  103,585,287
  103,585,804
  103,586,296
  103,586,551
  103,587,114
  103,587,250
  103,588,417
  103,588,904
  103,588,967
  103,588,983
  103,589,167
  103,589,314
  103,589,634
  103,590,646
  103,591,169
  103,591,312
  103,591,726
  103,591,802
  103,591,829
  103,592,255
  103,592,261
  103,592,495
  103,593,065
  103,593,342
  103,593,484
  103,594,103
  103,594,140
  103,594,263
  103,594,892
  103,595,004
  103,595,131
  103,595,173
  103,595,500
  103,595,602
  103,595,612
  103,596,538
  103,596,873
  103,597,024
  103,597,156
  103,597,404
  103,597,605
  103,597,665
  103,597,799
  103,598,163
  103,598,333
  103,598,782
  103,598,863
  103,598,950
  103,599,493
  103,599,497
  103,599,737
  103,599,838
  103,599,854
  103,599,992
  103,600,990
  103,600,991
  103,601,028
  103,601,220
  103,601,861
  103,602,106
  103,602,520
  103,602,601
  103,602,616
  103,602,730
  103,602,899
  103,603,296
  103,603,644
  103,603,713
  103,604,034
  103,604,240
  103,604,272
  103,604,341
  103,604,481
  103,605,381
  103,605,412
  103,605,743
  103,605,851
  103,606,012
  103,606,026
  103,606,356
  103,606,616
  103,606,737
  103,606,823
  103,607,884
  103,607,957
  103,608,118
  103,608,472
  103,608,714
  103,608,834
  103,608,839
  103,609,571
  103,609,730
  103,609,889
  103,610,176
  103,610,280
  103,610,357
  103,610,583
  103,610,805
  103,610,851
  103,611,103
  103,611,177
  103,611,303
  103,611,877
  103,612,670
  103,612,838
  103,612,929
  103,613,073
  103,613,087
  103,613,099
  103,613,183
  103,613,341
  103,613,771
  103,613,882
  103,614,518
  103,614,533
  103,614,567
  103,614,706
  103,614,950
  103,615,237
  103,615,389
  103,615,577
  103,615,831
  103,615,933
  103,616,020
  103,616,072
  103,616,100
  103,616,476
  103,616,571
  103,616,939
  103,617,092
  103,617,629
  103,617,630
  103,618,155
  103,618,338
  103,618,472
  103,618,495
  103,618,583
  103,618,687
  103,618,711
  103,619,064
  103,619,328
  103,619,535
  103,620,387
  103,621,256
  103,621,292
  103,621,374
  103,621,516
  103,621,601
  103,622,754
  103,623,007
  103,623,388
  103,624,870
  103,624,873
  103,625,500
  103,625,505
  103,625,507
  103,626,528
  103,627,830
  103,627,877
  103,628,210
  103,628,255
  103,628,449
  103,628,731
  103,628,878
  103,629,006
  103,629,010
  103,629,084
  103,629,501
T
3
G
T
C
G
T
G
-
G
C
G
C
T
G
A
T
5
C
T
A
C
7
-
-
G
T
G
T
G
A
A
T
A
C
T
G
-
C
A
A
C/3
2/-
-
T
T
T
2/-
T/5
A
G
T
A
2
C
2
G
G
T
T
-
T
T
-
3
T
-
T
C/G
7/-
14/-
G/C
-
C
C
G
G
A
T
A
A
T
T
C
T
2
A
2
-
2
3
G
T
C
C/3
3
C
T
14/16
C/T
T
G
G
T
8/-
C
T
A
T/-
-
2
A
10
A
-
A
G
2
T
6
-
-
A
3
2
T
G
-
2
3
4
G
G
T
3
C
6/-
9/-
C
A
T
T/-
T/C
T
A
T
A/-
7/-
G
T
A
A
-
-
G
-
8/-
6/-
A
A
G/2
C
2
A
12/-
A
T
A
A
-
-
G
T
19
-
T
A
A/5
-
C
GT/3
C
-
G
G
-
A
-
T/-
7
A
13
G
A
T
A
T
T
T
-
A
A
-
13
T
G
2
-
G
G
T
C
T
A
T
C
T
C
T
-
9
T
G
5
C
T
A
A
-
T
G
5
A
C
C
A
G
T
G
G/C
-
A
A
G
T
-
2
T
T
2
C
G
T
-
T
G
21
G
T
T
-
C
T
T
A
C
C
C
C
3
41
G
-
-
-
G
C
C
-
-
4
C
G
-
-
T
A
2
C
T
A
A
G
G
A
16
T
G
G
A
A
A
2
G
T
C
5/3
G
117
-
C
C
C
T
T
T
-
A
C
C
C
T
118
-
T
G
-
C
G
C
T
T
C
G
G
G/3
C
G
2
-
C
93/-
C
T
T
4
-
-
C
-
-
2
T
T
A
T
12/-
A
T
T
G
A
A
2
T
C
T
T
G
A
G
A
2
T
T
A
A
A
C
-