Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 175,703 (bp)   Positions: 482
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.007
.003
.006
.002
.013
--
--
.002
--
--
.002
.0
.034
.0
.15
.007
.823
.028
.013
.022
.062
.0
.006
.003
.193
.032
--
.051
.056
.046
.115
.18
--
.049
.083
.002
.028
.009
--
--
--
.003
.04
.003
.008
.008
.002
.004
.151
.152
--
.97
.042
.163
.0
.196
.018
.055
.024
.205
.051
.006
.019
.003
.018
.004
.018
.004
.039
.257
.01
.001
.071
.877
.823
.51
.477
.007
.005
.052
.098
.008
--
--
.001
.0
.026
.003
.001
.244
.001
.045
.059
.0
.003
.006
.209
.003
.003
.033
.023
.017
.016
.004
.375
.006
.018
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.179
.229
.001
.011
.001
.001
.001
.024
.012
.0
.0
.0
.0
.002
.003
.019
.0
.252
.005
.037
.013
.056
.006
.062
--
--
.002
.001
.001
.0
.0
.001
.001
.003
--
--
--
--
.0
.0
.0
.0
.002
.037
.182
.018
--
--
.101
.012
.034
.046
--
.002
.001
.0
.0
.926
.058
.08
1.0
.006
.027
.006
.001
.007
.0
.001
.0
.108
.022
.001
.131
.0
.001
.01
.011
.004
.001
.036
.146
--
.0
.043
.037
.032
.0
.002
.002
.006
.084
.0
.062
.134
.028
.001
.002
.086
.003
.025
.328
.425
.001
.001
.013
--
--
--
--
--
.004
.006
.335
.462
.001
.018
.032
.035
.006
.007
.005
--
--
--
--
.001
.005
.002
.005
.038
.056
--
.032
.012
.023
.007
.9
.063
.004
.284
.008
.001
.146
.0
.0
.001
.612
.081
.05
.042
.126
.06
.005
.0
.165
.0
.78
.113
.024
.002
.008
.006
.002
.009
--
--
--
--
--
.096
.346
--
--
.001
.07
.052
.001
.008
.004
.165
.005
.293
.0
.401
.0
.313
.01
.109
.033
.001
.011
.007
.001
.014
.004
.018
.039
.005
.016
.076
.001
.009
.004
.061
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.008
.011
.0
.0
.002
.028
.002
.001
.018
.012
.047
.006
.0
.002
.001
.001
.002
.0
.0
.009
.002
.044
.011
.0
.0
.049
.313
.002
.0
.462
.003
.014
.007
.024
.004
.187
.055
.076
.002
.001
.0
.004
.106
.146
.048
.005
.003
.85
.004
.001
.006
.001
.0
.0
.008
.022
.262
.145
.011
.006
.13
.004
.081
--
.001
--
--
--
--
--
--
.011
.017
.025
.025
.201
.084
.005
.004
.002
.912
.023
.0
.005
.006
.009
.109
.098
.102
.098
.015
.021
.542
.0
.0
.002
.002
.313
.043
.029
.003
.0
.01
.001
.151
.0
.005
.009
.068
.624
.002
.814
.901
.008
.0
.01
.007
.001
.001
.032
.008
.0
.028
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
Sv2b
T
A
G
C
G
T
15
G
2
G
A
C
A
C
C
8
T
C
A
2
A
T
T
C
T
C
T
G
C
G
A
A
A
A
C
A
T
A
G
G
A
A
34
G
T
C
A
C
C
G
T
2
T
2
G
A
C
C
G
T
T
G
7
T
G
T
A
A
T
G
T
T
A
2
2
G
C
C
C
G
G
T
41
78
A
G
G
C
C
8
T
G
A
C
T
C
C
T
G
A
A
G
C
A
G
A
T
T
A
A
G
A
G
T
C
C
A
T
T
C
2
A
T
A
A
A
T
A
A
A
T
C
G
28
G
T
A
T
C
A
G
C
T
C
T
A
T
G
A
T
A
G
T
C
T
C
A
4
A
G
T
G
C
C
T
A
A
T
A
C
T
G
T
G
A
C
3
G
T
C
G
A
T
T
C
12
T
A
A
C
T
G
T
C
A
A
A
A
T
G
C
T
G
A
A
A
T
A
G
T
T
A
T
G
T
C
2
A
9
T
G
C
T
G
T
6
T
A
G
A
C
4
C
T
2
T
T
T
A
A
T
T
114
T
G
A
3
T
A
A
A
A
G
T
A
12
A
8
12
G
T
T
T
A
90
T
C
G
C
A
C
A
A
C
A
A
T
C
A
C
C
C
G
A
C
G
G
G
T
A
A
A
A
T
A
T
A
A
A
C
G
C
A
G
G
5
G
C
C
G
C
C
C
C
A
A
A
A
T
C
A
A
C
C
G
T
T
A
C
C
T
A
C
C
T
C
G
A
C
A
T
G
A
T
C
C
G
C
C
T
6
A
3
A
C
C
A
A
A
A
A
C
T
G
T
C
G
G
C
C
C
C
G
G
A
G
6
C
A
T
C
G
T
G
G
C
C
2
A
G
T
16
T
2
A
G
G
16
T
G
4
A
3
6
G
T
G
A
A
G
C
T
T
T
T
2
A
A
C
C
G
A
T
G
T
T
T
A
C
T
A
3
T
C
C
G
C
G
A
A
T
G
T
T
T
2
G
9
G
A
3
4
T
T
A
A
G
T
T
C
T
A
62
C
C
A
C
A
C
T
G
C
T
C
A
T
T
G
A
A
A
A
  137,660,850
  137,661,024
  137,662,555
  137,663,010
  137,664,337
  137,664,698
  137,664,701
  137,665,920
  137,667,234
  137,667,936
  137,668,083
  137,668,924
  137,669,783
  137,670,590
  137,672,261
  137,672,348
  137,672,770
  137,673,330
  137,674,313
  137,675,592
  137,675,736
  137,678,296
  137,678,320
  137,681,091
  137,681,611
  137,683,610
  137,685,669
  137,687,376
  137,687,468
  137,687,705
  137,689,808
  137,689,812
  137,691,146
  137,691,950
  137,692,720
  137,693,757
  137,694,230
  137,695,186
  137,695,772
  137,695,789
  137,695,793
  137,696,403
  137,696,795
  137,697,006
  137,697,141
  137,698,012
  137,698,049
  137,699,014
  137,699,153
  137,699,255
  137,699,590
  137,699,764
  137,700,000
  137,700,220
  137,700,550
  137,701,176
  137,701,213
  137,702,761
  137,702,792
  137,703,119
  137,703,283
  137,703,479
  137,703,882
  137,703,996
  137,704,024
  137,704,155
  137,704,171
  137,704,587
  137,704,738
  137,705,153
  137,705,326
  137,705,333
  137,705,996
  137,706,278
  137,706,282
  137,706,298
  137,706,300
  137,706,426
  137,706,481
  137,706,616
  137,707,442
  137,707,467
  137,707,495
  137,707,539
  137,707,809
  137,707,921
  137,707,947
  137,708,024
  137,708,026
  137,708,341
  137,708,708
  137,708,831
  137,708,833
  137,709,060
  137,709,076
  137,709,093
  137,710,054
  137,710,142
  137,710,144
  137,710,488
  137,710,523
  137,710,620
  137,710,717
  137,711,083
  137,711,196
  137,711,347
  137,711,392
  137,711,478
  137,711,801
  137,711,813
  137,711,817
  137,711,819
  137,711,839
  137,711,948
  137,711,969
  137,712,086
  137,712,226
  137,712,227
  137,712,529
  137,712,571
  137,713,299
  137,713,302
  137,713,693
  137,713,965
  137,714,103
  137,714,726
  137,715,333
  137,715,909
  137,716,288
  137,716,526
  137,716,997
  137,717,026
  137,717,145
  137,717,703
  137,717,795
  137,717,838
  137,718,023
  137,718,270
  137,718,349
  137,718,655
  137,718,693
  137,718,698
  137,718,827
  137,718,830
  137,719,109
  137,719,342
  137,719,372
  137,719,385
  137,719,472
  137,719,833
  137,719,956
  137,719,991
  137,720,002
  137,720,027
  137,720,064
  137,720,720
  137,720,841
  137,720,992
  137,721,031
  137,722,573
  137,723,738
  137,723,832
  137,723,985
  137,724,011
  137,724,058
  137,724,374
  137,724,378
  137,724,386
  137,724,399
  137,724,406
  137,724,407
  137,724,591
  137,724,600
  137,724,840
  137,725,042
  137,725,160
  137,725,544
  137,725,591
  137,726,271
  137,727,085
  137,727,090
  137,727,346
  137,727,445
  137,727,661
  137,727,893
  137,728,001
  137,728,194
  137,728,369
  137,728,383
  137,729,008
  137,729,635
  137,731,009
  137,731,542
  137,731,977
  137,732,729
  137,733,008
  137,733,102
  137,733,221
  137,733,826
  137,733,917
  137,734,053
  137,734,235
  137,734,921
  137,735,102
  137,735,188
  137,735,494
  137,736,675
  137,736,751
  137,737,514
  137,737,890
  137,738,174
  137,738,277
  137,738,741
  137,739,004
  137,739,262
  137,740,286
  137,740,697
  137,740,700
  137,740,702
  137,741,029
  137,741,974
  137,742,081
  137,742,518
  137,742,577
  137,743,634
  137,743,774
  137,743,794
  137,745,179
  137,745,509
  137,745,900
  137,746,255
  137,746,868
  137,747,360
  137,747,689
  137,748,077
  137,748,105
  137,748,107
  137,748,111
  137,750,037
  137,752,076
  137,752,711
  137,752,870
  137,753,791
  137,753,983
  137,754,077
  137,754,488
  137,754,490
  137,754,586
  137,754,887
  137,755,230
  137,755,231
  137,755,433
  137,755,570
  137,755,735
  137,755,906
  137,755,908
  137,756,076
  137,756,103
  137,756,117
  137,756,915
  137,757,177
  137,757,238
  137,757,459
  137,757,483
  137,758,187
  137,758,827
  137,759,121
  137,759,197
  137,759,295
  137,759,585
  137,759,653
  137,759,726
  137,760,107
  137,760,257
  137,760,352
  137,760,594
  137,761,132
  137,761,142
  137,761,212
  137,761,894
  137,761,928
  137,761,944
  137,761,997
  137,761,998
  137,762,181
  137,762,429
  137,762,674
  137,762,730
  137,762,771
  137,762,903
  137,763,197
  137,763,264
  137,763,291
  137,763,415
  137,763,432
  137,763,531
  137,763,623
  137,763,756
  137,764,137
  137,764,390
  137,764,448
  137,764,455
  137,764,658
  137,765,184
  137,765,672
  137,765,676
  137,765,995
  137,766,044
  137,766,051
  137,766,692
  137,766,722
  137,767,344
  137,767,613
  137,769,345
  137,770,179
  137,770,917
  137,771,718
  137,772,000
  137,772,869
  137,773,043
  137,773,302
  137,773,833
  137,774,161
  137,774,696
  137,775,205
  137,775,696
  137,776,555
  137,776,597
  137,777,176
  137,777,217
  137,777,290
  137,777,551
  137,777,566
  137,777,606
  137,777,613
  137,778,148
  137,778,167
  137,778,769
  137,779,490
  137,779,572
  137,779,626
  137,779,789
  137,779,947
  137,780,016
  137,780,114
  137,780,170
  137,780,226
  137,780,347
  137,780,377
  137,780,482
  137,780,840
  137,780,874
  137,781,512
  137,781,918
  137,782,242
  137,782,812
  137,783,559
  137,783,606
  137,783,766
  137,783,782
  137,783,788
  137,783,823
  137,783,864
  137,783,998
  137,784,181
  137,784,222
  137,784,784
  137,784,867
  137,786,774
  137,788,615
  137,788,973
  137,789,008
  137,789,079
  137,789,284
  137,789,648
  137,789,939
  137,789,968
  137,790,500
  137,790,726
  137,791,234
  137,791,270
  137,791,416
  137,791,427
  137,791,557
  137,791,790
  137,791,914
  137,791,959
  137,792,160
  137,792,524
  137,792,536
  137,792,545
  137,793,649
  137,795,350
  137,795,635
  137,796,100
  137,796,196
  137,796,506
  137,796,530
  137,797,068
  137,797,588
  137,797,863
  137,797,879
  137,798,299
  137,799,062
  137,799,067
  137,799,973
  137,800,206
  137,801,773
  137,802,186
  137,802,561
  137,802,851
  137,802,852
  137,803,230
  137,803,349
  137,803,410
  137,804,943
  137,805,060
  137,805,404
  137,805,634
  137,807,793
  137,808,333
  137,809,330
  137,813,235
  137,814,307
  137,815,337
  137,815,796
  137,815,808
  137,815,877
  137,815,893
  137,816,241
  137,816,271
  137,816,819
  137,817,036
  137,817,051
  137,817,202
  137,817,281
  137,817,332
  137,817,405
  137,818,082
  137,818,164
  137,818,746
  137,818,762
  137,819,434
  137,819,438
  137,819,595
  137,819,731
  137,819,734
  137,819,736
  137,819,772
  137,819,926
  137,820,503
  137,821,625
  137,821,868
  137,822,227
  137,822,417
  137,822,591
  137,822,635
  137,822,659
  137,822,683
  137,822,771
  137,823,076
  137,823,235
  137,823,461
  137,824,813
  137,824,894
  137,825,388
  137,826,036
  137,826,366
  137,826,557
  137,826,646
  137,826,687
  137,826,838
  137,827,341
  137,827,493
  137,827,534
  137,828,320
  137,828,362
  137,828,650
  137,829,256
  137,829,304
  137,830,498
  137,833,043
C
T
A
T
T
-
-
A
-
3
-
T
G
T
21
8/-
A
T
G
-
-
C
-
2
G
T
A
A
-
C
G
A/3
-
-
C/2
G
A
G
T
G/57
A/53
G
-
A
C
T
G
T
5
A
C
2/-
C
-
A
T
A
T
T
C
C
T
-
5
A
C
G
G
G
C
A
27
C
-
-
C
A
T
T
A
C
C
-
-
T
A
A
2
12
8/-
C
12
C
2
A
G
T
G
A
G
G
2
G
C
A
C
40
2
G
C
C
C
A
G
A
-
T
A
G
T
2/-
A/3
G
5
2
C
G
C
G
T
2
T
A
-
A
C
-
G
T
G
A
T
A
T
G
T
G
A
T
C
G
-
C
8
C
T
C
-
5
A
C
A
T
T
C
2
-
6
2
T
C
A
C
C
T
T
-
A
C
T
A
-
C
G
T
-
C
G
G
T
C
A
C
T
G
G
T
G
C
A
T
C
A
G
G
7
C
C
A
C
-
G
C
A
C
T
-
C
-
C
A
G
A
A
C
-
G
G
2
G
T
-
T
C
2/-
-
C
-
-
T
C
C
-
T/3
4
-
-
C
G
G
G
G
A
-
-
-
G
-
-
A
3
C
-
G
-
A
T
2
-
G
T
C
G
T
C
T
G
T
G
T
A
3
3
7
T
C
A
A
C
G
23
G
G
C
G
A
G
G
G
A
3
T
G
A
-
-
A
T
T
A
2
T
G
A
T
G
G
2
C
3
T
2
T
T
T
G
C
G
T
T
G
G
T
9
A
T
A
C
A
G
C
A
G
C
T
T
C
T
G
C
6/-
A/-
-
2
A
C/-
2
C
T
-
T
G
C
2
C
T
A
3
T
T
T
-
A
A
G
T
-
T
G
C
T
T
A
A
A
T
2
-
G
A
C
-
A
-
-
T
A
-
C
A
-
-
-
-
8
G
2
G
11
A
C/2
T/-
C
C
G
2/-
AT/4
T
-
T
9
5
2
C
G
-
2
T
T
C
G
-
C
5
T
A
T
A
3
G
C
2
C
G
C
-
T
-
2
T
-
-
C
C
G
G
A
-
A
T
C
G
-
T
T
G
3
11
T
-
A
2
C
T
G
C
C
A
G
C
T
2