Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 643,848 (bp)   Positions: 364
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.0
.013
.011
.012
.0
.004
--
.0
.017
.004
.05
--
--
.001
.116
.071
.154
.02
--
.162
.225
.001
.998
.0
.041
.071
.001
.388
.001
.03
.008
.007
.001
.003
.0
.013
.001
.004
.002
.001
.002
.01
.024
.002
.017
.1
.155
.196
.518
.943
.083
.007
.0
.002
.0
.001
.168
.02
.025
.001
.01
.03
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.012
.008
.059
.004
.026
.008
.003
.001
.0
.053
.002
.003
.001
.101
.0
.003
.038
.0
.006
.0
.0
.008
.0
.114
.349
.001
.006
.002
.001
.002
.0
.104
.001
.003
.002
.029
.058
.011
.093
.0
.002
.004
.002
.033
.002
.003
.005
.008
.02
.022
.008
.0
.342
.144
--
.006
.003
.072
.026
.013
.004
.036
.099
.258
.204
.019
.054
.991
.011
.012
.113
.002
.057
.0
.007
.0
.0
.001
.003
.007
--
--
--
.275
.478
.173
.158
.004
.005
.41
.001
.018
.0
.002
.225
.009
.031
.006
.0
.001
.163
.383
.001
.005
.28
.0
.002
.0
.0
.001
.254
.988
1.0
.002
.001
.021
.466
.067
.998
.0
.002
.0
.044
.084
.0
.001
.001
.001
.065
.001
.014
.003
.003
.001
.001
.158
.001
.009
.0
.157
.013
.011
.005
.0
.002
.001
.004
.005
--
--
--
--
--
--
.002
.049
.123
.082
.003
.004
.0
.0
.006
.059
.295
.014
.016
.001
.223
.986
.006
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.03
.046
.009
.005
.271
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.021
.002
.002
.374
--
--
.111
.129
.22
.061
.054
.014
.0
.001
.902
.126
.0
.0
.002
.061
--
.005
--
--
--
--
--
.037
.006
.136
.13
.4
.011
.032
.037
.002
.015
.072
--
--
.002
.834
.738
--
.025
.001
--
.193
--
--
--
--
--
--
.138
.025
.0
.034
.001
.502
.001
.009
.009
.0
.0
.023
.165
--
.0
.0
.001
.0
.053
.995
--
.116
.078
--
--
.453
.033
.017
--
--
.203
.0
.002
.692
Sorcs3
Sorcs3
Sorcs3
Sorcs3
Sorcs3
Sorcs3
Sorcs3
Sorcs3
Sorcs3
Sorcs3
Sorcs3
Sorcs3
Sorcs3
Sorcs3
Sorcs3
Sorcs3
Sorcs3
Sorcs3
Sorcs3
Sorcs3
Sorcs3
Sorcs3
Sorcs3
Sorcs3
Sorcs3
Sorcs3
Sorcs3
Sorcs3
Sorcs3
Sorcs3
Sorcs3
Sorcs3
Sorcs3
Sorcs3
Sorcs3
Sorcs3
Sorcs3
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
G
A
T
C
G
G
C
T
C
A
2
A
A
C
C
6
T
C
C
T
2
T
T
G
G
C
C
G
A
T
C
A
T
T
G
T
2
T
A
A
G
A
T
G
3
G
G
G
A
G
A
C
C
T
C
T
G
C
C
G
A
G
4
G
C
G
C
G
4
6
G
A
T
T
T
T
C
T
A
A
T
T
A
T
A
T
A
A
A
C
C
T
G
G
C
C
C
C
T
G
A
C
A
C
T
A
T
G
C
G
A
G
A
16
T
T
C
T
T
G
G
G
T
4
T
2
C
T
A
T
G
G
C
G
T
G
C
G
T
4
2
14
C
G
T
T
T
A
T
2
T
T
T
C
G
6
T
T
C
G
2
G
A
C
T
5
G
A
C
4
A
G
T
C
2
C
G
T
T
A
T
T
A
A
G
C
G
G
A
A
C
A
A
T
T
A
10
C
G
3
A
G
C
C
A
G
C
A
A
T
T
T
G
T
G
G
C
G
A
G
A
G
A
C
T
G
5
G
T
A
A
T
G
T
A
G
G
G
T
T
T
A
A
A
G
G
T
T
G
2
G
T
C
A
G
A
C
C
T
T
G
G
G
C
G
C
C
G
T
G
G
C
G
2
A
T
G
A
T
G
C
G
T
A
T
T
C
A
A
T
A
G
G
C
C
G
C
C
G
A
G
G
C
G
G
A
G
G
C
T
T
C
A
2
T
2
2
28
10
G
G
G
8
T
2
A
T
C
C
G
4
2
4
2
G
T
T
T
6
T
A
T
C
4
C
2
T
T
A
A
A
2
2
17
A
4
G
C
G
G
G
C
T
C
  275,419,091
  275,422,727
  275,423,336
  275,424,736
  275,426,654
  275,428,791
  275,430,285
  275,431,581
  275,436,552
  275,437,411
  275,437,412
  275,437,727
  275,437,769
  275,438,436
  275,440,786
  275,440,922
  275,441,490
  275,441,952
  275,442,135
  275,450,005
  275,450,008
  275,450,263
  275,450,584
  275,450,819
  275,451,153
  275,451,700
  275,451,714
  275,458,090
  275,458,257
  275,458,534
  275,458,670
  275,458,689
  275,459,553
  275,459,638
  275,459,699
  275,459,797
  275,459,805
  275,460,941
  275,461,329
  275,461,414
  275,461,790
  275,461,975
  275,461,980
  275,462,290
  275,462,547
  275,462,594
  275,462,601
  275,462,609
  275,462,632
  275,462,664
  275,462,731
  275,463,199
  275,463,443
  275,463,922
  275,464,154
  275,464,377
  275,464,972
  275,465,042
  275,465,043
  275,465,530
  275,465,727
  275,465,928
  275,466,189
  275,466,286
  275,466,906
  275,466,925
  275,466,947
  275,466,983
  275,467,075
  275,467,131
  275,467,182
  275,467,290
  275,467,871
  275,467,901
  275,467,925
  275,467,961
  275,468,351
  275,468,378
  275,468,403
  275,468,464
  275,468,542
  275,468,563
  275,468,594
  275,468,596
  275,468,663
  275,468,857
  275,469,162
  275,469,233
  275,469,290
  275,469,607
  275,469,682
  275,469,979
  275,469,985
  275,470,861
  275,471,004
  275,471,020
  275,471,106
  275,471,188
  275,471,798
  275,472,279
  275,472,320
  275,472,376
  275,472,647
  275,473,251
  275,473,513
  275,474,339
  275,474,343
  275,474,850
  275,475,231
  275,475,719
  275,476,302
  275,476,815
  275,476,820
  275,476,910
  275,477,169
  275,477,545
  275,477,862
  275,478,579
  275,478,589
  275,478,887
  275,479,181
  275,479,995
  275,480,447
  275,481,215
  275,481,370
  275,481,405
  275,481,479
  275,481,778
  275,482,149
  275,482,518
  275,482,685
  275,483,081
  275,484,358
  275,486,038
  275,487,209
  275,487,406
  275,488,227
  275,488,717
  275,489,189
  275,489,338
  275,489,340
  275,489,457
  275,489,522
  275,490,034
  275,490,103
  275,490,157
  275,490,562
  275,490,910
  275,491,064
  275,491,076
  275,491,142
  275,491,203
  275,491,205
  275,491,225
  275,494,533
  275,494,576
  275,494,948
  275,494,972
  275,495,032
  275,495,035
  275,495,234
  275,495,389
  275,495,413
  275,495,441
  275,495,841
  275,496,020
  275,496,026
  275,496,030
  275,496,102
  275,496,178
  275,496,242
  275,496,290
  275,496,303
  275,496,639
  275,496,664
  275,496,725
  275,496,793
  275,496,810
  275,496,984
  275,497,155
  275,497,218
  275,497,250
  275,497,345
  275,497,577
  275,498,063
  275,498,083
  275,498,291
  275,498,356
  275,498,408
  275,499,277
  275,499,450
  275,499,473
  275,499,826
  275,500,259
  275,500,372
  275,500,608
  275,501,383
  275,502,285
  275,502,465
  275,503,646
  275,503,959
  275,505,050
  275,505,190
  275,505,266
  275,505,267
  275,505,268
  275,505,405
  275,505,473
  275,505,512
  275,505,517
  275,505,681
  275,505,913
  275,506,139
  275,506,168
  275,506,197
  275,506,256
  275,506,346
  275,506,494
  275,506,589
  275,506,694
  275,506,878
  275,506,890
  275,506,899
  275,506,921
  275,507,112
  275,507,345
  275,508,053
  275,508,058
  275,508,159
  275,508,279
  275,508,281
  275,508,509
  275,508,514
  275,508,543
  275,508,826
  275,508,894
  275,508,980
  275,508,981
  275,508,987
  275,509,175
  275,509,606
  275,509,871
  275,509,939
  275,510,008
  275,510,051
  275,510,053
  275,510,055
  275,510,223
  275,510,382
  275,510,598
  275,510,872
  275,511,771
  275,511,789
  275,511,793
  275,512,299
  275,512,358
  275,512,877
  275,513,529
  275,513,553
  275,513,617
  275,514,097
  275,514,341
  275,514,388
  275,514,556
  275,514,565
  275,514,587
  275,514,603
  275,514,653
  275,514,654
  275,514,861
  275,514,961
  275,515,017
  275,515,147
  275,515,687
  275,515,814
  275,516,028
  275,517,154
  275,517,168
  275,517,336
  275,517,439
  275,518,206
  275,518,320
  275,518,639
  275,518,648
  275,518,731
  275,518,801
  275,518,868
  275,519,000
  275,519,062
  275,519,122
  275,519,820
  275,519,861
  275,519,869
  275,521,054
  275,521,381
  275,521,724
  275,521,866
  275,522,099
  275,522,489
  275,522,974
  275,523,079
  275,523,084
  275,523,555
  275,523,686
  275,523,763
  275,524,019
  275,524,462
  275,524,798
  275,525,634
  275,532,775
  275,532,827
  275,532,946
  275,533,074
  275,566,576
  275,566,680
  275,566,765
  275,567,695
  275,587,687
  275,587,753
  275,589,487
  275,616,111
  275,616,132
  275,655,555
  275,671,475
  275,678,903
  275,678,990
  275,678,992
  275,679,125
  275,679,199
  275,761,254
  275,772,964
  275,776,297
  275,776,434
  275,778,488
  275,781,399
  275,785,484
  275,786,802
  275,790,209
  275,790,210
  275,821,942
  275,840,644
  275,850,991
  275,867,797
  275,868,566
  275,883,943
  275,883,944
  275,883,945
  275,938,566
  275,947,673
  275,948,709
  275,965,541
  275,975,885
  275,980,585
  275,987,290
  275,987,709
  276,000,235
  276,006,144
  276,006,146
  276,007,059
  276,007,061
  276,009,989
  276,010,168
  276,050,359
  276,055,500
C
T
-
T
-
-
7
C
-
A/5
-
3
3
T
3
6/-
C
T
3
T/3
2/-
C
A
T
A
T
T
A
G
C
A
3
12
C
A
A
-
C
G
G
A
C
19
A
3/-
18
2
6
4
16
T
2
2
C
A
C
2
2
T
A
G
T
-
13
2
G/3
C/9
11
-
-
7
G
T/-
C
C
C
T
C
G
C
A
C
G
3
G
G
G
G
G
T
T
C
A
A
G
A
T
T
-
C
G
T
G
G
C
G
A
2
T
5/3
G
A
3
-
C
C
T
T/3
5
T
A
?
C
-
C
-
29
2
G
C
C
C
5
A
A
C
T
A
C
-
2/-
-
G
T
C
C
C
G
C
-
C
C
C
T
2
-
C
C
2
2
-
A
G
T
A
-
4
G
A
-
3
3
3
2
-
A
A
G
C
G
C
A
C
G
C
T
A
A
61
G
T
G
G
C
G
C
-
5
T
-
G
A
T
T
G
A
T
G
G
C
T/4
C
A
G
C
A
G
A
2
-
G
A
G
A
-
A
5/-
G/35
G
T
G
C
A
G
C
T
2
9
C
15
C
G
G
T
-
-
6
C
2
-
C
C
T
G
A
G
T
T
C
C
C
A
A
T
A
T
T
A
C
A
A
T
T
-
5
3
21
C
C
T
G
A
C
-
C
C
T
G
G
G
G
C
2
T
C/5
C
4/5
T
5
G
A
A
G
T
T
2
A
A
T
C
4/3
T
G
-
C
2/-
2/-
28/-
10/-
A
T
C
-
T/13
2/-
A/T
T/A
C/160
C/158
3
-
2/-
-
2/-
2
T/4
C
T/11
6/-
10
G
C
5
4/-
C/2
2/-
T/-
G
9
G
C
2/-
2/-
17/-
A/2
4/-
9
10
G/C
G/C
G/9
C/-
-
5