Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 277,610 (bp)   Positions: 558
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.91
.0
.006
.012
.0
.966
.0
.002
.001
.983
.026
.001
.058
.0
.002
.006
.008
.224
.007
.001
.622
.864
.09
.008
.0
.0
.008
.744
.002
.001
.0
.0
.001
.11
.101
.154
.01
.042
.0
.0
.014
.0
.001
.012
.123
.004
.902
.273
.491
.0
.0
.002
.001
.029
.066
.208
.167
.001
.0
.002
.498
.493
.059
.005
.023
.007
.009
.042
.009
.003
.001
.002
.0
.0
.002
.007
.02
.021
.004
.227
.172
.005
.244
.0
.018
.877
.013
.002
.607
.0
.015
.007
.008
.035
.03
.007
.01
.002
.009
.0
.001
.002
.005
.001
.004
--
.052
.062
.003
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.292
.039
.031
.191
.004
.002
.251
.024
.021
.017
.046
.1
.002
.006
.015
.004
.004
.001
.016
.004
.007
.905
.178
.112
.121
.003
.0
.002
.0
.0
.001
.003
.002
.0
.001
.0
.028
.001
.002
.076
.0
.0
.034
.003
.0
.015
.001
.03
.0
.001
.001
.0
.004
.01
.0
.716
.009
.048
.001
.934
.002
.046
.193
.001
.057
.004
.01
.076
.018
.061
.005
.031
.309
.074
.003
.007
.034
.0
.001
.01
.18
.021
.142
.011
.041
.008
.048
.008
.001
.039
.004
.167
.378
.005
.0
.001
.007
.085
.013
.043
.0
.0
.0
.997
.153
.462
.715
.609
.026
.274
.155
.025
--
--
--
--
--
.205
.097
.017
.032
.0
.005
.005
.045
.016
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.002
.474
.005
.042
.007
.158
.026
.0
.001
.001
.004
.004
.009
.173
.122
.014
.003
.004
.002
.279
.01
.02
.002
.001
.052
.007
.17
.024
.005
.01
.005
.074
.0
.001
.107
.006
.0
.014
--
.104
--
--
--
.0
.009
.007
.015
.002
.028
.195
.001
.0
.012
.0
.0
.001
--
--
--
--
--
.403
.0
.032
.0
.146
.042
.038
.001
.001
.005
.001
.001
.002
.033
.102
.002
.0
.238
.749
.009
.042
.013
.037
.206
.001
.031
.003
.013
.021
.297
.014
.169
.063
.186
.056
.0
.218
.001
.008
.01
.031
.502
.528
.004
.0
.002
.082
.006
.0
.001
.012
.031
.003
.017
.009
.005
.0
.412
.136
.0
.424
.0
.055
.167
.001
.001
.003
.205
.002
.0
.672
.093
.136
.994
.787
.023
.011
.011
.004
.001
.002
.0
.0
.003
.007
.0
.0
.0
.002
.176
.038
.002
.001
.007
.014
.002
.005
.044
.112
.077
.683
.123
.587
.671
.676
.094
.002
.002
.002
.0
.005
.004
.004
.012
.031
.111
.028
.041
.009
.042
.078
.065
.003
.002
.001
.0
.0
.0
.0
.006
.011
.002
.0
.0
.001
.028
.1
.076
.698
.0
.001
.035
.001
.007
.0
.001
.033
.001
.0
.0
.0
.0
.0
.002
.004
.007
.007
.034
.035
.203
.004
.005
.452
.011
.21
.366
.504
.037
.034
.112
.001
.005
.095
.043
.001
--
.525
.01
.008
.0
.205
--
.001
.001
.157
.008
.005
.001
.023
.003
.102
.003
.0
.005
--
--
--
--
--
.012
.006
.0
.003
.423
.002
.001
.031
.0
.0
.0
.0
.123
.126
.133
.051
.007
.066
.067
.068
.068
.0
.005
--
.013
.016
.019
.077
.029
.005
.005
.015
.048
.027
.002
.101
.395
.026
.002
.023
.002
.003
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
Slco3a1
A
C
T
G
A
A
T
A
G
T
A
G
A
A
T
A
T
A
G
C
T
G
A
G
A
A
T
T
T
G
T
T
C
G
T
G
T
T
G
G
T
A
T
T
T
C
G
G
A
A
C
C
A
C
4
T
C
T
C
C
A
2
C
T
C
C
A
G
T
G
C
T
C
A
A
A
T
T
A
G
A
C
T
T
A
C
A
G
T
C
4
2
T
T
T
C
C
C
G
T
C
11
C
A
A
A
C
C
2
132
2
A
A
T
T
2
G
G
2
4
A
T
A
G
C
4
2
C
C
T
G
C
T
C
A
G
C
G
G
G
A
G
C
A
T
3
T
G
G
C
A
C
A
C
T
4
7
T
A
T
C
A
G
T
C
G
2
G
C
A
G
A
G
G
C
G
A
A
T
A
T
G
G
T
A
T
C
A
A
T
C
T
C
A
G
A
G
4
G
C
A
C
C
A
G
T
A
T
T
T
G
G
2
T
G
T
G
2
A
G
G
G
T
G
T
C
T
A
G
G
T
G
G
C
2
C
2
34
A
C
T
G
C
G
G
6
G
A
T
36
C
G
C
T
T
T
T
A
T
A
T
T
G
T
G
T
T
G
G
10
8
C
G
C
A
G
G
G
T
A
A
C
T
T
T
T
T
9
C
7
G
C
T
4
C
C
12
T
26
A
4
A
G
A
9
T
C
T
C
A
T
T
2
C
T
A
A
T
G
T
T
A
C
C
C
C
T
T
G
G
T
A
G
G
T
T
T
C
4
G
T
A
C
4
A
A
T
A
T
A
T
A
A
G
G
G
A
A
6
4
A
T
G
18
G
33
T
C
C
C
G
C
A
A
2
A
T
A
A
G
T
A
T
T
C
T
A
C
A
C
G
A
G
6
5
G
G
A
C
G
T
A
C
G
C
C
T
A
G
C
A
G
T
T
A
G
G
C
T
T
G
C
A
T
C
G
T
T
G
A
C
G
T
G
T
T
A
A
C
C
C
C
A
C
T
A
T
T
A
G
A
A
G
T
T
G
C
C
T
C
A
A
A
T
C
T
T
G
2
6
A
C
C
C
A
G
A
A
A
T
A
16
14
C
T
G
A
T
T
A
T
C
A
T
G
G
20
A
G
A
A
G
G
A
G
C
G
G
3
C
C
T
G
T
3
A
G
T
A
C
C
G
A
A
C
C
G
C
G
4
2
C
A
C
C
C
C
C
3
T
G
G
T
T
C
A
3
T
C
G
A
2
C
A
C
C
C
G
  136,793,983
  136,794,267
  136,794,674
  136,794,712
  136,794,809
  136,795,066
  136,795,409
  136,795,465
  136,795,476
  136,795,559
  136,795,593
  136,796,205
  136,797,144
  136,797,979
  136,798,114
  136,799,197
  136,799,315
  136,799,956
  136,800,187
  136,800,804
  136,800,829
  136,801,379
  136,801,512
  136,801,515
  136,801,519
  136,801,521
  136,801,523
  136,802,156
  136,802,834
  136,802,867
  136,802,931
  136,803,048
  136,803,211
  136,803,454
  136,803,455
  136,803,548
  136,803,674
  136,804,093
  136,804,383
  136,804,575
  136,805,169
  136,805,470
  136,805,493
  136,805,902
  136,806,035
  136,806,091
  136,806,255
  136,806,298
  136,806,318
  136,806,371
  136,806,660
  136,806,768
  136,807,429
  136,807,514
  136,807,574
  136,807,949
  136,807,950
  136,808,371
  136,808,779
  136,808,820
  136,809,087
  136,809,088
  136,809,408
  136,809,443
  136,809,575
  136,809,819
  136,809,850
  136,809,860
  136,809,933
  136,810,052
  136,810,083
  136,810,118
  136,810,262
  136,810,936
  136,811,072
  136,812,366
  136,812,617
  136,812,789
  136,813,334
  136,814,818
  136,815,737
  136,815,762
  136,815,911
  136,816,024
  136,816,908
  136,817,205
  136,818,026
  136,818,029
  136,818,118
  136,818,283
  136,820,499
  136,820,501
  136,821,579
  136,822,074
  136,822,280
  136,823,270
  136,823,340
  136,823,848
  136,824,635
  136,824,802
  136,825,133
  136,825,185
  136,825,928
  136,826,434
  136,826,615
  136,827,924
  136,827,968
  136,828,014
  136,828,181
  136,828,268
  136,828,278
  136,828,285
  136,828,297
  136,828,374
  136,828,376
  136,828,499
  136,828,541
  136,828,581
  136,828,603
  136,828,607
  136,828,614
  136,828,888
  136,829,275
  136,829,354
  136,829,974
  136,830,854
  136,830,856
  136,830,970
  136,831,442
  136,831,471
  136,831,475
  136,831,528
  136,831,628
  136,831,702
  136,831,753
  136,831,779
  136,831,792
  136,831,810
  136,831,905
  136,832,000
  136,832,093
  136,832,405
  136,832,910
  136,832,971
  136,833,079
  136,833,085
  136,833,128
  136,833,331
  136,833,390
  136,833,650
  136,833,805
  136,834,240
  136,834,266
  136,834,362
  136,834,373
  136,834,395
  136,834,721
  136,835,841
  136,836,082
  136,836,262
  136,836,319
  136,836,369
  136,836,766
  136,837,302
  136,837,366
  136,837,459
  136,837,677
  136,837,723
  136,837,747
  136,837,807
  136,837,940
  136,837,989
  136,838,038
  136,838,278
  136,838,334
  136,838,795
  136,838,940
  136,839,950
  136,840,272
  136,840,406
  136,840,642
  136,841,366
  136,842,860
  136,843,164
  136,843,366
  136,843,399
  136,843,427
  136,843,456
  136,843,782
  136,844,128
  136,844,351
  136,844,466
  136,844,764
  136,844,886
  136,845,261
  136,845,925
  136,846,092
  136,846,925
  136,846,929
  136,847,464
  136,847,660
  136,850,484
  136,852,581
  136,852,979
  136,853,454
  136,853,897
  136,853,903
  136,853,913
  136,853,915
  136,854,594
  136,856,645
  136,858,141
  136,858,186
  136,858,481
  136,859,708
  136,859,721
  136,860,503
  136,861,128
  136,862,040
  136,862,998
  136,864,028
  136,864,923
  136,868,561
  136,869,042
  136,869,538
  136,869,847
  136,870,299
  136,870,351
  136,870,361
  136,870,388
  136,870,817
  136,871,166
  136,871,219
  136,871,252
  136,871,274
  136,871,277
  136,871,296
  136,871,318
  136,871,495
  136,871,780
  136,872,546
  136,872,868
  136,872,937
  136,872,963
  136,873,011
  136,873,273
  136,873,282
  136,873,635
  136,873,709
  136,873,754
  136,873,942
  136,874,079
  136,874,131
  136,874,204
  136,874,260
  136,874,269
  136,874,322
  136,874,418
  136,874,633
  136,874,943
  136,875,057
  136,875,223
  136,875,353
  136,875,435
  136,875,447
  136,875,641
  136,875,659
  136,875,673
  136,875,679
  136,875,721
  136,875,776
  136,875,828
  136,876,361
  136,876,512
  136,876,516
  136,876,681
  136,876,753
  136,877,032
  136,877,927
  136,880,930
  136,881,328
  136,881,914
  136,882,112
  136,882,256
  136,882,639
  136,882,985
  136,883,739
  136,883,984
  136,887,180
  136,889,187
  136,889,650
  136,890,092
  136,890,559
  136,891,357
  136,891,451
  136,896,473
  136,899,163
  136,900,722
  136,901,055
  136,903,005
  136,904,278
  136,905,024
  136,905,718
  136,906,175
  136,906,461
  136,908,092
  136,908,501
  136,909,600
  136,909,787
  136,910,177
  136,911,465
  136,911,740
  136,912,558
  136,912,559
  136,912,766
  136,912,791
  136,912,956
  136,914,256
  136,914,710
  136,915,397
  136,915,724
  136,915,951
  136,916,544
  136,916,644
  136,917,221
  136,917,313
  136,917,549
  136,917,843
  136,917,856
  136,917,876
  136,917,924
  136,918,013
  136,918,478
  136,918,887
  136,919,055
  136,919,076
  136,919,150
  136,919,219
  136,919,389
  136,920,308
  136,920,942
  136,921,028
  136,921,525
  136,922,186
  136,922,457
  136,922,489
  136,922,923
  136,923,162
  136,923,444
  136,923,523
  136,923,687
  136,923,880
  136,924,560
  136,925,219
  136,925,312
  136,925,749
  136,925,751
  136,926,167
  136,926,981
  136,926,983
  136,928,064
  136,928,322
  136,928,556
  136,928,804
  136,929,024
  136,929,929
  136,929,996
  136,930,697
  136,930,737
  136,930,849
  136,931,122
  136,931,255
  136,931,539
  136,931,656
  136,931,846
  136,932,235
  136,933,484
  136,933,736
  136,934,092
  136,935,534
  136,936,657
  136,937,260
  136,938,106
  136,939,229
  136,940,418
  136,941,505
  136,941,924
  136,942,235
  136,942,598
  136,942,784
  136,943,067
  136,943,079
  136,943,898
  136,946,008
  136,946,009
  136,946,586
  136,948,191
  136,948,192
  136,948,322
  136,948,370
  136,948,460
  136,948,559
  136,948,638
  136,948,782
  136,948,787
  136,948,848
  136,948,879
  136,948,962
  136,949,055
  136,949,155
  136,949,157
  136,949,268
  136,949,269
  136,949,316
  136,949,440
  136,949,454
  136,949,473
  136,949,539
  136,949,625
  136,949,680
  136,949,740
  136,949,750
  136,949,770
  136,949,776
  136,949,778
  136,949,783
  136,949,788
  136,949,792
  136,949,801
  136,949,802
  136,949,813
  136,949,826
  136,949,987
  136,950,026
  136,950,061
  136,950,279
  136,950,404
  136,950,438
  136,951,059
  136,951,175
  136,951,204
  136,951,227
  136,951,369
  136,951,373
  136,951,612
  136,951,761
  136,951,815
  136,951,823
  136,952,020
  136,952,147
  136,952,774
  136,953,133
  136,953,341
  136,953,410
  136,953,776
  136,954,532
  136,954,654
  136,954,864
  136,954,930
  136,955,092
  136,955,263
  136,955,296
  136,955,434
  136,955,505
  136,955,628
  136,955,632
  136,955,744
  136,955,746
  136,955,799
  136,955,803
  136,956,268
  136,957,006
  136,957,376
  136,957,540
  136,957,809
  136,957,917
  136,958,122
  136,958,211
  136,958,278
  136,958,519
  136,958,720
  136,958,946
  136,958,948
  136,961,583
  136,962,397
  136,962,401
  136,962,477
  136,962,926
  136,964,686
  136,965,429
  136,967,941
  136,968,038
  136,969,138
  136,969,354
  136,969,804
  136,969,831
  136,969,899
  136,970,023
  136,970,516
  136,971,891
  136,972,033
  136,972,698
  136,973,360
  136,973,412
  136,973,958
  136,974,377
  136,975,433
  136,975,619
  136,975,652
  136,976,113
  136,976,820
  136,979,020
  136,979,057
  136,979,176
  136,979,353
  136,979,436
  136,981,535
  136,982,243
  136,982,830
  136,983,759
  136,984,892
  136,986,707
  136,986,985
  136,987,506
  136,987,529
  136,987,536
  136,987,586
  136,987,855
  136,992,758
  136,992,759
  136,992,761
  137,003,588
  137,009,090
  137,012,109
  137,012,110
  137,012,112
  137,012,113
  137,015,558
  137,028,042
  137,032,699
  137,033,661
  137,033,665
  137,033,694
  137,033,796
  137,033,805
  137,033,816
  137,033,820
  137,033,826
  137,033,840
  137,033,844
  137,046,524
  137,051,276
  137,054,429
  137,059,756
  137,059,867
  137,059,872
  137,059,920
  137,067,545
-
T
C
A
-
C
C
C
T
C
G
A
2
G
G
G
C
-
2
T
G
2
G
6
2
2
3
-
C
A
C
G
A
G/15
T/-
-
-
C
A
A
C
G
2
G
C
T
A
A
G
G
T
T
G
3
-
C
A
C
G
T
5/23
2/-
G
C
T
T
C
T
C
T
T
-
T
G
G
C
G
C
G
A
2
T
-
C
15
T
G
A
C
T
4/-
-
2
C
C
T
-
A
A
C
T
-
T
G
G
-
T
T
-
132/-
2/-
A/G
3
A
A
-
7
A
-
-
T
C
G
2
A
4/-
2/-
T
T
C
T
T
2
G
T/G
A
T
T
A
A
-
A
T
7
-
-
C
C
-
G
G
G
G
T
C
-
-
2
G
C
T
G
A
A
T
A
-
A
A
G
A
G
A
T
A
A
G
G
7/9
C
G
A
A
3
G
-
T
C
G
C
T
G
T
T
A
G
A
-
T
T
11
T
T
T
A
C
C
-
C
C
T
G/5
2/-
3/9
A
9
A
-
G
A
A
T
C
A
G
T
G
G
A
T
C
A
A
T
-
T
-
-
G
A
C
T
T
2
A
-
A
T
T/C
36/-
G
A
T
C
C
-
5
G
4
T
C
C
A
2
A
C
C
C
A
10/-
-
C/T
A
T
G
A
C
A
C
2
C
3
2
C
C
C
C
-
14
-
A
T
C
4/-
C/4
5
-
C
-
3/AC
-
9
2
T
-
C
2
G
2
G
C
C
2/-
C/-
C
G
2
C
A
A
C
G
T
T
T
T
G
C
T
T
C
-
76
2
C
2
T/-
T
-
A
C
G
T
4/-
G
3
C
C
C
G
A
C
G
5
A
A
G
G
6/-
4/-
G
45
3
-
T
-
-
T
T
T
T
A
G
T
-
G
C
6
G
A
C
G
C
C
T
2
G
6
G
T
A
G
A
-
5/-
A
3
A/-
T
A
G
G
T
A
T
T
C
C
A
T
G
A
C
G
G
A
A
A
C
C
-
2
-
2
T
2
G
2
A
G
G
A
G
A
A
C
-
2
T
T
T
3
G
T
C
G
C
A
T
A
G
G
A
4
C
A
T
T
C
T
2
G
T
C
T
C
C
A
2/-
6/-
2
T
T
T
G
A
G
G
G
C
G
16/-
14/-
T
G
C
C
C
G
G
C
T
G
C
C
T
20/-
21
A
G
G
2
3
2
A
T
A
A
-
T
A
C
A
A
-
2
A
2
G
A
T
A
G
G
A
A
T
T
G/5
4/-
2/-
10
-
T
T
-
T
C/-
3/-
2
-
-
-
-
-
3
-
C
2
T
A/-
2/-
2
-
A
A
-
G/2