Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 98,812 (bp)   Positions: 271
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.001
.003
.0
.012
.004
.033
.002
.002
.011
.148
.006
.002
.01
--
--
--
--
.492
.545
.591
.679
.02
.023
.378
.017
.001
.014
.995
.014
.01
.885
.001
.019
--
.773
--
.004
--
--
--
--
--
--
--
.706
.052
.0
.021
.044
.004
.001
.0
.0
.0
.018
.136
--
--
.026
.024
.001
.001
.484
.003
.014
.001
.003
.001
.002
.0
.006
.12
.029
.001
.836
.846
.843
.838
.834
.833
.851
.899
.065
.027
.004
.08
.003
.002
.001
.02
.014
.003
.027
.006
.065
.079
.061
.0
.013
.007
.994
.024
.034
.067
.994
.0
.002
.006
.162
.003
.081
.0
.019
.025
.451
.104
.003
.005
.808
.146
.169
.402
.045
.022
--
--
.237
.023
--
.029
.296
.005
.281
.297
.337
.222
.007
.987
.268
.001
.019
.006
.0
.06
.073
.058
.001
.003
.008
.119
.102
.004
.053
.007
.0
.412
.59
.565
.0
.002
.379
.01
.001
.0
.007
.063
.013
.023
--
--
--
--
--
--
--
.005
.006
.0
.888
.002
--
--
--
--
.027
.166
.167
.004
.526
.004
.027
.001
.327
.575
.229
.256
.739
.06
.001
.061
.031
.088
.28
.36
.053
.002
.001
.006
.004
--
--
--
--
.003
.029
.006
.0
.0
.0
.025
.435
.019
.918
.012
.616
.59
.57
.321
--
--
--
.09
.094
.024
.001
.001
.012
.391
.978
.023
.0
.009
.003
.007
.001
.001
.021
.07
.0
.002
.026
.0
.019
.002
.0
.001
.003
.01
--
--
--
--
--
.018
.836
.04
.998
.0
.0
.126
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Rasgrp3
Rasgrp3
Rasgrp3
Rasgrp3
Rasgrp3
Rasgrp3
Rasgrp3
Rasgrp3
Rasgrp3
Rasgrp3
Rasgrp3
Rasgrp3
Rasgrp3
Rasgrp3
Rasgrp3
Rasgrp3
Rasgrp3
Rasgrp3
Rasgrp3
Rasgrp3
Rasgrp3
Rasgrp3
Rasgrp3
Rasgrp3
Rasgrp3
Rasgrp3
Rasgrp3
Rasgrp3
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
A
C
G
A
G
G
A
A
C
C
C
C
8
A
5
C
G
10
C
A
C
G
T
C
C
C
G
G
A
C
A
G
C
A
A
G
C
A
T
C
C
A
4
2
A
C
T
A
A
G
16
C
G
G
A
G
A
T
C
T
T
T
C
G
G
A
T
T
G
G
G
G
G
A
A
A
A
G
G
G
T
A
2
G
T
A
A
T
C
A
A
T
A
T
T
T
A
G
T
C
A
A
T
C
T
14
A
G
C
G
C
T
A
T
G
3
T
A
A
A
C
C
C
G
3
A
T
C
T
C
C
A
A
8
4
T
4
G
T
G
C
A
T
2
T
C
A
A
G
G
4
A
8
T
C
A
12
10
A
T
G
A
A
T
T
G
G
G
T
5
A
C
T
2
A
A
C
T
G
G
C
T
A
14
C
G
2
G
2
T
G
C
C
A
T
6
T
C
A
A
A
A
A
T
A
A
C
T
A
T
C
A
T
6
3
C
A
G
A
G
4
C
A
8
2
A
T
G
T
C
C
T
T
T
A
A
C
G
A
A
A
G
A
T
G
C
A
T
A
3
G
C
T
G
C
A
G
G
6
G
A
A
A
A
C
G
T
T
C
C
G
  30,966,494
  30,966,822
  30,967,097
  30,967,150
  30,967,407
  30,967,451
  30,967,496
  30,967,823
  30,968,284
  30,968,381
  30,968,705
  30,968,802
  30,968,813
  30,968,856
  30,968,868
  30,968,919
  30,968,931
  30,969,218
  30,969,277
  30,969,280
  30,969,314
  30,969,451
  30,969,538
  30,969,684
  30,969,902
  30,969,968
  30,970,227
  30,970,341
  30,970,722
  30,970,870
  30,970,984
  30,971,731
  30,971,885
  30,972,168
  30,972,738
  30,973,555
  30,974,296
  30,975,755
  30,975,841
  30,976,262
  30,976,649
  30,976,695
  30,976,880
  30,976,906
  30,977,386
  30,977,632
  30,977,792
  30,977,975
  30,978,792
  30,979,612
  30,980,449
  30,980,943
  30,981,262
  30,983,157
  30,983,374
  30,983,452
  30,983,602
  30,983,787
  30,984,072
  30,984,184
  30,984,312
  30,984,487
  30,984,512
  30,984,535
  30,984,593
  30,984,654
  30,984,735
  30,984,749
  30,984,775
  30,984,815
  30,985,109
  30,985,141
  30,985,350
  30,985,549
  30,985,741
  30,985,751
  30,985,752
  30,985,754
  30,985,756
  30,985,758
  30,985,768
  30,985,777
  30,985,951
  30,986,099
  30,986,251
  30,986,639
  30,986,688
  30,986,767
  30,988,409
  30,991,301
  30,991,691
  30,992,203
  30,992,271
  30,992,484
  30,993,567
  30,993,583
  30,993,608
  30,994,595
  30,994,633
  30,994,997
  30,995,599
  30,995,724
  30,996,601
  30,996,636
  30,997,242
  30,998,873
  30,999,917
  30,999,962
  31,000,367
  31,000,574
  31,001,182
  31,002,709
  31,004,050
  31,005,250
  31,006,591
  31,006,843
  31,009,288
  31,009,289
  31,010,312
  31,010,324
  31,011,024
  31,011,763
  31,011,796
  31,012,683
  31,013,553
  31,013,595
  31,013,654
  31,014,153
  31,014,619
  31,015,139
  31,016,876
  31,017,243
  31,018,748
  31,018,749
  31,018,753
  31,019,334
  31,019,358
  31,019,847
  31,020,415
  31,020,628
  31,020,817
  31,021,610
  31,022,337
  31,023,745
  31,023,746
  31,024,190
  31,024,461
  31,024,592
  31,025,402
  31,025,614
  31,026,619
  31,026,866
  31,026,904
  31,027,027
  31,027,582
  31,028,260
  31,029,372
  31,029,374
  31,030,769
  31,032,131
  31,032,875
  31,033,324
  31,033,396
  31,033,866
  31,033,954
  31,034,507
  31,034,886
  31,035,092
  31,036,070
  31,036,175
  31,036,316
  31,036,769
  31,037,462
  31,037,475
  31,040,671
  31,040,791
  31,040,965
  31,041,591
  31,042,317
  31,043,873
  31,045,665
  31,045,680
  31,047,600
  31,048,112
  31,048,486
  31,048,730
  31,048,731
  31,048,785
  31,049,006
  31,049,556
  31,050,228
  31,050,407
  31,051,120
  31,051,154
  31,051,502
  31,051,534
  31,051,615
  31,051,727
  31,051,865
  31,051,991
  31,052,200
  31,052,395
  31,053,316
  31,053,767
  31,053,893
  31,053,991
  31,054,216
  31,054,224
  31,054,384
  31,054,386
  31,055,142
  31,055,145
  31,055,146
  31,055,235
  31,055,238
  31,055,555
  31,055,713
  31,055,825
  31,055,902
  31,055,993
  31,056,246
  31,056,421
  31,056,618
  31,056,724
  31,056,802
  31,056,847
  31,056,850
  31,056,898
  31,057,289
  31,057,317
  31,057,347
  31,057,596
  31,057,732
  31,057,832
  31,057,851
  31,058,093
  31,058,759
  31,058,992
  31,059,237
  31,059,868
  31,060,096
  31,060,187
  31,060,245
  31,060,325
  31,060,409
  31,060,413
  31,060,577
  31,060,705
  31,060,809
  31,061,059
  31,061,082
  31,061,127
  31,061,451
  31,061,509
  31,061,806
  31,061,830
  31,061,831
  31,062,650
  31,063,295
  31,063,454
  31,063,726
  31,063,730
  31,063,733
  31,063,736
  31,063,868
  31,063,979
  31,064,128
  31,064,451
  31,064,550
  31,064,568
  31,064,796
T
G
A
G
A
-
G
3
A
T
T
G
-
T
-
C/2
A
-
T
C
3
C
A
A
T
T
T
C
G
T
G
C
A
A/-
G
C
T
2
G
T
T
T
-
-
-
A
C
G
9
A
16/-
T
C
-
-
A
3
C
T
G
C
C
A
C
-
G
5
C
A
T
A
A
A
T
7
2
14
C
C
C
C
3
-
T
2
G
G
5
-
C
G
3
G
C
C
C
G
T
-
T
-
-
C
2
C
-
G
A
A
A
A
A
T
2
T
-
G
G
G
-
3
5
4
A
-
12
A
T
2
T
A
C
A/5
8/-
4/-
C
-
A
T/3
T
T
A/3
-
2/-
-
2
G
G
-
A
-
C
-
2
A
-
12/-
-
2
C
A
G
T
C
C
C
T
A
2
-
C
C/-
A
-
A/8
-
T
A
C
A
T
-
T
14/-
G
G/7
2/-
7
-
C
A
T
A
G
C
-
G
-
G
G
2
-
G
C
G
G
T
C
14
-
4
C
5
6/-
3/-
A
G
A
G
A
-
T
G
-
-
G
4
G/3
11
7
T
2
C
C
C
-
G
A
5
15
3
T
G
A
T
T
-
A
T
-
C
A
A
A
T
G
A
T
-
C
3
C
C
C
T
C
C
C
T
A
A