Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 24,050 (bp)   Positions: 198
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.009
.0
.0
.003
.011
.001
.002
.002
.022
.013
.001
.0
.001
.009
.001
.001
.0
.0
.001
.001
.001
.019
.022
.029
.029
.02
.0
.0
.001
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.005
.001
.002
.004
.0
.001
.009
.031
.001
.045
.018
.004
.0
.0
.018
.0
.0
.002
.0
.0
.001
.005
.004
.006
.021
.002
.003
.013
.062
.001
.005
.158
.967
.001
.001
.0
.002
.0
.001
.007
.007
.003
.001
.0
.0
.0
.053
.053
.07
.164
.793
.992
.999
.995
.991
.746
.581
.195
.182
.033
.958
.972
.972
1.0
.996
.714
.647
.974
.921
.954
.991
1.0
1.0
1.0
1.0
.972
.996
.986
.803
.001
.992
.999
.992
.994
.998
.983
.949
.954
.995
1.0
.009
.011
.07
.246
.301
.123
.153
.138
.016
.001
.0
.02
.117
.199
.881
.871
.308
.0
.002
.003
.002
.006
.0
.001
.034
.005
.001
.001
.11
.063
.004
.001
.008
.006
.001
.005
.201
.27
.982
.31
.226
.146
.189
.949
.018
.005
.687
.021
.006
.0
.014
.0
.001
.137
.014
.007
.014
.041
.0
.009
.0
.0
.0
.059
.941
.933
.65
.0
.0
.0
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
RT1-CE7
RT1-CE7
RT1-CE7
RT1-CE7
RT1-CE7
RT1-CE7
RT1-CE7
RT1-CE7
RT1-CE7
RT1-CE7
RT1-CE7
RT1-CE7
RT1-CE7
RT1-CE7
RT1-CE7
RT1-CE7
RT1-CE7
RT1-CE7
RT1-CE7
RT1-CE7
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
A
C
C
A
C
C
T
A
C
C
A
A
C
T
T
A
C
A
G
T
A
G
C
T
G
9
T
C
A
C
T
T
G
T
T
A
C
A
A
T
G
A
G
A
T
G
A
A
C
T
C
C
C
T
G
C
T
A
G
C
C
C
T
C
C
T
T
T
A
T
A
T
T
T
G
T
C
G
G
C
A
G
A
G
A
C
A
5
A
C
A
A
C
T
A
T
T
C
A
C
C
C
A
C
A
G
G
A
T
G
C
G
C
G
G
C
G
T
C
C
C
C
C
G
G
G
C
C
G
T
T
T
A
A
A
G
2
T
T
A
T
C
A
C
C
T
A
C
T
C
A
C
G
T
T
A
3
G
A
T
T
C
G
T
C
C
A
A
G
G
C
A
G
C
T
T
C
T
C
G
A
A
G
A
C
T
G
T
G
G
G
C
G
G
G
A
A
C
  6,755,289
  6,755,300
  6,755,304
  6,755,352
  6,755,419
  6,755,428
  6,755,460
  6,755,470
  6,755,622
  6,755,634
  6,755,645
  6,755,656
  6,755,666
  6,755,671
  6,755,680
  6,755,685
  6,755,892
  6,755,893
  6,755,899
  6,755,911
  6,755,913
  6,755,919
  6,755,920
  6,755,926
  6,755,927
  6,755,934
  6,755,945
  6,755,950
  6,755,951
  6,755,956
  6,755,958
  6,755,962
  6,755,963
  6,755,967
  6,755,977
  6,755,987
  6,756,115
  6,756,139
  6,756,140
  6,756,143
  6,756,144
  6,756,147
  6,756,148
  6,756,158
  6,756,175
  6,756,411
  6,756,425
  6,757,532
  6,757,535
  6,757,536
  6,757,537
  6,757,541
  6,757,556
  6,757,557
  6,757,572
  6,757,573
  6,757,578
  6,757,580
  6,757,589
  6,757,590
  6,757,593
  6,757,598
  6,757,604
  6,757,607
  6,757,717
  6,757,728
  6,757,734
  6,757,735
  6,757,741
  6,757,748
  6,757,813
  6,757,837
  6,757,841
  6,757,847
  6,758,389
  6,758,450
  6,758,465
  6,758,466
  6,758,468
  6,758,478
  6,758,485
  6,758,486
  6,758,488
  6,758,507
  6,758,509
  6,758,519
  6,766,051
  6,766,085
  6,766,104
  6,766,115
  6,766,120
  6,766,123
  6,766,142
  6,766,159
  6,766,167
  6,766,168
  6,766,365
  6,766,401
  6,766,430
  6,766,431
  6,766,455
  6,766,471
  6,766,498
  6,766,646
  6,766,662
  6,766,711
  6,766,717
  6,766,732
  6,766,753
  6,766,754
  6,766,755
  6,766,761
  6,766,777
  6,766,784
  6,766,791
  6,766,795
  6,766,804
  6,766,837
  6,766,842
  6,766,851
  6,766,857
  6,766,860
  6,766,863
  6,766,870
  6,766,876
  6,766,879
  6,766,884
  6,766,931
  6,766,943
  6,766,953
  6,766,962
  6,766,967
  6,775,899
  6,775,901
  6,775,903
  6,775,922
  6,775,946
  6,776,332
  6,776,339
  6,776,344
  6,776,350
  6,776,370
  6,776,372
  6,776,393
  6,776,400
  6,776,423
  6,776,523
  6,776,535
  6,776,542
  6,776,553
  6,776,565
  6,776,578
  6,776,588
  6,776,803
  6,776,806
  6,776,822
  6,776,838
  6,776,845
  6,776,849
  6,776,852
  6,777,007
  6,777,013
  6,777,018
  6,777,032
  6,777,033
  6,777,043
  6,777,050
  6,777,051
  6,777,055
  6,777,058
  6,777,086
  6,777,337
  6,777,348
  6,778,327
  6,778,343
  6,778,347
  6,778,369
  6,778,414
  6,778,424
  6,778,425
  6,778,467
  6,778,479
  6,778,489
  6,778,490
  6,778,517
  6,778,764
  6,778,780
  6,778,788
  6,778,801
  6,778,805
  6,778,978
  6,779,006
  6,779,009
  6,779,013
  6,779,199
  6,779,257
  6,779,263
  6,779,315
A/G
C/T
C/T
A/T
C/T
C/G
T/C
A/T
C/A
C/A
A/-
A/G
C/T
T/A
T/G
A/T
C/G
A/C
G/C
T/4
A/C
G/T
C/T
T/C
G/A
9/-
T/G
C/G
A/G
C/A
T/G
T/C
G/A
T/A
T/C
A/G
C/T
A/T
A/G
T/A
G/A
A/C
G/A
A/G
T/C
G/A
A/G
A/G
C/T
T/G
C/T
C/T
C/G
T/C
G/C
C/G
T/C
A/C
G/C
C/T
C/T
C/G
T/C
C/T
C/T
T/A
T/C
T/C
A/T
T/A
A/C
T/G
T/G
T/G
G/C
T/C
C/A
G/A
G/C
C/G
A/C
G/C
A/G
G/C
A/C
C/T
A/T
5/-
A/G
C/A
A/G
A/G
C/T
T/G
A/G
T/C
T/C
C/A
A/G
C/A
C/T
C/T
A/C
C/G
A/G
G/A
G/A
A/C
T/C
G/C
C/G
G/C
C/G
G/A
G/A
C/T
G/A
T/A
C/T
C/T
C/G
C/T
C/G
G/A
G/T
G/C
C/G
C/T
G/A
T/G
T/G
T/C
A/4
A/5
A/-
G/T
2/-
T/G
T/C
A/G
T/C
C/T
A/C
C/T
C/T
T/C
G/C
C/G
T/G
C/T
A/C
C/A
G/A
T/C
T/C
A/C
3/-
G/4
A/T
T/7
T/C
C/G
G/A
T/C
C/A
C/A
A/T
A/G
G/A
G/C
C/T
A/T
G/T
C/G
T/C
T/C
C/T
T/C
C/A
G/A
A/G
A/G
G/T
A/G
C/A
T/C
G/A
T/C
G/C
G/T
G/C
C/T
G/T
G/-
G/C
A/G
A/C
C/G