Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 1,191,090 (bp)   Positions: 203
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.103
--
.219
--
.008
.484
.464
.018
.243
.003
.051
.0
.002
.001
.0
.005
.005
.004
.0
.002
--
.001
--
--
.001
.001
.244
.203
.0
.001
--
--
.0
.0
.078
.103
--
.165
--
--
.004
.062
.671
.197
--
--
--
.174
.406
.003
.009
--
.0
.029
--
--
--
.033
.014
.416
--
.005
.261
.252
.137
.07
.021
.004
.002
.003
.003
.001
.041
.06
.002
.035
.032
.063
.017
--
.0
.0
.0
.0
.001
.0
.0
.212
.319
.339
.128
.052
.039
.033
.023
--
--
.605
.264
.351
.974
--
--
.011
.101
.006
.009
.06
.002
.001
.006
.094
.023
.01
.263
.004
.129
.0
.355
.061
.365
.127
--
.802
.592
.684
.312
.118
.13
.133
.001
.004
--
--
--
.002
.015
.001
.015
.008
--
--
.022
.0
.0
.001
.007
.689
.0
.008
.054
--
.059
.804
.983
.012
.003
.005
.001
.026
.169
.001
.005
.02
.033
.05
.005
.006
.182
--
--
.012
.014
.012
.025
.185
.191
.195
.06
.333
.372
.002
--
--
--
.089
.001
--
--
.78
.933
.001
--
.001
--
--
.0
.02
.029
.551
.566
.032
.036
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
C
T
C
60
2
G
A
2
A
A
A
G
G
A
T
T
T
G
C
C
2
G
2
A
C
3
G
C
A
T
3
47
2
T
G
2
T
T
G
2
G
C
2
2
C
C
G
2
2
T
A
T
A
4
G
2
T
2
A
2
2
23
A
G
G
G
G
G
G
G
G
G
G
G
G
2
A
T
G
A
C
C
3
G
C
G
C
A
G
2
A
A
A
T
G
G
C
2
A
2
2
A
C
2
4
A
3
C
C
2
2
T
2
2
T
4
C
4
2
A
4
2
2
2
A
2
2
4
A
2
A
T
G
4
2
2
A
4
C
G
2
T
3
T
T
C
2
C
G
2
2
G
2
2
A
A
2
2
3
T
C
2
A
A
C
G
C
T
2
A
C
2
C
A
G
G
C
G
A
4
2
4
T
2
2
40
2
T
G
G
A
C
C
G
3
A
6
4
2
2
T
2
T
  49,693,348
  49,713,934
  49,749,588
  49,758,748
  49,759,004
  49,779,523
  49,779,527
  49,780,315
  49,798,020
  49,798,027
  49,798,037
  49,809,055
  49,809,062
  49,809,066
  49,809,068
  49,809,074
  49,809,075
  49,809,079
  49,809,086
  49,822,006
  49,840,056
  49,842,902
  49,845,565
  49,849,506
  49,854,692
  49,854,693
  49,857,924
  49,857,928
  49,858,346
  49,858,347
  49,868,349
  49,868,917
  49,876,798
  49,876,799
  49,887,255
  49,892,311
  49,898,241
  49,909,307
  49,913,138
  49,913,153
  49,918,762
  49,921,141
  49,929,872
  49,929,924
  49,931,075
  49,931,132
  49,931,304
  49,936,876
  49,936,906
  49,946,828
  49,956,288
  49,959,407
  49,988,608
  49,997,503
  50,024,008
  50,024,010
  50,038,668
  50,045,400
  50,050,629
  50,050,648
  50,050,876
  50,051,079
  50,051,113
  50,051,114
  50,051,120
  50,051,124
  50,051,128
  50,051,130
  50,051,132
  50,051,134
  50,051,142
  50,051,146
  50,051,154
  50,051,162
  50,051,207
  50,058,052
  50,068,330
  50,068,346
  50,069,026
  50,073,988
  50,075,398
  50,075,399
  50,075,403
  50,075,405
  50,075,464
  50,075,468
  50,078,932
  50,081,114
  50,085,215
  50,088,329
  50,096,832
  50,096,889
  50,096,952
  50,096,954
  50,111,107
  50,122,725
  50,122,776
  50,156,497
  50,159,744
  50,173,182
  50,177,324
  50,184,580
  50,203,333
  50,208,558
  50,213,267
  50,213,722
  50,213,728
  50,213,749
  50,217,848
  50,232,024
  50,243,296
  50,248,969
  50,257,907
  50,259,335
  50,272,685
  50,277,905
  50,284,140
  50,286,021
  50,293,803
  50,306,354
  50,306,412
  50,328,991
  50,350,273
  50,357,016
  50,372,109
  50,389,561
  50,397,142
  50,410,158
  50,451,407
  50,451,416
  50,454,394
  50,468,809
  50,471,283
  50,479,696
  50,479,698
  50,487,493
  50,505,115
  50,515,082
  50,527,285
  50,527,644
  50,529,025
  50,529,026
  50,545,829
  50,545,922
  50,551,867
  50,553,137
  50,580,018
  50,583,224
  50,583,544
  50,586,613
  50,589,405
  50,590,254
  50,596,240
  50,601,558
  50,603,982
  50,617,490
  50,624,497
  50,625,011
  50,632,892
  50,632,894
  50,657,081
  50,675,441
  50,676,086
  50,676,097
  50,676,103
  50,676,109
  50,676,127
  50,676,128
  50,677,230
  50,697,198
  50,713,870
  50,715,656
  50,720,895
  50,730,728
  50,739,847
  50,739,918
  50,739,922
  50,739,925
  50,739,981
  50,752,622
  50,752,624
  50,765,538
  50,773,682
  50,773,695
  50,784,172
  50,794,979
  50,811,471
  50,813,774
  50,813,782
  50,814,450
  50,814,470
  50,831,692
  50,838,106
  50,840,269
  50,847,170
  50,847,221
  50,847,568
  50,847,570
  50,851,577
  50,855,960
  50,858,556
  50,861,281
  50,872,968
-
3
3
60/-
2/-
8
4
2/-
2
2
97
2
-
G
A
2
C
A
A
2
2/-
G/2
-
A/3
C/8
3/-
-
A
T
A
3/-
-
2/-
-
A
2/-
4
T/-
G/7
2/-
9
-
-
-
T
2
C
2/-
2/-
63
3
2
-
4/-
G/2
2/-
T/3
2/-
A/3
2/-
2/-
-
T
G/5
C
A
T
A
T
C
6
C
A
T
T
2/-
3
2
2
A/-
3
2
-
15
-
A
-
10
7
2/-
2
A/-
A/3
T/-
22
-
-
-
3
-
-
A/3
A
2/-
-
A/4
3/-
C/-
C/5
2/-
2/-
T/3
-
2/-
T/C
-
2
4/-
2/-
A/7
4/-
2/-
2/-
2/-
A/-
2/-
2/-
4/-
A/3
2/-
T
2
G/-
4/-
2/-
2/-
5
-
C/2
G/7
2/-
T/-
-
2
5
-
2/-
4
2
2/-
2/-
C
2/-
-
A/2
A/3
2/-
2/-
-
3
C/2
2/-
T
T
T
T
-
G
2/-
A/-
5/9
2/-
C/-
A/-
2
12
50
17
3
4/-
2/-
4/-
T/3
2/-
2/-
40/-
2/-
57
-
-
G
-
4
7
3/-
2
6/-
4/-
2/-
2/-
-
-
2