Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 1,191,090 (bp)   Positions: 180
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.103
--
.008
.484
.464
.018
.243
.003
.051
.795
.0
.002
.001
.0
.005
.005
.004
.0
.002
.0
--
.001
.287
.001
--
.244
.203
.044
.0
.001
.01
--
.078
.103
--
.002
.14
.045
.062
.174
.406
.003
.009
.0
.001
.416
.261
.252
.137
.07
.021
.004
.002
.003
.003
.001
.041
.06
.002
.032
.063
.017
--
.0
.0
.0
.0
.001
.0
.0
.212
.319
.346
.339
.007
.02
.054
.128
.051
.052
.023
--
--
.264
.063
--
--
--
.002
.006
.009
.06
.002
.002
.007
.006
.094
.129
.023
.263
.01
.07
.129
.0
.355
--
.005
--
--
--
--
--
.143
.802
.592
.015
.817
.133
.001
.213
.004
--
--
.178
.154
.022
.0
.001
.014
.007
.689
.0
.054
--
.059
.681
.804
.983
.275
.009
.036
.003
.001
.026
.015
.001
--
.005
.02
.033
.05
.005
.006
--
.025
.185
.191
.195
.06
.333
.372
.007
.089
.001
--
--
.78
.933
.938
.971
.011
.001
--
.001
--
--
--
.553
.566
.036
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
Prkn
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
C
T
2
G
A
2
A
A
A
2
G
G
A
T
T
T
G
C
C
G
2
G
2
C
2
G
C
C
A
T
2
47
G
2
3
2
A
T
C
2
2
T
A
A
4
2
A
G
G
G
G
G
G
G
G
G
G
G
G
A
T
G
A
C
C
3
G
C
G
C
A
G
G
2
2
2
A
A
C
A
G
G
C
A
T
T
A
C
2
A
3
C
2
C
A
2
T
2
2
T
6
2
C
4
2
C
6
A
6
G
A
T
T
2
A
T
2
2
A
T
T
G
2
2
C
3
T
G
2
2
C
G
2
G
2
4
2
A
2
2
2
2
3
T
2
2
2
A
A
C
G
C
T
7
G
G
C
G
A
4
2
T
40
2
T
G
G
A
G
G
C
C
C
G
T
3
A
G
T
T
  49,693,348
  49,713,934
  49,759,004
  49,779,523
  49,779,527
  49,780,315
  49,798,020
  49,798,027
  49,798,037
  49,798,185
  49,809,055
  49,809,062
  49,809,066
  49,809,068
  49,809,074
  49,809,075
  49,809,079
  49,809,086
  49,822,006
  49,822,018
  49,839,951
  49,842,902
  49,848,556
  49,854,692
  49,856,504
  49,857,924
  49,857,928
  49,858,079
  49,858,346
  49,858,347
  49,858,858
  49,868,917
  49,887,255
  49,892,311
  49,898,257
  49,912,090
  49,916,166
  49,919,637
  49,921,141
  49,936,876
  49,936,906
  49,946,828
  49,956,288
  49,988,608
  50,024,951
  50,050,648
  50,051,113
  50,051,114
  50,051,120
  50,051,124
  50,051,128
  50,051,130
  50,051,132
  50,051,134
  50,051,142
  50,051,146
  50,051,154
  50,051,162
  50,051,207
  50,068,330
  50,068,346
  50,069,026
  50,073,988
  50,075,398
  50,075,399
  50,075,403
  50,075,405
  50,075,464
  50,075,468
  50,078,932
  50,081,114
  50,085,215
  50,088,328
  50,088,329
  50,091,335
  50,091,554
  50,091,569
  50,096,832
  50,096,888
  50,096,889
  50,111,107
  50,122,725
  50,122,776
  50,159,744
  50,179,869
  50,184,566
  50,184,580
  50,203,333
  50,213,197
  50,213,722
  50,213,728
  50,213,749
  50,215,026
  50,217,848
  50,243,295
  50,243,296
  50,248,969
  50,255,487
  50,257,907
  50,272,685
  50,277,903
  50,279,942
  50,284,140
  50,286,021
  50,293,803
  50,299,482
  50,308,538
  50,310,283
  50,310,591
  50,310,597
  50,310,606
  50,310,617
  50,326,421
  50,357,016
  50,372,109
  50,388,416
  50,401,549
  50,451,416
  50,454,394
  50,455,395
  50,468,809
  50,471,283
  50,479,698
  50,505,940
  50,536,745
  50,545,829
  50,545,922
  50,553,136
  50,577,539
  50,580,018
  50,583,224
  50,583,544
  50,589,405
  50,590,254
  50,596,240
  50,601,556
  50,601,558
  50,603,982
  50,604,496
  50,617,493
  50,619,784
  50,624,497
  50,632,892
  50,632,894
  50,663,010
  50,675,441
  50,676,008
  50,676,086
  50,676,097
  50,676,103
  50,676,109
  50,676,127
  50,676,128
  50,696,159
  50,739,847
  50,739,918
  50,739,922
  50,739,925
  50,739,981
  50,752,622
  50,752,624
  50,765,533
  50,794,979
  50,811,471
  50,813,774
  50,813,782
  50,814,450
  50,814,470
  50,814,471
  50,814,477
  50,815,277
  50,831,692
  50,838,106
  50,840,269
  50,847,152
  50,847,170
  50,847,221
  50,858,555
  50,858,556
  50,872,968
-
3
2/-
8
4
2/-
2
2
97
2/-
2
-
G
A
2
C
A
A
2
2
2/-
G/2
2/-
C/8
2/-
-
A
C/2
T
A
2/-
-
A
2/-
-
2/-
A/-
T/-
-
2/-
2/-
63
3
-
4/-
2/-
T
5
C
A
T
A
T
C
6
C
A
T
T
3
2
2
A/-
3
2
-
15
-
A
-
10
7
G/3
2/-
2/-
2/-
A/11
2
C/2
A/-
22
-
-
3
T/-
T/-
A/3
C/A
2/-
A/4
3/-
C/-
2/-
5
A/9
2/-
T/3
2/-
-
C
6/-
2/-
2
4/-
2/-
C/5
6/-
A/-
6/-
G/2
A/5
T/2
T/-
2/-
A/-
T/-
2/-
2/-
T
T/-
2
G/-
2/-
2/-
C/3
-
2
G/2
2/-
2/-
4
2
2/-
C
2/-
4/-
2/-
2
2/-
2/-
2/-
2/-
-
3
2/-
2/-
2/-
T
T
T
T
-
G
7/-
2
12
50
17
3
4/-
-
T/5
40/-
2/-
57
-
-
G
A
-
C/-
-
4
7
T/-
3/-
2
G/2
T/-
2