Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 303,641 (bp)   Positions: 483
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.009
.008
.01
.004
.004
.001
.001
.001
.0
.04
.0
.002
.0
.034
.839
.001
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
.007
.897
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.25
.003
.0
.026
.009
.001
.015
.031
.04
.003
.001
.004
.002
.187
.102
.944
.011
.009
.011
.004
.002
.106
--
--
.009
.948
1.0
.999
1.0
.998
.078
.031
.183
.019
.001
.001
.002
.014
.001
.0
.019
.002
--
--
--
--
--
--
--
--
.002
.0
.086
.008
.0
.082
.04
.02
.003
.16
.31
.059
.001
.0
.0
.166
.144
.02
.001
.005
.025
.005
.036
.024
.101
.0
.0
--
--
--
.203
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
.011
.096
.001
.003
.041
.004
.025
.079
.034
.032
.005
.001
.004
.013
.283
.001
.016
.028
.979
.098
.098
.0
.02
.023
.025
--
--
.0
.0
.231
.002
.0
.002
.001
.025
.006
.03
.001
.461
.01
.001
.14
.0
.266
.003
.869
.886
.008
.004
.001
.013
.025
.002
.01
.045
.007
.0
.005
.001
.0
.016
.011
.013
.052
.033
.001
.0
.046
.011
.0
.0
.0
.001
.0
.001
.0
.0
.001
.166
.0
.046
.087
--
--
.071
.077
.0
.0
.0
.002
.03
.0
.827
.08
.01
.002
.008
.007
.17
.618
.53
.046
.018
.115
.092
.171
.029
.01
.002
.229
.006
.002
.0
.027
.001
.005
.103
.022
.034
.001
.006
.0
.0
.028
.001
.034
.207
.005
.001
.004
.176
.273
.292
.295
.016
.087
.022
.002
.055
.194
.183
.067
.332
.009
.008
.032
.08
.331
.143
.938
.295
.991
.514
.072
.042
.083
.152
.018
.415
.059
.002
.012
.002
.1
.404
.067
.004
.109
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.037
.001
.205
.265
.003
.12
.023
.519
.016
.0
.001
.0
.094
--
--
--
.102
.361
.214
--
--
.005
.31
.412
.001
.344
.29
.036
.007
.059
.816
.83
.001
.002
.073
.015
.004
.022
.218
.313
.169
.057
.057
--
.019
.021
.07
.004
.075
.009
.001
.016
--
.0
.022
.003
.813
.027
.692
.002
.041
.769
.001
.026
.01
.058
.023
.187
.204
.224
.408
.317
.003
.036
.272
.016
.442
--
.12
--
--
--
--
--
--
--
.074
.12
.023
.0
.081
.144
.003
--
.005
.001
.008
.134
.004
.031
.019
.0
.797
.004
.043
.008
.043
.011
.017
.006
.022
.001
.008
.004
.0
.096
.002
.379
.002
.033
.998
.972
.043
.601
.003
.01
.395
.014
.032
.025
.111
.206
.313
1.0
.266
.0
.001
.001
.027
.0
.0
.002
.007
--
.005
.008
.002
.001
.001
.003
--
--
--
--
.017
.003
.008
.006
.0
.033
.0
.004
.034
.443
.525
.001
.007
.009
.053
.007
.004
.002
.473
.263
.118
1.0
Pcsk2
Pcsk2
Pcsk2
Pcsk2
Pcsk2
Pcsk2
Pcsk2
Pcsk2
Pcsk2
Pcsk2
Pcsk2
Pcsk2
Pcsk2
Pcsk2
Pcsk2
Pcsk2
Pcsk2
Pcsk2
Pcsk2
Pcsk2
Pcsk2
Pcsk2
Pcsk2
Pcsk2
Pcsk2
Pcsk2
Pcsk2
Pcsk2
Pcsk2
Pcsk2
Pcsk2
Pcsk2
Pcsk2
Pcsk2
Pcsk2
Pcsk2
Pcsk2
Pcsk2
Pcsk2
Pcsk2
Pcsk2
Pcsk2
Pcsk2
Pcsk2
Pcsk2
Pcsk2
Pcsk2
Pcsk2
Pcsk2
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Wbp4-ps1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
T
C
T
C
G
C
C
G
G
A
G
G
G
A
2
3
C
A
A
T
G
T
T
T
T
T
T
C
T
G
T
G
G
G
A
C
T
G
G
A
A
C
G
T
T
8
G
A
A
G
T
26
G
C
C
G
G
A
A
A
G
G
C
A
A
A
C
A
A
G
C
T
A
C
G
A
A
G
A
A
C
C
A
A
G
A
G
C
T
G
115
G
C
T
T
C
T
A
G
G
A
C
12
4
G
G
T
G
C
A
G
4
C
G
T
G
T
A
C
T
C
G
C
G
T
6
2
G
G
T
T
T
G
C
C
A
T
T
C
T
A
T
T
C
C
T
A
C
G
2
A
A
G
A
A
T
10
T
G
T
C
T
T
G
G
A
T
A
A
T
C
A
8
6
A
A
A
C
C
C
4
C
C
T
11
G
A
T
G
A
T
G
G
G
T
G
A
G
G
G
A
C
G
C
A
C
A
5
A
T
T
3
2
C
T
G
G
C
A
T
3
A
G
G
A
A
2
11
C
A
A
A
T
G
G
6
4
C
A
C
C
G
G
4
20
A
A
T
G
G
G
C
A
C
T
T
T
2
A
2
14
2
G
T
A
T
G
14
A
A
G
A
G
T
T
A
G
G
A
C
C
2
10
T
C
T
A
C
A
T
G
11
T
C
2
A
G
C
C
G
A
G
G
G
2
A
T
G
C
T
A
C
A
8
A
T
C
T
C
A
G
18
A
T
G
2
4
T
T
T
T
G
A
T
A
A
C
T
G
T
G
G
A
G
C
T
C
A
T
G
A
C
T
A
C
T
T
G
C
A
T
A
C
T
G
T
C
T
6
T
T
A
T
4
A
C
T
2
T
C
C
A
A
C
G
4
T
T
A
C
A
2
A
A
G
6
A
10
6
T
T
C
A
A
G
G
C
C
C
C
G
T
T
C
C
G
G
T
T
A
A
G
G
G
T
T
T
T
T
T
A
A
C
T
T
2
A
A
T
A
G
T
C
C
A
C
G
G
G
T
16
A
T
A
G
T
T
4
26
A
4
T
A
C
C
T
A
T
T
A
C
T
A
G
A
20
G
T
A
T
A
A
G
  144,059,324
  144,060,042
  144,060,199
  144,060,228
  144,060,451
  144,060,652
  144,060,813
  144,061,637
  144,062,798
  144,062,909
  144,066,759
  144,066,820
  144,067,435
  144,067,503
  144,067,817
  144,067,993
  144,068,169
  144,068,702
  144,068,900
  144,069,125
  144,069,614
  144,069,617
  144,069,697
  144,070,256
  144,071,794
  144,072,324
  144,072,739
  144,073,418
  144,073,645
  144,073,654
  144,074,060
  144,075,636
  144,075,945
  144,077,281
  144,077,345
  144,078,046
  144,079,391
  144,081,156
  144,081,745
  144,083,826
  144,084,182
  144,084,844
  144,085,421
  144,085,547
  144,085,920
  144,086,238
  144,086,661
  144,087,363
  144,087,491
  144,087,923
  144,088,843
  144,089,041
  144,089,068
  144,090,413
  144,090,653
  144,090,774
  144,090,775
  144,090,776
  144,093,601
  144,095,868
  144,096,260
  144,098,050
  144,099,687
  144,099,781
  144,099,839
  144,100,117
  144,100,155
  144,100,262
  144,100,326
  144,100,652
  144,100,809
  144,100,893
  144,101,228
  144,101,611
  144,101,729
  144,102,529
  144,102,653
  144,103,014
  144,103,192
  144,103,722
  144,103,774
  144,103,785
  144,103,859
  144,103,872
  144,103,963
  144,104,008
  144,107,126
  144,109,794
  144,109,943
  144,110,109
  144,110,225
  144,110,468
  144,111,201
  144,111,331
  144,111,895
  144,112,088
  144,112,480
  144,112,986
  144,113,387
  144,113,976
  144,114,358
  144,114,383
  144,114,566
  144,114,623
  144,114,658
  144,114,966
  144,115,534
  144,116,741
  144,120,338
  144,120,900
  144,121,217
  144,121,460
  144,122,193
  144,122,911
  144,123,479
  144,123,908
  144,123,991
  144,126,075
  144,130,408
  144,135,509
  144,135,660
  144,135,730
  144,135,738
  144,135,742
  144,135,753
  144,135,810
  144,135,869
  144,143,621
  144,149,576
  144,151,460
  144,151,493
  144,151,510
  144,151,610
  144,153,296
  144,155,061
  144,156,108
  144,156,110
  144,156,241
  144,156,243
  144,156,246
  144,156,247
  144,156,266
  144,157,760
  144,159,701
  144,160,131
  144,174,787
  144,175,003
  144,175,070
  144,176,238
  144,176,535
  144,176,536
  144,176,849
  144,176,940
  144,176,944
  144,177,724
  144,179,286
  144,180,997
  144,181,119
  144,181,511
  144,182,326
  144,182,713
  144,182,726
  144,182,859
  144,183,242
  144,184,053
  144,184,407
  144,186,118
  144,187,843
  144,190,130
  144,192,620
  144,193,175
  144,193,546
  144,193,671
  144,193,673
  144,193,716
  144,194,051
  144,195,166
  144,197,537
  144,197,539
  144,198,497
  144,199,010
  144,199,345
  144,199,692
  144,200,114
  144,205,812
  144,206,931
  144,207,080
  144,207,107
  144,207,859
  144,207,870
  144,207,888
  144,207,906
  144,207,919
  144,207,928
  144,207,947
  144,207,954
  144,208,005
  144,208,006
  144,208,017
  144,208,025
  144,208,043
  144,208,055
  144,208,075
  144,208,122
  144,208,158
  144,208,883
  144,209,693
  144,209,950
  144,209,959
  144,210,996
  144,211,008
  144,213,142
  144,213,143
  144,213,496
  144,214,705
  144,214,882
  144,215,244
  144,215,262
  144,215,409
  144,217,864
  144,218,416
  144,219,165
  144,219,295
  144,220,008
  144,220,123
  144,220,496
  144,221,915
  144,221,955
  144,222,040
  144,222,909
  144,223,699
  144,223,700
  144,224,032
  144,224,043
  144,224,999
  144,225,419
  144,225,461
  144,225,477
  144,225,486
  144,225,495
  144,225,562
  144,225,768
  144,226,494
  144,226,849
  144,226,881
  144,227,377
  144,227,407
  144,227,690
  144,227,902
  144,227,974
  144,227,994
  144,229,120
  144,229,590
  144,229,608
  144,230,050
  144,230,189
  144,230,790
  144,231,999
  144,232,045
  144,232,073
  144,232,089
  144,233,056
  144,233,059
  144,233,179
  144,233,601
  144,233,940
  144,233,992
  144,234,316
  144,234,409
  144,234,597
  144,234,892
  144,234,916
  144,235,127
  144,236,829
  144,237,182
  144,237,854
  144,237,963
  144,238,061
  144,238,138
  144,238,556
  144,238,902
  144,238,966
  144,238,969
  144,238,981
  144,239,222
  144,239,623
  144,240,518
  144,241,227
  144,241,238
  144,241,684
  144,243,397
  144,243,401
  144,243,461
  144,244,526
  144,245,113
  144,245,385
  144,245,400
  144,245,427
  144,245,469
  144,245,472
  144,245,482
  144,245,633
  144,246,133
  144,246,936
  144,250,001
  144,250,002
  144,252,233
  144,252,287
  144,253,387
  144,253,950
  144,256,729
  144,257,187
  144,258,113
  144,258,333
  144,258,479
  144,259,591
  144,260,359
  144,260,763
  144,260,848
  144,261,137
  144,261,709
  144,261,718
  144,261,739
  144,261,872
  144,262,156
  144,262,171
  144,262,439
  144,262,491
  144,262,845
  144,262,918
  144,262,935
  144,263,386
  144,263,808
  144,263,809
  144,263,872
  144,263,917
  144,263,971
  144,269,205
  144,270,301
  144,272,124
  144,274,349
  144,275,279
  144,275,825
  144,276,122
  144,276,340
  144,277,061
  144,277,067
  144,277,272
  144,277,359
  144,277,532
  144,277,601
  144,278,271
  144,278,311
  144,278,532
  144,278,605
  144,279,603
  144,279,715
  144,279,754
  144,279,920
  144,281,807
  144,281,978
  144,282,207
  144,282,306
  144,282,593
  144,283,277
  144,283,361
  144,283,615
  144,284,456
  144,288,844
  144,288,989
  144,294,155
  144,294,205
  144,294,244
  144,294,389
  144,294,401
  144,294,574
  144,294,590
  144,294,605
  144,294,929
  144,295,820
  144,296,421
  144,296,718
  144,296,975
  144,297,189
  144,297,609
  144,298,161
  144,301,183
  144,316,986
  144,317,594
  144,319,087
  144,319,146
  144,319,456
  144,319,489
  144,320,050
  144,320,115
  144,320,447
  144,321,252
  144,324,654
  144,324,658
  144,324,842
  144,327,119
  144,328,351
  144,329,074
  144,329,481
  144,329,589
  144,330,434
  144,330,480
  144,330,511
  144,330,846
  144,331,012
  144,333,421
  144,333,482
  144,334,819
  144,334,862
  144,334,903
  144,334,943
  144,335,075
  144,335,085
  144,335,569
  144,335,627
  144,336,324
  144,336,413
  144,336,798
  144,338,923
  144,339,308
  144,340,451
  144,340,969
  144,341,569
  144,342,275
  144,342,317
  144,343,343
  144,343,540
  144,343,639
  144,344,397
  144,345,829
  144,345,936
  144,345,937
  144,347,384
  144,347,570
  144,348,815
  144,349,475
  144,350,569
  144,350,682
  144,350,685
  144,351,681
  144,352,172
  144,352,197
  144,352,326
  144,352,344
  144,352,347
  144,352,768
  144,353,258
  144,353,294
  144,353,306
  144,353,310
  144,353,312
  144,353,316
  144,354,314
  144,354,447
  144,355,090
  144,355,138
  144,355,398
  144,355,805
  144,355,806
  144,355,825
  144,356,319
  144,356,467
  144,356,939
  144,356,976
  144,357,025
  144,357,178
  144,357,183
  144,357,642
  144,357,703
  144,358,185
  144,358,977
  144,360,186
  144,360,319
  144,360,332
  144,361,595
  144,361,977
  144,361,990
  144,362,503
A
T
C
G
T
G
T
C
A
-
C
C
2
-
-
-
A
G
G
3
A
G
-
C
A
-
C
T
C
A
C
A
A
-
G
A
C
A
T
T
C
T
T
C
C
8/-
A
G
C
A
5
-
C
T
2
2
2
T
T
-
A
-
2
2
C
G
T
2
G
A
T
C
C
G
A
G
G
T
G
G
A
G
C
C
C
-
G/-
T
A
A
-
A
2
C
C
T
C
T
A
A
G
T
-
-
C
2
G
4
G
G
A
-
2
T
T/15
2
2
C
T
C
T
A
-
A
89
-
2/-
A
A
-
3
2
2
T
A
T
2
-
-
-
4
-
3
T
-
C
G
7
A
2/-
A/-
-
A
G
T
C
10/-
-
A
C
G
C
A
A
A
-
G
T
-
C
3
G
8/-
6/-
T
G
G
C/15
C/13
2
-
4
13
A
-
A
G
G
A
T
-
T
C
C
A
C
C
A
C
C
C
A
C
T
T
T
-
-
G
C
C
3/-
2/-
A
A
T
19
23
C
A
-
G
A
C
G
T
-
-
A
C
C
C
2
T
C
-
-
T
G
13
A
A
A
-
-
G
G
A
A
A
A
T
G
T
G
2
43
2/-
3
-
-
-
A
A
G
A
4
-
G
G
A
G
A
3
C
-
A
T
G
9
T
-
-
C
G
G
G
T
11
C
T
-
C
T
-
G
A
3
-
-
-
T
T
G/-
2/-
A/-
17
9
T
-
2
T
G
-
?
C
T
C
T
G
A
-
G
C
A
-
-
C
C
-
A
A
6
25
G
G
-
2
A
-
A
A
C
C
T
C
T
C
C
A
C
G
C
G
3/4
C
G
T
A
-
C
G
T
G
C
C
A
C
-
2
C
G
A
-
G
T
-
-
C
A
T
G
G
A
A
-
T/2
G
-
G
T
2/-
2
-
26
-
G
10/-
-
A
3/5
T
G
T
A
A
T
T
T
G
A
C
C
A
T
A
T
C
A
G
T
A
A
A
-
C
TA/3
C
4
G
22
5
A
C
C
2/-
-
G
C
4/6
A
C
T
T
2
19
T
A
A
2
-
G
G
T
T
A
G
-
-
2
4/-
C
T
A
T
C
G
C
G
G
T
-
G
A
G
-
A
C
C
2
A/-
A/-
A