Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 50,464 (bp)   Positions: 285
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.18
.001
.016
.002
.043
.059
.996
.006
.001
.009
.002
.003
.001
.001
.012
.011
.007
.0
1.0
.905
.003
.002
.003
--
--
--
--
--
--
--
.009
.003
.002
.027
.005
.001
.0
.328
.034
.0
.563
.538
--
.906
.089
.072
.338
.224
.027
--
.065
.09
.079
.118
.027
.066
.006
.029
.03
.101
.007
.008
.021
.068
.139
.79
.137
.058
.156
.083
--
--
--
.054
.811
.042
.162
.14
.045
.406
.188
.387
.223
.208
.178
.161
.078
.049
.179
.179
.283
.017
.012
.004
1.0
.003
.0
.0
.017
.001
.002
.181
.002
.001
.22
.301
.004
.079
.011
.014
.026
.039
.07
.041
.036
.092
.078
.058
.1
.299
.005
.6
.622
--
--
--
.018
--
.022
--
.017
.007
.017
.48
--
--
.013
--
.066
.53
--
--
--
.139
--
--
--
--
--
--
.071
.012
.058
.029
.212
.182
.203
.003
.055
.009
.669
.079
--
.012
.006
.013
--
--
--
--
--
.008
.73
.002
.009
.002
.022
.001
.013
.002
--
.071
.122
.151
.277
.035
.051
.465
.002
.016
.005
.001
.006
.104
.0
.0
.012
.0
.0
.077
.07
.013
.002
.13
.003
.188
.149
.312
.0
.209
.086
.001
.002
.009
.0
.0
.002
.01
.029
1.0
.229
.999
.008
.0
.004
.072
.001
.001
.055
.096
.027
.015
.125
.121
.109
.003
.981
.998
.019
.003
.0
.025
.014
.116
.002
.482
.141
.018
.031
.001
.065
.002
.002
--
.01
.114
.044
.264
.022
.075
.017
--
.003
.059
.056
.014
.0
.0
.0
.001
.063
.003
.02
.018
.064
.059
.019
.177
.118
.001
.003
.331
.009
.134
.063
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
G
A
A
C
G
C
T
C
G
G
G
G
C
T
A
8
T
T
A
A
2
A
G
T
G
G
T
T
A
T
A
T
T
C
T
C
C
G
35
G
2
C
C
T
G
T
A
C
G
C
G
C
A
T
C
A
T
G
T
G
T
C
A
C
A
T
T
A
T
A
G
C
T
2
C
6
G
G
2
10
8
4
C
C
C
C
G
9
G
G
12
C
G
T
T
T
T
A
C
G
T
G
C
A
A
A
C
14
C
A
2
2
G
T
G
G
G
A
2
C
T
12
10
2
T
G
T
71
C
G
G
A
G
G
A
A
C
G
A
C
10
8
6
A
G
C
A
C
C
T
T
T
A
T
A
8
T
A
A
A
G
C
C
G
A
A
A
2
A
3
T
A
T
C
G
T
T
A
C
A
T
A
G
C
T
G
A
G
C
A
G
G
C
18
C
C
G
C
C
C
A
G
T
T
A
G
G
G
T
C
A
T
A
2
C
A
20
A
A
A
G
2
T
T
C
G
T
T
C
2
A
C
4
A
3
G
A
C
G
2
A
G
G
C
G
C
T
C
T
T
T
C
T
A
G
A
15
A
G
T
A
G
A
G
C
T
2
A
C
C
A
C
2
A
A
A
C
G
T
T
T
G
G
G
G
  108,785,854
  108,786,528
  108,786,648
  108,787,180
  108,787,347
  108,787,353
  108,787,584
  108,787,815
  108,787,820
  108,788,027
  108,788,116
  108,788,153
  108,788,191
  108,788,502
  108,788,645
  108,788,670
  108,788,876
  108,788,896
  108,788,980
  108,789,077
  108,789,211
  108,789,214
  108,789,285
  108,789,665
  108,789,884
  108,789,963
  108,790,013
  108,790,171
  108,790,307
  108,790,448
  108,790,722
  108,790,739
  108,790,966
  108,791,051
  108,791,144
  108,791,206
  108,791,370
  108,791,659
  108,791,710
  108,791,779
  108,792,024
  108,792,121
  108,792,444
  108,792,594
  108,792,688
  108,792,799
  108,792,858
  108,793,020
  108,793,211
  108,793,393
  108,793,542
  108,793,727
  108,793,832
  108,794,285
  108,794,341
  108,794,648
  108,794,704
  108,794,764
  108,794,839
  108,794,958
  108,795,287
  108,795,357
  108,795,364
  108,795,373
  108,795,448
  108,795,543
  108,795,591
  108,795,619
  108,795,699
  108,795,885
  108,796,770
  108,796,992
  108,797,009
  108,797,164
  108,797,257
  108,797,339
  108,797,492
  108,797,495
  108,797,610
  108,797,657
  108,797,699
  108,797,771
  108,797,797
  108,797,798
  108,797,802
  108,797,804
  108,797,833
  108,797,835
  108,798,094
  108,798,097
  108,798,436
  108,798,449
  108,798,630
  108,798,698
  108,798,777
  108,798,880
  108,798,960
  108,799,018
  108,799,081
  108,799,200
  108,799,465
  108,800,181
  108,800,368
  108,800,837
  108,800,895
  108,800,925
  108,801,446
  108,801,793
  108,803,267
  108,803,274
  108,803,344
  108,803,348
  108,803,367
  108,803,406
  108,803,407
  108,803,480
  108,803,644
  108,803,651
  108,803,766
  108,803,777
  108,803,898
  108,804,336
  108,804,338
  108,804,411
  108,804,560
  108,804,563
  108,804,698
  108,805,962
  108,806,418
  108,806,478
  108,806,605
  108,807,038
  108,807,059
  108,807,617
  108,808,771
  108,809,025
  108,810,252
  108,810,458
  108,810,709
  108,810,816
  108,811,795
  108,811,797
  108,811,799
  108,812,510
  108,813,358
  108,813,609
  108,814,478
  108,814,657
  108,814,670
  108,814,778
  108,814,856
  108,814,896
  108,815,094
  108,816,218
  108,818,604
  108,818,686
  108,818,735
  108,818,887
  108,819,354
  108,819,524
  108,819,598
  108,820,482
  108,821,150
  108,821,664
  108,821,695
  108,821,985
  108,822,162
  108,822,419
  108,822,420
  108,822,627
  108,822,629
  108,822,936
  108,823,534
  108,824,053
  108,824,285
  108,824,700
  108,824,775
  108,825,493
  108,825,633
  108,826,200
  108,826,343
  108,826,541
  108,826,595
  108,826,630
  108,826,871
  108,827,019
  108,828,247
  108,828,351
  108,828,939
  108,829,205
  108,829,281
  108,829,378
  108,829,574
  108,829,807
  108,829,882
  108,829,887
  108,830,108
  108,830,131
  108,830,138
  108,830,171
  108,830,172
  108,830,202
  108,830,319
  108,830,525
  108,830,767
  108,830,811
  108,830,887
  108,830,965
  108,831,309
  108,831,443
  108,831,628
  108,831,638
  108,831,655
  108,831,658
  108,831,666
  108,831,667
  108,831,675
  108,831,818
  108,831,819
  108,831,853
  108,831,897
  108,831,923
  108,832,021
  108,832,089
  108,832,127
  108,832,166
  108,832,222
  108,832,374
  108,832,581
  108,832,759
  108,832,771
  108,832,815
  108,832,876
  108,832,884
  108,832,890
  108,833,123
  108,833,307
  108,833,315
  108,833,491
  108,833,534
  108,833,540
  108,833,614
  108,833,633
  108,833,641
  108,833,649
  108,833,672
  108,833,684
  108,833,695
  108,833,764
  108,833,845
  108,833,950
  108,834,021
  108,834,022
  108,834,078
  108,834,512
  108,834,541
  108,834,562
  108,834,693
  108,834,749
  108,834,868
  108,834,919
  108,834,963
  108,835,022
  108,835,064
  108,835,145
  108,835,166
  108,835,172
  108,835,174
  108,835,264
  108,835,288
  108,835,399
  108,835,426
  108,835,459
  108,835,485
  108,835,498
  108,835,507
  108,835,532
  108,835,615
  108,835,630
  108,835,705
  108,835,735
  108,836,013
  108,836,057
  108,836,072
  108,836,116
A
G
6
T
A
T
C
3
A
A
3
A
T
C
G
-
C
C
G
G
-
G
A
C
A
A
C
C
4
20
G
3
C
T
C
A
T
T
-
A
2/-
T
2
C
A
A
9
T
A
T
A
T
G
C
T
G
C
T
C
A
C
T
G
T
G
C
A
G
-
C
A
T
C
-
T
-
2
33
-
-
-
-
A
T
T
T
G/-
9/-
A
A
-
-
A
C
C
C
G
G
T
2
A
A
T
C
3
7
C/2
-
-
3
-
-
T
C
C
A
A
G
-
G
A
12/-
-
-
2
A
C
-
C/3
A
A
G
A
C
C
2
T
A
G
T
10/-
8/-
6/-
G
9/7
T
T
8
C/4
TA/3
G
C
C
C
G
-
C
T
G
T
7/5
A
3/4
C
G
T
-
-
A/-
-
T/-
G
C
A
A
A
9
-/11
T
G
C
4
A
T
2
A
T
A
T
G
A
13
T
-
T
T
T
3
T
T
20
A
C
C
G
A
A
A
C
T
2
5
G
-
T
G
-
G
G
G
A
-
C
C
T
A
3
C
T
-
T
T
-
C
-
A
G
G
T
-
T
A
A
A
T
T
G
T
C
G
C
T
G
T
A
T
-
20
C
A
93
A
G
4
T
-
-
4
T
A
G
8
-
-
-
4
T
A
C
C
C
A
C
A
A