Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 50,464 (bp)   Positions: 323
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.18
.001
.016
.002
.043
.059
.996
.006
.001
.009
.002
.003
.001
.001
.012
.011
.007
.0
1.0
.905
.003
.002
.003
--
--
--
--
--
--
--
.009
.004
.019
.002
.002
.027
.005
.001
.0
.328
.004
.0
.538
--
.906
.089
.072
.374
.338
.224
--
.065
.09
.079
.111
.445
.118
.027
.066
.006
.029
.03
.101
.007
.008
.021
.068
.139
.79
.137
.058
.156
.083
--
--
--
.054
.861
.811
.042
.162
.061
.045
.406
.188
.387
.223
.178
.168
.179
.179
.283
.017
.012
.004
1.0
.003
.0
.0
.017
.001
.002
.181
.001
.338
.301
.143
.306
.004
.012
.037
.004
.026
.039
.041
.036
.024
.078
.058
.1
.299
.028
.005
.004
--
--
--
.018
.199
.013
--
.007
.017
.223
--
--
.066
--
--
--
--
--
.089
.152
.139
--
--
--
--
--
--
--
.012
.029
.051
--
.109
.032
.182
.203
.003
.055
.009
.669
.541
.02
.048
.079
--
.013
--
--
--
.008
.001
.003
.013
.002
.022
.998
.001
.0
.001
.0
.335
.039
.002
--
.049
.033
.056
.732
.369
.277
.035
.002
.002
.653
.006
.007
.013
.006
.406
.148
.051
.066
.042
.013
.0
.002
.024
.062
.001
.0
.016
.005
.008
.003
.002
.086
.104
.0
.032
.012
.0
.011
.013
.002
.13
.312
.0
.18
.137
.124
.001
.013
.014
.025
.002
.005
.068
.086
.043
.001
.009
.002
.009
.0
.0
.002
.01
.029
1.0
.229
.999
.03
.019
.012
.009
.008
.003
.0
.008
.072
.001
.003
.004
.022
.001
.055
.1
.015
.121
.114
.109
.003
.01
.981
.998
.019
.003
.0
.025
.014
.116
.002
.141
.018
.031
.001
.065
.002
--
.01
.114
.014
.044
.043
.264
.01
.022
.075
.007
--
.059
.008
.056
.014
.0
.0
.001
.011
.063
.022
.004
.003
.06
.044
.02
.062
.019
.153
.003
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
Pccb
G
A
A
C
G
C
T
C
G
G
G
G
C
T
A
8
T
T
A
A
2
A
G
T
G
G
T
T
A
T
A
T
T
G
T
C
T
C
C
G
A
G
C
C
T
G
T
A
A
C
C
G
C
A
8
T
T
C
A
T
G
T
G
T
C
A
C
A
T
T
A
T
A
G
C
T
2
T
C
6
G
2
2
10
8
4
2
6
2
G
G
C
C
G
T
T
T
T
A
C
G
T
G
A
C
A
A
C
C
G
T
A
2
2
T
G
C
G
A
2
C
G
T
G
T
G
G
T
C
G
T
A
G
T
T
A
A
G
G
A
6
C
T
C
A
C
3
A
A
A
A
C
T
T
C
C
T
T
8
T
A
A
A
G
A
T
G
C
C
A
2
G
4
A
G
C
C
C
T
G
C
9
11
13
C
A
A
T
G
G
A
T
G
T
G
A
T
G
G
T
T
A
G
G
A
A
A
G
G
C
A
C
G
T
A
G
7
A
G
G
15
C
G
G
C
G
G
T
T
G
T
G
T
T
G
G
A
A
A
T
C
A
A
T
A
A
2
C
A
20
A
A
A
G
2
T
G
T
C
T
G
T
T
G
T
2
C
G
T
C
4
C
A
5
3
G
C
A
C
G
2
A
G
G
C
G
T
C
T
T
T
T
A
G
A
A
15
T
A
C
G
T
G
G
G
C
C
T
C
C
C
C
A
G
A
A
C
A
2
A
C
C
T
  108,785,854
  108,786,528
  108,786,648
  108,787,180
  108,787,347
  108,787,353
  108,787,584
  108,787,815
  108,787,820
  108,788,027
  108,788,116
  108,788,153
  108,788,191
  108,788,502
  108,788,645
  108,788,670
  108,788,876
  108,788,896
  108,788,980
  108,789,077
  108,789,211
  108,789,214
  108,789,285
  108,789,665
  108,789,884
  108,789,963
  108,790,013
  108,790,171
  108,790,307
  108,790,448
  108,790,722
  108,790,741
  108,790,761
  108,790,776
  108,790,966
  108,791,051
  108,791,144
  108,791,206
  108,791,370
  108,791,659
  108,791,730
  108,791,779
  108,792,121
  108,792,444
  108,792,594
  108,792,688
  108,792,799
  108,792,853
  108,792,858
  108,793,020
  108,793,393
  108,793,542
  108,793,727
  108,793,832
  108,793,868
  108,793,897
  108,794,285
  108,794,341
  108,794,648
  108,794,704
  108,794,764
  108,794,839
  108,794,958
  108,795,287
  108,795,357
  108,795,364
  108,795,373
  108,795,448
  108,795,543
  108,795,591
  108,795,619
  108,795,699
  108,795,885
  108,796,770
  108,796,992
  108,797,009
  108,797,164
  108,797,235
  108,797,257
  108,797,339
  108,797,492
  108,797,534
  108,797,610
  108,797,657
  108,797,699
  108,797,771
  108,797,797
  108,797,802
  108,797,822
  108,798,094
  108,798,097
  108,798,436
  108,798,449
  108,798,630
  108,798,698
  108,798,777
  108,798,880
  108,798,960
  108,799,018
  108,799,081
  108,799,200
  108,799,465
  108,800,181
  108,800,837
  108,800,916
  108,800,925
  108,800,941
  108,801,173
  108,801,446
  108,801,843
  108,802,353
  108,802,615
  108,803,344
  108,803,348
  108,803,406
  108,803,407
  108,803,471
  108,803,644
  108,803,651
  108,803,766
  108,803,777
  108,803,806
  108,803,898
  108,804,370
  108,804,560
  108,804,563
  108,804,646
  108,804,698
  108,805,549
  108,806,210
  108,806,439
  108,807,038
  108,807,059
  108,807,640
  108,808,156
  108,809,025
  108,810,709
  108,811,037
  108,811,480
  108,811,702
  108,811,785
  108,811,830
  108,812,466
  108,812,475
  108,812,510
  108,812,919
  108,813,186
  108,814,113
  108,814,114
  108,814,466
  108,814,478
  108,814,670
  108,814,896
  108,816,218
  108,816,440
  108,816,677
  108,818,108
  108,818,397
  108,818,686
  108,818,735
  108,818,887
  108,819,354
  108,819,524
  108,819,598
  108,819,629
  108,819,920
  108,820,191
  108,820,482
  108,821,150
  108,821,985
  108,822,161
  108,822,344
  108,822,417
  108,822,936
  108,824,376
  108,824,377
  108,824,526
  108,824,694
  108,824,775
  108,825,126
  108,825,487
  108,825,491
  108,825,493
  108,825,495
  108,825,540
  108,826,015
  108,826,200
  108,826,343
  108,826,437
  108,826,452
  108,826,537
  108,826,777
  108,826,813
  108,826,871
  108,827,019
  108,827,206
  108,827,222
  108,827,324
  108,827,364
  108,827,430
  108,827,431
  108,827,587
  108,827,643
  108,828,033
  108,828,247
  108,828,559
  108,828,621
  108,828,692
  108,828,705
  108,828,749
  108,828,753
  108,829,066
  108,829,073
  108,829,076
  108,829,205
  108,829,281
  108,829,413
  108,829,435
  108,829,625
  108,829,806
  108,829,807
  108,829,882
  108,829,983
  108,830,108
  108,830,131
  108,830,184
  108,830,202
  108,830,319
  108,830,525
  108,830,965
  108,831,309
  108,831,455
  108,831,486
  108,831,494
  108,831,542
  108,831,576
  108,831,577
  108,831,586
  108,831,607
  108,831,614
  108,831,625
  108,831,628
  108,831,633
  108,831,638
  108,831,649
  108,831,655
  108,831,658
  108,831,666
  108,831,667
  108,831,675
  108,831,818
  108,831,819
  108,831,853
  108,831,897
  108,831,923
  108,831,951
  108,831,987
  108,831,988
  108,831,989
  108,832,021
  108,832,062
  108,832,089
  108,832,099
  108,832,166
  108,832,222
  108,832,229
  108,832,234
  108,832,334
  108,832,374
  108,832,581
  108,832,757
  108,832,815
  108,832,884
  108,832,888
  108,832,890
  108,833,123
  108,833,237
  108,833,307
  108,833,315
  108,833,491
  108,833,534
  108,833,540
  108,833,614
  108,833,633
  108,833,641
  108,833,649
  108,833,684
  108,833,695
  108,833,764
  108,833,845
  108,833,950
  108,834,022
  108,834,078
  108,834,512
  108,834,541
  108,834,545
  108,834,562
  108,834,576
  108,834,693
  108,834,694
  108,834,749
  108,834,868
  108,834,922
  108,834,963
  108,835,064
  108,835,082
  108,835,145
  108,835,166
  108,835,171
  108,835,197
  108,835,288
  108,835,299
  108,835,399
  108,835,404
  108,835,417
  108,835,419
  108,835,440
  108,835,453
  108,835,459
  108,835,505
  108,835,532
  108,835,620
  108,835,735
A
G
6
T
A
T
C
3
A
A
3
A
T
C
G
-
C
C
G
G
-
G
A
C
A
A
C
C
4
20
G
T/C
T/C
G/A
C
T
C
A
T
T
-
A
T
2
C
A
A
A/-
-/4
T
T
A
T
G
-
T/A
C
T
G
C
T
C
A
C
T
G
T
G
C
A
G
-
C
A
T
C
-
T/2
T
-
2
2/-
-
-
8/-
4/-
-
6/-
-
A
A
C/G
C/G
A
C
C
C
G
G
T
2
A
A
C
3
G/7
3
T
2
C
G
G
-
-
C
C
T
A
G
-
G
A
A
G/2
2
G/A
3
C
T
A
T/C
G
A
5
2
3
G
2
A
G
-
3
C
T
G
T
-
T
T
T
T
3
C
C
2
T
C
C
-
C
T
G
T
7
A/G
C
A
A
?
T
-
G/3
-
G
T
T
T
2
9
A
6
-
-
13/-
A
G
G
C
7
A
G
C
A
2
A
G
C
A
T
A
C
G
A
A
T
G
G
A
A
A
G
T
C
-
G
A
7/-
G
A
G/C
15/-
T
A
T
3
G/T
A
C
C
A
C
A
G
C
G/A
G/A
A/G
A/G
A/G
T/G
C/T
A/2
A/-
A/5
T
A/G
-
T
G
20/-
G
G
G
A
-
-
A
A
A
C
A
C
A
A
3
-
T
A
C
T
-
T
-
-
-
A
T
G
G
T
-
T
A
A
A
T
G
T
C
G
C
G
T
A
T
T
15/-
2
20
C/T
C
A
G/T
A
4
T
T
-
2
T
A
T
G
A
4
A/G
-
6
-
-
T
G
C