Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 131,273 (bp)   Positions: 273
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.003
.162
.005
.018
.002
--
--
--
.008
.079
.0
.985
.996
.05
.033
.0
.0
.317
--
.004
--
.001
.02
.002
.229
.008
.12
.147
.128
.014
.465
.03
--
--
.001
.0
.254
.003
--
.059
.012
--
.039
.341
.011
--
.001
.001
.001
.007
.044
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.319
.307
.271
.0
.002
.013
.634
.009
.0
.063
.061
.021
.005
.01
.137
.004
.007
.006
.012
.0
1.0
1.0
.919
.327
.0
.009
.013
.092
.055
.01
.024
.0
.011
.001
.01
.409
.161
.005
--
--
.004
.314
.004
.038
.041
.001
.01
.015
.0
.0
.007
.027
.014
1.0
.37
.215
.653
.081
.001
.055
.005
--
--
.026
.016
1.0
.15
.001
.015
.024
.869
.905
.905
.001
.037
.059
.096
.059
.057
.004
.011
.001
.001
--
.19
.001
.004
--
.003
.187
.082
.0
.016
.0
.184
.003
.001
.002
.0
.034
.595
.124
.002
.971
--
--
--
--
.002
.003
.334
.024
.034
.014
.001
.0
.0
.0
.0
.0
.186
.122
.717
.068
--
.004
--
.068
.315
.005
.155
.004
.073
--
.014
.567
.0
.0
.001
.003
--
--
--
.084
.003
.001
.001
.021
.013
.01
.013
--
--
--
.521
.852
.0
.0
.0
--
.047
.011
.053
.308
.052
.102
.436
.005
.0
.005
--
--
.004
.001
.009
.222
--
--
--
.007
.14
.356
.0
1.0
.0
.002
.002
.007
.816
.02
.001
.002
.001
.791
.899
.064
.0
.0
.564
.004
.002
.0
.002
.832
.918
1.0
.001
.01
.001
.001
.0
.974
1.0
Pcca
Pcca
Pcca
Pcca
Pcca
Pcca
Pcca
Pcca
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
T
C
A
T
C
2
A
4
C
A
T
2
2
G
C
T
2
2
C
T
T
G
T
G
T
G
12
2
17
A
C
A
T
A
A
C
C
G
T
G
C
G
A
C
T
C
A
C
A
T
C
A
A
T
G
T
G
G
A
A
T
A
T
C
T
T
2
A
C
G
A
4
G
T
C
12
C
C
T
T
T
35
A
C
T
C
T
G
G
T
T
T
T
T
T
G
G
T
6
4
A
T
A
2
T
C
C
T
A
12
C
G
T
C
G
A
A
T
C
T
T
2
A
C
A
A
A
G
C
A
T
G
T
A
A
G
G
10
8
C
G
G
A
T
T
G
C
C
A
A
2
T
A
A
C
T
G
G
T
T
A
C
G
T
G
G
C
A
T
A
64
A
G
T
4
C
C
C
C
C
T
T
G
C
T
A
6
C
A
C
T
G
T
4
A
C
10
8
A
C
A
T
T
2
21
4
A
G
C
C
C
4
C
A
29
G
C
G
A
6
T
G
A
A
2
T
A
G
T
C
T
4
8
G
C
A
C
C
T
A
T
T
C
T
T
G
T
C
T
T
G
T
C
C
A
C
G
C
A
C
T
T
T
T
G
G
C
A
A
C
2
2
T
  112,348,085
  112,349,303
  112,351,208
  112,355,285
  112,355,489
  112,355,490
  112,359,458
  112,359,640
  112,363,161
  112,372,620
  112,373,072
  112,386,874
  112,386,910
  112,388,390
  112,393,601
  112,394,065
  112,394,082
  112,394,274
  112,395,429
  112,397,683
  112,397,697
  112,408,606
  112,409,820
  112,414,966
  112,421,290
  112,423,036
  112,423,653
  112,423,729
  112,423,733
  112,425,909
  112,431,519
  112,431,730
  112,434,137
  112,434,997
  112,444,041
  112,444,042
  112,445,448
  112,447,180
  112,448,208
  112,450,784
  112,452,295
  112,452,340
  112,453,252
  112,454,138
  112,454,280
  112,454,604
  112,456,067
  112,456,207
  112,456,226
  112,456,650
  112,459,983
  112,460,589
  112,460,625
  112,460,746
  112,460,960
  112,461,747
  112,462,674
  112,463,147
  112,464,109
  112,464,507
  112,465,545
  112,465,972
  112,465,987
  112,467,870
  112,468,185
  112,468,602
  112,469,604
  112,470,308
  112,470,530
  112,471,239
  112,471,665
  112,473,268
  112,473,295
  112,473,549
  112,474,432
  112,475,454
  112,476,206
  112,476,209
  112,503,962
  112,503,981
  112,504,708
  112,505,105
  112,505,204
  112,505,345
  112,505,773
  112,505,781
  112,505,782
  112,506,348
  112,506,413
  112,507,524
  112,508,299
  112,509,827
  112,511,695
  112,511,743
  112,512,103
  112,512,817
  112,513,079
  112,513,771
  112,515,745
  112,515,747
  112,518,387
  112,519,025
  112,519,222
  112,519,720
  112,519,721
  112,519,995
  112,523,241
  112,523,243
  112,523,346
  112,524,584
  112,526,086
  112,527,903
  112,528,009
  112,529,888
  112,532,976
  112,532,997
  112,533,871
  112,534,350
  112,534,688
  112,534,731
  112,535,434
  112,541,917
  112,543,021
  112,543,814
  112,544,962
  112,545,594
  112,546,262
  112,549,950
  112,551,826
  112,551,830
  112,555,561
  112,555,573
  112,555,574
  112,556,442
  112,556,464
  112,558,085
  112,558,725
  112,558,795
  112,558,797
  112,559,411
  112,563,018
  112,563,738
  112,563,743
  112,565,229
  112,566,108
  112,566,615
  112,570,286
  112,570,369
  112,571,472
  112,573,209
  112,574,855
  112,576,872
  112,577,068
  112,578,624
  112,580,034
  112,580,388
  112,580,389
  112,581,332
  112,583,495
  112,585,178
  112,585,478
  112,585,496
  112,585,792
  112,585,951
  112,586,916
  112,587,303
  112,587,808
  112,590,198
  112,591,571
  112,593,174
  112,594,866
  112,595,756
  112,595,795
  112,595,947
  112,596,241
  112,600,378
  112,600,379
  112,600,380
  112,600,383
  112,600,384
  112,600,802
  112,601,376
  112,602,447
  112,602,644
  112,603,039
  112,603,671
  112,604,262
  112,607,050
  112,607,465
  112,607,851
  112,610,244
  112,610,279
  112,610,573
  112,612,482
  112,613,065
  112,613,212
  112,616,246
  112,616,248
  112,621,613
  112,622,154
  112,624,125
  112,630,386
  112,631,112
  112,633,179
  112,635,015
  112,635,856
  112,637,311
  112,637,808
  112,642,613
  112,643,175
  112,643,718
  112,644,344
  112,644,359
  112,645,412
  112,645,894
  112,646,884
  112,646,944
  112,649,155
  112,649,159
  112,651,303
  112,651,744
  112,652,881
  112,653,972
  112,654,216
  112,654,881
  112,655,579
  112,656,306
  112,656,988
  112,657,506
  112,658,156
  112,659,290
  112,659,323
  112,661,200
  112,661,996
  112,662,287
  112,662,988
  112,663,375
  112,663,387
  112,663,498
  112,664,024
  112,664,125
  112,665,776
  112,666,149
  112,667,159
  112,667,737
  112,667,798
  112,668,535
  112,669,252
  112,669,652
  112,669,750
  112,671,293
  112,671,772
  112,672,330
  112,672,411
  112,672,412
  112,673,743
  112,674,201
  112,675,240
  112,675,566
  112,675,776
  112,678,792
  112,679,049
  112,679,524
  112,680,780
  112,681,810
  112,681,828
  112,682,304
  112,683,015
  112,685,156
  112,687,300
  112,687,372
  112,687,612
  112,687,718
C
7/9
5
C
C/20
2/-
-
-
T
2
C
2/-
-
9/13
-
T/5
2/-
2/-
C/2
-
-
2
3
A
2
A
-
-
-
C
T
9
C
G
G
G
-
A
T/2
A
3
2
2
-
G
2
G
T
G
C
G
A/3
7/5
C
A
C
T
A
G
-
-
G
C
T
C
C
2/-
C
A
A
C
-
A
C
2
-
A
2
A
C
C
-
2
T
C
C/2
T/-
A
C
T/11
2
C
11
A
C
T
2
C
6/-
4/-
G
T/2
G
2/-
T/-
G
T
C
2
12/-
T
A
-
T
T
C
G
A
T
C
T/-
-
G
A
C
G
G
A
2
3
C
A
C
A/17
A/3
A
4
10/-
8/-
T
A
13
17
-
C
A
T
T
G
G
-
C
G
G
T
G
T
A
C
-
2
T
T
-
2
A
T
G
C
G
64/-
T
C
C
-
T
T
A
-
G
C
C
A
T
C
G
6/-
C/2
3
T
C
A
C
-
2
T
10/-
8/-
G
T
2
A
C
-
-
-
G
A
T
T
T
-
A
-
-
A
G
7
51
-
C
A
G
15
2/-
31
5
T
C
T
T/-
4/-
8/-
C
7
A/5
7/15
C/G
C
G
G
-
T
C
C
C
6
T
2
A
A
G
T
T
G
T
T
3
-
T
C
A
G
G
A
A
3
C
G
T
-
-
C