Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 131,273 (bp)   Positions: 376
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.128
--
.003
.16
.162
.064
.023
.682
.005
.271
.008
.208
.196
--
.271
.315
.359
.018
.002
--
.063
.498
.207
.235
--
--
--
.066
--
--
--
.557
.016
--
--
--
--
--
--
--
.224
.379
.006
.005
.013
.003
--
--
.005
.586
.457
--
.079
.0
.013
.003
.004
.018
.133
.039
.054
.008
--
.058
.998
.016
.061
.05
.028
.001
.001
.033
.001
.001
.317
.002
.008
.025
.95
.01
.002
.001
.001
.002
.007
.014
.03
.009
.003
.001
.034
.029
.037
.002
.286
--
--
--
.307
.212
.229
.004
.318
.147
.128
.057
.014
.015
.006
.032
.002
--
--
--
--
--
.241
.049
.063
--
.001
.0
--
.254
.032
.003
.007
--
.115
.099
.076
.067
.12
--
.049
.039
.341
.011
.001
.001
.007
.005
.044
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.319
.307
.271
.002
.013
.634
.061
.229
.348
.021
.01
.021
.001
.007
.006
.031
.012
.0
.002
1.0
.919
.327
.0
.009
.092
.055
.068
.01
.083
.0
.002
.011
.001
.01
.409
.005
--
--
.004
.314
.007
.038
.041
.001
.01
.015
.0
.007
.027
.014
.215
.653
.055
.005
--
--
--
1.0
.952
.15
.001
.015
.024
--
.869
.905
.905
.006
.064
.062
.135
.059
.096
.056
.059
.05
.06
.011
.001
.001
.19
.369
.001
.018
.003
.004
.003
.002
.187
.082
.0
.0
.184
.003
.001
.033
.014
.002
.012
.0
.034
.124
.002
.971
--
--
--
.002
.003
.658
.013
.014
.016
.0
.0
.0
.0
.0
.186
.122
.717
.028
--
.004
.061
.315
.077
.005
.004
.567
.001
.0
.003
.001
--
--
--
--
--
.04
.295
.084
.354
.004
.001
.001
.002
.157
.013
--
--
--
--
--
.0
.0
.019
--
.047
.053
.308
.307
.052
.175
.175
.439
.017
.0
.017
.005
--
--
--
.109
.002
.001
.001
.014
.009
.01
.071
.222
--
--
--
.007
.14
.382
1.0
.0
.002
.015
.002
.007
.816
.02
.001
.002
.791
.899
.064
.0
.002
.0
.014
.0
.013
.564
.0
.002
.832
.918
.001
.0
.01
.001
.05
.051
.0
.974
1.0
Pcca
Pcca
Pcca
Pcca
Pcca
Pcca
Pcca
Pcca
Pcca
Pcca
Pcca
Pcca
Pcca
Pcca
Pcca
Pcca
Pcca
Pcca
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
A
T
T
T
C
2
G
2
A
T
T
T
10
G
G
T
T
T
C
C
T
A
G
G
4
G
4
T
A
T
C
4
A
C
5
78
8
8
71
C
T
A
2
T
T
C
A
G
G
T
A
T
A
T
C
T
G
G
T
T
G
A
T
20
10
T
A
G
C
A
T
C
18
12
2
T
T
C
G
A
T
G
A
G
T
A
T
C
T
G
A
4
2
G
C
T
G
G
A
T
T
C
T
2
17
T
A
T
G
4
C
3
T
T
C
T
T
T
G
C
A
C
T
C
A
G
C
C
A
A
T
T
C
G
G
A
C
T
A
A
T
C
C
A
A
T
G
3
G
G
15
G
A
A
A
T
A
T
T
T
2
A
C
C
4
T
G
10
C
C
G
T
T
G
35
A
C
T
C
G
G
10
T
G
T
C
T
T
T
G
T
6
4
A
T
C
2
T
C
C
T
A
C
G
T
A
A
T
T
2
A
C
A
A
A
G
C
A
G
T
G
T
2
4
2
7
G
G
12
10
C
A
G
G
A
T
G
G
C
C
C
A
C
A
2
T
A
C
T
G
T
A
G
C
T
T
C
G
T
G
C
A
T
A
16
G
T
C
C
C
C
C
C
T
T
G
C
T
A
T
A
A
C
G
C
12
10
C
A
A
A
C
T
T
G
A
2
G
14
4
A
T
G
C
G
C
G
C
G
G
A
G
4
T
A
A
G
2
C
T
6
A
T
11
C
3
4
5
A
14
12
G
C
C
G
G
A
C
C
T
A
T
2
T
T
G
G
T
C
T
T
G
T
C
A
C
T
C
G
G
C
11
A
T
T
T
G
11
10
A
A
T
A
2
2
T
  112,347,223
  112,347,439
  112,348,085
  112,348,541
  112,349,303
  112,349,347
  112,349,965
  112,350,498
  112,351,208
  112,351,788
  112,352,276
  112,352,846
  112,353,574
  112,354,979
  112,355,096
  112,355,099
  112,355,102
  112,355,285
  112,355,489
  112,355,522
  112,355,847
  112,357,109
  112,358,599
  112,359,365
  112,359,640
  112,359,647
  112,359,684
  112,360,072
  112,360,264
  112,360,269
  112,361,533
  112,363,371
  112,363,585
  112,363,722
  112,364,174
  112,364,180
  112,364,366
  112,364,375
  112,364,386
  112,364,558
  112,365,693
  112,366,769
  112,366,814
  112,366,815
  112,366,818
  112,367,351
  112,367,742
  112,367,743
  112,369,909
  112,370,371
  112,372,067
  112,372,263
  112,372,620
  112,373,072
  112,374,715
  112,375,053
  112,375,766
  112,376,124
  112,376,696
  112,376,821
  112,378,146
  112,382,116
  112,382,728
  112,386,479
  112,386,888
  112,387,580
  112,387,637
  112,388,390
  112,388,652
  112,388,756
  112,389,850
  112,393,601
  112,394,066
  112,394,072
  112,394,274
  112,394,439
  112,395,064
  112,396,010
  112,397,210
  112,397,316
  112,406,515
  112,406,516
  112,406,518
  112,406,521
  112,406,524
  112,406,525
  112,406,528
  112,407,111
  112,407,426
  112,408,606
  112,408,779
  112,409,821
  112,409,823
  112,414,966
  112,415,057
  112,416,280
  112,416,282
  112,416,283
  112,416,557
  112,420,262
  112,421,290
  112,422,484
  112,423,659
  112,423,729
  112,423,733
  112,425,377
  112,425,909
  112,430,541
  112,430,727
  112,431,731
  112,431,807
  112,431,876
  112,434,137
  112,434,966
  112,435,239
  112,435,955
  112,436,531
  112,436,677
  112,437,088
  112,438,821
  112,444,041
  112,444,042
  112,444,804
  112,445,448
  112,447,105
  112,447,180
  112,447,249
  112,448,209
  112,450,373
  112,450,376
  112,450,380
  112,450,381
  112,451,247
  112,452,340
  112,453,037
  112,453,252
  112,454,138
  112,454,280
  112,456,067
  112,456,226
  112,456,650
  112,458,245
  112,459,983
  112,460,589
  112,460,625
  112,460,746
  112,460,960
  112,461,234
  112,462,674
  112,462,687
  112,463,034
  112,463,147
  112,464,109
  112,464,507
  112,464,625
  112,465,545
  112,465,972
  112,465,987
  112,468,185
  112,468,602
  112,469,604
  112,471,665
  112,471,720
  112,472,432
  112,473,268
  112,473,549
  112,474,250
  112,475,456
  112,476,206
  112,476,209
  112,476,283
  112,503,962
  112,503,981
  112,503,993
  112,505,105
  112,505,204
  112,505,345
  112,505,773
  112,505,781
  112,506,348
  112,506,413
  112,507,482
  112,507,524
  112,508,296
  112,509,827
  112,510,531
  112,511,695
  112,511,743
  112,512,103
  112,512,817
  112,513,771
  112,515,745
  112,515,747
  112,518,387
  112,519,025
  112,519,178
  112,519,720
  112,519,721
  112,519,995
  112,523,241
  112,523,243
  112,523,346
  112,526,086
  112,527,903
  112,528,009
  112,532,997
  112,533,871
  112,534,731
  112,535,434
  112,541,917
  112,543,021
  112,544,133
  112,545,594
  112,545,709
  112,546,262
  112,549,950
  112,551,826
  112,551,830
  112,552,023
  112,555,561
  112,555,573
  112,555,574
  112,556,426
  112,556,465
  112,556,528
  112,556,987
  112,558,085
  112,558,725
  112,558,793
  112,558,795
  112,559,419
  112,559,563
  112,563,018
  112,563,738
  112,563,743
  112,566,108
  112,566,120
  112,566,615
  112,566,710
  112,568,001
  112,570,286
  112,571,472
  112,572,907
  112,573,209
  112,574,855
  112,576,872
  112,578,624
  112,580,034
  112,580,388
  112,580,389
  112,581,206
  112,581,301
  112,581,332
  112,581,825
  112,583,495
  112,585,178
  112,585,496
  112,585,792
  112,585,951
  112,587,303
  112,587,808
  112,590,198
  112,591,571
  112,593,174
  112,594,818
  112,594,929
  112,595,947
  112,596,012
  112,600,378
  112,600,379
  112,600,380
  112,600,383
  112,600,384
  112,600,802
  112,601,376
  112,602,447
  112,602,925
  112,603,039
  112,603,671
  112,607,051
  112,607,465
  112,607,523
  112,607,851
  112,610,279
  112,613,212
  112,616,244
  112,616,246
  112,616,671
  112,621,613
  112,623,547
  112,624,125
  112,624,150
  112,624,152
  112,631,112
  112,631,499
  112,633,132
  112,633,179
  112,634,692
  112,635,022
  112,635,856
  112,637,311
  112,637,450
  112,640,176
  112,643,718
  112,644,346
  112,644,359
  112,645,380
  112,648,081
  112,648,208
  112,649,155
  112,649,159
  112,649,202
  112,651,305
  112,651,744
  112,653,972
  112,654,216
  112,654,510
  112,654,881
  112,655,597
  112,655,606
  112,656,307
  112,656,369
  112,657,506
  112,657,837
  112,658,156
  112,659,288
  112,659,323
  112,659,344
  112,661,068
  112,661,194
  112,661,196
  112,661,996
  112,662,078
  112,662,287
  112,662,766
  112,662,809
  112,662,988
  112,663,375
  112,663,387
  112,663,498
  112,664,024
  112,664,125
  112,665,775
  112,667,159
  112,667,737
  112,667,798
  112,668,132
  112,668,535
  112,669,252
  112,669,652
  112,669,750
  112,671,293
  112,671,772
  112,672,411
  112,672,412
  112,673,743
  112,673,831
  112,673,879
  112,674,201
  112,674,429
  112,675,240
  112,675,265
  112,675,566
  112,679,049
  112,679,524
  112,680,780
  112,681,810
  112,682,305
  112,682,306
  112,683,015
  112,685,156
  112,685,620
  112,685,622
  112,687,372
  112,687,612
  112,687,718
T
-
C
C
9
-
A
-
A/5
9
C
G
-
6
T
5
T/2
C
20
T
C
T
A
A
-
A
-
G
C
A
T
-
G
G
5/-
78/-
8/-
8/-
71/-
T
C
-
-
4
C
2
G
T
A
C
G
C
2
C
T
C
T
A
12
C
T
G
2
-
-
C
-
9/13
T
G
C
8
18/-
12/-
2/-
G
2
T
A
C
A
C
C
T
A
2
A
A
C
2
G
4/-
2/-
A
A
8
C
A
G
G
2
T
9
-
-
C
C
C
-
-
G
-
C
C
T
C
C
G
A
G
G
G
C
-
C
A
T
-
4
-
C
A
3
2
A
2
-
G
G
G
C
T
G
3
11
C
A
-
T
2
-
A
G
-
T
-
G
C
C
C
-
C
T
7
-
C
2
-
A
C/2
A
A
C
A
35/-
A/2
T
C
C/2
A
C
-
11
3
C
T
11
A
C
T
C
6/-
4/-
G
T/2
C/36
2/-
T/-
G
T
C
2
T
A
-
C
G
C
T/-
-
G
13
G
G
G
A
2
3
A
C
A
C
2/-
4/-
-
-
A
4
12/-
10/-
T
G
A
13
17
C
A
A
T
T
T
G
T
G
-
C
G
T
G
T
C
11
A
5
C
-
T
T
-
A
T
G
C
G
-
17
C
-
T
T
A
-
G
C
C
A
T
C
G
-
3
3
T
A
T
12/-
10/-
T
G
G
2
T
A
C
A
G
-
A
-
-
G
C
T
T
2
A
C
-
A
7
51
A
4/-
C
G
5
A
-
10
13
-
T
C
-
T
-
4/-
5/-
-
14/-
-
C
T
7/5
A
2
6/5
15/3
G
C
G
G
-
C
C
C
5
6
T
T/2
A
A
G
T
G
T
C
T
T
A
3
11/-
-
A
G
G
A
-
10/-
C
G
14
2
-
-
C