Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 160,282 (bp)   Positions: 293
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.877
.001
.069
.845
--
--
.006
.005
.0
.462
.146
.549
1.0
.001
.038
.163
.005
.013
.013
.029
.033
.001
.005
.002
.271
.093
.046
.001
.0
.0
.002
.0
.001
.0
.003
.017
.125
.089
.01
.012
.06
.067
.016
.326
.043
.068
.0
.04
.021
.005
.001
.361
.273
.003
.007
.231
.039
.021
.02
.004
.053
.049
.006
.001
.141
.162
.009
.002
.051
.004
.005
.227
.016
.09
.002
.001
.716
.001
.0
.028
.3
.009
--
--
.059
.013
.087
.019
.205
--
--
--
--
--
--
.028
.091
.004
.022
.081
.306
--
.066
.072
.034
.018
.338
.003
.026
.002
.002
--
.021
.074
.134
.015
.041
.151
.0
.017
.016
--
.075
.001
.002
.0
.0
.053
.548
.092
.537
--
--
--
--
.002
.0
.0
.001
.001
.002
.005
.08
.001
.011
.004
.0
.013
.003
.0
.146
.001
.002
.003
.004
.058
.006
.002
.09
.002
.169
.001
.08
--
--
.844
.006
.422
.0
.0
.0
.027
.992
.99
.0
.019
.169
.003
--
.01
.001
.013
--
.154
.007
.001
.004
.081
.101
.0
.095
.0
.0
.002
.037
.005
.005
.01
.0
.001
1.0
.034
.074
.063
.0
.014
.001
.001
.029
.0
.043
--
--
--
--
--
.053
.112
.076
.035
.042
.054
--
.071
.001
.001
.021
.002
.257
.023
.037
.015
.008
.007
.009
.0
.0
.001
.045
.004
.002
.013
.103
.018
.054
.214
.223
.099
.01
.003
.064
.01
.003
.227
.372
.066
.03
.0
.023
.003
.001
.0
.004
.0
.019
.0
.0
.0
.002
.001
.0
.0
.004
.001
.002
.008
.001
.003
.0
.001
.01
.023
.005
.181
.112
.059
.001
.001
.0
.0
.0
.0
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
G
G
C
T
G
C
A
A
C
C
C
G
A
C
T
A
A
C
T
C
11
C
G
A
T
T
T
G
A
T
G
C
G
C
A
T
T
A
A
T
11
A
C
T
A
T
C
T
A
A
A
T
8
A
C
T
T
4
G
C
C
C
G
T
T
T
10
40
G
A
C
G
T
A
C
C
G
G
G
A
G
C
A
T
G
G
C
C
A
G
A
G
A
C
C
A
T
G
C
A
T
T
C
C
T
A
G
T
T
T
C
C
C
G
A
G
C
C
C
T
A
61
C
T
G
C
G
6
G
A
A
C
C
T
T
C
C
A
A
A
C
T
G
G
A
T
T
T
C
G
G
T
A
T
T
C
G
T
A
G
T
T
G
C
C
T
G
A
G
G
T
T
A
T
A
C
T
A
A
A
A
T
A
C
A
G
C
T
2
G
G
T
T
T
A
A
A
3
A
A
G
4
T
G
A
C
A
T
G
A
T
T
G
C
C
C
T
19
A
T
C
A
C
T
T
G
C
T
C
T
A
T
C
C
A
T
A
T
C
T
T
T
G
A
G
10
8
C
T
A
T
G
A
C
A
G
C
T
C
C
C
T
G
T
A
G
C
C
G
G
G
C
A
A
A
T
G
C
T
A
T
G
T
T
4
T
A
C
G
T
G
T
G
  46,049,661
  46,050,480
  46,050,730
  46,050,743
  46,051,026
  46,051,093
  46,051,600
  46,053,210
  46,053,664
  46,053,817
  46,054,798
  46,054,948
  46,055,331
  46,055,761
  46,056,242
  46,056,766
  46,056,933
  46,056,961
  46,057,094
  46,057,182
  46,057,252
  46,057,556
  46,057,889
  46,057,905
  46,058,166
  46,058,237
  46,058,271
  46,058,360
  46,058,425
  46,058,650
  46,058,690
  46,058,785
  46,058,896
  46,059,036
  46,059,585
  46,059,663
  46,059,736
  46,059,738
  46,059,787
  46,060,016
  46,060,181
  46,060,522
  46,060,553
  46,060,910
  46,060,982
  46,061,135
  46,061,467
  46,061,534
  46,061,611
  46,061,751
  46,061,820
  46,062,260
  46,062,280
  46,063,407
  46,063,415
  46,063,463
  46,066,555
  46,066,564
  46,066,572
  46,086,662
  46,086,983
  46,087,074
  46,087,836
  46,087,868
  46,088,849
  46,089,249
  46,092,282
  46,092,294
  46,094,259
  46,095,796
  46,095,908
  46,095,935
  46,099,744
  46,099,890
  46,106,576
  46,106,598
  46,107,105
  46,107,538
  46,107,541
  46,107,797
  46,109,067
  46,109,201
  46,111,475
  46,113,068
  46,113,225
  46,114,752
  46,115,144
  46,115,244
  46,116,096
  46,117,815
  46,118,287
  46,118,477
  46,118,494
  46,118,507
  46,119,201
  46,119,355
  46,119,555
  46,119,964
  46,120,586
  46,120,638
  46,121,080
  46,121,772
  46,122,647
  46,122,718
  46,123,313
  46,123,503
  46,123,552
  46,123,820
  46,124,524
  46,143,572
  46,143,642
  46,144,319
  46,144,719
  46,144,947
  46,145,340
  46,145,416
  46,145,656
  46,145,914
  46,146,217
  46,146,244
  46,147,400
  46,147,829
  46,147,984
  46,148,655
  46,148,935
  46,149,488
  46,149,642
  46,150,075
  46,150,218
  46,150,418
  46,150,454
  46,151,513
  46,151,517
  46,151,550
  46,151,616
  46,152,348
  46,152,354
  46,152,505
  46,153,604
  46,153,618
  46,153,730
  46,153,862
  46,154,259
  46,154,713
  46,155,104
  46,155,228
  46,155,631
  46,156,305
  46,156,677
  46,156,688
  46,156,831
  46,157,160
  46,157,163
  46,157,170
  46,157,175
  46,158,442
  46,158,527
  46,159,286
  46,160,920
  46,161,217
  46,161,240
  46,161,598
  46,161,771
  46,161,838
  46,161,865
  46,162,075
  46,162,318
  46,162,419
  46,163,294
  46,163,296
  46,163,327
  46,163,352
  46,163,500
  46,163,502
  46,163,810
  46,165,850
  46,166,020
  46,166,414
  46,169,461
  46,169,821
  46,170,136
  46,170,409
  46,172,318
  46,172,675
  46,173,317
  46,173,906
  46,174,219
  46,174,363
  46,174,665
  46,175,221
  46,175,328
  46,175,356
  46,175,357
  46,175,362
  46,176,698
  46,176,815
  46,177,145
  46,177,689
  46,177,884
  46,178,254
  46,182,753
  46,183,053
  46,183,098
  46,183,415
  46,183,855
  46,184,105
  46,184,113
  46,184,340
  46,184,733
  46,184,754
  46,185,124
  46,185,243
  46,185,947
  46,186,247
  46,186,305
  46,186,812
  46,187,594
  46,187,880
  46,188,140
  46,188,413
  46,188,453
  46,188,460
  46,189,020
  46,191,887
  46,192,275
  46,193,082
  46,194,020
  46,194,886
  46,195,068
  46,196,240
  46,196,254
  46,196,660
  46,196,887
  46,196,900
  46,196,902
  46,197,771
  46,199,167
  46,200,305
  46,200,786
  46,202,470
  46,203,005
  46,203,518
  46,203,788
  46,203,814
  46,204,475
  46,204,554
  46,204,556
  46,204,657
  46,204,733
  46,204,793
  46,204,807
  46,204,845
  46,204,895
  46,204,928
  46,204,938
  46,204,953
  46,205,022
  46,205,141
  46,205,207
  46,205,222
  46,205,352
  46,205,493
  46,205,514
  46,205,520
  46,205,836
  46,205,979
  46,206,022
  46,206,094
  46,206,142
  46,206,146
  46,206,150
  46,206,166
  46,206,318
  46,206,349
  46,206,441
  46,206,500
  46,206,510
  46,206,516
  46,206,521
  46,206,538
  46,206,584
  46,206,585
  46,206,645
  46,206,657
  46,206,672
  46,206,865
  46,207,515
  46,208,217
  46,208,317
  46,208,420
  46,208,457
  46,208,573
  46,209,539
A
C
T
C
2
T
G
G
T
2
T
A
G
A
G
-
G
T
C
G
-
T
A
T
C
C
C
A
G
A
A
T
A
T
G
C
C
G
G
C
-
G
T
C
G
2
T
C
G
-
G
G
-
3
T
C
3
-
T
A
T
T
C
G
C
C
-
-
2
G
T
A
C
G
T
T
A
A
A
C
C
-
-
C
C
A
T
T
T
A
-
9
7
5
7
G
C
C
T
-
C
-
A
G
C
G
A
7
C
A
T
T
T
A
G
A
T
T
T
C
G
-
T
C
2
3
C
-
A
-
-
3
3
3
5
T
A
G
C
G
T
5
A
A
G
C
C
C
C/G
2
2
2
2
C
2
G
A
C
G
A
C
C
A
T
T
2
3
G
A
A
3
C
C
C
G
T
2
T
3
G
G
C
-
A
C
A
T
7
-
A
-
A
A
A
G
G
G
-
G
G
A
-
5
A
G
G
G
C
T
G
C
C
-
T
T
G
A
-
T
5
T
2
-
C
C
A
T
G
T
2
T
C
A
A
C
C
A/C
C
T
C
3
2
A
G
A
10/-
8/-
T
C
C
C
A
T
T
3
A
A
C
T
T
T
C
A
C
G
A
T
T
-
A
C
T
G
G
C
C
C
T
C
G
C
A
C
C
-
C
G
-
A
C
A
C
A