Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 160,282 (bp)   Positions: 376
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.877
.007
.001
.069
.845
--
--
.006
--
--
.005
.0
.462
.009
.146
.549
1.0
.001
.038
.163
.005
.013
.013
.029
.033
.001
.005
.002
.024
.041
.271
.093
.046
.001
.0
.0
.002
.0
.001
.0
.003
.017
.125
.089
.01
.012
.06
.031
.067
.016
.326
.043
.068
.001
.0
.04
.021
.005
.001
.001
.001
.002
.361
.273
.003
.007
.231
.039
.021
.007
.007
--
.161
.082
.004
.053
.049
.006
.001
.139
.141
.162
.008
--
.051
.004
.005
.227
.017
.016
.09
.002
.001
.716
.001
.0
.028
.01
.3
.009
--
--
--
--
--
.019
.018
--
.011
.059
--
.013
.087
.019
.205
--
--
--
--
--
--
--
--
.028
.091
.004
.022
.081
.306
--
.0
.004
.007
.003
.0
.002
.066
.072
.034
.018
.338
.003
.005
.026
--
.04
.226
.002
--
.021
.074
.134
.015
.041
.225
.154
.135
.074
.092
.151
.0
.017
.016
--
--
--
--
--
--
.075
.001
.002
.0
.0
.009
.012
.012
.548
.092
.537
.013
--
--
--
--
--
--
.002
.0
.0
.001
.001
.002
.005
.003
.002
--
--
.08
.001
.011
.004
.0
.013
.0
.157
.001
.002
.003
.004
.09
.002
.169
.001
.08
--
--
--
.844
.006
.422
.0
.0
.0
.0
.027
.992
.99
.0
.005
.019
.169
.003
.096
.626
.662
--
.01
.001
.013
--
.154
.007
.001
.017
.018
.008
.004
.081
.001
.103
.101
.106
--
--
--
--
--
--
.095
.0
.0
.002
.027
.003
.037
.001
.012
.001
.006
.013
.04
.001
.002
.288
.079
.251
.268
.127
.137
.145
.0
.014
.087
.043
--
.009
--
--
.042
.054
--
.029
.065
.383
.071
.128
.178
.039
.01
.002
.031
.051
.125
.023
.037
.015
.511
.069
.018
.027
.0
.0
.148
.0
.637
.006
.001
.987
.825
.173
.001
.117
.011
.002
.002
.004
.0
.002
.013
.018
.064
.003
.125
.227
.372
.066
.03
.016
.0
.023
.0
.004
.0
.019
.0
.0
.0
.002
.0
.0
.004
.001
.002
.008
.001
.003
.0
.001
.01
.023
.005
.181
.112
.059
.069
.008
.001
.001
.001
.0
.0
.009
.0
.0
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
Nos1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
G
G
G
C
T
G
C
A
3
2
A
C
C
T
C
G
A
C
T
A
A
C
T
C
11
C
G
A
G
C
T
T
T
G
A
T
G
C
G
C
A
T
T
A
A
T
11
A
A
C
T
A
T
A
C
T
A
A
A
T
A
A
T
4
A
C
T
T
4
2
G
T
G
T
C
C
C
G
T
G
T
T
A
A
G
A
C
G
T
T
A
C
C
G
G
G
A
G
G
C
G
3
T
T
A
T
T
T
T
G
C
G
C
C
A
G
A
A
T
A
T
C
C
A
T
G
C
A
T
T
T
3
C
T
7
T
C
C
T
A
G
T
T
T
C
A
G
C
C
C
G
A
G
C
A
G
G
T
A
C
C
T
A
C
A
G
A
C
G
C
T
G
C
G
C
8
T
G
A
A
4
C
C
C
T
T
T
C
C
A
A
A
C
T
C
3
C
C
G
G
A
T
T
T
G
G
T
A
T
T
A
G
T
T
G
C
C
C
T
G
A
2
G
4
T
T
A
T
A
T
C
T
A
T
4
2
A
A
A
T
A
C
A
G
C
C
G
C
T
C
T
4
2
A
2
2
9
6
3
G
T
T
T
A
C
A
2
T
A
G
C
C
G
G
3
C
T
T
A
C
C
A
C
13
T
C
C
C
C
C
A
C
T
T
C
T
C
C
C
T
T
G
C
G
T
A
T
A
T
A
A
T
T
T
C
C
2
G
A
G
C
T
T
T
C
C
T
C
C
T
A
T
A
A
C
A
G
C
G
T
C
T
G
T
A
G
C
C
G
G
C
A
A
A
T
G
C
T
A
T
G
T
T
4
T
A
T
A
A
C
T
G
G
T
G
G
  46,049,661
  46,050,312
  46,050,480
  46,050,730
  46,050,743
  46,051,026
  46,051,093
  46,051,600
  46,051,993
  46,051,994
  46,053,210
  46,053,664
  46,053,817
  46,053,838
  46,054,798
  46,054,948
  46,055,331
  46,055,761
  46,056,242
  46,056,766
  46,056,933
  46,056,961
  46,057,094
  46,057,182
  46,057,252
  46,057,556
  46,057,889
  46,057,905
  46,058,002
  46,058,153
  46,058,166
  46,058,237
  46,058,271
  46,058,360
  46,058,425
  46,058,650
  46,058,690
  46,058,785
  46,058,896
  46,059,036
  46,059,585
  46,059,663
  46,059,736
  46,059,738
  46,059,787
  46,060,016
  46,060,181
  46,060,404
  46,060,522
  46,060,553
  46,060,910
  46,060,982
  46,061,135
  46,061,387
  46,061,467
  46,061,534
  46,061,611
  46,061,751
  46,061,820
  46,061,862
  46,061,869
  46,061,881
  46,062,260
  46,062,280
  46,063,407
  46,063,415
  46,063,463
  46,066,555
  46,066,564
  46,067,743
  46,067,744
  46,072,137
  46,077,969
  46,085,617
  46,086,662
  46,086,983
  46,087,074
  46,087,836
  46,087,868
  46,088,041
  46,088,849
  46,089,249
  46,092,283
  46,092,333
  46,094,259
  46,095,796
  46,095,908
  46,095,935
  46,097,627
  46,099,744
  46,099,890
  46,106,576
  46,106,598
  46,107,105
  46,107,538
  46,107,541
  46,107,797
  46,108,328
  46,109,067
  46,109,201
  46,110,319
  46,110,320
  46,110,333
  46,110,384
  46,111,475
  46,112,285
  46,112,286
  46,113,068
  46,113,172
  46,113,225
  46,113,870
  46,114,752
  46,115,144
  46,115,244
  46,116,096
  46,117,815
  46,117,865
  46,117,875
  46,118,045
  46,118,287
  46,118,429
  46,118,507
  46,119,201
  46,119,355
  46,119,555
  46,119,964
  46,120,586
  46,120,638
  46,121,080
  46,121,772
  46,122,135
  46,122,152
  46,122,171
  46,122,212
  46,122,215
  46,122,221
  46,122,647
  46,122,718
  46,123,313
  46,123,503
  46,123,552
  46,123,820
  46,124,120
  46,124,524
  46,125,026
  46,125,232
  46,142,706
  46,143,642
  46,144,319
  46,144,719
  46,144,947
  46,145,340
  46,145,416
  46,145,656
  46,145,797
  46,145,813
  46,145,815
  46,145,826
  46,145,832
  46,145,914
  46,146,217
  46,146,244
  46,147,400
  46,147,853
  46,147,857
  46,147,876
  46,147,878
  46,147,886
  46,147,889
  46,147,984
  46,148,655
  46,148,935
  46,149,488
  46,149,642
  46,150,106
  46,150,134
  46,150,137
  46,150,218
  46,150,418
  46,150,454
  46,151,329
  46,151,507
  46,151,513
  46,151,517
  46,151,550
  46,151,563
  46,151,616
  46,152,348
  46,152,354
  46,152,505
  46,153,604
  46,153,618
  46,153,730
  46,153,862
  46,154,052
  46,154,055
  46,154,086
  46,154,162
  46,154,259
  46,154,713
  46,155,104
  46,155,228
  46,155,631
  46,156,305
  46,156,688
  46,156,836
  46,157,160
  46,157,163
  46,157,170
  46,157,175
  46,160,920
  46,161,217
  46,161,240
  46,161,598
  46,161,771
  46,161,824
  46,161,838
  46,161,865
  46,162,075
  46,162,318
  46,162,419
  46,163,280
  46,163,294
  46,163,295
  46,163,327
  46,163,352
  46,163,500
  46,163,502
  46,163,810
  46,164,197
  46,165,850
  46,166,020
  46,166,414
  46,167,837
  46,167,889
  46,167,891
  46,169,461
  46,169,821
  46,170,136
  46,170,409
  46,172,318
  46,172,675
  46,173,317
  46,173,906
  46,173,979
  46,174,050
  46,174,068
  46,174,219
  46,174,363
  46,174,382
  46,174,664
  46,174,665
  46,174,667
  46,174,711
  46,174,719
  46,174,747
  46,174,826
  46,174,830
  46,174,831
  46,175,328
  46,175,356
  46,175,357
  46,175,362
  46,176,025
  46,176,428
  46,176,698
  46,177,675
  46,177,688
  46,178,254
  46,178,764
  46,179,637
  46,179,704
  46,181,235
  46,182,122
  46,182,389
  46,183,345
  46,183,368
  46,183,377
  46,183,602
  46,183,605
  46,183,608
  46,183,855
  46,184,105
  46,185,061
  46,185,124
  46,185,159
  46,185,627
  46,186,762
  46,186,812
  46,188,453
  46,188,460
  46,189,139
  46,189,912
  46,190,669
  46,191,836
  46,191,887
  46,192,584
  46,192,795
  46,193,811
  46,194,876
  46,194,886
  46,195,193
  46,195,224
  46,195,369
  46,196,240
  46,196,254
  46,196,660
  46,197,002
  46,197,199
  46,197,329
  46,197,330
  46,197,703
  46,197,771
  46,198,014
  46,198,160
  46,198,409
  46,198,938
  46,199,203
  46,199,268
  46,199,319
  46,200,069
  46,200,305
  46,200,660
  46,200,813
  46,201,238
  46,202,405
  46,202,470
  46,202,648
  46,203,062
  46,203,518
  46,203,814
  46,204,807
  46,204,895
  46,204,920
  46,204,928
  46,204,938
  46,204,953
  46,205,022
  46,205,067
  46,205,141
  46,205,207
  46,205,493
  46,205,514
  46,205,520
  46,205,836
  46,205,979
  46,206,022
  46,206,094
  46,206,142
  46,206,150
  46,206,166
  46,206,318
  46,206,349
  46,206,441
  46,206,500
  46,206,510
  46,206,516
  46,206,521
  46,206,538
  46,206,584
  46,206,585
  46,206,645
  46,206,657
  46,206,672
  46,206,865
  46,207,120
  46,207,175
  46,207,515
  46,207,816
  46,208,217
  46,208,420
  46,208,457
  46,208,546
  46,208,573
  46,208,596
  46,209,539
A
A
C
T
C
2
T
G
3/-
2/-
G
T
2
2
T
A
G
A
G
-
G
T
C
G
-
T
A
T
A
4
C
C
C
A
G
A
A
T
A
T
G
C
C
G
G
C
-
G
G
T
C
G
2
2
T
C
G
-
G
C
AC/4
A/G
G
-
3
T
C
3
-
2/-
G/-
-
A
-
A
T
T
C
G
A
C
C
G
G
2
G
T
A
G
C
G
T
T
A
A
A
C
3
C
-
G/2
3/-
2
3
-
2
5
C
T/G
C
3
A
T
T
T
A
A/2
G
T/C
-
2
C/T
7
G
C
C
T
-
C
-
T/C
3/-
-
T/C
-
3/TC
A
G
C
G
A
7/C
C
C
C/G
2
3
T
T
T
A
G
A
T
G
G/A
G/A
2
G
T
T
C
G
C/T
G
A
-
T
A
T
C
2
3
C
2
-
T/C
A
-
-
-
5
3
T/3
3
T/3
5
T
A
G
C
G
T
T/5
2
3/-
C/T
C/-
A
A
G
C
C
C
4
-
2
2
C
2
G
A
C
C
A
C/T
C/T
C/T
2
3
G
2/-
A
4/-
3
C
C
C
G
-
T
2
T
C
4/-
2/-
3
G
G
C
-
CT/CA
C
A
T
T
A
T
7
T
5
4/-
2/-
A/G
2/-
2/-
9/-
6/-
-
-
A
A
A
C
T
G
-
T/-
G
A
T
A
A
A
-
T
T/C
T/C
3
2
3
G
G
-
C
T
T
T
G
T
2
T
T/G
G
2
C
T
A
T
C
G
A
T
A
2
T
C
G
C
2
13
C
C
G
T
T
-
3
G
A
-
C
C
C
C/T
T
C
T
T
2
G
C
T
T
T
3
A
A
A
C
T
C
A
C
G
A
T
T
-
C
T
G
G
C
C
C
T
C
G
C
A
C
C
-
C
-
C
G
G
-
C
A
A
C
A
A