Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 609,362 (bp)   Positions: 395
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.0
.625
1.0
.224
.002
.0
.001
.013
.014
.0
.002
.035
.0
.001
.001
.004
.003
.001
.002
.0
.123
.0
.003
.0
.0
.144
.001
.007
.0
.233
.996
.002
.164
.006
.001
.0
.544
.0
.001
.011
.004
.769
.987
.002
1.0
.004
.004
.002
.02
.001
.711
.001
.002
.141
.357
.0
.088
.0
.001
.037
.003
.004
.0
.016
.299
.032
.047
.015
.079
--
.001
.0
.002
.0
.0
.068
.406
.509
.005
.0
.004
.021
.007
.013
.088
.043
.001
.001
.001
.001
.0
.001
.017
.001
.01
.007
.095
.032
.066
.002
.147
.009
.02
.036
.001
--
.002
.0
.001
.015
.034
.082
.004
.0
.004
.002
.003
.004
.006
.001
.071
.009
.063
.053
.034
.071
.007
.056
.004
.022
.011
.035
.052
.304
.539
.132
.225
.122
.005
.0
.28
.001
.049
--
.0
.005
.051
.018
--
--
--
--
--
.028
.014
.0
.001
.001
.113
.155
--
--
--
.11
.001
.058
.013
.005
.004
.027
.054
.015
.01
.639
.013
.014
.013
.002
.003
.621
.008
.007
.007
.007
.174
.045
.03
.006
.003
.0
--
--
.104
.001
.001
.008
.074
.914
.011
.0
.002
.025
.01
.037
.636
.0
.003
.013
.002
.001
--
.0
.003
.017
.003
.009
.004
.032
.003
.034
.0
.0
.105
.001
.0
.696
.193
.001
.002
.006
.012
.0
.051
.028
.095
.008
.0
.001
.267
.035
.253
.059
.115
.037
.307
.198
.045
.003
.023
.188
.002
.001
.0
.026
.001
.345
.014
--
--
--
.074
.142
.001
.007
.014
.005
.047
.06
.302
.002
.052
.004
.003
.002
.001
.274
--
.495
.07
.012
.001
.011
.009
.001
.002
.001
.033
.07
.002
.0
.006
--
.35
.088
.001
.006
.047
.555
.427
.001
.0
.006
.005
.025
.008
.633
.144
.009
.609
.121
.001
.0
.001
.0
.001
.006
.003
.12
.033
.03
.017
.035
.003
.092
.069
.817
.006
.044
.197
--
--
.01
.008
.009
.004
.153
.3
.035
.0
.069
1.0
.016
.005
--
--
--
--
--
--
--
.012
.019
.018
.007
.011
.052
.001
.001
.002
.0
.008
.046
--
--
.015
.039
.053
.055
.0
.086
.133
.178
.105
--
.005
.231
.014
--
--
--
--
--
--
.003
--
.001
--
--
.004
.005
.002
.0
.005
.005
.184
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Magi1
Magi1
Magi1
Magi1
Magi1
Magi1
Magi1
Magi1
Magi1
Magi1
Magi1
Magi1
Magi1
Magi1
Magi1
Magi1
Magi1
Magi1
Magi1
Magi1
Magi1
Magi1
Magi1
Magi1
Magi1
Magi1
Magi1
Magi1
Magi1
Magi1
Magi1
Magi1
Magi1
Magi1
Magi1
Magi1
Magi1
Magi1
Magi1
Magi1
T
C
A
C
T
T
G
C
A
G
G
G
C
T
C
12
C
C
A
C
A
A
A
T
G
C
3
T
T
A
A
A
2
G
C
C
C
T
G
6
C
T
A
C
T
A
G
C
C
2
C
A
A
2
A
G
G
3
C
C
A
A
A
T
A
A
G
T
C
C
C
A
A
G
T
G
C
A
C
G
3
4
A
C
A
12
G
G
4
4
T
A
G
C
16
A
C
C
A
T
T
C
A
G
C
T
T
T
T
G
T
G
T
T
A
C
G
T
A
T
G
G
G
G
T
G
T
C
G
C
A
C
C
T
G
C
T
T
G
G
T
C
3
3
T
G
T
C
T
G
A
A
C
C
A
A
A
C
T
A
T
T
T
G
C
G
C
C
C
G
C
G
C
T
C
C
C
A
T
C
A
G
A
G
G
A
T
T
C
C
46
6
C
C
A
C
T
T
A
T
G
C
T
G
T
C
G
C
T
T
124
T
A
C
A
C
C
A
A
G
G
A
G
C
G
G
A
G
G
A
A
C
C
C
A
G
G
G
G
A
A
T
4
C
G
C
C
A
A
C
C
C
C
A
G
G
G
T
A
G
2
T
G
C
G
T
T
C
10
C
T
T
T
T
T
A
G
G
T
G
C
T
G
T
T
T
C
G
6
C
T
G
C
G
A
G
T
C
T
A
C
T
C
A
A
T
G
C
C
G
A
C
C
A
C
C
G
G
C
A
C
G
G
T
T
T
A
C
G
6
A
C
T
A
C
G
A
8
A
C
T
C
G
A
A
G
G
G
G
G
G
A
T
T
A
C
C
T
T
A
G
G
2
A
A
2
C
G
G
G
G
C
C
G
C
G
A
G
G
A
C
G
T
38
A
C
2
A
C
T
A
T
T
T
12
  190,203,955
  190,204,234
  190,204,509
  190,205,206
  190,205,691
  190,205,714
  190,205,772
  190,215,210
  190,215,211
  190,215,658
  190,222,148
  190,222,767
  190,224,528
  190,224,625
  190,226,802
  190,227,241
  190,229,056
  190,229,195
  190,229,202
  190,230,788
  190,231,019
  190,234,333
  190,234,761
  190,234,906
  190,234,935
  190,235,554
  190,235,699
  190,236,748
  190,237,445
  190,237,641
  190,238,177
  190,238,385
  190,240,051
  190,240,417
  190,241,313
  190,241,492
  190,241,637
  190,241,997
  190,242,139
  190,242,141
  190,246,385
  190,246,731
  190,247,139
  190,247,755
  190,248,091
  190,249,639
  190,251,257
  190,251,795
  190,252,192
  190,252,286
  190,252,624
  190,253,437
  190,255,136
  190,255,402
  190,255,498
  190,256,477
  190,257,689
  190,258,548
  190,258,962
  190,258,989
  190,259,132
  190,259,155
  190,259,388
  190,259,477
  190,259,527
  190,259,587
  190,259,707
  190,260,050
  190,260,544
  190,261,014
  190,261,557
  190,261,655
  190,261,884
  190,261,889
  190,261,928
  190,262,014
  190,262,661
  190,262,729
  190,262,978
  190,263,032
  190,264,610
  190,264,618
  190,264,876
  190,265,173
  190,267,066
  190,269,917
  190,269,968
  190,270,170
  190,270,993
  190,271,005
  190,271,020
  190,272,199
  190,273,075
  190,273,135
  190,273,804
  190,274,104
  190,274,605
  190,274,704
  190,275,722
  190,276,107
  190,276,258
  190,276,777
  190,277,083
  190,277,223
  190,277,572
  190,278,694
  190,280,074
  190,280,843
  190,281,453
  190,282,527
  190,283,888
  190,284,190
  190,286,257
  190,286,399
  190,286,849
  190,287,004
  190,287,008
  190,287,556
  190,288,050
  190,288,473
  190,289,914
  190,290,795
  190,290,942
  190,291,391
  190,291,409
  190,291,412
  190,291,907
  190,292,251
  190,292,381
  190,292,651
  190,292,974
  190,293,006
  190,293,017
  190,293,048
  190,293,106
  190,294,428
  190,295,755
  190,295,832
  190,297,575
  190,298,100
  190,299,457
  190,300,533
  190,315,097
  190,315,115
  190,319,828
  190,325,413
  190,331,722
  190,333,339
  190,335,568
  190,335,633
  190,338,742
  190,338,932
  190,339,596
  190,341,900
  190,343,808
  190,344,247
  190,344,857
  190,345,021
  190,345,623
  190,345,929
  190,346,318
  190,346,363
  190,346,414
  190,347,953
  190,351,252
  190,351,473
  190,351,494
  190,351,542
  190,351,550
  190,351,567
  190,351,585
  190,351,623
  190,351,934
  190,352,293
  190,352,496
  190,352,593
  190,352,699
  190,352,996
  190,353,160
  190,353,300
  190,353,382
  190,353,497
  190,353,598
  190,353,654
  190,353,878
  190,353,988
  190,353,998
  190,354,625
  190,354,650
  190,355,026
  190,355,592
  190,355,704
  190,355,834
  190,356,000
  190,356,005
  190,356,672
  190,356,719
  190,357,823
  190,358,573
  190,359,359
  190,359,383
  190,359,433
  190,359,983
  190,359,998
  190,360,831
  190,360,990
  190,361,414
  190,362,686
  190,362,732
  190,363,293
  190,363,902
  190,364,137
  190,364,161
  190,364,238
  190,364,664
  190,364,725
  190,364,815
  190,365,075
  190,365,788
  190,365,862
  190,365,876
  190,365,896
  190,366,092
  190,366,136
  190,366,156
  190,366,212
  190,366,255
  190,366,633
  190,366,765
  190,366,864
  190,367,046
  190,367,386
  190,368,082
  190,368,950
  190,370,077
  190,371,250
  190,371,933
  190,377,267
  190,378,722
  190,379,541
  190,380,438
  190,380,700
  190,380,709
  190,380,811
  190,381,311
  190,381,694
  190,381,809
  190,382,078
  190,383,004
  190,384,109
  190,384,151
  190,385,296
  190,385,530
  190,386,253
  190,387,434
  190,389,480
  190,389,992
  190,390,458
  190,390,476
  190,390,484
  190,390,661
  190,390,671
  190,391,431
  190,392,229
  190,392,362
  190,392,490
  190,392,717
  190,392,828
  190,392,867
  190,392,954
  190,394,049
  190,394,137
  190,394,140
  190,395,107
  190,395,362
  190,395,525
  190,395,563
  190,395,880
  190,396,087
  190,396,545
  190,396,565
  190,396,628
  190,396,629
  190,396,662
  190,396,797
  190,396,840
  190,396,922
  190,396,931
  190,397,761
  190,398,000
  190,398,134
  190,398,363
  190,398,669
  190,398,757
  190,399,053
  190,399,769
  190,399,783
  190,399,834
  190,400,851
  190,401,337
  190,401,482
  190,401,571
  190,401,872
  190,401,966
  190,402,002
  190,402,191
  190,403,426
  190,403,737
  190,403,873
  190,404,736
  190,404,914
  190,405,243
  190,405,860
  190,405,954
  190,405,993
  190,406,781
  190,407,682
  190,407,797
  190,407,952
  190,407,953
  190,407,964
  190,408,826
  190,408,946
  190,409,218
  190,409,859
  190,410,692
  190,411,064
  190,412,267
  190,412,298
  190,412,526
  190,412,579
  190,413,777
  190,414,220
  190,414,424
  190,414,453
  190,415,255
  190,415,521
  190,415,676
  190,416,316
  190,416,619
  190,416,758
  190,417,369
  190,417,924
  190,418,169
  190,420,147
  190,420,180
  190,420,679
  190,420,704
  190,420,877
  190,422,164
  190,422,593
  190,423,493
  190,423,939
  190,424,237
  190,424,794
  190,425,806
  190,425,992
  190,426,571
  190,426,872
  190,427,108
  190,428,001
  190,428,254
  190,428,366
  190,428,368
  190,429,073
  190,429,518
  190,429,731
  190,444,932
  190,445,014
  190,448,095
  190,448,213
  190,448,239
  190,448,304
  190,498,710
  190,546,977
  190,596,172
  190,620,773
  190,642,828
  190,642,871
  190,642,878
  190,642,887
  190,642,981
  190,642,994
  190,651,200
  190,660,297
  190,665,754
  190,691,778
  190,730,149
  190,738,000
  190,738,001
  190,746,589
  190,760,786
  190,761,618
  190,764,797
  190,799,961
T/C
T
-
T
C
C
-
A
G
A
G/A
A
T
C
A
12/-
T
T
C
T
-
G
C
T/C
20
T
-
-
C
T
G
G
-
A
T
T
T
A
T
-
G
C
A/2
C/T
C
-
A
T
T
-
T
G
-
-
2
C
C
3/-
G
A
T
G
G
C
15
G
A
C
T
4
G
G
G
A
C
A
T
-
T
T
-
4/-
2
T
A/G
-
A
G/T
-
-
T/5
T
T
T
16/-
G
C/T
C/2
C
T/C
T/2
T
G
A
C/2
C
5
C
2
A
C
T
T/G
C
G
T
A
-
-
T/C
A
A
A
A
C
A
A
T
-
G
T
-
T
C
2
T
C
-
C
A
T/G
T
-
-
12
3
C
T
C
A
C
G
T
C/T
G
A/2
G
C/T
C
G
C
G
C
A
C/G
A
T
A
A
G/3
T
A
T
A
T
T
T
G
C
T
G
A
G
A
A
G
C
A
T
A
-
6/-
A
A
G
G
C
A
C
A
A
A
C
A
T/A
A
2
T
A
C
-
C
G
T
-
2
A
G
G
A
A
C
T
T
A
C
G
C
A
G
G
T
G
T
A/G
A
A
A
A
A/-
G
C
-
T
A
G
T
C
G
A
T
A
G
2
G/-
6
A
2
G
G/A
-
T/C
A
T
A
C
9
T
-
T
C
T/-
T/G
C
C
G
A
2
T/13
A
T
C
A
2
2
C
-
-
-
G
C
A
T
G/2
G
A
T/C
C/G
C
-
T
G
T
-
G
C
A
C/T
T
2
G
T
T
C
C/T
C/T
T
-
G
G
T
A
3
T/C
G
C
-
T
C
-
C
G
C
C
A
T
G
-
G
T
3
T
A
G
C
G/C
T
C
G/T
A
A
G
C
T/C
7
T
G
3
G
G
-
A
-
A/T
A/G
2/-
T
G/A
G/3
-
-
G
2
G/T
2
G/2
G
-
-
-
-
-
-
-
12
C/2
-
A/C
T
A
A/G
T/C
10
T/-
-