Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 121,116 (bp)   Positions: 307
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.136
.002
--
.005
.031
--
.009
.008
.131
.027
.002
--
--
.199
.053
.168
.597
.365
.23
.223
.003
.001
.496
.039
.26
.016
.091
.15
.045
--
--
.019
.012
.115
.118
.132
--
--
--
--
--
.008
--
.105
.017
.068
.001
.001
.303
.003
.021
.004
.001
.085
.026
--
.006
.003
--
--
.025
.093
.039
--
--
--
--
--
.034
.078
.272
.095
.286
.104
.103
.091
.025
.438
--
--
--
.023
.008
.006
.274
.0
.211
.101
.101
.766
.765
.457
.003
.016
.009
.048
.002
.004
.008
.013
--
--
--
--
.116
.047
.089
.073
.013
.014
--
.004
.037
.012
.059
.007
.002
.007
.001
.026
.003
--
--
.001
.03
.598
.012
.045
.231
.052
.004
.131
.195
--
--
.017
.025
.004
.041
.023
--
--
--
.999
.003
.3
.002
.004
.014
.005
--
.601
.003
.014
.012
.001
.001
.019
.252
--
--
--
.017
.015
.212
.005
.004
.0
.478
.0
.038
.202
.016
.113
.068
--
--
--
.447
.208
.003
.0
.013
.048
.039
.007
.008
.037
.083
.186
.037
--
--
.001
--
.06
.0
.029
.016
.996
.998
.015
.068
.019
.015
--
.572
.0
.001
.004
.412
.026
.121
.007
.007
.134
--
.005
.011
.038
.113
.01
--
--
--
.137
.004
--
--
.004
.009
--
--
.298
.003
.004
.026
.075
.178
.325
.301
.0
.001
.218
.0
.009
.003
.017
.02
.217
.001
.008
.374
.003
.064
.151
.007
.001
.012
.001
--
.034
.098
.008
--
.029
.001
.02
.031
.008
.271
.367
.981
.016
.526
.002
--
--
--
.076
.027
.013
.007
.998
.003
.305
.012
.009
.015
.0
.001
.0
.0
.013
.0
.004
.007
.001
--
.005
.002
.009
.127
.033
.003
.973
.001
Kcnh3
Kcnh3
Kcnh3
Kcnh3
Kcnh3
Kcnh3
Kcnh3
Kcnh3
Kcnh3
Kcnh3
Kcnh3
Kcnh3
Kcnh3
Kcnh3
Kcnh3
Kcnh3
Kcnh3
Kcnh3
Kcnh3
Kcnh3
Kcnh3
Kcnh3
Kcnh3
Kcnh3
Kcnh3
Kcnh3
Kcnh3
Kcnh3
Kcnh3
Kcnh3
Kcnh3
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
T
G
A
G
T
C
T
A
T
C
C
G
T
G
C
G
C
A
C
A
C
A
A
G
C
A
G
A
T
T
T
A
C
A
C
C
A
C
A
A
A
C
T
A
110
G
G
G
C
T
A
G
T
A
G
A
A
G
G
4
T
A
A
A
C
C
A
A
C
G
A
G
A
G
G
2
A
C
T
G
T
G
G
T
C
T
G
2
C
T
G
G
G
T
T
C
A
T
A
T
G
A
G
G
G
T
G
A
C
T
T
G
G
C
T
A
G
C
T
G
T
T
T
T
A
T
G
C
G
C
T
G
G
T
T
C
G
C
A
T
A
T
C
G
T
C
36
G
A
A
G
A
C
C
A
C
A
A
A
C
C
T
2
G
A
C
C
T
G
G
T
C
T
G
A
C
A
T
C
G
T
G
C
A
C
T
C
C
T
T
4
A
G
A
C
C
C
T
A
C
C
A
T
G
G
T
T
C
A
G
C
T
G
A
4
G
C
T
C
A
C
G
A
G
T
G
A
G
A
G
T
A
4
G
A
C
G
T
A
C
A
G
A
A
A
A
G
G
T
C
A
A
G
A
A
T
G
G
T
T
T
A
G
C
C
G
T
C
T
C
A
G
C
A
A
2
A
T
T
A
G
G
2
A
8
27
A
C
T
A
T
A
C
A
G
T
C
A
A
G
4
C
T
4
G
C
C
  115,294,409
  115,294,482
  115,295,053
  115,295,897
  115,296,174
  115,297,395
  115,297,961
  115,297,974
  115,298,012
  115,298,177
  115,298,189
  115,300,660
  115,300,971
  115,301,201
  115,301,244
  115,301,337
  115,301,369
  115,301,406
  115,301,413
  115,301,414
  115,301,526
  115,301,628
  115,301,822
  115,302,255
  115,302,300
  115,302,400
  115,302,415
  115,302,434
  115,302,959
  115,303,022
  115,303,098
  115,303,451
  115,303,607
  115,303,636
  115,303,644
  115,303,800
  115,303,887
  115,303,958
  115,304,016
  115,304,075
  115,304,348
  115,304,512
  115,304,571
  115,304,717
  115,304,938
  115,305,253
  115,305,283
  115,305,285
  115,305,335
  115,305,362
  115,305,379
  115,305,657
  115,305,663
  115,306,040
  115,306,134
  115,306,246
  115,306,517
  115,306,560
  115,307,104
  115,307,241
  115,307,478
  115,307,663
  115,308,376
  115,308,589
  115,309,092
  115,309,222
  115,309,223
  115,309,244
  115,309,871
  115,311,078
  115,311,467
  115,311,898
  115,312,611
  115,313,052
  115,313,053
  115,313,056
  115,313,071
  115,313,139
  115,313,325
  115,313,392
  115,313,434
  115,313,752
  115,313,883
  115,313,959
  115,314,219
  115,315,333
  115,315,545
  115,315,768
  115,315,771
  115,316,081
  115,316,095
  115,316,526
  115,316,940
  115,317,215
  115,317,241
  115,317,890
  115,318,283
  115,318,284
  115,318,285
  115,319,002
  115,319,141
  115,319,528
  115,319,779
  115,320,290
  115,320,583
  115,321,049
  115,321,192
  115,321,279
  115,322,606
  115,322,640
  115,322,758
  115,323,148
  115,323,643
  115,324,064
  115,324,101
  115,324,199
  115,324,446
  115,324,515
  115,324,524
  115,324,729
  115,325,201
  115,327,532
  115,327,650
  115,328,114
  115,328,146
  115,328,222
  115,328,632
  115,328,663
  115,328,728
  115,329,151
  115,329,703
  115,329,877
  115,330,522
  115,330,657
  115,330,885
  115,330,995
  115,331,432
  115,332,065
  115,332,077
  115,332,137
  115,333,196
  115,333,210
  115,333,329
  115,333,495
  115,334,060
  115,334,587
  115,334,899
  115,335,365
  115,335,573
  115,335,664
  115,335,856
  115,336,000
  115,336,028
  115,336,308
  115,337,085
  115,337,211
  115,337,255
  115,337,557
  115,337,885
  115,338,055
  115,338,058
  115,338,222
  115,338,741
  115,338,743
  115,339,512
  115,339,934
  115,342,219
  115,342,298
  115,342,958
  115,343,580
  115,345,495
  115,345,559
  115,345,569
  115,346,365
  115,346,373
  115,347,146
  115,347,199
  115,347,879
  115,348,092
  115,348,343
  115,348,590
  115,348,876
  115,348,952
  115,349,113
  115,349,346
  115,349,609
  115,349,645
  115,350,103
  115,351,056
  115,351,374
  115,351,682
  115,351,729
  115,351,825
  115,352,019
  115,352,450
  115,352,701
  115,353,009
  115,353,080
  115,353,168
  115,353,674
  115,353,752
  115,354,258
  115,354,350
  115,354,442
  115,354,553
  115,354,644
  115,355,014
  115,355,105
  115,355,240
  115,355,965
  115,357,327
  115,357,467
  115,358,297
  115,358,353
  115,358,367
  115,358,509
  115,359,139
  115,359,456
  115,359,482
  115,360,357
  115,360,422
  115,360,561
  115,361,080
  115,361,202
  115,361,244
  115,361,612
  115,361,669
  115,361,718
  115,361,782
  115,361,881
  115,361,945
  115,362,011
  115,362,078
  115,362,208
  115,362,461
  115,362,519
  115,362,994
  115,363,068
  115,363,178
  115,363,267
  115,363,578
  115,363,722
  115,363,743
  115,363,798
  115,364,217
  115,364,302
  115,364,833
  115,364,981
  115,365,023
  115,365,339
  115,365,879
  115,365,957
  115,366,391
  115,366,540
  115,366,672
  115,366,733
  115,366,755
  115,366,927
  115,366,959
  115,367,069
  115,367,371
  115,369,257
  115,369,868
  115,370,586
  115,371,187
  115,371,637
  115,371,721
  115,372,952
  115,373,094
  115,373,237
  115,376,785
  115,377,041
  115,377,111
  115,381,342
  115,382,089
  115,386,077
  115,386,493
  115,386,592
  115,386,985
  115,390,679
  115,392,555
  115,392,684
  115,397,692
  115,397,754
  115,403,389
  115,403,697
  115,403,931
  115,405,419
  115,405,423
  115,405,980
  115,406,472
  115,406,761
  115,406,783
  115,406,881
  115,407,007
  115,407,064
  115,407,115
  115,407,194
  115,408,616
  115,409,110
  115,409,132
  115,409,208
  115,409,312
  115,412,500
  115,413,611
  115,414,432
  115,414,545
T/G
A
T
T
C
2
C
G
C
T
T
C
-
C
T
A
T
T
T
C
T
T
G
A
T
G
A
G
T/C
2
3
G
T
T
A
T
G
T
C
11
T
T
C
G
-
A
T
A
T
C
A/G
T
A
C
5
G
G
A
T
-
G
A/-
G
3
T
A
T
G
T
A
2
12
A/G
C
T
-
G
T
C
T
T/2
A
A
C
C/A
G
T
-
3
A
2
A
A
A
C
T
G
A
C
C
A
G
-
A
2
C
A
G
T
C
C
A
G/A
T
2
2
3
T
T/5
A
A
-
C
G
G
T/A
A
T
A
T
C
G/A
A
C
C
G
A
C/T
G
C
G
T/C
T
C
C
A
-
A
G
T
G/A
A/G
C/T
T
A/2
T
G
C
G
C/A
A
2
2/-
G/A
G
3
T
C
A
C
A
T
C
A
G
C/G
A/G
-
5
11
C
T
T
G
C/2
C
T
C/T
C
C
-
-
A
G
C/A
T
T
G
A/T
G
C/T
G
-
A
A
-
G
T
T
T
T
A
G/A
G
-
A
T
C
T
A/G
C/2
A
C
A
T/23
A
G
T
G
-
C
A/C
4/-
A
G
G
A
T/C
G
C/T
A/G
-
A/G
C
G
G
3
A
A
4
G
G
A
G
G
5
A
T
C
C
2
2
5
T
T
43
T/C
T
G
T
3
A
T
G
A/G
2/-
G
-
T/G
G
G/2
A
-
G
8/-
27/-
C
6
A
G
T/C
G
T
G
A
C
T
G
A/C
G/A
-
T
C
-
C
T
T