Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 333,173 (bp)   Positions: 551
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.096
.003
.002
.001
.881
.945
.001
.106
.217
.208
.001
.045
.736
.206
.084
.006
.016
.017
.006
.001
.023
.024
.026
.009
.016
.0
.22
.003
.001
.0
.003
.002
.009
.005
.001
.0
.0
.346
.072
.157
.017
.017
.004
.002
.006
.024
.001
.319
.003
.663
.012
.0
.046
.048
.049
.0
.0
.499
.008
.0
.0
.003
.001
.001
.757
.0
.01
.364
.893
.003
.0
.059
.193
.01
.0
.002
.039
.009
.0
.0
.001
.0
.001
.001
.0
.0
.002
.001
.0
.017
.063
.182
.014
.0
.014
.392
.116
.0
.003
.641
.002
.856
.005
.021
.883
.047
--
.004
.007
.002
.0
.143
.001
.0
.0
.206
.001
.0
.003
.004
.003
.001
.022
.024
.002
.0
.02
.848
.963
.007
.001
.0
.007
.001
1.0
.005
.007
.001
.056
.024
.027
.314
.005
.069
.054
.862
.049
.062
.207
.288
.298
.049
.167
.0
.0
.012
.006
.005
.076
.062
.027
--
.0
.174
.007
.002
.745
.002
.005
.836
.992
.984
1.0
.999
1.0
.999
.999
.004
.018
.001
.039
.443
.455
.492
.014
.015
.014
.066
.896
.001
.066
.001
.099
.0
.0
.053
.094
.285
.14
.053
.123
.018
.047
.076
.0
.0
.007
.004
.0
.0
.009
.003
.017
.004
.143
.01
.018
.128
.004
--
--
--
--
.0
.005
.0
--
.002
.003
.045
.048
.063
.012
.001
.003
.056
.001
.002
.003
.106
.01
.008
.024
.003
.004
.001
.092
.008
.038
.0
.04
.162
.078
.033
.027
.025
--
.057
.295
.028
.013
.013
.002
.009
.028
.011
.019
--
--
.002
.006
.0
.001
.043
.006
.001
.475
.127
.02
.007
.001
.055
.079
.061
.766
.0
.166
.355
.0
.029
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
.694
.749
.966
.074
.116
.001
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.032
.027
.0
.005
.011
.026
.03
.0
.018
.065
.009
.022
.191
.0
.009
.006
.084
.022
.0
.0
.009
.007
.002
.001
.011
.002
.0
.002
.004
.078
.003
.205
.0
.001
.001
.863
.85
.847
.993
.004
.008
.008
.005
.091
.001
.002
.004
.002
.025
.002
.001
.014
.0
.008
.001
.0
.001
.006
.975
.145
.007
.021
.001
.001
.001
.057
.0
.0
.0
.011
.001
.026
.024
.1
.067
.2
.068
.528
.239
.097
.001
.01
.023
.0
.001
.329
.252
--
--
--
.001
.0
.003
.001
.06
.001
.0
.002
.124
.007
.0
.0
.0
.001
.025
.0
.003
.001
.071
.001
.554
.002
.0
.0
.023
.0
.161
.015
.015
.005
.003
.001
.004
.005
--
--
--
--
--
--
.0
.0
.0
.98
.923
.003
.03
.017
.001
.0
.004
.396
.0
.015
.001
.072
.002
.001
.0
.001
.001
.004
.0
.001
.001
.145
.011
.041
.0
.0
.54
.0
.0
.004
.011
.025
.118
.272
.0
.023
.013
.059
.003
.014
.549
.001
.001
.001
.0
.009
.015
.172
.0
.029
.062
.586
.15
.152
.157
.0
.001
.004
.046
.01
.038
.008
.001
.006
.128
.0
.002
.333
.0
.008
.434
.0
.012
.01
.036
.015
.145
.432
.021
.873
.348
.009
.897
.0
.0
.009
.207
.0
.699
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
Itpr1
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
T
A
G
T
A
G
A
C
A
T
A
G
C
A
G
2
G
T
T
T
C
T
G
A
G
A
T
G
T
A
T
C
G
A
2
T
A
T
T
T
G
G
G
T
A
G
C
T
G
G
C
T
T
T
G
A
A
2
C
T
G
T
T
2
A
T
G
T
G
T
A
C
A
C
A
G
T
C
T
C
T
G
T
T
A
T
T
C
A
A
4
C
4
A
A
A
C
C
C
C
G
A
T
T
T
A
G
C
T
A
A
C
T
G
C
C
C
G
A
A
G
G
C
C
G
A
A
A
C
A
G
C
T
3
C
T
G
T
G
G
G
3
T
A
A
C
2
T
G
G
6
C
T
T
C
7
2
A
C
C
C
C
G
T
T
T
C
C
A
2
T
T
4
2
T
4
6
C
T
A
A
2
A
2
G
C
A
G
A
4
G
C
T
A
G
12
A
T
C
T
C
C
2
C
T
G
C
C
T
G
2
C
G
A
A
G
T
T
G
G
C
G
T
C
T
A
T
A
A
A
T
A
A
A
A
G
A
T
A
C
C
T
T
T
C
G
T
T
T
T
A
A
A
4
T
C
16
A
C
C
A
C
T
T
G
C
C
8
2
T
A
A
5
A
G
T
C
A
G
G
C
T
C
G
C
G
C
G
8
T
A
6
A
2
2
2
T
C
T
G
T
A
A
G
T
A
A
A
T
G
T
T
T
G
T
A
A
T
G
T
T
G
T
T
G
T
C
G
G
C
T
C
19
A
T
A
T
A
G
A
A
A
G
G
T
A
C
G
T
A
T
T
T
T
T
T
A
G
C
A
G
T
T
T
T
T
T
A
9
5
4
G
G
4
G
G
A
G
T
T
C
T
2
C
2
C
G
12
G
G
T
C
A
T
T
T
G
C
C
C
C
A
A
A
A
A
T
G
A
T
A
C
T
A
A
C
G
C
A
T
A
G
T
T
T
C
C
A
C
G
T
2
G
G
T
C
T
3
T
2
G
A
G
C
A
4
2
T
T
G
G
A
T
A
T
C
T
G
C
T
C
G
T
C
T
G
G
C
A
C
G
G
A
A
G
4
A
2
A
G
A
A
4
A
A
A
G
G
T
G
C
A
A
C
A
A
A
G
G
G
A
T
C
T
C
A
C
T
C
T
T
G
C
G
C
C
G
T
T
C
C
T
G
C
A
A
6
T
A
C
A
A
G
C
A
G
C
T
T
G
C
A
A
T
G
A
T
G
T
G
C
  204,715,073
  204,715,144
  204,715,286
  204,715,566
  204,715,929
  204,716,227
  204,717,206
  204,718,110
  204,718,197
  204,718,393
  204,718,887
  204,719,090
  204,720,598
  204,720,929
  204,721,139
  204,721,273
  204,721,592
  204,721,848
  204,722,047
  204,722,117
  204,722,272
  204,722,428
  204,722,429
  204,722,925
  204,723,119
  204,723,837
  204,724,271
  204,724,297
  204,724,305
  204,724,317
  204,724,318
  204,724,370
  204,724,875
  204,725,083
  204,725,188
  204,725,874
  204,726,039
  204,726,071
  204,726,280
  204,726,301
  204,727,195
  204,727,245
  204,727,354
  204,727,608
  204,727,643
  204,728,178
  204,728,315
  204,728,463
  204,730,076
  204,730,162
  204,730,172
  204,730,353
  204,730,698
  204,730,700
  204,730,703
  204,730,954
  204,730,969
  204,731,513
  204,731,597
  204,731,635
  204,731,701
  204,731,971
  204,732,021
  204,732,298
  204,732,467
  204,732,675
  204,732,693
  204,732,809
  204,732,868
  204,733,509
  204,733,651
  204,734,033
  204,734,121
  204,734,442
  204,734,669
  204,734,709
  204,735,862
  204,736,160
  204,736,428
  204,736,509
  204,736,665
  204,737,106
  204,737,450
  204,737,451
  204,737,489
  204,737,539
  204,737,586
  204,737,630
  204,737,642
  204,738,093
  204,738,133
  204,738,179
  204,739,427
  204,739,788
  204,740,991
  204,741,509
  204,742,135
  204,742,241
  204,742,470
  204,742,573
  204,742,689
  204,743,189
  204,743,530
  204,743,547
  204,743,649
  204,743,697
  204,743,724
  204,743,865
  204,744,322
  204,745,214
  204,745,232
  204,745,258
  204,745,513
  204,745,517
  204,745,519
  204,745,601
  204,746,736
  204,746,787
  204,746,938
  204,746,944
  204,746,973
  204,746,978
  204,746,991
  204,746,996
  204,747,811
  204,748,041
  204,748,239
  204,748,472
  204,749,012
  204,749,819
  204,751,204
  204,751,866
  204,751,929
  204,752,267
  204,752,933
  204,753,327
  204,754,156
  204,754,306
  204,756,571
  204,758,714
  204,758,721
  204,759,870
  204,761,099
  204,761,776
  204,761,921
  204,761,924
  204,762,392
  204,762,393
  204,762,409
  204,762,924
  204,762,925
  204,763,366
  204,763,407
  204,764,454
  204,764,609
  204,764,753
  204,764,758
  204,764,759
  204,765,232
  204,765,234
  204,765,244
  204,765,589
  204,766,473
  204,766,827
  204,767,417
  204,768,137
  204,768,604
  204,768,854
  204,769,696
  204,770,558
  204,770,617
  204,770,619
  204,770,659
  204,770,663
  204,770,667
  204,770,686
  204,770,703
  204,770,856
  204,770,917
  204,771,372
  204,771,411
  204,771,554
  204,771,555
  204,771,565
  204,772,058
  204,772,858
  204,772,860
  204,772,966
  204,773,227
  204,773,461
  204,773,643
  204,773,846
  204,773,911
  204,773,964
  204,774,688
  204,774,949
  204,775,406
  204,775,783
  204,776,507
  204,776,647
  204,776,748
  204,776,976
  204,777,183
  204,777,336
  204,777,442
  204,777,951
  204,778,033
  204,778,070
  204,778,407
  204,778,408
  204,778,930
  204,779,066
  204,779,809
  204,779,873
  204,779,903
  204,779,942
  204,779,981
  204,780,051
  204,780,120
  204,780,318
  204,780,344
  204,780,358
  204,780,397
  204,780,613
  204,780,740
  204,780,769
  204,781,144
  204,781,231
  204,781,232
  204,781,274
  204,781,555
  204,782,322
  204,782,608
  204,782,710
  204,782,878
  204,782,960
  204,783,135
  204,783,480
  204,783,619
  204,783,645
  204,783,659
  204,784,494
  204,784,645
  204,784,696
  204,785,025
  204,785,420
  204,785,597
  204,786,136
  204,787,366
  204,787,722
  204,789,071
  204,789,101
  204,789,538
  204,789,792
  204,790,045
  204,790,050
  204,791,206
  204,791,809
  204,791,964
  204,792,074
  204,793,037
  204,794,587
  204,796,456
  204,796,688
  204,798,681
  204,799,243
  204,799,814
  204,801,346
  204,801,354
  204,802,221
  204,802,865
  204,803,695
  204,803,803
  204,804,956
  204,806,639
  204,806,930
  204,808,849
  204,809,471
  204,809,888
  204,810,199
  204,810,268
  204,812,919
  204,813,067
  204,813,204
  204,813,999
  204,814,164
  204,814,973
  204,816,338
  204,818,409
  204,819,048
  204,819,081
  204,821,263
  204,821,268
  204,821,329
  204,821,345
  204,821,367
  204,821,412
  204,821,457
  204,821,480
  204,821,578
  204,821,582
  204,821,592
  204,821,826
  204,821,837
  204,821,884
  204,821,885
  204,822,139
  204,822,182
  204,822,199
  204,822,200
  204,822,215
  204,822,258
  204,822,263
  204,822,267
  204,822,270
  204,822,372
  204,822,415
  204,822,432
  204,822,433
  204,822,448
  204,822,457
  204,822,478
  204,822,491
  204,822,496
  204,822,500
  204,822,503
  204,822,562
  204,822,673
  204,823,483
  204,823,846
  204,825,024
  204,825,037
  204,825,041
  204,826,015
  204,826,794
  204,831,821
  204,834,732
  204,835,107
  204,836,163
  204,836,164
  204,837,723
  204,838,402
  204,838,813
  204,838,837
  204,841,003
  204,841,407
  204,842,490
  204,842,667
  204,843,199
  204,843,523
  204,843,620
  204,843,624
  204,843,628
  204,843,642
  204,843,654
  204,843,662
  204,843,761
  204,843,939
  204,843,967
  204,844,083
  204,844,259
  204,844,452
  204,844,490
  204,844,647
  204,844,649
  204,844,651
  204,844,667
  204,844,964
  204,845,233
  204,845,234
  204,845,252
  204,845,266
  204,845,302
  204,845,305
  204,845,442
  204,845,454
  204,846,054
  204,846,358
  204,846,524
  204,846,573
  204,846,779
  204,847,081
  204,847,096
  204,847,099
  204,847,110
  204,847,115
  204,847,437
  204,847,714
  204,847,942
  204,847,989
  204,848,139
  204,848,141
  204,848,297
  204,848,310
  204,848,448
  204,848,579
  204,848,856
  204,848,962
  204,849,055
  204,849,273
  204,849,667
  204,849,702
  204,849,723
  204,850,662
  204,850,704
  204,851,252
  204,851,332
  204,860,385
  204,864,110
  204,864,350
  204,865,353
  204,867,189
  204,867,483
  204,868,708
  204,869,516
  204,870,323
  204,870,347
  204,870,350
  204,873,649
  204,890,210
  204,890,319
  204,893,254
  204,897,907
  204,914,739
  204,916,970
  204,924,773
  204,926,308
  204,928,382
  204,929,584
  204,929,585
  204,934,620
  204,934,658
  204,940,597
  204,940,611
  204,940,743
  204,940,809
  204,941,948
  204,951,843
  204,957,099
  204,965,351
  204,965,358
  204,965,361
  204,983,038
  204,983,822
  204,984,344
  204,986,249
  204,986,251
  204,993,018
  204,993,019
  205,001,071
  205,001,073
  205,001,178
  205,007,672
  205,007,713
  205,007,774
  205,007,795
  205,007,818
  205,007,839
  205,009,103
  205,009,440
  205,009,812
  205,009,905
  205,010,005
  205,010,071
  205,010,137
  205,010,275
  205,010,387
  205,010,683
  205,010,788
  205,011,931
  205,013,891
  205,015,486
  205,015,796
  205,018,107
  205,018,131
  205,018,132
  205,018,135
  205,018,140
  205,018,141
  205,018,155
  205,018,163
  205,018,166
  205,018,168
  205,018,319
  205,018,628
  205,018,866
  205,019,638
  205,020,772
  205,020,825
  205,020,866
  205,021,014
  205,021,837
  205,021,991
  205,022,289
  205,023,083
  205,023,365
  205,024,989
  205,026,082
  205,026,571
  205,026,974
  205,027,792
  205,028,446
  205,028,534
  205,028,897
  205,029,074
  205,029,083
  205,029,879
  205,030,180
  205,030,575
  205,031,106
  205,031,295
  205,031,395
  205,032,120
  205,032,135
  205,032,881
  205,032,885
  205,033,093
  205,033,347
  205,033,355
  205,033,384
  205,033,406
  205,034,568
  205,034,871
  205,035,839
  205,036,145
  205,036,391
  205,036,672
  205,037,232
  205,037,236
  205,039,200
  205,040,102
  205,040,154
  205,041,061
  205,041,080
  205,041,228
  205,041,230
  205,041,424
  205,041,517
  205,041,661
  205,041,700
  205,041,760
  205,041,785
  205,041,922
  205,042,275
  205,042,407
  205,043,027
  205,043,045
  205,043,279
  205,043,387
  205,045,569
  205,046,365
G
3
A
C
5
A
G
CT/3
-
-
G
C
T
G
A
-
C
A
G
C
T
C
A
-
A
-
T/9
G/C
T/A
A/G
T/2
T
A
G
-
C
G
G
24
17
-
A
A
G
T
C
3
-
6
2
4
C
T/2
8/TG
6/5
G
G
-
3
C
A
C
3/TC
-
15
C
A
-
3
C
C
T
23
T
G
A
-
T
C
T
2
3
G
A
C
-
G
T
T
T
-
T
-
G
G
G
T
A
A
T
C
-
C
G
-
2
G/C
T
A
G
2
T
-
-
2
-
T
A
-
-
G/A
G/A
A
A
A
2
G
T
A
G
T
T
T/-
-
T
C
A
-
3/GA
3
G/T
3/-
C
G
T
G
2/-
-
G/-
G/5
-
A
A
-
T
7/-
-
A/4
2
-/CA
C/-
T
A
C
-
C
T
T
G
2/-
T/3
T/G
4/-
-
T/A
4/-
6/-
T
7
T
G
2/-
A/-
-
C
T
T
G/2
G
-
2
T
C
G
2
-
AT/3
G
T
C
T
T
-
T
C
C
G
A
C
A
-
T
A
G
G
A
C
A
A
G/A
C/T
G/A
2
T
C
G
C
G
G
-
C
G
C
G
C
A
G
C
T
T
T
C
G
C
G
A
C
C
3
G
4
A/G
G
-
2
A
-
T
T
T
C
A
G
G
A
T
5
8/-
2/-
C
2
G
-
-
A
G
T
2
A
A
T
3
5/3
G/2
T
A
T
9/A
-
2
5
-
A/3
-
-
2/-
T/3
C/A
T/3
A
C
3
G
T
A
G
G
C
T/A
G/A
T/G
C
G
G/C
T/G
A/G
A/C
T/A
G/A
T/G
T/C
G/A
T/C
G
C
G
T
C
?
G
C
A
-
-
A
G
-
G
-
6
2
G
11/C
C
C
2
T
A
6
-
T/C
T/C
T/C
T/G
T/G
T/G
T
-
T
C
A
G
C
7
C
C
C
8
-
-
-
G/A
G/A
-
A
A
T
A
C
C
T
T/C
2/-
T
2/-
T
G/A
-
A
A
C
T
G
G
C
C
A
T
T
G
T
G
C
G
G
G
-
2
G
G
T
T
C
G
G
C/3
G/T
C/T
-
C
T
3/5
7
3
-
-
3/CA
-
C/2
G/-
T/G
2/-
2
2
T/C
2
9
-
T/2
-
-
2
A
T
6
4/-
2/-
T/2
A
-
2
G
-
A/T
T/C
C/T
C/A
G/A
T
A
2
A
G
A
G
3
A
G
-
T
A
A
G
3
G/2
4/-
-/AG
2/-
A/3
G/3
A/-
-/AG
-
4
2
-
A
A
2
2
T
G
G
A
G
G
G
A
T
A
G
-
T
G
G
G
T
A
T
A
C
A
2
A
2
C/2
G/A
T/2
3
C/T
7/3
A
A
T
G
T
-
G
G
2
G
G
C
T
G
A
C/T
-
-
A
T
-
G
-
A
-
G
G/-
A
A
C/3