Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 140,633 (bp)   Positions: 303
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.022
.993
.135
.001
.006
.146
.009
--
.06
.065
.018
.601
.421
.013
--
.016
.0
.014
.039
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.121
.063
.649
.002
.001
--
.017
.056
.002
.991
.037
.082
.05
.021
.308
.083
.041
.006
.182
.152
.0
.021
.075
.147
.011
--
--
--
--
--
--
--
.03
.212
.055
.025
.805
--
--
--
--
--
--
.084
.718
.006
--
.036
.696
.692
.724
.051
.03
.072
--
.658
.679
.011
.058
.002
.333
.007
.113
.002
.002
.002
.001
.026
.006
.001
.027
.055
.088
.319
.001
.189
.004
.72
.031
.003
.097
.108
.065
.002
.001
.01
.008
.168
.034
.098
.214
.013
.205
.023
--
--
--
--
--
.212
.047
.078
.029
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.002
.002
.005
--
--
.065
1.0
.082
.719
.028
.125
.135
--
.065
.152
.107
.018
.326
.004
.023
.166
--
--
--
.009
--
--
.002
.044
.001
.005
.011
.002
--
--
.436
.002
.005
.02
.005
.231
--
.02
.246
.008
.081
.033
.001
.002
.037
.024
.017
.047
.082
.416
.43
.102
.015
.051
.005
.006
.013
.007
.101
--
--
--
.026
.347
.004
.025
.039
.021
.826
--
--
--
--
--
--
--
--
.066
.385
.001
.094
.004
.05
.104
.375
.588
.095
.008
.202
.184
.277
--
--
--
--
--
.477
.45
.448
.003
.588
.303
.114
.095
.029
.169
.72
.791
.023
.345
.099
.025
.004
.274
.257
--
--
--
--
.025
.0
.411
.346
--
--
--
.128
.144
--
--
--
--
--
--
.245
.021
.009
.193
.402
.005
.184
.175
.003
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
T
T
A
8
G
G
G
C
12
10
4
G
4
T
A
C
A
T
T
T
T
2
2
5
6
C
G
T
A
4
G
G
T
10
C
G
G
A
T
G
C
C
C
C
G
G
A
4
2
A
G
2
14
4
8
7
19
16
15
7
18
T
A
C
4
A
T
2
T
A
C
A
T
C
A
A
G
2
A
A
T
G
T
C
G
2
G
T
C
C
G
G
A
A
C
G
17
G
4
A
T
C
G
T
G
G
T
A
C
2
4
G
2
G
T
T
C
A
A
6
6
G
C
T
G
4
T
8
G
A
A
C
C
C
4
2
T
T
A
G
C
G
16
4
2
A
A
A
8
6
4
2
4
2
16
T
G
C
6
4
4
A
T
G
C
A
2
T
G
C
G
G
A
2
A
A
3
2
7
8
6
4
G
C
A
G
T
A
A
66
A
A
G
A
C
C
G
T
2
G
27
G
C
C
C
2
A
G
4
18
16
A
A
C
G
45
C
A
C
A
G
G
T
T
A
G
A
2
C
C
A
A
G
T
T
15
A
C
C
2
C
A
8
6
12
8
T
G
G
T
C
12
8
4
3
4
G
C
8
C
A
10
A
T
C
G
G
T
G
T
4
C
C
T
C
G
A
A
A
G
G
T
29
T
T
T
T
G
T
4
4
G
A
A
C
G
C
T
T
2
T
G
G
  3,850,752
  3,851,040
  3,852,371
  3,852,453
  3,852,708
  3,853,122
  3,854,648
  3,855,630
  3,857,129
  3,857,131
  3,858,894
  3,859,123
  3,859,195
  3,859,400
  3,860,293
  3,862,059
  3,863,234
  3,864,013
  3,864,388
  3,864,674
  3,865,893
  3,866,147
  3,866,157
  3,866,176
  3,866,271
  3,866,278
  3,866,279
  3,866,356
  3,866,371
  3,866,572
  3,868,051
  3,868,263
  3,870,327
  3,870,979
  3,871,553
  3,875,657
  3,878,574
  3,879,089
  3,880,569
  3,881,327
  3,881,373
  3,881,380
  3,881,666
  3,881,706
  3,881,888
  3,882,522
  3,882,585
  3,882,701
  3,882,703
  3,883,582
  3,883,619
  3,883,676
  3,883,695
  3,883,853
  3,883,860
  3,883,870
  3,883,878
  3,883,900
  3,883,919
  3,883,936
  3,883,945
  3,883,999
  3,884,198
  3,884,450
  3,885,204
  3,885,375
  3,886,873
  3,886,919
  3,886,965
  3,887,129
  3,887,150
  3,887,286
  3,887,510
  3,887,916
  3,887,954
  3,888,199
  3,888,292
  3,888,423
  3,888,424
  3,888,438
  3,889,968
  3,890,549
  3,890,894
  3,890,911
  3,892,519
  3,892,520
  3,893,060
  3,893,574
  3,893,905
  3,896,515
  3,896,922
  3,897,430
  3,897,937
  3,897,938
  3,898,505
  3,898,725
  3,898,731
  3,898,984
  3,899,041
  3,899,781
  3,899,934
  3,899,999
  3,900,049
  3,900,139
  3,900,760
  3,900,840
  3,901,322
  3,901,728
  3,902,236
  3,902,272
  3,902,278
  3,902,310
  3,902,323
  3,902,328
  3,902,351
  3,902,353
  3,903,025
  3,903,044
  3,903,285
  3,903,880
  3,904,181
  3,904,236
  3,904,380
  3,904,490
  3,904,504
  3,904,507
  3,904,518
  3,904,673
  3,904,820
  3,904,886
  3,905,057
  3,905,239
  3,905,797
  3,906,034
  3,906,362
  3,907,470
  3,907,485
  3,908,446
  3,908,639
  3,908,698
  3,908,973
  3,909,807
  3,910,559
  3,910,562
  3,910,605
  3,910,607
  3,911,185
  3,911,338
  3,912,970
  3,912,972
  3,913,040
  3,913,068
  3,913,085
  3,913,087
  3,913,205
  3,913,368
  3,913,382
  3,913,709
  3,915,240
  3,915,242
  3,915,437
  3,916,216
  3,916,982
  3,919,053
  3,920,780
  3,921,027
  3,921,088
  3,922,145
  3,922,585
  3,922,701
  3,923,787
  3,923,871
  3,924,405
  3,924,770
  3,924,771
  3,924,846
  3,924,939
  3,924,967
  3,925,092
  3,925,854
  3,927,046
  3,927,048
  3,927,406
  3,929,811
  3,929,990
  3,930,688
  3,931,340
  3,931,764
  3,932,324
  3,932,348
  3,935,461
  3,935,545
  3,935,866
  3,936,052
  3,936,250
  3,937,030
  3,937,177
  3,937,779
  3,938,398
  3,938,571
  3,938,907
  3,939,188
  3,939,638
  3,940,750
  3,940,832
  3,942,501
  3,942,502
  3,943,360
  3,943,800
  3,944,270
  3,944,271
  3,944,764
  3,945,168
  3,945,176
  3,946,219
  3,946,650
  3,946,733
  3,947,370
  3,947,411
  3,947,951
  3,948,019
  3,948,033
  3,948,292
  3,949,136
  3,949,678
  3,949,794
  3,950,179
  3,950,428
  3,951,117
  3,953,854
  3,953,855
  3,954,628
  3,955,613
  3,956,699
  3,956,728
  3,956,972
  3,957,312
  3,957,715
  3,957,862
  3,958,213
  3,959,361
  3,959,390
  3,961,764
  3,961,766
  3,961,827
  3,961,831
  3,962,470
  3,962,768
  3,963,967
  3,963,968
  3,964,210
  3,964,753
  3,964,757
  3,964,802
  3,965,062
  3,965,111
  3,965,366
  3,965,401
  3,965,475
  3,965,621
  3,966,542
  3,966,906
  3,969,331
  3,969,351
  3,969,846
  3,970,148
  3,971,296
  3,972,062
  3,972,361
  3,972,803
  3,973,041
  3,973,502
  3,973,965
  3,973,987
  3,974,000
  3,975,063
  3,975,124
  3,975,208
  3,975,226
  3,975,484
  3,975,504
  3,977,052
  3,977,332
  3,978,174
  3,978,739
  3,979,410
  3,980,169
  3,981,907
  3,982,368
  3,982,446
  3,982,477
  3,982,952
  3,982,967
  3,983,051
  3,983,610
  3,984,080
  3,985,161
  3,986,194
  3,986,336
  3,987,252
  3,987,562
  3,987,567
  3,988,386
-
2
3
-
A
2
A
C/T
12/-
10/-
-
G/5
-
9/11
-
G
G
G
C
T/3
-
-
2/-
5/-
6/-
C/7
G/-
T/6
11/6
-
A
-
C
-
-
A
12
G
3
A
T
T
G
T
C
C
G
4/-
-
15
A
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
A
6
T
-
T
C
-
T/7
G
T
G
C
T
5
-
A
2/-
-
T
C
A
T/-
C/3
G/3
2/-
A
C
T
T
-
A
G
C
T
A
-
5
-
G
A
T
T
G
A
A
G
G
G
-
-
3
-
3
G
G
T
G
G
-
-
A
T
G
T
-
5
8/-
A
G
G
T
T
A
4/-
-
C
4
T
A
T
2
-
4/-
2/-
G
T
T
8/-
6/-
-
-
4/-
-
-
T/G
G/T
A
6/-
4/-
-
G
C
A
T
2
-
6
33
11
A
T
G
2/-
A/-
T
3/-
2/-
7/-
8/-
6/-
-
A
T
G
A
C
2
G
66/-
4
G
A
6
G
T
A
3
2/-
A
-
C
T
T
2
-
A/-
A
4/-
18/-
16/14
G
G
G
C
-
4
G
T
G
2
A
G
C
G
A
G
2/-
2
T
G
G
A
C
G
-
C
T
CA/3
-
3
C
8/-
6/-
12/-
8/-
C
A
G/2
T/-
T
-
8/-
-
-
-
5
T
-
T
G
-
G
7
G
A
A
A
-
2
-
A
C/-
T/81
C/T
2
4
5
13
-
5
21
-
A
G
3
5
A
C
-
-
3
T
2
T
18
C/G
4
C
-
T/2
G/T
A