Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 140,633 (bp)   Positions: 296
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.993
.015
.135
.052
.006
.146
.06
.065
.009
.025
.496
.013
--
.01
.016
.0
.014
.039
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.119
.657
.002
.001
--
--
.017
.005
.056
.012
.002
.991
.037
.05
.021
.308
.041
.006
.182
.0
.021
.075
.147
.119
.011
--
--
--
--
--
--
--
.03
.212
.055
.025
.805
--
--
--
--
--
--
.084
.718
--
.036
.696
.692
.724
.051
--
.648
.132
.002
.333
.007
.113
.002
.002
.002
.041
.001
.026
.006
.001
.252
.247
.027
.055
.088
.319
.001
.189
.004
.72
.031
.003
.097
.108
.065
.002
.001
.01
.008
.168
.034
.098
.214
.013
.047
.205
.023
--
--
--
--
--
.212
.047
.078
.029
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.002
.005
--
--
.065
1.0
.082
.0
.719
.028
.135
--
.152
.107
.018
.326
.004
.023
.166
--
--
.004
.095
--
--
--
.002
.044
.001
.005
.011
.002
--
.57
.004
.436
.002
.005
.02
.005
.231
--
.02
.032
.034
.246
.324
.086
.033
.001
.259
.007
.002
.037
.065
.024
.017
.047
.082
.416
.43
.102
.015
.051
.005
.024
.007
.16
--
--
.026
.003
.022
.45
.347
.04
.025
.044
.03
.021
.826
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.066
.385
.001
.094
.031
.095
.202
--
--
--
.477
.475
.588
.512
.311
.29
.216
.033
.489
.496
.078
.095
.398
.169
.001
.791
.011
.345
.293
.084
.025
.012
.899
.875
.004
.281
.268
.025
.0
.387
--
.144
--
--
--
.021
.193
.062
.188
.175
.008
.003
.992
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
T
G
A
C
G
G
12
10
C
16
T
T
A
C
C
A
T
T
T
2
5
7
73
6
C
G
T
A
G
G
T
10
16
A
G
A
G
C
A
T
G
C
C
C
G
A
4
A
G
2
14
12
4
8
7
19
16
15
7
18
T
A
C
4
A
C
T
2
A
C
A
T
C
A
G
2
A
A
T
C
G
C
C
C
G
G
A
A
C
T
G
17
G
4
G
G
A
T
C
G
T
G
G
T
A
C
2
4
G
2
G
T
T
C
A
A
6
6
4
G
C
T
G
4
T
8
G
A
A
C
C
C
6
4
2
T
T
A
G
C
G
16
2
A
A
A
4
2
4
2
16
G
C
6
4
4
A
T
10
G
C
2
T
C
G
G
A
2
A
A
3
2
C
A
4
6
4
G
C
A
G
T
A
A
A
A
A
A
G
A
C
C
G
T
G
T
2
A
G
G
G
G
A
C
C
C
2
A
G
4
18
14
A
A
C
G
C
A
G
A
3
T
G
C
A
T
C
G
C
4
2
C
A
G
C
A
A
A
G
A
A
T
A
C
C
2
C
C
T
G
12
G
12
G
T
A
G
4
C
G
C
T
C
G
T
C
G
4
T
C
T
C
T
C
G
G
A
C
C
A
G
G
2
C
G
T
A
A
G
T
10
T
G
G
G
A
  3,851,040
  3,852,176
  3,852,371
  3,852,423
  3,852,708
  3,853,122
  3,857,129
  3,857,131
  3,857,741
  3,858,882
  3,859,144
  3,859,400
  3,860,293
  3,860,875
  3,862,059
  3,863,234
  3,864,013
  3,864,388
  3,865,893
  3,866,147
  3,866,176
  3,866,184
  3,866,195
  3,866,271
  3,866,278
  3,866,279
  3,866,356
  3,866,371
  3,866,571
  3,868,246
  3,870,327
  3,870,979
  3,871,476
  3,871,952
  3,875,657
  3,876,331
  3,878,574
  3,878,630
  3,879,089
  3,880,569
  3,881,327
  3,881,380
  3,881,666
  3,881,706
  3,882,522
  3,882,585
  3,882,701
  3,883,582
  3,883,619
  3,883,676
  3,883,695
  3,883,697
  3,883,853
  3,883,860
  3,883,870
  3,883,878
  3,883,900
  3,883,919
  3,883,936
  3,883,945
  3,883,999
  3,884,198
  3,884,450
  3,885,204
  3,885,375
  3,886,871
  3,886,873
  3,886,919
  3,887,129
  3,887,150
  3,887,286
  3,887,510
  3,887,916
  3,888,199
  3,888,292
  3,888,423
  3,888,424
  3,888,438
  3,889,968
  3,890,911
  3,892,566
  3,892,731
  3,893,905
  3,896,515
  3,896,922
  3,897,430
  3,897,937
  3,897,938
  3,898,505
  3,898,671
  3,898,725
  3,898,731
  3,898,984
  3,899,041
  3,899,536
  3,899,537
  3,899,781
  3,899,934
  3,899,999
  3,900,049
  3,900,139
  3,900,760
  3,900,840
  3,901,322
  3,901,728
  3,902,236
  3,902,272
  3,902,278
  3,902,310
  3,902,323
  3,902,328
  3,902,351
  3,902,353
  3,903,025
  3,903,044
  3,903,285
  3,903,880
  3,904,181
  3,904,183
  3,904,236
  3,904,380
  3,904,490
  3,904,504
  3,904,507
  3,904,518
  3,904,673
  3,904,820
  3,904,886
  3,905,057
  3,905,239
  3,905,797
  3,906,034
  3,906,360
  3,906,362
  3,907,470
  3,907,485
  3,908,446
  3,908,639
  3,908,698
  3,908,973
  3,909,807
  3,910,559
  3,910,605
  3,910,607
  3,911,185
  3,911,338
  3,913,040
  3,913,068
  3,913,085
  3,913,087
  3,913,205
  3,913,382
  3,913,709
  3,915,240
  3,915,242
  3,915,437
  3,916,216
  3,916,982
  3,918,295
  3,919,053
  3,920,780
  3,921,088
  3,922,145
  3,922,701
  3,923,787
  3,923,871
  3,924,405
  3,924,770
  3,924,771
  3,924,846
  3,924,939
  3,924,967
  3,925,448
  3,925,496
  3,927,026
  3,927,046
  3,927,048
  3,927,406
  3,929,811
  3,929,990
  3,930,688
  3,931,340
  3,931,764
  3,932,324
  3,934,365
  3,934,501
  3,935,461
  3,935,545
  3,935,866
  3,936,052
  3,936,250
  3,937,030
  3,937,177
  3,937,779
  3,938,266
  3,938,357
  3,938,398
  3,938,440
  3,938,910
  3,939,188
  3,939,626
  3,939,749
  3,940,027
  3,940,750
  3,940,832
  3,941,613
  3,942,501
  3,942,502
  3,943,360
  3,943,800
  3,944,270
  3,944,271
  3,944,764
  3,945,168
  3,945,176
  3,946,219
  3,947,128
  3,947,370
  3,947,707
  3,947,951
  3,948,031
  3,948,292
  3,948,624
  3,948,697
  3,949,089
  3,949,136
  3,949,191
  3,949,794
  3,949,900
  3,950,426
  3,950,428
  3,951,117
  3,951,761
  3,952,319
  3,953,854
  3,953,855
  3,954,380
  3,954,628
  3,955,613
  3,956,551
  3,956,697
  3,956,699
  3,957,312
  3,957,715
  3,957,862
  3,958,213
  3,959,361
  3,959,494
  3,962,470
  3,963,967
  3,964,753
  3,964,838
  3,965,153
  3,965,366
  3,965,474
  3,966,542
  3,966,864
  3,966,912
  3,967,060
  3,967,532
  3,967,644
  3,967,797
  3,968,755
  3,969,011
  3,969,351
  3,969,378
  3,970,148
  3,971,954
  3,972,062
  3,972,568
  3,972,803
  3,972,946
  3,973,040
  3,973,502
  3,973,510
  3,973,839
  3,973,840
  3,973,965
  3,973,984
  3,973,990
  3,975,484
  3,975,504
  3,977,053
  3,979,456
  3,981,907
  3,982,368
  3,982,967
  3,983,051
  3,984,080
  3,986,194
  3,987,244
  3,987,559
  3,987,567
  3,987,593
  3,988,386
  3,989,263
2
A
3
C/5
A
2
12/-
10/-
A
-
9/13
7
-
T
G
G
G
C
-
-
5/-
-
73/-
-
C/7
-
T/6
11/6
15
A
C
-
-
9
A
73
12
5
G
T/43
A
T
G
T
C
G
-
13
A
-
14/-
12/-
-
-
-
-
-
-
-
-
A
6
T
-
T
T
C
-
G
T
G
C
T
-
A
2/-
-
T
C
3/CT
5
T
T
T
-
A
G
C
T
-
A
-
5
-
3
3
G
A
T
T
G
A
A
G
G
G
-
-
3
-
3
G
G
T
G
G
-
6/-
4/-
A
T
G
T
-
5
-
A
G
G
T
T
A
6/-
4/-
-
C
4
T
A
T
2
-
2/-
G
T
T
-
-
4/-
2/-
-
T
A
6/-
4/-
-
G
C
-
A
T
-
6
7/11
A
T
G
2/-
A/-
T
3/-
2/-
C/3
A/6
-
6/-
4/-
A
T
G
A
C
2
G
G
G
4
G
A
6
G
T
A
3
T
11
-
G
A
C
A
A
-
T
3/CG
7
-
A/-
A
-
18/-
14/16
G
G
G
C
T
G
5
G
-
G
A
G
C
C
T
A
-
4/-
2/-
2
G
2
T
G
-
G
A
G
T
C
C
T
3/CA
-
3
T
C
3
-
G/5
-
13/9
5
G
A
-
-
A
T
C
T
A
4
10
A
-
A
T
2
2
9
A
A
2
A/-
-
5
33
-
31
-
C/6
A
C
T
2
18
4
-
G
T
T
A
G