Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 140,633 (bp)   Positions: 313
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.003
.022
.993
.312
.135
.001
.002
.006
.146
--
.06
.065
.018
.496
.421
.013
--
.016
.002
.0
.014
.039
--
--
--
--
--
--
--
--
.649
.002
.001
.001
--
.017
.056
.014
.002
.966
.991
.037
.082
.05
.021
.308
.083
.041
.006
.152
.0
.021
.075
.147
.011
--
--
--
--
--
--
--
.03
.212
.055
.025
.805
--
--
--
--
--
--
--
.084
.718
.006
--
.036
.696
.692
.724
.051
.03
.209
--
.011
.237
.058
.002
.333
.007
.113
.002
.002
.002
.006
.001
.027
.055
.088
.319
.001
.189
.004
.72
.031
.003
.097
.108
.001
.01
.008
.168
.034
.098
.214
.013
.205
.023
--
--
--
--
.212
.047
.078
.029
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.007
.079
--
--
--
--
--
.06
.002
.005
--
--
1.0
.368
.082
.307
.043
.676
.031
.305
.024
.125
.135
--
--
--
--
--
--
.065
.152
.107
.111
.018
.326
.023
--
--
--
.185
.015
--
--
.049
.0
.004
.334
.015
--
.044
.005
.011
--
--
--
.57
.004
.436
.002
.005
.02
.005
.231
--
.02
.032
.034
.246
.324
.081
.033
.001
.259
.007
.002
.037
.065
.024
.047
.082
.416
.43
.102
.015
.051
.005
.002
.024
.007
.16
--
--
.026
.003
.022
.45
.347
.04
.025
.044
.021
.13
.826
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.066
.385
.001
.094
.031
.0
.006
.004
.723
.095
.008
.184
--
--
--
--
--
--
.64
.081
.003
.588
.311
.114
.095
.454
.169
.002
.714
.056
.791
.345
.084
.025
.875
.004
--
--
.025
.0
.411
.022
--
--
--
.021
.009
.193
.069
.194
.175
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
2
T
T
G
A
8
6
G
G
C
12
10
4
T
4
T
A
C
G
A
T
T
T
2
2
5
6
G
T
A
G
T
10
9
C
G
G
4
A
A
T
G
C
C
C
C
G
G
A
2
A
G
2
14
4
8
7
19
16
15
7
18
T
A
C
4
A
2
T
2
T
A
C
A
T
C
A
A
G
2
A
A
T
G
C
C
G
C
T
C
C
G
G
A
A
C
G
4
A
T
C
G
T
G
G
T
A
C
2
4
G
T
T
C
A
A
6
6
G
C
T
G
4
T
G
A
A
C
C
C
6
4
2
T
T
A
G
C
G
G
A
4
A
10
A
C
A
A
G
8
6
2
2
18
T
T
C
6
C
A
G
T
G
C
T
G
3
T
A
2
4
2
T
T
G
4
G
C
G
T
G
A
A
C
2
7
A
A
4
4
C
G
T
C
G
G
C
G
T
A
64
66
A
A
A
A
G
A
C
C
G
T
G
T
2
A
27
G
G
G
A
C
C
C
2
G
4
18
16
A
A
C
G
12
C
A
G
A
3
T
G
C
A
T
C
G
C
2
T
C
A
C
G
C
A
A
A
G
A
A
T
A
C
C
2
C
C
12
C
A
4
T
G
T
8
4
7
A
4
4
T
T
C
A
4
A
T
A
G
C
A
20
T
T
T
C
A
C
G
A
G
G
T
A
T
T
A
G
C
T
A
3
G
  3,850,022
  3,850,752
  3,851,040
  3,851,765
  3,852,371
  3,852,453
  3,852,455
  3,852,708
  3,853,122
  3,855,630
  3,857,129
  3,857,131
  3,858,894
  3,859,144
  3,859,195
  3,859,400
  3,860,293
  3,862,059
  3,862,816
  3,863,234
  3,864,013
  3,864,388
  3,865,893
  3,866,147
  3,866,157
  3,866,176
  3,866,271
  3,866,279
  3,866,356
  3,866,371
  3,868,263
  3,870,327
  3,870,979
  3,870,980
  3,871,061
  3,875,657
  3,878,574
  3,878,631
  3,879,089
  3,880,565
  3,880,569
  3,881,327
  3,881,373
  3,881,380
  3,881,666
  3,881,706
  3,881,888
  3,882,522
  3,882,585
  3,882,703
  3,883,582
  3,883,619
  3,883,676
  3,883,695
  3,883,853
  3,883,860
  3,883,870
  3,883,878
  3,883,900
  3,883,919
  3,883,936
  3,883,945
  3,883,999
  3,884,198
  3,884,450
  3,885,204
  3,885,375
  3,886,269
  3,886,873
  3,886,919
  3,886,965
  3,887,129
  3,887,150
  3,887,286
  3,887,510
  3,887,916
  3,887,954
  3,888,199
  3,888,292
  3,888,423
  3,888,424
  3,888,438
  3,889,968
  3,890,549
  3,890,888
  3,890,911
  3,893,060
  3,893,209
  3,893,574
  3,893,905
  3,896,515
  3,896,922
  3,897,430
  3,897,937
  3,897,938
  3,898,505
  3,898,984
  3,899,041
  3,899,781
  3,899,934
  3,899,999
  3,900,049
  3,900,139
  3,900,760
  3,900,840
  3,901,322
  3,901,728
  3,902,236
  3,902,272
  3,902,278
  3,902,328
  3,902,351
  3,902,353
  3,903,025
  3,903,044
  3,903,285
  3,903,880
  3,904,181
  3,904,236
  3,904,380
  3,904,490
  3,904,504
  3,904,507
  3,904,518
  3,904,820
  3,904,886
  3,905,057
  3,905,239
  3,905,797
  3,906,034
  3,906,360
  3,906,362
  3,907,470
  3,907,485
  3,908,446
  3,908,639
  3,908,698
  3,908,973
  3,909,807
  3,910,521
  3,910,556
  3,910,562
  3,910,564
  3,910,597
  3,910,607
  3,910,756
  3,911,338
  3,912,000
  3,912,605
  3,912,970
  3,912,972
  3,913,068
  3,913,087
  3,913,203
  3,913,314
  3,913,368
  3,913,709
  3,915,240
  3,915,279
  3,916,216
  3,916,461
  3,916,982
  3,917,149
  3,917,293
  3,917,558
  3,917,768
  3,918,383
  3,920,371
  3,921,027
  3,921,088
  3,922,050
  3,922,122
  3,922,145
  3,922,180
  3,922,181
  3,922,252
  3,922,585
  3,922,701
  3,923,787
  3,923,844
  3,923,871
  3,924,405
  3,924,771
  3,924,941
  3,924,967
  3,925,092
  3,925,354
  3,925,359
  3,927,026
  3,927,048
  3,927,136
  3,927,419
  3,927,732
  3,928,217
  3,928,346
  3,928,434
  3,929,811
  3,930,688
  3,931,340
  3,932,324
  3,932,345
  3,932,348
  3,934,365
  3,934,501
  3,935,461
  3,935,545
  3,935,866
  3,936,052
  3,936,250
  3,937,030
  3,937,177
  3,937,779
  3,938,266
  3,938,357
  3,938,398
  3,938,440
  3,938,907
  3,939,188
  3,939,626
  3,939,749
  3,940,027
  3,940,750
  3,940,832
  3,941,613
  3,942,501
  3,943,360
  3,943,800
  3,944,270
  3,944,271
  3,944,764
  3,945,168
  3,945,176
  3,946,219
  3,946,683
  3,947,128
  3,947,370
  3,947,707
  3,947,951
  3,948,031
  3,948,292
  3,948,624
  3,948,697
  3,949,089
  3,949,136
  3,949,191
  3,949,794
  3,949,900
  3,950,428
  3,950,780
  3,951,117
  3,951,761
  3,952,190
  3,952,319
  3,953,854
  3,953,855
  3,954,380
  3,954,628
  3,955,613
  3,956,551
  3,956,697
  3,956,699
  3,957,312
  3,957,715
  3,957,862
  3,958,213
  3,959,361
  3,959,494
  3,960,546
  3,961,378
  3,961,760
  3,961,835
  3,962,470
  3,962,768
  3,963,968
  3,964,757
  3,964,802
  3,965,058
  3,965,080
  3,965,111
  3,965,161
  3,965,397
  3,965,424
  3,965,621
  3,966,542
  3,966,912
  3,969,331
  3,969,351
  3,969,686
  3,970,148
  3,970,642
  3,971,503
  3,971,938
  3,972,062
  3,972,803
  3,973,040
  3,973,502
  3,973,840
  3,973,965
  3,975,062
  3,975,226
  3,975,484
  3,975,504
  3,977,052
  3,977,900
  3,978,174
  3,979,410
  3,982,967
  3,984,080
  3,985,161
  3,986,194
  3,987,233
  3,987,546
  3,987,567
-
-
2
T
3
8/-
6/-
A
2
T
12/-
10/-
-
T/9
-
9
-
G
T
G
G
C
-
-
2/-
5/-
6/-
-
T/6
11/6
-
C
10/-
9/-
A
A
12
-
G
A/3
T/45
A
T
T
G
T
C
C
G
-
15
A
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
A
6
T
-
T
-
C
-
T/3
G
T
G
C
T
9
-
A
-
A/-
T
C
A
T
CT/4
A
2
C
T
T
-
A
G
C
T
5
-
G
A
T
T
G
A
A
G
G
G
-
-
3
G
G
T
G
G
-
-
A
T
G
T
-
3
A
G
G
T
T
A
6/-
4/-
-
C
4
T
A
T
2
C
G
-
G
10/-
G
A
T
C
11
8/-
6/-
-
2/-
-
A
T/G
A
-
A
G
A
C
A
T
C
C
3/-
C
2
-
-
-
5
C
A
-
9
11
A
C
T
G
G/-
C/4
2/-
-
-
G
-
-
T
A
C
9
A
-
T
A
C
G
-
66/-
G
G
4
G
A
6
G
T
A
3
T
11/15
-
G
-
C
A
A
-
T
3/CG
7
-
A
4/-
18/-
16/-
G
G
G
C
-
T
G
5
G
-
G
A
G
C
C
T
A
-
-
T/3
2
A/G
C/9
2
T
G
-
G
A
G
T
C
C
T
3
-
3
T
12/-
T
G
-
C
A
-
-
-
-
-
-
-
43
9
T
G
-
G
7
5
A
T
G
-
A
2
T/3
A
-
-
-
17
-
19
21
G
A
3
T
18
G
4
3
3/-
T