Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 140,633 (bp)   Positions: 339
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.993
.135
.052
.002
.006
.146
.06
.065
.009
.025
.496
.013
.01
.016
.0
.014
.039
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.657
.002
.001
.001
.002
--
--
--
--
--
--
.017
.005
.001
.002
.991
.037
.05
.021
.308
.041
.006
.182
.0
.021
.075
.119
--
.03
.212
.055
.022
.011
.002
.025
.805
.027
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.084
.718
--
.036
.696
.692
.051
--
.648
.132
.002
.333
.007
.113
.002
.002
.002
.041
.001
.026
.036
.001
.003
.001
.262
.027
.055
.088
.319
.001
.189
.004
.72
.031
.003
.097
.108
.102
.107
.065
.008
.002
.001
.001
.006
.01
.008
.168
.034
.098
.214
.013
.205
.023
--
--
--
--
--
.018
.212
.047
.078
.029
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.002
.005
--
.065
1.0
.082
.719
.028
.125
.135
--
--
--
.065
.152
.107
.018
.326
.166
--
--
--
--
--
--
--
.002
.044
.001
.005
.011
.003
--
.57
.004
.436
.002
.005
.028
.02
.005
.231
--
.02
.032
.204
.246
.324
.033
.001
.259
.007
.002
.037
.065
.046
.07
.024
.047
.082
.416
.102
.015
.051
.005
.024
.007
.16
--
--
.026
.003
.022
.45
.347
.04
.025
.044
.03
.145
.083
.826
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.066
.385
.001
.094
.031
.094
.375
.095
.202
--
--
.004
.251
.475
.588
.512
.303
.312
.29
.216
.033
.489
.496
.078
.095
.328
.458
.169
.056
.791
.011
.345
.293
.084
.025
.012
.004
.27
.279
.281
.268
.025
.0
.387
.341
.028
.051
.108
.111
.053
.144
--
--
--
.021
.193
.069
.07
.188
.179
.177
.008
.003
.992
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
Insr
T
A
C
6
G
G
12
10
C
16
T
T
C
C
A
T
T
2
C
A
T
A
G
T
C
2
2
2
2
2
2
2
2
2
2
3
G
T
T
A
C
G
T
10
9
8
A
A
A
G
2
A
G
C
G
A
T
G
C
C
C
G
A
4
A
G
2
12
G
T
A
C
C
T
C
4
A
G
G
C
C
C
T
5
G
C
C
T
2
T
A
A
C
A
T
C
A
G
2
A
T
C
G
C
C
C
G
G
A
A
C
T
G
G
2
4
A
4
4
A
T
C
G
T
G
G
T
A
C
2
4
C
T
G
G
2
4
G
4
T
T
C
A
A
6
6
G
C
T
G
2
G
C
C
G
A
A
C
C
C
4
C
G
2
T
T
A
G
C
G
2
16
2
A
A
4
2
4
2
2
18
16
2
C
4
4
A
T
G
C
A
2
C
T
C
G
C
G
G
A
A
3
C
2
C
C
4
4
G
C
A
G
T
A
A
A
A
A
A
G
A
A
C
C
G
T
G
T
2
A
G
G
G
A
C
C
C
C
C
2
G
4
16
A
A
C
G
C
A
G
A
3
T
G
C
A
T
C
G
C
2
A
C
C
A
G
C
A
A
A
G
A
A
T
A
C
C
2
C
C
T
4
T
G
12
12
4
T
T
A
G
6
4
C
G
C
T
C
G
T
3
C
G
4
T
C
T
C
T
C
G
C
T
A
C
A
G
G
4
2
8
G
C
T
A
G
T
A
A
G
T
A
10
T
3
2
G
G
A
  3,851,040
  3,852,371
  3,852,423
  3,852,455
  3,852,708
  3,853,122
  3,857,129
  3,857,131
  3,857,741
  3,858,882
  3,859,144
  3,859,400
  3,860,875
  3,862,059
  3,863,234
  3,864,013
  3,864,388
  3,864,675
  3,865,835
  3,865,873
  3,865,893
  3,865,906
  3,865,929
  3,865,932
  3,866,070
  3,866,147
  3,866,157
  3,866,167
  3,866,177
  3,866,187
  3,866,197
  3,866,207
  3,866,217
  3,866,227
  3,866,237
  3,866,263
  3,866,279
  3,866,281
  3,866,356
  3,866,371
  3,866,424
  3,868,246
  3,870,327
  3,870,979
  3,870,980
  3,870,981
  3,871,491
  3,871,529
  3,871,533
  3,871,871
  3,871,883
  3,871,952
  3,875,657
  3,877,406
  3,878,447
  3,879,089
  3,880,569
  3,881,327
  3,881,380
  3,881,666
  3,881,706
  3,882,522
  3,882,585
  3,882,701
  3,883,582
  3,883,619
  3,883,676
  3,883,697
  3,883,962
  3,883,999
  3,884,198
  3,884,450
  3,885,153
  3,885,159
  3,885,192
  3,885,204
  3,885,375
  3,885,572
  3,886,289
  3,886,293
  3,886,415
  3,886,575
  3,886,587
  3,886,603
  3,886,604
  3,886,607
  3,886,871
  3,886,873
  3,886,919
  3,886,965
  3,886,996
  3,887,129
  3,887,150
  3,887,286
  3,887,510
  3,887,916
  3,888,199
  3,888,292
  3,888,423
  3,888,424
  3,889,968
  3,890,911
  3,892,566
  3,892,731
  3,893,905
  3,896,515
  3,896,922
  3,897,430
  3,897,937
  3,897,938
  3,898,505
  3,898,671
  3,898,725
  3,898,731
  3,898,733
  3,898,818
  3,898,821
  3,899,041
  3,899,534
  3,899,781
  3,899,934
  3,899,999
  3,900,049
  3,900,139
  3,900,760
  3,900,840
  3,901,322
  3,901,728
  3,902,236
  3,902,272
  3,902,278
  3,902,289
  3,902,303
  3,902,310
  3,902,320
  3,902,323
  3,902,325
  3,902,328
  3,902,337
  3,902,351
  3,902,353
  3,903,025
  3,903,044
  3,903,285
  3,903,880
  3,904,181
  3,904,236
  3,904,380
  3,904,490
  3,904,504
  3,904,509
  3,904,696
  3,904,698
  3,904,750
  3,904,820
  3,904,886
  3,905,057
  3,905,239
  3,905,797
  3,906,034
  3,906,360
  3,907,386
  3,907,396
  3,907,470
  3,907,485
  3,908,446
  3,908,639
  3,908,698
  3,908,973
  3,909,807
  3,910,565
  3,910,591
  3,910,605
  3,911,185
  3,911,338
  3,912,970
  3,912,972
  3,913,040
  3,913,068
  3,913,085
  3,913,203
  3,913,205
  3,913,381
  3,913,709
  3,915,242
  3,915,437
  3,916,216
  3,916,982
  3,919,053
  3,920,780
  3,921,027
  3,921,088
  3,922,142
  3,922,145
  3,922,159
  3,922,585
  3,922,701
  3,923,787
  3,923,871
  3,924,405
  3,924,846
  3,924,939
  3,924,941
  3,924,967
  3,924,986
  3,925,171
  3,927,026
  3,927,048
  3,927,406
  3,929,811
  3,929,990
  3,930,688
  3,931,340
  3,931,765
  3,932,324
  3,934,365
  3,934,501
  3,935,461
  3,935,545
  3,935,866
  3,936,044
  3,936,052
  3,936,250
  3,937,030
  3,937,177
  3,937,779
  3,938,266
  3,938,384
  3,938,398
  3,938,440
  3,939,188
  3,939,626
  3,939,749
  3,940,027
  3,940,750
  3,940,832
  3,941,613
  3,941,619
  3,941,625
  3,942,501
  3,943,360
  3,943,800
  3,944,270
  3,944,764
  3,945,168
  3,945,176
  3,946,219
  3,947,128
  3,947,370
  3,947,707
  3,947,951
  3,948,031
  3,948,292
  3,948,624
  3,948,697
  3,949,089
  3,949,136
  3,949,191
  3,949,794
  3,949,900
  3,950,426
  3,950,474
  3,950,784
  3,951,117
  3,951,761
  3,952,319
  3,953,854
  3,953,855
  3,954,380
  3,954,628
  3,955,613
  3,956,551
  3,956,697
  3,956,699
  3,957,312
  3,957,715
  3,957,862
  3,958,213
  3,959,361
  3,959,494
  3,961,798
  3,961,827
  3,962,470
  3,963,967
  3,964,753
  3,965,153
  3,965,220
  3,965,362
  3,965,474
  3,966,542
  3,966,864
  3,966,906
  3,966,908
  3,967,060
  3,967,532
  3,967,644
  3,967,797
  3,968,755
  3,969,011
  3,969,351
  3,969,376
  3,969,647
  3,970,148
  3,971,938
  3,972,062
  3,972,568
  3,972,803
  3,972,946
  3,973,040
  3,973,502
  3,973,510
  3,973,965
  3,973,980
  3,973,982
  3,973,984
  3,973,990
  3,975,484
  3,975,504
  3,977,053
  3,977,055
  3,980,670
  3,980,675
  3,980,705
  3,980,707
  3,980,916
  3,981,907
  3,982,368
  3,982,967
  3,983,051
  3,984,080
  3,986,194
  3,987,233
  3,987,234
  3,987,559
  3,987,565
  3,987,566
  3,987,593
  3,988,386
  3,989,263
2
3
3/5
6/-
A
2
12/-
-
A
-
T/A
9/7
T
G
G
G
C
2/-
C/G
A/-
-
A/C
C
T/G
C/G
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
3
6
T
A
C
-
-
-
A/G
A/G
G
G/2
2/-
9/G
A
A
A
G
T/3
A
T
G
T
C
G
-
AC/G
A
-
12/-
A
A
6
T
T
G
T
-
T
C
G/C
C/G
A
2
T/-
-
3
3
T
C
-
3
A/C
G
T
G
C
T
-
A
2/-
-
C
3/CT
G/T
T
T
T
-
A
G
C
T
-
G/A
2
2/-
-
-
-
4/-
G
A
T
T
G
A
A
G
G
G
2/-
4/-
C/T
T/C
G/3
G/3
2/-
-
G/3
4/-
T/G
G
T
G
G
-
-
A
T
G
T
-
G/C
C/G
T
A
G
G
T
T
A
-
C/G
G/C
-
C
4
T
A
T
2
2/-
-
-
T
T
4/-
2/-
-
-
-
18/-
-
2/-
A
-
-
G
C
A
T
2
-
2
6
C/T
9
5
A
T
G
T
3/-
C/-
2/-
C/T
C/3
-
4/-
A
T
G
A
C
G
G
G
G
4
G
A
A/-
6
G
T
A
3
T
T/A
-
G
C
A
A
-
T
CG/3
7
T
T
-
A
-
-
G
G
G
C
T
G
5
G
-
G
A
G
C
C
T
A
-
-
3
C/T
2
A/G
2
T
G
-
G
A
G
T
C
C
T
3/CA
-
3
T
7
-
C
3
-
-
-
T/2
5
G
A
6/-
4/-
-
A
T
C
T
A
T/4
3/-
9
A
-
A
T
2
2
9
A
A
-
T/4
A/2
C/5
A/5
-
G/A
4/-
-
8/-
G/3
C/3
T/3
A/C
A
C
T
2
18
4
A/3
10/-
T/G
3/-
2/-
T
A
G