Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 990,844 (bp)   Positions: 189
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
--
.41
.658
--
--
.154
.997
.998
--
--
--
--
.784
.104
.155
--
--
--
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.438
.008
.029
--
.019
.014
.014
.03
.235
.001
.171
.37
--
.118
--
.038
.001
--
--
--
--
--
--
--
.09
.07
.011
.012
--
--
.287
.076
.0
.001
.002
.036
.751
.006
.167
--
.145
.097
.011
.003
.034
--
.075
.01
.011
--
.223
.461
.003
.007
.002
--
.004
--
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.212
.001
.133
--
--
.001
.217
.003
.001
.0
.0
--
.002
.129
.013
.005
--
--
.028
.002
.001
.001
.001
.002
.002
.009
.013
.001
.001
.003
.097
.061
.011
.001
.023
.075
.14
.465
.569
.184
--
--
.018
.0
.001
.001
.001
--
--
.005
.065
.079
--
--
--
--
.001
.004
.035
--
--
--
--
.026
.003
--
--
--
--
.007
.018
.002
--
--
--
--
.001
.0
.01
--
.021
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
Il1rapl1
T
T
C
G
C
T
4
2
C
4
4
G
C
G
2
C
8
C
T
C
2
G
A
C
T
T
T
T
C
T
T
C
C
C
A
C
3
C
G
G
A
A
T
A
4
T
2
T
T
G
A
C
2
C
C
G
G
G
A
5
4
2
G
G
G
2
2
T
A
2
A
2
T
2
G
G
T
2
C
C
2
G
C
A
A
T
A
T
C
2
A
T
G
A
C
C
C
A
A
G
A
C
2
C
G
C
C
C
4
G
C
C
T
T
2
8
2
4
G
A
G
T
A
T
T
A
T
G
G
G
G
G
4
G
G
G
G
G
G
G
G
G
G
3
A
G
G
C
C
C
2
T
A
A
A
A
A
T
C
2
T
G
2
A
4
C
T
C
A
A
18
2
T
T
4
T
2
2
T
T
C
T
C
A
T
T
A
2
T
  55,637,098
  55,649,360
  55,652,437
  55,658,764
  55,668,082
  55,670,668
  55,675,350
  55,675,352
  55,678,179
  55,678,186
  55,678,218
  55,678,221
  55,680,486
  55,680,736
  55,683,576
  56,571,688
  56,577,031
  56,583,743
  56,615,639
  56,636,834
  56,641,644
  56,651,905
  56,651,911
  56,651,920
  56,652,054
  56,652,057
  56,652,082
  56,652,096
  56,652,097
  56,652,100
  56,652,102
  56,652,105
  56,652,109
  56,667,811
  56,679,409
  56,688,514
  56,689,178
  56,696,816
  56,702,615
  56,702,629
  56,702,630
  56,702,672
  56,702,727
  56,702,974
  56,703,219
  56,711,951
  56,714,845
  56,715,690
  56,716,387
  56,719,256
  56,722,806
  56,743,658
  56,759,322
  56,769,120
  56,769,149
  56,773,872
  56,773,873
  56,785,720
  56,790,205
  56,790,469
  56,790,647
  56,790,649
  56,799,501
  56,804,646
  56,806,328
  56,841,056
  56,849,077
  56,849,079
  56,849,086
  56,852,558
  56,864,627
  56,889,527
  56,896,274
  56,921,259
  56,938,088
  57,000,193
  57,019,529
  57,019,541
  57,019,659
  57,038,015
  57,050,471
  57,051,707
  57,061,549
  57,070,151
  57,090,496
  57,094,645
  57,105,524
  57,120,957
  57,123,439
  57,129,157
  57,136,558
  57,138,569
  57,143,375
  57,144,855
  57,144,858
  57,144,861
  57,144,874
  57,144,875
  57,144,880
  57,144,899
  57,144,902
  57,144,905
  57,144,911
  57,144,915
  57,144,918
  57,144,924
  57,144,927
  57,144,933
  57,150,654
  57,163,986
  57,170,511
  57,175,756
  57,175,798
  57,176,985
  57,182,918
  57,183,523
  57,183,529
  57,201,930
  57,201,933
  57,203,071
  57,213,655
  57,216,933
  57,217,478
  57,220,492
  57,225,045
  57,225,322
  57,227,485
  57,227,906
  57,227,907
  57,227,908
  57,227,913
  57,227,930
  57,227,932
  57,227,935
  57,227,971
  57,227,990
  57,227,994
  57,227,998
  57,228,018
  57,228,027
  57,228,036
  57,228,055
  57,228,078
  57,228,083
  57,228,086
  57,228,092
  57,228,103
  57,228,136
  57,234,918
  57,237,844
  57,240,113
  57,243,269
  57,243,274
  57,243,275
  57,243,596
  57,256,114
  57,258,882
  57,262,968
  57,268,185
  57,268,186
  57,277,318
  57,287,013
  57,287,016
  57,287,022
  57,311,064
  57,314,960
  57,317,598
  57,348,456
  57,348,457
  57,348,542
  57,348,553
  57,350,526
  57,369,928
  57,374,564
  57,411,857
  57,425,717
  57,438,412
  57,440,665
  57,480,715
  57,482,945
  57,489,957
  57,490,165
  57,513,001
  57,522,928
  57,536,486
  57,536,495
  57,536,519
  57,536,921
  57,542,286
-
5
C/7
15
C/2
T/-
4/-
2/-
C/-
4/-
4/-
G/4
3
A
2/-
G
-
-
4
-
2/-
-
-
-
-
-
-
-
G
-
-
-
-
C/2
5
-
-
5
2
T
G
2
-
2
-
5
-
3
T/-
2
64
5
-
C/2
C/2
C
A
G/A
2
-
4/-
2/-
-
2
2
2/-
-
4
G
-
7
2/-
T/5
2/-
A
-
2
-
A
7
2/-
G/2
-
A/-
A/-
G
-
2
3
-
2
27
A
T
T
T
T
T
T
T
T
T
-
2
T
T
A
-
4/-
3
2
-
-
C
2/-
8/-
2/-
-
6
C
G/2
2
-
2
56
G
2
A
C
T
A
A
-
5
A
A
A
A
C
-
T
T
T
-
3
T
T
2
C/2
30
2/-
A
T
T
A/-
3
G
-
C/5
2/-
2
-
-
2
4/-
T
2
T
G
2
-
2/-
A
-
4/-
T/3
2/-
2/-
T/-
-
C/-
T/-
-
A/3
-
-
-
-
T/-