Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 234,718 (bp)   Positions: 375
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.999
.998
.305
.002
.057
.03
.124
.008
--
.548
.455
.446
.0
.007
.003
.004
.002
.279
.353
.431
.019
.002
--
--
.263
.281
.059
.012
.014
.007
.003
.001
.0
.002
.001
.001
.0
.03
.009
.037
.022
.178
.216
.001
.006
.009
.011
.135
.196
.002
.0
.001
.209
.185
.256
.004
.05
.594
.004
.004
.421
.871
.001
.004
.003
.001
.0
.044
.313
.011
.005
.001
.0
.008
.001
.001
.009
.007
.002
.009
.153
.576
.009
.028
.057
.005
.018
.109
.001
.004
.113
.274
.949
.898
.839
.731
.865
.543
.005
.018
.007
.728
.019
.0
.003
.004
.0
--
.032
.0
.003
.039
.006
.002
.002
.235
.104
.045
.001
.116
.012
.056
.09
.0
.006
.002
.005
--
--
--
.655
.17
.439
.021
.67
.142
.044
.039
.0
.001
.002
--
--
--
.001
--
.0
.0
.0
.0
.002
.001
.004
.006
--
.012
.003
.178
.034
--
--
.001
.209
.007
.801
.001
.0
.006
.243
.0
.233
.084
.006
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.175
.039
.001
.069
.193
.003
.136
--
.011
--
--
--
--
.001
.0
.004
.059
.003
.46
.483
.02
.0
.019
.033
.524
.018
.007
.986
1.0
.017
.193
.001
.327
--
.02
--
--
.001
.066
.119
.002
.077
.111
.148
.174
.017
.157
.02
--
--
.239
.089
.141
.005
.005
.001
--
--
.01
.009
.182
.133
.102
.022
.008
.07
.011
.047
.006
.007
.258
.01
.004
.003
.009
.01
.004
.007
.032
.004
.007
.181
.004
.002
.007
--
--
--
.014
.117
.02
.101
.142
.298
.116
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.002
.04
.007
.014
.012
.003
.017
--
--
--
--
--
.0
.008
.004
.004
.019
.003
.001
.063
.058
--
--
--
--
--
--
.068
.004
--
.18
.019
.148
.024
--
.0
--
--
--
--
--
--
.053
.036
--
.023
.052
.03
.0
.148
.024
--
--
--
.019
.029
--
--
--
.018
.017
.235
.035
.003
.315
.038
.002
--
--
--
.003
.166
.007
.261
.005
.0
.001
.061
.0
.012
.003
--
--
--
--
.001
.041
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
Htr2c
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
T
10
T
G
C
5
A
G
T
A
A
A
A
T
C
A
A
4
4
G
T
A
18
2
19
23
T
3
C
T
4
T
4
C
T
T
C
G
C
G
G
C
T
G
C
A
T
C
T
5
C
C
18
A
G
2
C
C
2
A
T
A
A
T
G
G
A
G
2
T
G
G
G
A
T
C
A
G
T
G
A
A
G
A
T
T
T
C
G
G
3
T
C
4
5
5
G
C
T
G
A
T
2
T
C
C
G
G
A
T
A
G
G
C
T
2
G
G
G
G
C
C
T
T
C
2
C
T
A
T
C
2
A
6
C
G
G
12
C
C
C
C
C
2
C
C
T
2
T
A
G
T
G
C
3
C
T
C
G
G
A
C
G
T
C
A
T
T
A
T
T
G
C
C
T
A
T
T
C
T
C
T
T
A
A
G
A
T
G
T
C
T
A
C
A
T
G
G
G
G
G
C
10
8
T
A
8
2
16
G
T
C
C
T
A
G
G
12
T
A
T
G
T
C
C
2
T
5
T
A
T
A
A
T
A
C
A
G
T
14
C
C
T
A
3
T
T
A
G
C
T
A
A
G
A
A
T
C
T
A
G
T
A
G
C
C
G
T
A
G
T
G
A
G
A
T
C
C
C
G
G
A
G
C
C
T
G
C
T
C
T
A
A
G
A
C
A
A
A
T
G
T
G
C
G
G
T
T
T
G
C
C
T
G
T
A
C
C
T
G
G
A
8
G
T
T
T
T
T
T
A
G
T
C
A
C
G
T
2
G
T
C
C
A
A
C
T
C
2
G
C
G
T
A
2
T
C
C
3
A
C
T
G
A
C
2
A
T
C
T
A
6
6
T
T
  118,227,993
  118,228,074
  118,228,160
  118,228,844
  118,228,963
  118,229,094
  118,229,098
  118,229,428
  118,231,353
  118,231,721
  118,231,724
  118,231,725
  118,231,802
  118,232,266
  118,233,337
  118,233,368
  118,233,375
  118,233,528
  118,233,565
  118,233,960
  118,234,090
  118,234,484
  118,234,802
  118,234,856
  118,234,880
  118,234,882
  118,235,010
  118,236,021
  118,236,036
  118,236,040
  118,236,044
  118,236,104
  118,236,115
  118,236,124
  118,236,128
  118,236,135
  118,236,136
  118,236,176
  118,236,196
  118,236,199
  118,236,209
  118,236,216
  118,236,219
  118,236,253
  118,236,271
  118,236,276
  118,236,861
  118,237,951
  118,237,956
  118,238,019
  118,238,023
  118,238,046
  118,240,116
  118,240,151
  118,240,404
  118,240,809
  118,240,871
  118,241,806
  118,242,784
  118,243,209
  118,243,387
  118,243,500
  118,244,656
  118,245,334
  118,246,084
  118,246,131
  118,246,156
  118,246,299
  118,246,843
  118,246,959
  118,246,960
  118,246,965
  118,246,987
  118,249,458
  118,249,616
  118,249,622
  118,249,646
  118,249,690
  118,249,809
  118,249,921
  118,250,247
  118,250,316
  118,250,619
  118,251,509
  118,251,643
  118,251,662
  118,252,429
  118,252,664
  118,252,674
  118,252,679
  118,252,690
  118,252,699
  118,252,793
  118,252,797
  118,252,803
  118,252,810
  118,252,882
  118,253,000
  118,253,131
  118,253,864
  118,253,876
  118,254,963
  118,255,103
  118,255,554
  118,255,617
  118,255,813
  118,256,405
  118,257,328
  118,258,243
  118,259,085
  118,261,422
  118,262,342
  118,262,423
  118,262,575
  118,264,256
  118,265,206
  118,265,952
  118,268,619
  118,268,760
  118,269,530
  118,269,761
  118,269,877
  118,270,429
  118,271,360
  118,271,623
  118,275,061
  118,275,660
  118,276,602
  118,277,291
  118,277,837
  118,278,308
  118,279,228
  118,280,199
  118,280,904
  118,284,019
  118,284,335
  118,284,367
  118,284,405
  118,284,457
  118,284,470
  118,284,662
  118,284,828
  118,284,831
  118,286,407
  118,286,687
  118,287,220
  118,290,256
  118,291,063
  118,292,339
  118,292,841
  118,293,155
  118,293,197
  118,296,834
  118,296,895
  118,307,474
  118,307,800
  118,308,015
  118,308,337
  118,308,805
  118,309,109
  118,309,201
  118,310,551
  118,310,724
  118,311,114
  118,311,240
  118,312,327
  118,312,410
  118,312,698
  118,313,242
  118,313,525
  118,315,279
  118,317,300
  118,317,318
  118,318,819
  118,318,831
  118,318,847
  118,318,857
  118,318,866
  118,318,872
  118,318,900
  118,318,907
  118,318,954
  118,319,017
  118,319,435
  118,320,187
  118,320,333
  118,323,973
  118,324,206
  118,325,032
  118,327,278
  118,327,533
  118,328,187
  118,328,879
  118,329,336
  118,330,779
  118,330,780
  118,331,558
  118,332,629
  118,332,729
  118,333,031
  118,333,491
  118,333,721
  118,335,450
  118,335,452
  118,335,863
  118,336,602
  118,337,881
  118,338,076
  118,340,164
  118,340,276
  118,342,101
  118,342,580
  118,342,585
  118,343,595
  118,343,946
  118,344,105
  118,347,180
  118,347,443
  118,348,151
  118,349,481
  118,349,906
  118,350,259
  118,351,086
  118,351,119
  118,351,210
  118,352,065
  118,352,070
  118,352,073
  118,352,080
  118,353,201
  118,354,257
  118,356,133
  118,359,350
  118,364,173
  118,364,870
  118,367,995
  118,368,123
  118,368,939
  118,369,006
  118,369,764
  118,369,841
  118,370,909
  118,371,705
  118,372,120
  118,373,280
  118,373,310
  118,373,324
  118,373,493
  118,373,502
  118,373,541
  118,373,663
  118,373,704
  118,373,770
  118,373,771
  118,374,159
  118,374,356
  118,374,685
  118,374,693
  118,374,844
  118,374,993
  118,375,161
  118,375,307
  118,375,851
  118,375,862
  118,376,394
  118,376,439
  118,376,600
  118,376,764
  118,376,795
  118,376,944
  118,377,040
  118,377,063
  118,377,601
  118,377,850
  118,378,361
  118,378,765
  118,379,139
  118,380,152
  118,380,437
  118,381,008
  118,381,168
  118,381,658
  118,381,758
  118,382,747
  118,383,019
  118,383,789
  118,384,009
  118,384,094
  118,385,295
  118,385,414
  118,385,637
  118,386,792
  118,387,105
  118,387,339
  118,388,023
  118,388,263
  118,391,261
  118,391,262
  118,391,456
  118,391,520
  118,391,953
  118,392,326
  118,392,513
  118,392,562
  118,392,994
  118,393,551
  118,394,305
  118,395,712
  118,396,605
  118,398,189
  118,399,028
  118,399,329
  118,399,359
  118,399,574
  118,399,613
  118,401,824
  118,402,020
  118,402,741
  118,402,836
  118,402,884
  118,402,989
  118,403,404
  118,403,671
  118,405,932
  118,406,802
  118,407,832
  118,409,558
  118,411,279
  118,411,536
  118,412,059
  118,412,455
  118,413,314
  118,413,323
  118,413,852
  118,414,199
  118,414,326
  118,414,623
  118,414,916
  118,415,576
  118,415,956
  118,415,996
  118,416,064
  118,416,884
  118,417,776
  118,418,304
  118,418,514
  118,418,542
  118,419,164
  118,419,395
  118,421,127
  118,429,358
  118,432,757
  118,437,399
  118,441,564
  118,442,134
  118,442,135
  118,442,199
  118,442,475
  118,444,246
  118,445,050
  118,445,174
  118,445,484
  118,445,913
  118,446,221
  118,448,027
  118,448,217
  118,449,316
  118,450,661
  118,452,055
  118,452,757
  118,453,035
  118,453,054
  118,453,597
  118,456,751
  118,458,421
3
-
21
A
2
-
5
T
C
G
2
G
3
C
T
C
T
-
-
A
2
T
-
-
19/-
23/-
-
-
G
G
-
A
-
A
A
G
A
A
T
-
A
G
C
A
T
T
A
-
-
-
7
A
-
G
A
-
T
A
-
G
A
G
T
G
C
C
G
A
-
A
T
2
A
4
C
2
G
A
G
A
T
G
A
C
A
G
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
2
T
C
T
T
A
-
G
T
G
A
-
T
C
T
3
A
3
C
-
C
A
A
T
T
9
2
G
G
-
T
C
G
C
-
2/-
2
6/-
A
-
2
-
-
-
A
-
A
2/-
T
4
A
-
G
-
C
-
A
3
-
C/T
-
T
12
-
2
A
A
C
T
-
C
C
2
A
C
17
T
-
G
-
-
C
G
C
T
C
G
G
C
C
9
2
A
-
T
G
3
T
C
A
A
A
A
A
T
T
10/-
8/-
9
G
-
-
-
2
G
A
A
4
G
A
3
-
C
G
G
A
13
10
T
2/-
T/3
5/-
T/4
G
7
C
T
C
-
T
15
A
A
-
G
T
G
G
-
C
G
G
A
G
-
C
G
A
G
G
G
G
C
C
T
C
-
-
15
5
T
C
G
T
2
A
G
A
G
C
G
T
T
59
A
G
A
T
A
C
C
2
C
T
C
T
T
T
G
2
-
T
T
C
T
G
T
T
2
A
A
-
C
A
T
G
9
2
12
-
T
T
2
C
G/2
G
-
T
2
G
G
C
C
A
T
A
-
T
T
2
A
C
-
A
-
A
T
G
17
T
C
G
-
C
G
A
A
G
2/-
T/-
G
G
-
G
T
C
2
G
2
-
C
4
2
G
-
-
-
9
-