Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 178,327 (bp)   Positions: 505
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.011
.001
.08
.05
.002
.007
.144
.002
.003
.043
.003
.002
.001
.002
.016
.12
.155
.001
.013
.003
.003
.001
.001
.001
.008
.0
.018
.012
--
--
.06
.001
.001
.001
.487
.059
.001
.007
.003
.003
.018
.021
.073
.0
.005
.0
.003
.007
.026
.034
.054
.115
.003
.0
.0
.002
.136
.008
.015
.011
.004
.0
.007
.965
.005
.006
.113
.077
.363
.456
.002
.0
.007
.116
.002
.047
.337
.173
.223
.151
.003
.0
.002
.0
.004
.003
.002
.002
.005
.03
.003
.001
.041
.07
.067
.062
.054
.011
.002
.0
.163
.072
.212
.009
.089
.062
.502
.519
--
.048
.053
.358
.011
.002
.035
.0
.003
.001
.174
.992
.001
.194
.193
.036
.003
.0
.03
.0
.001
.184
.01
.456
.502
.002
--
.081
.159
--
.156
.006
.005
.035
.001
.005
.0
.039
.0
.002
.013
.0
.034
.154
.232
.239
.029
.021
.056
.022
.088
.005
.028
.0
.002
.047
.174
.035
.025
1.0
.0
.001
.0
.04
.0
.0
.001
.017
.081
.02
.162
.017
.002
.039
.009
.015
.013
.0
.002
.058
.602
.001
.0
.004
.003
.018
.0
.001
.025
.002
.0
.004
.006
.0
.001
.004
.001
.001
.001
.027
.15
.014
.007
.0
.001
.033
.038
.01
.0
.0
.996
.051
.009
.002
.006
.053
.066
.002
.009
.001
.005
.001
.018
.034
.058
.0
.128
.001
.009
.002
.149
.011
.033
.0
.002
--
.021
.001
.0
.0
.001
.0
.004
.114
.001
.0
.003
.0
.668
.079
.024
.884
.138
--
.068
.572
.0
.001
.001
.0
.019
.002
.001
.0
.001
.014
.004
.0
.005
.108
.027
.725
.05
.356
.0
.322
.001
.005
.036
--
--
--
--
.0
.037
.391
.001
.031
--
--
.018
.008
.007
.001
.0
.002
.006
.001
.0
.001
.001
.001
.022
.006
.001
.817
.0
.0
.03
.193
.026
--
.233
.013
.018
.025
.0
.004
.002
.0
.001
.007
.002
.013
.004
.028
.057
.001
.001
.009
.0
.0
.081
.001
.001
.01
.032
.003
.021
.0
.001
.001
.007
.009
.034
.008
.001
.086
.012
.001
.891
.005
.001
.96
.004
.0
.0
.013
.012
.003
.001
.007
.003
.025
.003
.016
.012
.03
.0
.001
.062
.0
.001
.0
.002
.0
.0
.0
.003
.0
.001
.006
.003
.022
.269
.259
.004
.214
.215
--
--
--
--
.068
.156
.108
.031
.137
.01
.101
.0
.0
.0
.001
.001
.044
.048
.929
.002
.007
.008
.022
.12
.015
--
.008
.002
.002
.003
.016
.061
.153
.003
.003
.059
.089
.057
--
--
--
.1
.003
.007
.0
.015
.964
.004
.153
.065
.0
.002
.0
.004
.004
.0
.018
.027
.343
.442
.131
.003
.001
.001
.008
.001
.0
.008
.02
.004
.0
.028
.5
.032
.025
.003
.018
.016
.1
.16
.203
.027
.042
.005
.032
.17
.086
.029
.134
.075
.0
.0
.001
.001
.007
.036
.002
.0
.008
.003
.001
.014
.004
.028
.003
.109
.003
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Egfr
Egfr
Egfr
Egfr
Egfr
Egfr
Egfr
Egfr
Egfr
Egfr
Egfr
Egfr
Egfr
Egfr
Egfr
Egfr
Egfr
Egfr
Egfr
Egfr
Egfr
Egfr
Egfr
Egfr
Egfr
Egfr
Egfr
Egfr
Egfr
Egfr
Egfr
Egfr
Egfr
Egfr
Egfr
Egfr
Egfr
Egfr
Egfr
Egfr
Egfr
Egfr
Egfr
Egfr
Egfr
Egfr
Egfr
Egfr
Egfr
Egfr
Egfr
C
16
C
C
2
T
12
G
T
13
C
C
T
C
A
C
T
A
C
G
C
G
C
G
C
C
G
T
2
C
T
8
6
C
T
T
T
G
4
2
A
G
2
G
T
G
A
T
A
G
C
T
T
T
C
T
A
G
G
C
A
T
C
G
C
2
T
T
G
G
T
A
G
A
A
4
T
A
C
C
A
C
A
A
A
A
A
T
G
G
A
A
C
T
T
T
T
T
A
C
3
A
T
C
G
A
A
A
98
10
T
T
C
G
C
A
G
A
A
A
A
C
G
T
6
4
G
C
C
A
T
T
T
C
18
T
C
A
A
G
T
C
A
A
T
A
G
G
T
T
G
A
G
G
G
G
C
T
C
T
C
G
T
T
A
C
T
A
A
A
C
C
G
T
C
T
C
T
G
C
A
T
A
G
T
T
T
T
A
A
T
C
C
G
T
T
C
C
T
T
A
A
T
A
C
G
A
C
G
14
T
G
A
4
3
T
G
C
G
A
A
C
A
20
18
T
C
A
A
C
A
A
A
A
G
3
A
A
A
A
T
A
T
A
C
T
G
C
G
G
C
A
C
T
C
C
A
G
G
C
A
G
C
T
T
C
A
C
G
2
C
T
T
T
C
A
G
G
T
A
G
C
A
G
T
G
6
12
10
T
36
C
T
2
A
T
G
T
G
C
C
T
T
12
G
T
2
C
T
A
G
A
T
T
C
T
A
A
G
T
A
6
4
G
A
C
G
G
A
C
C
T
G
T
G
T
A
G
T
T
G
A
12
T
A
T
T
T
T
A
C
C
A
2
C
T
C
G
T
C
T
G
G
C
G
T
A
C
T
T
T
G
C
C
A
A
C
A
A
A
T
T
A
C
A
T
G
A
G
A
A
C
C
C
T
T
A
G
3
G
3
A
T
G
T
T
A
A
G
A
T
G
C
G
2
A
C
T
G
C
G
G
C
T
A
A
T
C
12
A
A
G
G
C
T
C
34
31
T
C
G
T
T
T
G
C
T
A
T
G
A
T
T
T
G
T
T
T
T
G
G
A
A
T
A
T
A
G
A
T
C
C
T
T
G
T
T
C
A
C
A
C
A
T
C
T
A
T
C
T
T
C
3
A
A
C
T
G
T
A
A
G
G
G
T
  100,439,960
  100,440,067
  100,440,753
  100,441,302
  100,441,460
  100,441,648
  100,441,673
  100,442,035
  100,443,037
  100,443,801
  100,444,799
  100,445,552
  100,445,800
  100,446,013
  100,447,704
  100,447,735
  100,448,111
  100,448,241
  100,448,379
  100,448,434
  100,448,492
  100,448,521
  100,448,560
  100,448,563
  100,448,566
  100,448,583
  100,448,604
  100,448,626
  100,449,978
  100,452,016
  100,453,976
  100,454,655
  100,454,657
  100,455,522
  100,455,786
  100,456,831
  100,457,361
  100,459,104
  100,459,615
  100,459,617
  100,460,579
  100,460,752
  100,460,781
  100,461,425
  100,462,069
  100,464,946
  100,465,072
  100,465,091
  100,465,133
  100,465,137
  100,465,140
  100,465,284
  100,465,896
  100,466,030
  100,466,051
  100,466,254
  100,466,383
  100,466,933
  100,467,084
  100,467,925
  100,467,949
  100,468,128
  100,468,256
  100,468,346
  100,468,701
  100,469,917
  100,470,160
  100,471,284
  100,471,334
  100,471,346
  100,471,618
  100,471,628
  100,471,988
  100,472,365
  100,472,895
  100,472,934
  100,473,132
  100,473,197
  100,473,214
  100,473,244
  100,473,986
  100,473,992
  100,474,051
  100,474,367
  100,474,444
  100,474,490
  100,474,985
  100,474,988
  100,474,990
  100,475,213
  100,475,229
  100,475,393
  100,475,856
  100,475,872
  100,475,875
  100,475,878
  100,475,881
  100,476,501
  100,476,924
  100,476,982
  100,477,483
  100,477,655
  100,477,672
  100,477,985
  100,478,026
  100,478,032
  100,478,109
  100,478,186
  100,478,622
  100,478,843
  100,479,231
  100,479,857
  100,480,317
  100,481,971
  100,482,132
  100,482,597
  100,482,833
  100,483,062
  100,483,757
  100,484,466
  100,484,854
  100,484,961
  100,484,962
  100,485,349
  100,485,449
  100,485,451
  100,485,669
  100,487,186
  100,487,804
  100,488,347
  100,488,603
  100,488,804
  100,489,147
  100,489,215
  100,489,497
  100,490,215
  100,490,616
  100,490,821
  100,490,953
  100,491,135
  100,491,154
  100,491,610
  100,491,650
  100,491,656
  100,491,798
  100,491,937
  100,492,084
  100,492,194
  100,492,432
  100,492,948
  100,493,163
  100,493,194
  100,493,226
  100,493,236
  100,494,054
  100,494,243
  100,494,391
  100,494,516
  100,494,533
  100,494,625
  100,495,012
  100,495,482
  100,495,714
  100,495,917
  100,495,963
  100,496,104
  100,496,153
  100,496,447
  100,496,629
  100,496,698
  100,496,744
  100,496,918
  100,497,036
  100,497,362
  100,497,509
  100,497,528
  100,497,562
  100,497,638
  100,497,704
  100,497,750
  100,498,200
  100,498,228
  100,498,288
  100,498,302
  100,498,335
  100,498,584
  100,498,640
  100,499,257
  100,500,010
  100,500,276
  100,500,390
  100,500,425
  100,500,724
  100,501,380
  100,501,491
  100,501,830
  100,502,114
  100,502,414
  100,502,625
  100,502,634
  100,502,930
  100,503,498
  100,503,668
  100,503,749
  100,503,760
  100,503,831
  100,504,366
  100,504,940
  100,504,973
  100,505,601
  100,505,749
  100,506,453
  100,506,553
  100,507,753
  100,507,754
  100,509,611
  100,510,009
  100,510,476
  100,510,687
  100,511,006
  100,511,985
  100,512,126
  100,512,129
  100,512,135
  100,512,137
  100,512,321
  100,512,394
  100,512,710
  100,512,731
  100,512,760
  100,513,018
  100,513,385
  100,513,564
  100,513,821
  100,515,153
  100,515,375
  100,515,572
  100,516,131
  100,516,318
  100,516,784
  100,516,921
  100,517,086
  100,517,338
  100,518,599
  100,520,324
  100,520,428
  100,520,440
  100,520,569
  100,520,989
  100,521,051
  100,521,493
  100,521,583
  100,522,367
  100,522,849
  100,523,005
  100,523,020
  100,523,148
  100,523,160
  100,523,869
  100,524,964
  100,525,149
  100,526,048
  100,526,677
  100,527,130
  100,527,623
  100,530,764
  100,532,070
  100,532,522
  100,532,885
  100,533,144
  100,533,260
  100,533,261
  100,533,499
  100,534,376
  100,534,976
  100,535,419
  100,535,490
  100,535,826
  100,537,012
  100,537,559
  100,537,623
  100,537,658
  100,538,710
  100,538,754
  100,539,254
  100,539,913
  100,541,505
  100,541,650
  100,541,652
  100,541,793
  100,541,837
  100,542,038
  100,542,554
  100,542,700
  100,542,805
  100,543,028
  100,543,555
  100,543,854
  100,544,403
  100,544,429
  100,544,470
  100,544,758
  100,544,830
  100,545,310
  100,545,467
  100,545,488
  100,545,549
  100,545,931
  100,546,763
  100,546,764
  100,547,669
  100,548,821
  100,548,825
  100,549,186
  100,549,375
  100,549,405
  100,550,438
  100,550,890
  100,550,984
  100,551,879
  100,551,978
  100,552,101
  100,552,103
  100,552,187
  100,552,334
  100,552,750
  100,553,003
  100,553,297
  100,554,873
  100,555,192
  100,555,205
  100,555,266
  100,555,364
  100,555,381
  100,555,394
  100,555,708
  100,555,768
  100,555,963
  100,556,065
  100,556,108
  100,556,546
  100,556,651
  100,557,005
  100,557,059
  100,557,073
  100,557,311
  100,557,338
  100,557,629
  100,557,643
  100,557,706
  100,557,951
  100,557,983
  100,558,071
  100,558,118
  100,558,188
  100,558,206
  100,558,221
  100,558,293
  100,558,370
  100,558,528
  100,558,549
  100,558,889
  100,559,474
  100,559,633
  100,559,996
  100,560,118
  100,560,859
  100,560,881
  100,561,096
  100,561,669
  100,561,995
  100,562,131
  100,562,254
  100,562,322
  100,562,719
  100,562,723
  100,562,734
  100,562,778
  100,563,064
  100,563,340
  100,563,755
  100,563,791
  100,563,909
  100,563,969
  100,564,048
  100,564,094
  100,564,218
  100,564,302
  100,564,485
  100,564,496
  100,564,520
  100,564,596
  100,564,709
  100,564,712
  100,564,938
  100,564,997
  100,565,025
  100,565,103
  100,565,120
  100,565,140
  100,565,178
  100,565,296
  100,565,315
  100,565,407
  100,565,564
  100,565,603
  100,565,665
  100,565,696
  100,566,272
  100,566,378
  100,566,449
  100,567,551
  100,569,733
  100,570,303
  100,570,304
  100,571,763
  100,572,280
  100,573,087
  100,573,228
  100,574,170
  100,574,253
  100,574,340
  100,577,080
  100,578,064
  100,578,659
  100,578,660
  100,581,958
  100,582,130
  100,583,013
  100,584,327
  100,584,949
  100,585,094
  100,585,182
  100,586,060
  100,587,073
  100,587,534
  100,587,535
  100,587,538
  100,587,659
  100,587,849
  100,588,051
  100,588,207
  100,588,386
  100,588,515
  100,590,250
  100,590,640
  100,590,957
  100,591,123
  100,591,266
  100,591,269
  100,591,281
  100,591,285
  100,591,875
  100,591,955
  100,591,956
  100,592,050
  100,592,078
  100,592,214
  100,592,377
  100,592,579
  100,592,581
  100,592,814
  100,592,934
  100,592,949
  100,592,964
  100,593,591
  100,594,078
  100,594,768
  100,594,959
  100,595,375
  100,595,386
  100,595,417
  100,595,615
  100,595,650
  100,595,689
  100,595,851
  100,595,863
  100,595,902
  100,595,944
  100,596,046
  100,596,135
  100,596,239
  100,596,260
  100,596,507
  100,596,673
  100,596,952
  100,596,962
  100,597,000
  100,597,013
  100,597,031
  100,598,121
  100,598,129
  100,598,299
  100,598,685
  100,598,961
  100,599,137
  100,599,195
  100,599,228
  100,599,481
  100,610,749
  100,611,670
  100,612,835
  100,614,263
  100,616,009
  100,616,131
C/3
-
G
T
-
T/2
-
A
C
-
T
T
C
T
4
2
A
G
T
T
A
T
T
A
2
T
10
-
-
-
C
8/-
6/-
T
A
-
C
A
4/-
2/-
T
5/3
-
A
C
A
G
A
C
A
T
C
C
C
T
C
G
A
T
T
-
C
2
3
T
-
C
8
3
9
C
G
A
G
G
-
C
-
A
A
T
T
T
G
G
C
T
C
A
A
G
G
A
-
-
A
A
C
C
T
-
T
G
3
C
G
T
G
-
-
C
G
T
A
T
-
A
2
-
G
G
5
A
C
6/-
4/-
A
T
A
G
3
C
G
A
-
G
T
2
C
A
-
T
G
G
C
G
A
T
G
C
T
3
3
C
A
A
G
G
T
C
T
T
G
C
-
T
C
G
C
G
T
A
A
C
G
A
2
C
C
T
T
G
G
C
G
G
A
C
-
G
29
T
T
T
T/113
G
T
G
C
C
G
T
C
G
T
A
G
A
A
-
-
A
G
-
3/-
5
A
A
A
G
T
-
-
20/-
18/-
C
T
C
G
T
11
6/5
C
G
T
-
G
G
G
T
C
G
G
C
T
A
A
G
2
A
10
G
T
2
T
A
G
2
A
T
2
A
3
-
G
2
G
T
7/9
-
A
A
C
TG/3
G
G
A
A
5
G
A
T
C
C
A
C
-
12/-
10/-
C
36/-
T
2
-
T
C
C
C
A
T
T
-
-
-
C
5
-
T
6
T
A
-
C
C
T
C
-
T
T
A
G
6/-
4/-
A
G
T
T
C
G
T
T
A
T
-
T
C
T
A
A
A
A
G
-
C
2
C
C
C
C
G
T
5/3
9
-
T
C
2
A
2
T
C
2
T
T
A
G
G
T
-
G
C
A
T
G
C
28
2
G
G
G
C
C
C
T
G
C
-
G
T
35
G
G
A
T
A
C
A/2
A
-
A
-
G
C
A
C
C
C
T
T
G
C
A
G
G/14
2/-
-
T
G
A
-
A
A
3/CA
C
-
C
G
T
-
3
G
A
G/4
2
C
C/-
34/-
31/-
C
T
C
C
11/9
C
T
T
G
G
C
C
T
C
A
C
A
C
C
10/9
G
T
A
C
G
C
G
A
G
A
G
A
A
T
C
G
T
-
C
G
G
T
G
T
G
C
T
A
G
C
T
C
C
T
-
C
G
T
C
A
5/3
-
G
T
13
A
G