Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 2,224,084 (bp)   Positions: 205
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.003
.075
.096
.028
.022
.036
.004
.235
.321
.412
.373
.357
.283
--
.003
.061
.016
--
--
--
--
--
.435
.162
.294
.682
.272
.669
--
.01
--
--
.257
--
--
.006
.0
--
.165
--
.007
--
--
--
.431
.009
.107
--
.998
.004
.002
--
--
--
--
--
--
.004
.022
.02
.028
.223
.991
--
.0
--
--
.052
.002
.076
.025
--
.0
.001
.01
.15
--
--
.008
.09
.087
.154
.0
--
.006
--
--
--
--
.776
.031
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.085
--
.03
.032
.007
--
--
.168
.035
--
.199
.005
.044
--
--
.099
.023
.027
--
--
.174
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.004
.289
.052
--
--
.002
.006
--
.002
.002
.001
.018
.042
.064
.084
.09
.001
.042
.013
.32
.587
--
--
.414
--
--
.002
.009
.959
.003
.002
.007
--
--
--
.594
.068
.997
.01
.083
.001
--
--
--
.01
.001
.005
.072
.467
.11
.003
.0
.006
--
.054
.009
--
--
.294
.029
.87
.8
.013
.021
.136
.001
.972
.973
Dmd
Dmd
Dmd
Dmd
Dmd
Dmd
Dmd
Dmd
Dmd
Dmd
Dmd
Dmd
Dmd
Dmd
Dmd
Dmd
Dmd
Dmd
Dmd
Dmd
Dmd
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
LOC102549123
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
9
C
3
G
14
6
2
T
A
T
A
T
A
T
G
4
T
T
A
C
T
34
C
2
G
2
2
12
T
A
2
T
T
A
A
2
2
C
T
A
G
2
2
G
T
T
2
2
C
C
T
6
3
A
G
C
T
2
4
2
A
2
16
C
T
4
2
2
2
C
2
A
C
2
G
T
6
2
132
2
G
2
4
T
T
A
C
5
T
2
G
T
C
T
G
T
4
T
2
5
3
6
T
10
4
T
G
4
2
T
C
T
T
4
T
T
T
4
C
C
A
G
T
2
5
2
T
G
A
G
G
A
G
A
G
T
G
2
T
G
T
T
2
C
C
2
G
T
A
T
T
G
G
T
2
A
T
2
A
T
T
C
2
2
12
C
T
4
T
T
2
C
2
2
A
T
2
A
A
A
T
2
C
3
C
2
G
6
2
T
T
4
6
G
G
G
T
C
A
G
2
2
2
4
2
  51,504,503
  51,504,515
  51,504,520
  51,504,527
  51,504,529
  51,504,550
  51,504,559
  51,504,567
  51,504,570
  51,504,575
  51,504,577
  51,504,578
  51,504,582
  51,515,209
  51,536,930
  51,550,814
  51,552,054
  51,566,024
  51,566,615
  51,596,330
  51,596,637
  51,602,746
  51,619,786
  51,656,274
  51,686,320
  51,701,601
  51,703,673
  51,738,504
  51,751,103
  51,775,279
  51,780,595
  51,786,139
  51,853,983
  51,866,049
  51,866,050
  51,867,632
  51,892,024
  51,936,868
  51,942,952
  51,947,128
  51,990,791
  51,995,330
  52,007,435
  52,007,438
  52,025,298
  52,045,122
  52,048,513
  52,061,540
  52,064,698
  52,065,060
  52,080,003
  52,098,481
  52,098,484
  52,120,169
  52,138,332
  52,141,304
  52,141,399
  52,144,066
  52,145,657
  52,145,659
  52,154,690
  52,155,814
  52,156,926
  52,165,866
  52,167,744
  52,192,901
  52,210,008
  52,257,884
  52,260,743
  52,291,758
  52,332,674
  52,338,343
  52,340,732
  52,346,549
  52,347,548
  52,355,508
  52,374,491
  52,406,424
  52,410,923
  52,442,458
  52,442,674
  52,442,675
  52,459,800
  52,468,272
  52,473,620
  52,491,720
  52,503,697
  52,536,606
  52,539,943
  52,551,863
  52,565,334
  52,565,342
  52,565,345
  52,565,347
  52,565,350
  52,565,351
  52,565,357
  52,565,362
  52,565,365
  52,565,370
  52,565,379
  52,565,385
  52,565,392
  52,565,396
  52,565,407
  52,576,142
  52,584,756
  52,587,703
  52,587,705
  52,597,173
  52,622,330
  52,622,408
  52,666,282
  52,684,049
  52,694,201
  52,783,049
  52,796,947
  52,800,770
  52,839,884
  52,840,474
  52,866,603
  52,877,723
  52,877,725
  52,893,708
  52,896,379
  52,935,740
  52,955,146
  52,955,149
  52,955,155
  52,955,972
  52,984,347
  52,984,658
  52,999,531
  53,030,330
  53,030,873
  53,031,973
  53,101,172
  53,137,466
  53,148,368
  53,148,371
  53,163,924
  53,167,719
  53,178,679
  53,207,000
  53,209,174
  53,215,831
  53,215,832
  53,231,002
  53,231,010
  53,231,013
  53,231,016
  53,231,019
  53,231,020
  53,237,006
  53,240,139
  53,244,420
  53,248,564
  53,248,571
  53,273,808
  53,314,481
  53,321,979
  53,326,372
  53,326,374
  53,335,514
  53,347,395
  53,348,811
  53,369,481
  53,369,810
  53,371,654
  53,384,316
  53,384,538
  53,384,540
  53,396,478
  53,403,040
  53,458,955
  53,461,778
  53,467,951
  53,494,780
  53,515,303
  53,515,305
  53,515,725
  53,530,677
  53,558,953
  53,560,178
  53,560,228
  53,572,565
  53,579,116
  53,586,032
  53,606,439
  53,608,558
  53,617,481
  53,620,309
  53,621,403
  53,630,246
  53,630,266
  53,632,431
  53,642,083
  53,644,534
  53,644,535
  53,647,274
  53,647,278
  53,681,327
  53,684,412
  53,697,940
  53,697,942
9/-
C/-
3/-
G/-
14/-
6/-
2/-
T/2
A/-
T/2
A/3
T/2
A/3
T/-
G/2
-
T/-
T/-
A/2
C/-
T/-
-
C/2
2/-
G/3
2/-
2/-
-
C
C
2/-
T/-
5
G
C
2/-
2/-
3
T/-
A/-
5
-
2/-
G/3
A
21
2/-
2/-
C/9
2
T/3
6/-
3/-
A/2
G/-
C/-
T/C
2/-
4/-
2/-
-
2/-
16/-
C/2
G
4/-
2/-
-
2/-
C/T
2/-
A/-
C/2
2/-
G/2
C
-
2/-
132/-
2/-
G/3
2/-
4/-
26
T/-
C
2
5/-
T/-
2/-
T
T/6
C/2
T/3
G/7
T/3
-
A
-
-
-
-
C
-
-
T/C
-
4/-
2/-
-
-
2
T/3
4/-
2
T/11
3
4/-
C/3
C/5
T
7
-
2/-
5/-
2/-
T/-
G/5
A/5
G/2
G/-
A/-
G/2
-
G/2
T/-
A
-
A
A
A
T/-
2/-
C/2
C/2
2/-
G/-
3
5
10
4
4
2
T/-
2/-
A/2
T/5
2/-
2
T/-
T/2
3
-
2/-
12/-
131
T/-
4/-
T/25
A
-
3
2/-
-
A/9
T/13
2/-
C
-
-
A
-
2
-
2
2/-
G/9
6/-
2/-
-
T/4
-
6/-
T
T
G/2
2
C/2
A/-
G/2
2/-
2/-
2/-
4/-
2/-