Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 168,353 (bp)   Positions: 555
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.143
.036
.0
.031
.924
.001
.001
.009
.001
.006
.005
.0
.305
.165
.01
.913
.198
.013
.003
.002
.051
.206
.003
.007
.005
.009
.497
.073
.064
.023
.053
.194
.803
.003
.004
--
--
--
--
--
--
--
.015
.002
.004
.032
.013
--
.098
.028
.025
.006
.003
.002
.212
.028
.006
.001
.0
.01
.271
.998
.852
.997
.999
1.0
1.0
.0
.962
.001
.156
.002
.005
.107
.005
.31
.002
.021
.036
--
--
--
--
.072
.024
.023
.126
.008
.908
.982
.006
.0
.504
.001
.048
.139
.007
.043
.001
.088
.08
.097
.308
.005
.025
.01
.1
.214
.3
.002
.0
.103
.1
.008
.005
.009
.006
.002
.04
.004
.002
.02
.017
.013
.121
.156
.288
.013
.304
.013
.024
.097
.08
.013
.061
.03
.002
.004
.0
.073
.081
1.0
.129
.001
.051
.0
.057
.005
.006
.0
.0
.005
.015
.002
.007
.004
--
--
.004
.032
.03
.007
--
--
--
--
--
--
--
--
.001
.003
.09
.001
.002
.189
.193
.252
.119
.129
.209
.0
.0
.002
.002
.052
.061
.077
.01
.04
.015
.011
.015
.471
.19
.0
.996
.076
.001
.0
.0
.006
.019
.008
.004
.133
.0
.056
.004
.426
.164
.043
.059
.058
.071
.001
.005
.003
.071
.032
.0
.029
.006
.012
.01
.484
.134
.063
.03
.0
.0
.0
.535
.882
.841
.177
.031
.997
.213
.986
.0
.001
--
.105
.035
.028
.025
.017
--
.013
--
--
.008
.016
.006
.002
.009
.0
.008
.487
.077
.0
.01
.0
.1
.074
.001
.0
.009
.0
.003
.001
.001
--
.027
.011
.007
.268
.879
.806
.001
.022
.003
.96
.005
.095
.0
.001
.001
.002
.001
.062
.011
.001
.589
.0
.04
.177
.0
.018
.994
.522
.996
1.0
1.0
.305
1.0
.016
.001
.882
.177
.181
.184
.004
.005
.049
.12
.006
.003
.003
.02
.063
.61
.65
.681
.704
.721
.269
.001
.002
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.017
.013
1.0
.595
.245
--
.007
.005
.011
.002
.067
.958
--
--
--
.043
.114
.004
.007
.076
.0
.001
.009
.013
.005
.008
.105
.015
.003
.089
.086
.008
.051
.063
.024
.012
.004
.002
.006
.006
.078
.008
.313
.017
.001
.169
.024
.0
.009
.256
.0
.001
.001
.002
.0
.001
.02
.011
.009
.993
.001
.08
.087
.081
.006
.0
1.0
.001
.025
.001
.003
.007
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.012
.026
.016
.009
.005
.0
.059
.0
.004
.032
--
.003
.036
.524
.07
.137
.01
.003
.001
.001
.0
.003
.045
.002
.004
.008
.006
.0
.042
.008
.005
.993
.004
.004
.033
--
.062
.017
.163
.001
.006
.065
.036
--
.024
.022
.033
.07
.127
.19
.146
.267
.023
.181
.068
.07
.069
.0
.35
.007
.006
.003
.002
.003
.104
.0
.002
.015
.009
.002
.017
.179
--
--
.027
.006
.088
.021
.04
--
--
--
.037
.991
.096
.001
.017
.976
.956
.616
.003
.001
.0
.014
.166
.05
.244
.009
.015
--
--
.08
.005
.028
--
--
--
--
.006
.03
.006
.146
.006
.001
.728
.921
--
--
--
--
.001
.0
.0
.127
.001
.003
.132
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Cyp7b1
Cyp7b1
Cyp7b1
Cyp7b1
Cyp7b1
Cyp7b1
Cyp7b1
Cyp7b1
Cyp7b1
Cyp7b1
Cyp7b1
Cyp7b1
Cyp7b1
Cyp7b1
Cyp7b1
Cyp7b1
Cyp7b1
Cyp7b1
Cyp7b1
Cyp7b1
Cyp7b1
Cyp7b1
Cyp7b1
Cyp7b1
Cyp7b1
Cyp7b1
Cyp7b1
Cyp7b1
Cyp7b1
Cyp7b1
Cyp7b1
Cyp7b1
Cyp7b1
Cyp7b1
Cyp7b1
Cyp7b1
Cyp7b1
Cyp7b1
Cyp7b1
Cyp7b1
Cyp7b1
Cyp7b1
Cyp7b1
Cyp7b1
Cyp7b1
Cyp7b1
Cyp7b1
Cyp7b1
Cyp7b1
Cyp7b1
Cyp7b1
Cyp7b1
Cyp7b1
Cyp7b1
Cyp7b1
Cyp7b1
C
T
A
C
G
A
T
A
A
G
A
C
T
G
A
A
T
C
A
T
C
G
T
T
C
A
T
T
T
A
C
A
G
A
A
G
G
A
C
C
A
T
A
A
G
C
3
G
C
4
A
8
A
A
22
C
T
A
C
C
A
A
C
T
T
C
A
C
G
T
T
G
66
A
G
A
C
T
C
6
T
56
54
C
A
T
C
C
T
T
T
T
T
4
T
4
C
C
A
A
C
18
A
A
105
T
A
12
10
T
C
C
T
G
G
T
T
C
G
A
G
G
C
A
T
T
A
A
G
C
C
A
C
C
T
G
C
C
A
G
8
A
G
G
T
T
T
T
A
T
G
T
A
A
T
G
A
A
G
T
T
T
A
G
A
G
A
T
C
A
G
G
T
C
A
12
11
A
T
T
C
T
G
16
14
A
A
C
C
C
4
C
G
A
C
G
A
A
G
C
C
T
A
T
T
C
A
C
G
A
G
G
G
A
9
T
T
A
G
A
A
T
G
2
T
A
C
A
A
C
G
A
T
T
T
A
C
C
C
T
T
A
T
A
A
T
T
C
6
T
A
A
A
G
T
T
C
T
T
A
C
C
A
C
T
C
2
A
C
G
C
G
A
C
T
A
T
G
A
G
C
C
T
G
G
A
C
G
T
C
T
G
A
T
T
T
T
C
G
G
G
T
G
T
C
C
T
A
A
A
A
A
A
3
2
T
T
G
G
C
C
T
T
G
G
G
G
A
C
A
T
G
A
G
G
G
G
G
G
T
C
A
A
A
C
A
4
G
C
C
G
G
C
G
T
T
T
5
C
G
G
A
T
T
T
G
A
T
T
G
C
6
3
A
C
G
T
C
G
G
C
T
C
A
A
G
T
A
A
G
A
C
A
G
A
T
G
A
T
G
T
T
T
T
T
C
T
C
A
C
A
G
C
G
C
20
4
G
G
G
G
A
G
G
3
4
T
C
C
T
T
G
A
T
A
T
G
C
A
G
T
A
T
C
C
T
T
G
C
T
A
A
A
T
C
G
G
G
G
T
C
T
G
4
A
T
C
G
C
C
4
T
C
A
A
C
G
G
T
A
A
G
G
C
C
A
A
G
G
A
A
T
A
C
A
C
C
C
A
A
G
A
T
C
A
T
A
T
A
A
G
C
G
A
C
G
T
A
G
C
T
C
T
8
T
A
T
A
2
T
A
A
A
G
C
T
T
A
T
6
G
G
T
G
T
C
2
A
G
C
A
T
6
G
A
  122,442,360
  122,444,165
  122,444,317
  122,444,417
  122,444,628
  122,445,217
  122,445,223
  122,445,334
  122,445,817
  122,446,225
  122,446,308
  122,446,459
  122,448,486
  122,450,472
  122,451,164
  122,451,551
  122,452,824
  122,453,681
  122,453,993
  122,454,130
  122,454,667
  122,454,787
  122,455,059
  122,455,262
  122,455,267
  122,456,929
  122,456,988
  122,457,578
  122,458,155
  122,458,210
  122,458,429
  122,458,645
  122,458,677
  122,458,828
  122,458,879
  122,459,432
  122,459,687
  122,460,438
  122,461,164
  122,461,239
  122,461,482
  122,461,492
  122,461,547
  122,462,004
  122,462,062
  122,462,101
  122,462,217
  122,463,386
  122,463,559
  122,464,001
  122,464,259
  122,464,735
  122,464,808
  122,465,199
  122,465,337
  122,465,417
  122,465,429
  122,465,455
  122,465,468
  122,465,483
  122,465,706
  122,465,731
  122,465,794
  122,465,829
  122,465,830
  122,466,552
  122,466,590
  122,467,180
  122,467,316
  122,467,356
  122,467,409
  122,467,764
  122,467,875
  122,467,991
  122,468,311
  122,468,505
  122,468,722
  122,468,906
  122,469,035
  122,469,208
  122,469,216
  122,469,247
  122,469,249
  122,469,427
  122,469,445
  122,469,615
  122,469,647
  122,469,746
  122,469,807
  122,470,038
  122,470,051
  122,470,381
  122,470,564
  122,470,657
  122,471,257
  122,471,671
  122,472,116
  122,472,213
  122,472,378
  122,473,656
  122,473,976
  122,473,980
  122,474,460
  122,474,623
  122,474,804
  122,474,954
  122,477,209
  122,479,003
  122,479,005
  122,479,715
  122,480,663
  122,480,895
  122,481,264
  122,481,373
  122,481,388
  122,481,440
  122,481,496
  122,481,500
  122,481,633
  122,481,709
  122,482,126
  122,482,189
  122,482,357
  122,482,410
  122,482,744
  122,482,963
  122,482,971
  122,483,189
  122,483,313
  122,483,525
  122,483,905
  122,484,240
  122,484,247
  122,484,278
  122,484,357
  122,484,407
  122,485,006
  122,485,236
  122,485,868
  122,486,138
  122,486,140
  122,486,574
  122,487,216
  122,487,281
  122,487,412
  122,487,432
  122,487,559
  122,487,714
  122,487,722
  122,487,778
  122,487,831
  122,487,918
  122,488,955
  122,489,623
  122,490,367
  122,490,588
  122,490,965
  122,491,020
  122,492,004
  122,494,749
  122,494,994
  122,495,096
  122,496,481
  122,496,504
  122,496,508
  122,496,646
  122,497,261
  122,498,054
  122,498,971
  122,499,109
  122,499,685
  122,500,379
  122,500,572
  122,501,067
  122,501,706
  122,501,823
  122,501,824
  122,501,847
  122,501,935
  122,501,936
  122,502,147
  122,502,164
  122,502,165
  122,502,191
  122,502,193
  122,502,258
  122,502,295
  122,502,448
  122,502,829
  122,502,941
  122,503,172
  122,503,369
  122,503,770
  122,504,136
  122,504,358
  122,505,119
  122,505,913
  122,506,374
  122,507,056
  122,508,182
  122,508,185
  122,508,526
  122,509,637
  122,510,347
  122,510,658
  122,510,802
  122,511,037
  122,511,534
  122,511,660
  122,512,164
  122,512,206
  122,513,005
  122,513,228
  122,513,238
  122,513,633
  122,514,222
  122,514,310
  122,514,383
  122,514,402
  122,514,516
  122,514,868
  122,514,952
  122,515,093
  122,515,112
  122,515,116
  122,515,169
  122,515,211
  122,515,243
  122,515,278
  122,515,832
  122,516,125
  122,516,345
  122,516,699
  122,516,711
  122,516,719
  122,516,754
  122,516,758
  122,517,103
  122,517,475
  122,517,845
  122,518,357
  122,518,795
  122,518,904
  122,519,133
  122,519,379
  122,519,645
  122,519,680
  122,519,682
  122,520,048
  122,520,524
  122,520,600
  122,520,631
  122,520,632
  122,520,677
  122,521,029
  122,521,162
  122,521,184
  122,521,303
  122,521,309
  122,521,596
  122,521,640
  122,522,095
  122,522,275
  122,522,622
  122,522,985
  122,523,134
  122,523,530
  122,524,037
  122,524,041
  122,524,069
  122,524,228
  122,524,720
  122,525,234
  122,525,810
  122,525,970
  122,526,145
  122,527,681
  122,527,990
  122,528,162
  122,528,164
  122,528,511
  122,528,683
  122,528,950
  122,529,407
  122,529,906
  122,530,024
  122,530,635
  122,530,649
  122,530,731
  122,530,854
  122,530,876
  122,531,110
  122,531,148
  122,531,178
  122,531,237
  122,531,675
  122,531,917
  122,531,985
  122,532,542
  122,532,695
  122,533,477
  122,533,551
  122,534,822
  122,535,273
  122,535,287
  122,536,004
  122,536,860
  122,536,979
  122,537,031
  122,537,084
  122,537,138
  122,537,140
  122,537,141
  122,537,321
  122,537,322
  122,537,375
  122,537,385
  122,537,639
  122,538,239
  122,538,242
  122,538,460
  122,538,496
  122,538,562
  122,538,564
  122,538,566
  122,538,568
  122,538,570
  122,538,636
  122,538,882
  122,538,884
  122,539,035
  122,539,232
  122,539,358
  122,539,427
  122,539,519
  122,539,580
  122,539,588
  122,539,732
  122,539,771
  122,539,825
  122,540,604
  122,540,618
  122,540,715
  122,541,571
  122,541,767
  122,542,327
  122,542,338
  122,542,526
  122,543,002
  122,543,042
  122,543,430
  122,543,463
  122,543,480
  122,543,500
  122,544,043
  122,544,220
  122,544,501
  122,544,764
  122,544,768
  122,545,058
  122,545,180
  122,545,256
  122,545,365
  122,545,757
  122,545,829
  122,545,956
  122,545,986
  122,546,031
  122,546,104
  122,546,238
  122,546,250
  122,546,325
  122,546,393
  122,546,414
  122,546,585
  122,546,586
  122,546,709
  122,546,817
  122,546,824
  122,546,849
  122,546,957
  122,547,230
  122,548,298
  122,548,303
  122,548,354
  122,548,475
  122,548,598
  122,548,793
  122,548,819
  122,549,074
  122,549,590
  122,549,605
  122,549,655
  122,549,689
  122,549,728
  122,549,944
  122,550,136
  122,550,173
  122,550,346
  122,550,386
  122,550,725
  122,550,749
  122,550,824
  122,550,939
  122,551,700
  122,552,406
  122,554,092
  122,555,631
  122,555,632
  122,557,825
  122,559,361
  122,560,134
  122,560,671
  122,562,311
  122,562,843
  122,564,952
  122,565,116
  122,567,339
  122,567,366
  122,567,712
  122,567,962
  122,569,090
  122,569,614
  122,569,713
  122,570,333
  122,570,339
  122,570,345
  122,570,347
  122,572,820
  122,572,899
  122,573,123
  122,573,158
  122,574,018
  122,574,091
  122,574,100
  122,574,149
  122,576,219
  122,576,963
  122,577,742
  122,578,065
  122,578,639
  122,579,319
  122,579,580
  122,579,886
  122,579,897
  122,580,005
  122,580,083
  122,580,095
  122,580,446
  122,580,532
  122,580,638
  122,580,892
  122,580,977
  122,581,187
  122,581,210
  122,581,579
  122,581,658
  122,581,678
  122,581,692
  122,581,805
  122,582,035
  122,582,037
  122,582,234
  122,582,284
  122,582,576
  122,582,582
  122,582,624
  122,582,633
  122,582,769
  122,582,911
  122,583,072
  122,583,183
  122,583,588
  122,583,590
  122,583,592
  122,584,126
  122,584,283
  122,584,292
  122,584,314
  122,584,344
  122,584,354
  122,584,619
  122,585,026
  122,585,027
  122,585,031
  122,585,575
  122,585,774
  122,585,898
  122,585,946
  122,585,957
  122,585,959
  122,586,053
  122,586,347
  122,586,407
  122,586,512
  122,586,619
  122,586,803
  122,586,811
  122,587,431
  122,587,715
  122,588,567
  122,588,954
  122,589,140
  122,589,385
  122,591,142
  122,592,660
  122,593,765
  122,595,191
  122,595,192
  122,595,663
  122,596,233
  122,597,166
  122,598,382
  122,599,405
  122,599,553
  122,599,893
  122,599,963
  122,599,972
  122,600,323
  122,600,347
  122,600,647
  122,600,714
  122,600,743
  122,600,927
  122,601,024
  122,601,258
  122,601,398
  122,602,279
  122,602,330
  122,603,272
  122,603,366
  122,603,741
  122,605,586
  122,605,590
  122,605,699
  122,605,847
  122,606,409
  122,606,624
  122,606,895
  122,607,608
  122,607,621
  122,607,625
  122,607,975
  122,608,016
  122,608,105
  122,608,116
  122,608,160
  122,608,175
  122,608,851
  122,609,094
  122,609,907
  122,610,019
  122,610,196
  122,610,223
  122,610,340
T
T/2
G
A
-
T
C
G
G
A
G
A
2
3/GA
-
G
C
T
2
C
-
2
A
C
T
C
C
C
G
G
T
G
A
T
C
C
A
G
T
-
C
2
G
G
C
T
-
A
T
-
G
-
G
G
22/-
T
C
G
T
T
G
G
T
C
C
CA/3
C
T
2
C
A
A
-
T
T
G
A
A
T
-
C
56/-
54/-
T
C
C
T
T
C
C
G
C
C
-
C
-
T
A
2
G
T
18/-
-
T
-
C
G
12/-
10/-
A
G
T
C
T
A
C
C
A
A
G
T
T
T
G
C
C
G
G
A
T
T
G
T
G
9/5
A
T
T
T
-
-
G
A
C
2
C
A
C
G
C
A
G
T
A/2
C
A
G
-
A
2
G
C
G
8
3
A
8
G
G
-
A
T
-
T
G
12/-
-
T
2
8
T
C
A
16/-
14/-
G
T
T
A
T
-
A
A
2
T
A
G
2
A
7
G
-
G
-
A
11
T
T
-
G
GT/4
T
A
C
-
C
-
T
A
G
G
C
A
-
7
-
3
G
G
G
C
G
-
C
C
G
T
T
T
C
C
T
C
T
G
5
C
T
-
G
-
T
T
A
C
C
T
C
C
T
-
T
G
-
C
T
-
C
T
C
A
2
G
T
A
G
A
A
2
A
T
A
G
T
2
T
T
C
C
T
G
A
G
G
G
C
C
A
T
C
A
C
A
C
A
G
-
G
-
T
3
4
8
3/-
-
C
C
A
T
T
T
G
C
C
C
C
C
T
T
G
G
A
G
28
A
A
2
A
A
C
T
G
G
T
T
C
-
A
2
2
A
A
A
A
A
G
C
-
7
A
A
T
C
C
A
A
G
C
C
T
A
-
-
G
A
A
2
G
A
T
T
A
T
2
G
A
C
G
T
A
G
A
G
A
G
C
A
G
C
A
C
C
G
C
C
6
G
A
4
C/T
C
G/A
T
5
T
-
4/-
G/T
G/T
A
C
3
T
G/A
-
-
9
-
T
G
5/9
A
3
4
2
C
A
T
A/G
T
2
C
C
T
T
-
G
A
T
C
G
G
G
C
T
A
9
-
G/7
C
T
G
A
-
-
C
2
A
T
T
-
C
C/4
A/5
A/14
G
A
A
C
C
G
4/3
A
T
G
2
T
T
A
T
G
C
G
T
G
3
T
T
G
A/-
C
T
A
G
T
-
G
A
A/T
T
2
T
A
T
A
T
T/C
A/G
T
T
T/C
2
C
-
C
14
G
G
2/-
C
G
G
A/G
G/A
T
C
2
C
C
-
C
C
2
10
G
T
2/-
A/-
A
G
T
C
-
T
C