Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 624,365 (bp)   Positions: 411
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.719
.073
.06
.001
.829
.017
--
--
--
.042
.005
.003
.001
.009
.078
.343
.128
.004
--
--
.034
.006
.085
.082
.286
--
.081
.372
.442
.16
.116
.063
--
.025
.002
.01
.003
.005
.01
.011
.001
.002
.005
.002
.001
.002
.001
.019
.02
.007
.0
.003
.113
.002
.001
.001
.001
.017
.001
.0
.001
.0
.0
.084
.582
.585
.813
.831
.079
.098
.081
.028
--
.001
.143
.001
.025
.802
.055
.001
.079
.399
.004
.078
.042
.102
.049
.002
.078
.002
.001
.492
.015
.032
--
.628
.915
.559
.555
.497
.077
.039
.01
.002
.026
.046
.011
.008
.001
.205
.0
--
--
.154
.032
.001
.505
.205
.994
.869
.009
.749
.03
.756
.035
.399
.001
.01
.08
.002
.354
.087
.002
.28
.004
.0
.011
.001
.0
.007
.995
.995
.962
.445
.003
.001
.005
.37
.185
.04
.0
.0
.007
.001
.001
.004
.927
.896
.016
.257
.479
.012
.008
.038
--
--
.101
.051
.067
--
--
--
.996
.999
.994
.999
--
.037
.002
.0
.012
.037
.009
.006
.179
.957
.593
--
--
--
--
--
--
--
--
.484
.056
.016
.049
.0
.0
--
.011
.053
.005
.043
.031
.002
.006
.117
.049
.027
--
--
--
--
.061
--
--
--
--
--
--
.118
.004
.015
.014
--
--
--
--
--
.004
.047
.019
.012
.003
.329
.242
.156
--
--
.099
--
.096
.014
.201
--
--
--
--
--
.011
.021
.021
.002
.002
.047
.006
.001
.003
.022
.013
.074
.01
.003
.138
.001
.407
.724
.599
--
--
.219
.211
.024
.299
.001
.22
.009
.102
.009
.006
.001
.009
.002
.006
.49
.002
.001
--
--
.0
.023
.24
.001
.84
.004
.002
.744
.969
.098
.405
.0
.005
.033
.069
.113
.002
.014
.001
.001
.03
.008
--
.645
.09
.027
.04
.037
.988
.003
.036
.009
.035
.153
.002
.029
.02
.019
.008
.001
.027
.029
.935
.002
.014
.508
.101
.601
.004
--
.294
--
--
.006
.108
.014
.012
.01
--
--
.663
.483
.478
.005
.996
.994
.699
.046
.024
.002
.016
.031
.02
.001
.189
1.0
.998
.002
.053
.938
.128
.007
--
.076
.294
.894
--
.005
--
.032
.002
.105
.049
.032
.03
.784
--
--
--
.045
--
--
.005
.004
.009
.006
.328
--
.051
.001
.466
--
.057
.685
--
.029
.093
.027
.069
Cdh13
Cdh13
Cdh13
Cdh13
Cdh13
Cdh13
Cdh13
Cdh13
Cdh13
Cdh13
Cdh13
Cdh13
Cdh13
Cdh13
Cdh13
Cdh13
Cdh13
Cdh13
Cdh13
Cdh13
Cdh13
Cdh13
Cdh13
Cdh13
Cdh13
Cdh13
Cdh13
Cdh13
Cdh13
Cdh13
Cdh13
Cdh13
Cdh13
Cdh13
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
C
G
2
T
G
2
6
A
3
C
2
C
C
T
2
2
G
4
2
4
2
2
2
C
G
T
T
T
2
2
4
T
G
C
T
A
T
C
T
A
C
T
3
A
T
T
G
G
C
A
T
C
G
T
G
A
A
G
T
T
C
A
G
G
G
G
C
G
C
T
T
G
2
T
T
A
2
2
C
4
C
72
C
C
4
A
C
C
G
C
G
A
A
C
G
G
G
2
G
G
T
G
A
T
4
C
C
T
C
G
A
T
A
10
G
G
G
A
A
T
T
T
A
C
G
G
C
40
C
A
G
G
A
A
G
G
G
A
C
T
T
G
A
T
T
C
C
A
4
C
C
A
G
C
G
T
T
C
A
C
G
C
T
2
C
G
T
T
C
C
A
T
T
A
T
T
T
A
A
T
A
T
A
A
T
C
C
G
G
A
C
A
A
C
G
A
C
G
T
C
C
C
G
T
A
G
T
C
A
T
C
G
A
C
T
A
T
T
T
T
G
T
A
T
C
A
A
T
4
T
12
T
T
A
C
T
T
T
T
G
C
C
G
A
2
T
G
G
T
G
C
T
G
T
G
C
C
A
A
G
A
T
T
C
G
T
A
A
G
A
A
G
T
T
T
G
A
T
T
A
A
G
A
A
C
T
T
T
C
C
T
C
C
C
C
C
G
C
C
C
C
T
2
2
T
4
C
G
2
T
2
T
2
2
G
A
G
6
4
A
A
2
G
G
T
2
C
A
C
C
T
T
T
C
2
G
2
G
T
2
A
4
2
11
C
2
C
T
T
C
G
2
2
A
2
2
4
2
4
6
A
A
4
A
T
T
2
T
A
2
73
A
2
T
2
C
2
2
2
G
A
2
2
C
G
G
G
2
4
G
C
G
A
A
G
A
C
C
4
2
2
G
2
T
T
A
4
A
2
2
2
  61,621,753
  61,628,846
  61,635,090
  61,647,612
  61,648,811
  61,672,186
  61,673,063
  61,673,068
  61,673,316
  61,676,107
  61,688,089
  61,688,929
  61,688,932
  61,699,794
  61,704,542
  61,709,603
  61,714,262
  61,722,163
  61,726,835
  61,728,717
  61,737,453
  61,738,451
  61,758,023
  61,758,283
  61,760,064
  61,772,132
  61,783,382
  61,783,847
  61,785,378
  61,790,048
  61,794,263
  61,818,007
  61,844,734
  61,865,222
  61,865,227
  61,865,237
  61,865,240
  61,865,243
  61,865,247
  61,865,261
  61,865,266
  61,865,268
  61,865,277
  61,865,281
  61,865,285
  61,865,287
  61,865,289
  61,865,301
  61,865,305
  61,865,308
  61,865,314
  61,865,319
  61,865,334
  61,865,352
  61,865,353
  61,865,370
  61,865,371
  61,865,377
  61,865,426
  61,865,431
  61,865,435
  61,865,440
  61,865,444
  61,865,456
  61,865,466
  61,865,467
  61,865,527
  61,865,531
  61,865,560
  61,865,585
  61,865,607
  61,865,727
  61,884,787
  61,897,139
  61,898,004
  61,906,228
  61,911,632
  61,919,358
  61,933,584
  61,934,561
  61,942,205
  61,956,433
  61,958,970
  61,959,792
  61,960,327
  61,960,568
  61,960,574
  61,960,588
  61,960,630
  61,960,648
  61,960,660
  61,965,813
  61,977,866
  61,982,800
  61,982,803
  61,982,920
  61,983,350
  61,983,490
  61,983,492
  61,983,495
  61,983,816
  61,983,824
  61,983,952
  61,984,065
  61,984,237
  61,984,298
  61,984,415
  61,984,529
  61,984,703
  61,984,824
  61,984,922
  61,985,950
  61,985,962
  61,986,066
  61,986,142
  61,986,614
  61,986,847
  61,987,170
  61,987,294
  61,987,736
  61,987,742
  61,987,961
  61,988,097
  61,988,183
  61,988,280
  61,988,393
  61,988,810
  61,988,884
  61,988,989
  61,989,065
  61,989,352
  61,989,652
  61,990,167
  61,990,286
  61,990,520
  61,990,606
  61,990,693
  61,990,813
  61,990,976
  61,991,109
  61,991,180
  61,991,231
  61,991,310
  61,991,404
  61,991,417
  61,991,514
  61,992,510
  61,992,647
  61,992,649
  61,992,712
  61,992,853
  61,992,854
  61,993,403
  61,993,432
  61,993,549
  61,994,114
  61,994,214
  61,994,240
  61,995,709
  61,996,011
  61,996,411
  61,996,773
  61,996,827
  61,997,476
  61,997,703
  61,997,717
  61,998,024
  61,998,290
  61,998,482
  61,998,718
  61,998,747
  61,998,861
  61,999,706
  61,999,761
  61,999,769
  61,999,787
  61,999,849
  62,000,904
  62,001,002
  62,001,328
  62,001,417
  62,001,460
  62,001,502
  62,001,781
  62,001,877
  62,002,020
  62,002,232
  62,003,068
  62,003,074
  62,003,080
  62,003,100
  62,003,113
  62,003,210
  62,003,849
  62,004,566
  62,004,759
  62,004,827
  62,005,096
  62,005,139
  62,005,966
  62,006,106
  62,006,863
  62,007,424
  62,008,401
  62,008,570
  62,008,656
  62,008,657
  62,008,871
  62,008,874
  62,009,658
  62,010,645
  62,010,689
  62,010,882
  62,010,985
  62,011,201
  62,011,251
  62,011,606
  62,011,686
  62,012,966
  62,012,970
  62,012,982
  62,013,699
  62,013,772
  62,014,615
  62,015,111
  62,015,548
  62,016,063
  62,016,969
  62,017,208
  62,017,279
  62,017,484
  62,017,733
  62,017,908
  62,018,100
  62,018,363
  62,018,853
  62,019,192
  62,019,705
  62,019,707
  62,019,872
  62,020,091
  62,025,289
  62,026,298
  62,026,901
  62,028,005
  62,028,865
  62,029,618
  62,029,828
  62,029,874
  62,029,882
  62,030,097
  62,030,248
  62,030,602
  62,030,968
  62,031,188
  62,031,331
  62,031,625
  62,031,802
  62,031,892
  62,032,289
  62,032,674
  62,034,998
  62,035,146
  62,035,299
  62,036,044
  62,036,205
  62,036,404
  62,036,457
  62,036,776
  62,036,947
  62,036,956
  62,037,099
  62,037,545
  62,040,391
  62,040,426
  62,040,759
  62,041,126
  62,042,025
  62,042,635
  62,043,000
  62,043,063
  62,043,343
  62,043,496
  62,043,573
  62,043,643
  62,043,723
  62,044,320
  62,044,421
  62,044,482
  62,044,876
  62,045,050
  62,045,206
  62,045,634
  62,047,667
  62,048,054
  62,049,515
  62,049,566
  62,049,615
  62,049,751
  62,050,505
  62,050,696
  62,055,140
  62,055,418
  62,057,254
  62,057,408
  62,065,068
  62,065,073
  62,074,812
  62,081,089
  62,092,048
  62,094,104
  62,096,017
  62,097,968
  62,100,683
  62,102,099
  62,111,205
  62,114,661
  62,114,672
  62,114,674
  62,130,057
  62,130,526
  62,147,675
  62,154,927
  62,160,377
  62,170,026
  62,170,103
  62,180,016
  62,192,263
  62,192,544
  62,192,550
  62,192,582
  62,192,649
  62,193,783
  62,197,665
  62,209,651
  62,220,865
  62,231,917
  62,240,235
  62,240,821
  62,352,903
  62,373,273
  62,380,111
  62,399,709
  62,405,482
  62,405,492
  62,406,134
  62,415,034
  62,420,970
  62,420,971
  62,440,088
  62,442,219
  62,446,709
  62,454,240
  62,458,640
  62,458,641
  62,460,656
  62,462,095
  62,462,097
  62,466,765
  62,471,946
  62,471,951
  62,471,986
  62,471,988
  62,471,991
  62,473,265
  62,473,266
  62,476,395
  62,478,194
  62,478,195
  62,482,208
  62,482,773
  62,483,035
  62,484,524
  62,484,638
  62,489,927
  62,500,676
  62,506,093
  62,506,926
  62,529,685
  62,531,207
  62,543,400
  62,550,381
  62,556,614
  62,559,958
  62,560,903
  62,560,905
  62,573,301
  62,573,626
  62,575,818
  62,575,999
  62,585,506
  62,600,875
  62,614,024
  62,614,042
  62,614,164
  62,614,166
  62,629,746
  62,631,967
  62,638,082
  62,647,697
  62,652,826
  62,660,658
  62,668,528
  62,673,073
  62,680,370
  62,681,248
  62,681,982
  62,689,575
  62,691,093
  62,697,422
  62,715,185
7/3
6
2/-
3
3
2/-
-
8
3/-
C/3
2/-
-
-
T/3
-
2/-
3
4/-
2/-
4/-
2/-
2/-
2/-
A
3
-
T/-
T/-
2/-
2/-
4/-
T/2
5
A
C
G
G
T
G
T
G
A
-
C
3
2
A
C
G
G
G
T
C
A
C
C
T
-
G
G
T
C
C
C
T
T
A
T
A
-
A
C
2/-
T/-
-
2
2/-
2/-
2
4/-
2
72/-
2
C/2
4/-
-
2
A
2
2
-
5
A/7
34
24
2
A
-
A
T
C
A
G
C
-
T
T
C
T
A
-
C
3
10/-
T
T
2
-
C
C
C
C
G
T
T
A
T
-
T
C
A
A
G
2
T
A
A
C
T
C
C
C
G
C
G
T
T
2
-
T
A
G
T
T
A
C
2
T
2
A
A
T
A
-
3
11
G
G
T
4
-
-
C
G
C
C
64
-
G
G
C
A
G
G
3
A
T
A
T
G
T
G
G
T
13
G
T
A
C
A
2
A
A
G
G
T
G
2
-
C
T
2
T
T
A
C
A
-
A
C
T
TA/3
T
2
G
G
G
5
4/-
9
-
220
C
C
3
4
C
3
C
A
2
49
2
A/-
-
C
41
25
2
T
9
T/19
A
2
GA/3
T
A
G
T
3
3
C
C
T
A
2
G
2
A
2
T
A
C
T/13
T/20
2
G
A
-
C
-
T
G
2
3
C
-
-
A
G
-
T
T
A
T
T
A
T
-
G
T
5
2/-
2/-
-
-
C/2
A
2/-
T/C
-
C
2/-
2/-
7
A/-
3
6/-
4/-
A/2
A/-
2/-
17
3
9
2/-
5
99
-
-
2
C
T/-
-
-
G/-
2/-
2
2
2/-
A/-
-
2/-
-
12
2/-
-
2
4
5
A
2/-
2/-
A/7
2/-
2/-
4/-
2/-
4/-
-
8
C
-
4
4
C
2/-
T/2
A/-
2/-
-
A/-
2/-
T/2
2/-
5
2/-
2/-
2/-
G/5
-
2/-
2/-
3
2
2
G/2
2/-
4/-
G/9
126
G/-
T
A/G
C
C
C/-
C/-
4/-
-
2/-
2
2/-
T/3
T/-
17
-
A/G
2/-
2/-
2/-