Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 224,507 (bp)   Positions: 451
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.093
.001
.012
.472
.435
.001
.006
.012
.115
.015
.011
.069
.018
.085
.155
.421
.576
.021
.048
.137
.073
.072
.001
.038
.42
.192
.011
.019
.004
.005
.003
.032
.092
.168
.006
--
--
--
.029
.068
.211
.0
.005
.041
.049
.701
.726
.051
.0
.0
.013
.009
.873
.188
.992
--
.087
.004
.03
.056
.082
.061
.008
.196
.194
.188
.044
.027
.031
--
--
--
--
--
--
.24
.229
.005
.012
.402
.014
.06
.105
.123
.047
.047
.037
.012
.011
.002
.023
.006
.022
.009
.018
.082
.003
.005
.072
.036
--
.05
.004
.028
--
--
.007
.034
.001
.004
.0
.0
.0
.0
.977
.032
--
--
--
--
.573
.007
.76
.001
.001
.101
.057
.003
.079
.047
.061
.516
.488
--
--
.069
.052
--
--
--
--
.104
.02
.001
.003
.006
--
.017
.004
.393
.019
.084
.057
--
.003
.004
.019
.0
.449
.532
--
--
.008
.094
.123
.269
.266
.032
.049
.002
--
--
--
--
.009
.019
.016
.164
.007
.002
.032
.138
.004
.512
.131
.402
.157
.215
.445
.502
--
.004
.072
.005
.013
.024
.009
.002
.029
.537
.011
.339
.149
.001
.05
.008
.115
.122
--
.025
.0
.0
.228
.016
--
--
.091
.002
.063
.058
.601
--
.263
.03
.058
.008
.006
.017
.005
.127
--
.013
.001
.063
.018
.015
.072
.792
.008
--
.065
.01
.018
.001
.002
.02
--
.008
.083
.095
.023
.064
.032
.029
.008
.994
--
.001
.038
.013
.017
.202
.007
.163
.138
.878
.894
.131
.525
.003
.002
.152
.038
.057
.225
.004
.03
.016
.001
.095
.002
.074
.981
.0
.028
.001
.014
.006
.006
.047
.161
.209
.227
.138
.008
--
.172
.051
.142
.018
.019
.156
.652
--
--
--
.0
.036
.041
.055
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.032
.015
.259
.0
.001
.053
--
.01
.282
.549
.936
.47
.016
.005
.011
.004
.053
.024
.088
.001
.578
.0
.002
.001
.021
.01
.103
.008
.007
.076
.003
.0
.01
.115
.004
.002
.018
.006
.005
.001
.004
.0
.002
.0
.001
.0
.003
.123
.122
.018
.007
.019
.021
.019
.014
.008
.06
.002
.026
.01
.01
.484
.183
--
--
--
.001
.008
.014
.085
--
--
--
--
.0
.166
.001
.167
.0
.002
.987
.001
.01
--
.004
.052
.004
.023
.028
--
--
.083
.014
.023
--
.01
.694
.68
.057
.007
.0
.065
--
.079
.008
--
.187
.328
.025
--
.795
.018
.003
.016
--
--
--
.005
1.0
1.0
.036
.008
--
--
1.0
.99
.005
.094
.086
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
Cacna1a
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
T
G
A
C
A
C
C
T
C
T
G
G
G
A
T
C
2
A
A
G
3
2
C
C
G
C
2
C
A
T
C
G
G
4
G
4
A
T
G
G
A
G
C
A
C
16
14
G
A
C
C
T
T
G
C
T
G
G
G
T
T
C
C
C
C
9
C
2
C
G
G
T
C
G
A
G
T
T
T
G
A
C
A
T
G
T
C
C
A
C
T
G
4
C
G
G
G
A
T
A
2
A
A
T
2
A
G
A
C
G
A
T
A
T
T
C
C
G
G
A
G
A
G
A
A
G
G
G
C
A
T
6
T
2
44
T
C
A
A
A
108
A
T
2
G
C
G
T
G
C
T
C
3
G
4
2
G
G
T
T
C
T
C
G
G
G
A
C
T
A
C
C
T
C
A
T
C
A
G
C
C
A
T
T
A
A
A
T
G
A
2
C
A
C
C
G
G
T
G
10
C
T
T
A
T
G
T
A
G
G
A
T
T
2
G
A
C
C
G
T
A
A
A
A
A
G
C
G
C
4
A
T
T
G
C
G
A
C
T
A
T
G
3
20
C
170
T
A
T
T
G
G
G
C
T
T
24
T
G
G
T
T
C
C
4
A
A
G
A
C
A
G
C
G
4
C
2
A
12
A
T
G
G
T
A
18
3
C
A
A
C
T
G
2
T
T
A
G
G
2
10
T
C
G
T
C
C
G
T
C
G
16
C
C
G
T
G
C
C
A
G
T
12
T
A
C
T
T
G
C
C
G
A
A
G
G
G
C
G
A
C
G
G
A
C
A
A
A
C
C
T
G
G
A
C
A
A
A
T
G
G
G
A
A
A
T
A
T
G
T
A
A
G
2
2
C
5
5
6
G
2
A
A
A
C
T
G
18
G
G
G
G
3
C
G
G
A
A
T
A
C
C
A
C
C
5
T
T
2
G
A
12
G
T
T
G
C
G
3
2
3
T
A
2
T
C
5
7
G
G
6
A
C
T
G
A
A
G
10
T
G
C
A
A
C
C
A
T
T
G
G
  36,502,914
  36,503,692
  36,503,706
  36,503,766
  36,503,892
  36,506,023
  36,507,435
  36,507,799
  36,507,915
  36,507,946
  36,508,415
  36,508,901
  36,509,130
  36,509,985
  36,510,611
  36,510,641
  36,510,658
  36,511,301
  36,511,422
  36,511,482
  36,511,741
  36,511,742
  36,512,090
  36,512,764
  36,512,931
  36,513,054
  36,513,278
  36,513,292
  36,513,331
  36,513,333
  36,513,924
  36,513,933
  36,514,069
  36,514,495
  36,514,987
  36,517,808
  36,517,938
  36,518,028
  36,518,599
  36,519,092
  36,519,524
  36,519,828
  36,520,044
  36,521,310
  36,521,446
  36,521,587
  36,521,589
  36,521,640
  36,522,315
  36,522,651
  36,523,036
  36,523,098
  36,523,250
  36,526,173
  36,526,858
  36,527,067
  36,527,250
  36,527,513
  36,527,641
  36,527,862
  36,527,864
  36,527,954
  36,528,523
  36,529,334
  36,529,336
  36,529,340
  36,530,645
  36,530,647
  36,530,649
  36,530,766
  36,531,192
  36,531,340
  36,531,397
  36,531,720
  36,531,749
  36,532,319
  36,533,068
  36,533,104
  36,533,212
  36,533,346
  36,533,924
  36,533,928
  36,533,929
  36,533,932
  36,533,949
  36,533,950
  36,534,088
  36,534,476
  36,536,185
  36,536,339
  36,537,103
  36,539,065
  36,539,112
  36,540,388
  36,540,526
  36,541,163
  36,542,362
  36,542,406
  36,542,681
  36,542,863
  36,542,883
  36,543,718
  36,543,744
  36,544,694
  36,544,934
  36,544,935
  36,545,288
  36,545,381
  36,545,633
  36,545,788
  36,546,198
  36,546,559
  36,546,568
  36,546,591
  36,546,860
  36,547,514
  36,547,720
  36,548,187
  36,548,322
  36,548,538
  36,549,332
  36,549,756
  36,549,863
  36,550,493
  36,550,717
  36,551,540
  36,552,241
  36,552,338
  36,552,406
  36,552,845
  36,552,892
  36,554,146
  36,554,913
  36,555,097
  36,555,137
  36,555,208
  36,555,457
  36,555,628
  36,555,689
  36,555,714
  36,555,907
  36,556,079
  36,556,142
  36,556,354
  36,556,355
  36,556,837
  36,557,042
  36,557,742
  36,558,302
  36,558,548
  36,559,673
  36,559,790
  36,560,304
  36,562,581
  36,562,651
  36,563,826
  36,563,838
  36,564,645
  36,565,924
  36,565,928
  36,566,149
  36,566,218
  36,566,939
  36,567,685
  36,567,756
  36,568,608
  36,568,609
  36,569,073
  36,570,347
  36,570,381
  36,570,542
  36,570,561
  36,570,618
  36,570,643
  36,571,233
  36,571,419
  36,572,142
  36,573,023
  36,574,177
  36,574,184
  36,574,412
  36,574,572
  36,576,609
  36,576,835
  36,577,823
  36,579,094
  36,579,191
  36,579,420
  36,579,428
  36,579,445
  36,580,684
  36,581,131
  36,581,194
  36,581,248
  36,581,269
  36,582,141
  36,582,217
  36,582,276
  36,582,332
  36,582,439
  36,583,417
  36,583,750
  36,583,919
  36,583,992
  36,584,291
  36,584,648
  36,585,001
  36,585,003
  36,585,116
  36,585,713
  36,585,737
  36,585,936
  36,586,985
  36,587,267
  36,587,674
  36,587,675
  36,588,386
  36,588,678
  36,589,603
  36,589,629
  36,590,685
  36,591,143
  36,591,850
  36,592,874
  36,594,284
  36,594,632
  36,594,757
  36,594,869
  36,594,872
  36,595,099
  36,595,400
  36,595,489
  36,595,929
  36,596,928
  36,597,010
  36,597,068
  36,597,172
  36,597,468
  36,597,636
  36,598,541
  36,598,653
  36,599,991
  36,600,021
  36,600,186
  36,600,662
  36,600,745
  36,601,022
  36,601,300
  36,601,591
  36,601,709
  36,601,909
  36,602,055
  36,602,867
  36,604,232
  36,604,665
  36,604,841
  36,605,751
  36,606,170
  36,606,260
  36,606,403
  36,606,833
  36,607,491
  36,608,098
  36,609,911
  36,610,212
  36,610,872
  36,610,873
  36,611,162
  36,612,027
  36,612,909
  36,614,360
  36,614,786
  36,615,387
  36,615,604
  36,615,702
  36,617,527
  36,617,851
  36,619,138
  36,619,316
  36,619,371
  36,620,079
  36,620,519
  36,621,138
  36,623,155
  36,623,274
  36,624,857
  36,625,599
  36,625,671
  36,626,142
  36,627,775
  36,627,906
  36,628,673
  36,628,694
  36,628,858
  36,628,868
  36,628,943
  36,629,098
  36,629,300
  36,629,455
  36,629,559
  36,629,565
  36,630,098
  36,631,932
  36,634,609
  36,635,458
  36,636,462
  36,637,755
  36,639,173
  36,640,018
  36,640,340
  36,640,392
  36,640,459
  36,640,480
  36,640,482
  36,640,590
  36,640,591
  36,640,608
  36,640,611
  36,640,613
  36,640,752
  36,640,861
  36,640,915
  36,641,297
  36,641,566
  36,642,338
  36,644,496
  36,644,533
  36,644,864
  36,644,914
  36,644,979
  36,646,575
  36,646,708
  36,647,852
  36,647,864
  36,651,780
  36,652,167
  36,653,255
  36,654,332
  36,654,652
  36,654,677
  36,654,759
  36,654,987
  36,655,103
  36,655,371
  36,655,460
  36,655,506
  36,655,576
  36,655,808
  36,655,926
  36,656,348
  36,656,650
  36,656,893
  36,657,189
  36,657,303
  36,657,345
  36,657,769
  36,657,927
  36,657,939
  36,657,986
  36,658,892
  36,658,958
  36,659,276
  36,659,780
  36,659,944
  36,660,111
  36,660,446
  36,660,902
  36,660,960
  36,661,062
  36,662,306
  36,662,315
  36,662,358
  36,662,895
  36,662,898
  36,662,901
  36,662,904
  36,662,906
  36,662,912
  36,663,770
  36,663,808
  36,664,704
  36,667,361
  36,668,116
  36,669,076
  36,669,296
  36,671,405
  36,671,943
  36,672,959
  36,673,708
  36,673,760
  36,674,228
  36,674,897
  36,679,153
  36,679,536
  36,679,538
  36,679,960
  36,681,155
  36,681,742
  36,683,541
  36,684,024
  36,684,747
  36,686,096
  36,688,835
  36,689,217
  36,689,472
  36,690,493
  36,691,203
  36,691,495
  36,692,329
  36,692,423
  36,693,223
  36,693,700
  36,695,364
  36,696,117
  36,696,509
  36,696,944
  36,697,071
  36,698,749
  36,700,251
  36,700,252
  36,700,345
  36,702,552
  36,703,028
  36,705,718
  36,706,653
  36,707,056
  36,707,181
  36,707,298
  36,707,415
  36,709,828
  36,709,971
  36,712,998
  36,714,556
  36,715,329
  36,715,682
  36,715,796
  36,715,928
  36,716,536
  36,718,055
  36,719,789
  36,721,060
  36,721,072
  36,722,479
  36,723,109
  36,723,370
  36,723,482
  36,725,533
  36,725,651
  36,726,116
  36,726,461
  36,726,683
C
A
G
T
G
T
3
-
G
C
A
T
A
C
G
3
2/-
G
G
A
3/-
2/-
A
T
C
T
-
T
G
C
T
T
A
-
A
-
9
C
2
A
5
A
T
G
T
16/-
14/-
A
G
T
T
C
T/16
2
34
G
16
T
C
4
A
A
T
C/4
C/T
-
4
-
A
A
C
C
C/3
A
G
T
2
C
C
T
G
G
G
2
A
C
G
T
G
A
C
5
-
7
A
A
A
G
-
G
-
G
G
C
2/-
-
T
G
T
A
G
C
G
A
C
T
G
A
5/6
G
A
G
-
G
G
A
A
A
9
T
G
-
7
-
44/-
G
9
G
G
G
-
C
C
2/-
G/5
G
10/4
C
2
T
C
T
-
T
-
-
T
-
C
3
CT/3
G
T
C
T
G/2
A/-
T
C
G
C/2
2
A
A
T
C
T
G
A
7/5
T
2
C
C
C
G
4
C
2
5
-
G
G
T
T
A
T
G
2
10/-
2
3
A
G
C
A
C
C
A
A
G
A
2
2/-
G/3
A/-
7
G
A
C
C
5
C
G
G
T
T
A
T
4/-
G
7
C
-
T
A
G
9
C
-
C
A
-
-
T
-
5
G
C
G
T
A
C
T
C
C
-
C
A
-
2
3
T
T
-
2
2
T
T
T
G
A
T
A
-
T
-
G
-
5
C
5
A
C
G
18/-
-
2
19
G
2
3
A
-
3/5
13
-
A
3
-
-
C
T
T
2
T
T
A
G
A
11
-
T
G
A
G
T
G
G
G
3
C
12/-
4
G
5
C
T/4
C
3/4
T
A
T
G
A
A
A
T
A
G
A
T
T
G
2
G
G
G
A
T
9
-
A
T
T
G
G
G
A
T
T
G/-
G
G
2
C
C
G
C
C
G
-
A
-
-
A
-
-
-
A
2/-
C
-
C
9
C
A
18/-
A
A
T
A
-
-
T
C
11
G
2
-
T
-
G
A
C/-
-
5
C
-
A
G
-
A
C
C
A
6
A
-
2/-
-
-
T
-
4
T
-
-
C
A
-
2
T
A
-
A/2
C
4
-
A
2
10
-
G
T
C/7
-
-
C
2
A