Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 124,913 (bp)   Positions: 370
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.976
.099
.007
.001
.049
.021
.0
.037
.002
.129
.055
.001
.004
.001
.016
.028
.033
--
.002
--
.742
.574
--
--
--
--
--
.039
.079
.055
.048
.055
.041
.03
.595
.063
.287
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.0
.002
.0
.003
.823
.018
.02
.026
.001
.009
.0
.0
.001
.001
.838
.956
.01
.002
.003
.0
.002
.022
.011
.003
.001
.0
.005
.001
.001
.108
.085
.0
.003
.003
.083
.011
.0
.011
.003
.0
.021
.003
.001
.016
.0
.008
.019
.0
.003
.001
.002
.001
.998
.001
.002
.011
.003
.01
.005
.001
.001
.0
.04
.012
.0
.0
.002
.001
.003
.031
.01
.012
.012
.001
.008
.008
.124
.072
.028
.005
.0
.0
.0
.008
.002
--
.017
.012
.129
--
--
.0
.011
--
--
.094
.0
.0
.953
.996
.999
1.0
.0
.0
.023
.001
.0
.001
.251
.176
.051
.172
.204
.583
.031
.042
.046
.127
.125
.111
.103
.008
.047
.009
.228
.005
.021
.065
.068
.059
.033
.048
.003
.013
.0
.061
.006
.001
.001
.004
.0
.001
.001
.662
.564
.014
--
.287
.301
.177
.08
.068
.077
.01
.416
.142
.005
.016
.01
.027
.02
.005
.021
.111
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.963
.038
.008
.005
.015
.121
.19
.079
.023
.139
.053
.002
.0
.023
.337
.353
.329
--
.043
--
--
--
--
--
.001
.001
.0
--
.015
.001
--
.039
.002
.003
.021
.02
.001
.0
.001
.0
.001
.021
--
.002
.014
--
--
--
.03
.054
.351
.348
.007
.01
.213
.016
.015
.03
--
.017
.037
.027
.854
.0
.0
.277
.007
.001
.0
.001
.006
.006
.001
.024
.173
.016
.001
--
--
.049
.005
.001
.006
.062
.139
.507
.012
.222
.074
.02
.079
.046
.264
.001
.002
.002
.054
.01
.083
.015
.309
.0
--
--
--
.694
.034
.006
.002
.024
--
--
--
--
.01
.0
.002
.942
.052
.016
.0
.001
.015
.001
.002
.126
.0
.01
.016
.096
.104
.75
.711
.002
.027
.0
.0
.017
.001
.003
.014
.948
.912
.91
.914
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Bcr
Bcr
Bcr
Bcr
Bcr
Bcr
Bcr
Bcr
Bcr
Bcr
Bcr
Bcr
Bcr
Bcr
Bcr
Bcr
Bcr
Bcr
Bcr
Bcr
Bcr
Bcr
Bcr
Bcr
Bcr
Bcr
Bcr
Bcr
Bcr
Bcr
Bcr
Bcr
Bcr
Bcr
Bcr
Bcr
Bcr
G
G
C
7
T
C
T
C
A
C
T
C
C
5
C
C
A
G
T
G
T
10
G
A
A
G
C
G
G
G
G
T
4
T
T
T
A
C
T
T
52
A
T
T
C
C
C
C
G
G
G
G
C
G
T
T
C
A
T
C
C
A
T
A
G
G
C
G
A
G
C
G
G
A
C
T
A
G
A
G
G
C
C
G
G
A
T
G
T
G
T
T
C
2
C
A
C
G
C
T
G
G
C
T
G
G
A
A
G
C
C
C
C
A
A
C
C
5
4
G
C
G
6
C
C
T
A
A
A
C
A
4
G
C
T
C
C
G
A
C
A
A
T
A
A
C
A
A
G
T
C
C
A
T
C
T
G
G
A
G
C
A
T
A
T
G
T
G
A
G
C
C
T
A
T
G
C
2
T
G
T
T
G
G
G
A
A
C
A
A
G
A
G
A
A
T
C
T
C
G
A
G
G
T
C
4
C
C
A
T
C
G
G
C
C
T
2
A
A
T
A
A
T
G
A
G
C
C
A
C
C
G
C
C
T
20
T
C
A
4
C
A
A
A
8
16
12
C
T
2
G
4
G
T
A
C
T
T
C
G
G
T
T
T
G
G
G
T
C
A
A
A
T
T
A
2
A
T
T
6
A
A
T
T
T
A
4
2
A
A
C
C
C
C
A
2
C
C
A
T
C
T
20
T
T
G
C
C
G
T
C
G
T
G
2
G
T
A
G
A
C
G
C
10
C
T
A
T
A
63
8
A
32
C
A
A
A
10
G
T
G
A
T
G
4
G
G
T
T
A
T
T
T
A
A
T
T
T
T
T
T
T
T
T
T
A
2
T
T
A
  16,604,481
  16,604,836
  16,605,147
  16,605,576
  16,605,600
  16,605,653
  16,606,019
  16,608,864
  16,611,374
  16,612,917
  16,614,649
  16,615,489
  16,615,715
  16,616,369
  16,617,923
  16,618,695
  16,618,696
  16,619,535
  16,619,579
  16,619,951
  16,624,150
  16,625,589
  16,626,682
  16,626,685
  16,626,687
  16,626,691
  16,626,695
  16,627,296
  16,627,688
  16,628,102
  16,628,109
  16,628,133
  16,628,310
  16,628,341
  16,628,646
  16,628,805
  16,628,974
  16,629,038
  16,629,179
  16,629,238
  16,629,345
  16,629,539
  16,629,661
  16,629,794
  16,630,143
  16,630,186
  16,630,208
  16,630,544
  16,630,576
  16,630,589
  16,630,800
  16,630,999
  16,631,046
  16,631,047
  16,631,053
  16,631,082
  16,631,194
  16,631,215
  16,631,276
  16,631,324
  16,631,345
  16,631,558
  16,631,561
  16,631,646
  16,631,661
  16,631,674
  16,631,721
  16,631,884
  16,631,954
  16,631,958
  16,631,960
  16,631,966
  16,632,110
  16,632,118
  16,632,354
  16,632,389
  16,632,432
  16,632,436
  16,632,442
  16,632,453
  16,632,461
  16,632,504
  16,632,543
  16,632,653
  16,632,684
  16,632,737
  16,632,772
  16,633,427
  16,633,465
  16,633,540
  16,634,014
  16,634,204
  16,634,291
  16,634,651
  16,634,961
  16,635,008
  16,635,144
  16,636,049
  16,636,771
  16,637,175
  16,637,498
  16,637,590
  16,637,612
  16,637,642
  16,637,768
  16,637,772
  16,637,902
  16,637,908
  16,637,912
  16,637,934
  16,637,976
  16,638,069
  16,638,078
  16,638,157
  16,638,217
  16,638,651
  16,638,759
  16,638,908
  16,638,909
  16,639,296
  16,639,508
  16,639,688
  16,639,843
  16,640,319
  16,640,654
  16,640,693
  16,640,887
  16,641,046
  16,641,494
  16,641,565
  16,641,752
  16,641,877
  16,642,096
  16,642,281
  16,642,282
  16,642,659
  16,642,828
  16,642,846
  16,643,041
  16,643,059
  16,643,361
  16,643,412
  16,643,988
  16,644,331
  16,644,446
  16,644,506
  16,644,557
  16,644,572
  16,644,596
  16,644,615
  16,644,630
  16,644,807
  16,644,864
  16,644,905
  16,644,957
  16,645,316
  16,645,383
  16,645,394
  16,645,465
  16,645,484
  16,645,515
  16,645,573
  16,645,634
  16,645,635
  16,645,670
  16,645,673
  16,645,676
  16,645,677
  16,645,728
  16,645,775
  16,645,789
  16,645,840
  16,646,045
  16,646,098
  16,646,104
  16,646,105
  16,646,110
  16,646,112
  16,646,139
  16,646,196
  16,646,220
  16,646,665
  16,646,943
  16,646,950
  16,646,999
  16,647,003
  16,647,084
  16,647,206
  16,647,237
  16,647,282
  16,647,382
  16,647,414
  16,647,535
  16,647,553
  16,647,645
  16,647,652
  16,647,660
  16,647,668
  16,647,675
  16,647,677
  16,647,943
  16,648,188
  16,648,211
  16,648,273
  16,648,378
  16,648,383
  16,648,409
  16,648,413
  16,648,434
  16,648,564
  16,648,737
  16,648,777
  16,648,867
  16,648,877
  16,648,879
  16,648,915
  16,648,936
  16,648,938
  16,649,185
  16,649,213
  16,649,358
  16,649,389
  16,649,442
  16,649,461
  16,649,468
  16,649,992
  16,650,166
  16,650,309
  16,650,505
  16,650,728
  16,650,750
  16,651,317
  16,651,338
  16,651,355
  16,651,657
  16,652,057
  16,652,173
  16,653,238
  16,653,977
  16,654,626
  16,654,641
  16,655,178
  16,656,229
  16,656,287
  16,657,176
  16,657,256
  16,657,260
  16,657,426
  16,657,488
  16,658,902
  16,658,903
  16,660,142
  16,662,597
  16,664,934
  16,665,277
  16,666,083
  16,668,898
  16,670,418
  16,671,567
  16,672,863
  16,674,588
  16,677,310
  16,677,717
  16,677,718
  16,678,309
  16,678,938
  16,679,004
  16,679,902
  16,680,586
  16,681,372
  16,681,717
  16,681,820
  16,681,840
  16,682,156
  16,682,853
  16,683,880
  16,683,881
  16,683,950
  16,684,833
  16,684,930
  16,685,509
  16,685,885
  16,686,183
  16,686,384
  16,686,921
  16,686,980
  16,686,992
  16,687,190
  16,687,234
  16,687,235
  16,687,310
  16,687,597
  16,687,629
  16,687,645
  16,689,698
  16,690,624
  16,690,870
  16,691,459
  16,691,474
  16,692,511
  16,694,449
  16,694,591
  16,697,119
  16,697,185
  16,698,160
  16,699,016
  16,700,784
  16,704,694
  16,707,109
  16,707,576
  16,707,985
  16,708,093
  16,708,143
  16,708,208
  16,708,452
  16,709,761
  16,709,874
  16,709,928
  16,710,387
  16,710,417
  16,710,804
  16,711,662
  16,714,584
  16,714,612
  16,716,759
  16,717,044
  16,717,143
  16,718,770
  16,720,282
  16,721,627
  16,723,327
  16,724,030
  16,724,273
  16,724,891
  16,725,284
  16,725,333
  16,725,351
  16,725,360
  16,725,408
  16,725,571
  16,725,668
  16,726,414
  16,726,526
  16,726,801
  16,726,994
  16,727,347
  16,727,351
  16,728,526
  16,728,539
  16,728,541
  16,728,557
  16,728,574
  16,728,595
  16,728,596
  16,728,598
  16,728,599
  16,728,603
  16,728,607
  16,728,613
  16,728,615
  16,728,637
  16,728,639
  16,728,648
  16,728,654
  16,728,656
  16,728,722
  16,728,867
  16,728,870
  16,728,872
  16,728,873
T
A
19
-
C
2
C
C/2
G
A
4
A
G
-
T
C/T
A/G
2
C
-
T/-
-
11
5
2
13
-
A
A
A
C
A
-
C
9
3
2
2
C
C
-
G
C
C
T
T
T
T
C
A
2
A
-
T
A
C
T
G
A
T
-
G
C
T
T
A
T
C
G
4
A
-
C
G
T
C
G
-
G
T
A
T
T
C
-
G
C
A
A
C
C
C
T
-
T
C
T
A
T
C
T
T
T
C
T
A
G
-
T
A
T
T
G
T
G
T
T
5/-
-
A
G
-
-
A
T
G
G
14
-
T
G
-
A
T
A
T
T
A
G
T
G
G
G
T
G
T
G
G
A
C
T
T
G
C
G
C
A
A
G
C
-
G
C
G
C
A
C
T
G
A
G
T
C
G
C
A
3
-
2
A
A
A
-
A
2
-
G
T
C
G
A
2
A
5
C
C
T
C
T
C
T
A
A
C
T
-
G
-
T
C
T
A
A
T
T
C
-
2
G
C
A/19
G
C
2
G
A
T
T
T
T
T
A
G
T
C
-
A
T
C
4/-
C/G
3
A/5
-
-
-
12/-
9
C
2/-
G/-
-
A
3
G
5
2
C
4
A
A
A
C
C
A
A
A
C
5
G
5
-
2
2
C
2/-
-
G
3
-
G
C
C
-
23
G
-
2/-
AC/--
A/2
T
C/8
T
2
G
-
4
A
G
G
-
C
-
C
C
A
T
T
A
C
T
-
A
A
-
2
A
-
C
G
T
A
T
-
T
C
G
3
2
63/-
-
8
-
T
G
G
3
-
G/-
G
3
G
-
A
-
C
A
C
G
2
G
C
C
C
T
C
C
G
G
C
G
G
G
G
G
2
-
C
G
3