Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 136,237 (bp)   Positions: 306
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.988
.007
.991
.112
--
--
--
.006
.093
--
--
.666
.007
--
.755
.006
.0
.0
.967
.0
.002
.001
--
.243
.009
.003
.001
.14
.07
.007
.002
.022
.03
.051
.002
.002
.002
.018
.024
--
--
--
--
.034
.009
.007
.001
.091
.001
.003
.012
.001
.916
.013
--
--
.004
.021
.008
.0
.478
.038
.212
.031
.033
.028
.004
.001
.125
.474
.017
.083
.003
.051
.001
.0
.03
.078
.006
.0
.001
.002
.002
.001
.001
.004
.001
.007
.006
.0
.002
.003
.011
.001
.002
.001
.001
.619
.01
.104
.139
.061
.0
.022
.001
.994
.011
.466
.008
.0
.001
.63
.014
.996
.0
.464
--
--
--
--
--
--
.124
.005
.087
.029
.06
.009
.065
.109
.012
.016
.378
.001
.0
.063
.472
.066
.067
.001
.001
.996
.001
.136
.025
.01
.183
.024
.035
.069
.0
.042
.083
.001
.02
.001
.001
.057
.01
.068
.455
--
.014
.26
.005
.012
.01
.004
.001
.001
.002
.002
.014
.0
.0
.0
.202
.069
.049
.024
.084
.035
.142
.002
.016
.015
.058
.004
.004
.023
.005
.0
.006
.001
.0
.003
.061
.006
.0
.005
.0
.001
.003
.0
.002
.001
.001
.12
.022
.0
.566
.004
.146
.0
.003
.152
.04
.001
.002
--
.0
.012
.001
.003
.032
.0
.001
.0
.027
.032
.01
.011
.101
1.0
.052
.009
.009
.018
.004
.055
.085
.162
.18
.083
.718
.011
.004
.022
.0
.0
.027
.004
.0
.002
.079
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.575
.014
.001
.001
.013
.238
.153
.006
.001
.001
.067
.84
.587
.104
.017
.007
.134
.008
.294
.018
.003
.06
.014
.002
.013
.02
.008
.157
.431
.192
.0
.002
.001
.555
.005
.005
.016
.002
.069
.134
.0
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Akap9
Akap9
Akap9
Akap9
Akap9
Akap9
Akap9
Akap9
Akap9
Akap9
Akap9
Akap9
Akap9
Akap9
Akap9
Akap9
Akap9
Akap9
Akap9
Akap9
Akap9
Akap9
Akap9
Akap9
Akap9
Akap9
Akap9
Akap9
Akap9
Akap9
Akap9
2
C
C
3
A
C
C
C
3
T
12
A
A
A
G
A
C
G
T
2
G
C
A
C
C
8
A
G
T
C
T
G
A
18
A
T
G
A
4
2
G
4
G
G
C
C
T
T
A
C
T
C
A
T
2
C
G
G
G
T
G
A
T
T
G
C
A
G
A
G
C
C
C
A
A
G
A
C
A
G
C
C
C
G
A
G
C
C
G
G
A
G
T
T
G
A
A
C
A
C
A
G
C
G
C
C
T
4
G
G
G
2
A
T
C
G
A
G
G
G
G
2
A
A
G
T
A
A
A
2
G
G
T
T
T
G
A
C
T
A
T
A
T
21
G
G
11
G
C
T
T
4
C
C
G
G
T
C
C
4
C
A
A
G
T
C
A
T
C
A
C
A
T
A
A
A
G
T
C
C
C
A
C
G
A
A
T
A
C
T
C
C
G
A
T
C
T
T
G
A
C
C
T
G
C
G
T
C
C
A
T
C
C
G
T
C
A
C
G
8
T
C
A
C
G
T
T
T
G
T
C
G
G
G
3
A
C
T
G
G
T
T
24
81
C
G
A
A
T
G
T
T
C
G
6
G
G
2
A
A
T
A
C
C
4
C
A
A
C
T
A
C
C
C
T
G
G
C
C
G
C
G
T
G
A
T
T
T
G
G
4
C
8
A
T
2
C
T
A
A
C
C
C
C
C
A
  27,099,319
  27,099,579
  27,101,412
  27,101,972
  27,103,209
  27,104,027
  27,104,786
  27,105,054
  27,105,593
  27,105,721
  27,105,990
  27,106,386
  27,107,645
  27,108,103
  27,109,458
  27,110,389
  27,112,042
  27,113,222
  27,113,669
  27,114,286
  27,114,290
  27,114,770
  27,116,186
  27,118,667
  27,119,220
  27,122,794
  27,134,087
  27,134,442
  27,134,796
  27,134,842
  27,134,934
  27,135,398
  27,140,167
  27,142,702
  27,142,830
  27,142,862
  27,143,098
  27,144,179
  27,144,292
  27,145,052
  27,145,145
  27,145,282
  27,145,359
  27,145,409
  27,146,302
  27,148,382
  27,148,668
  27,150,374
  27,151,101
  27,152,506
  27,153,044
  27,154,481
  27,155,642
  27,158,598
  27,158,916
  27,159,003
  27,160,254
  27,162,749
  27,163,048
  27,163,552
  27,163,601
  27,163,987
  27,164,033
  27,164,122
  27,164,157
  27,164,237
  27,164,334
  27,164,487
  27,164,703
  27,164,901
  27,165,039
  27,165,235
  27,165,393
  27,165,572
  27,165,588
  27,166,242
  27,166,611
  27,166,875
  27,167,305
  27,167,499
  27,167,961
  27,168,197
  27,168,207
  27,168,221
  27,168,243
  27,168,286
  27,168,289
  27,168,324
  27,168,341
  27,168,358
  27,168,602
  27,168,603
  27,169,069
  27,169,541
  27,169,799
  27,169,858
  27,170,056
  27,170,187
  27,170,818
  27,170,883
  27,170,922
  27,170,941
  27,171,442
  27,171,759
  27,171,928
  27,172,671
  27,173,173
  27,175,084
  27,175,115
  27,175,231
  27,175,657
  27,176,019
  27,176,646
  27,176,734
  27,176,812
  27,177,072
  27,177,469
  27,177,579
  27,177,675
  27,177,699
  27,178,002
  27,178,003
  27,178,198
  27,178,283
  27,178,902
  27,179,860
  27,180,052
  27,181,852
  27,182,023
  27,182,152
  27,182,478
  27,182,589
  27,182,605
  27,182,701
  27,182,769
  27,182,889
  27,183,989
  27,184,057
  27,184,416
  27,184,527
  27,184,980
  27,185,159
  27,185,427
  27,185,933
  27,186,287
  27,186,337
  27,186,858
  27,186,915
  27,187,085
  27,187,142
  27,187,410
  27,187,503
  27,187,794
  27,188,025
  27,188,096
  27,188,304
  27,188,471
  27,188,881
  27,188,983
  27,189,147
  27,189,580
  27,189,812
  27,190,070
  27,190,233
  27,190,331
  27,190,661
  27,190,985
  27,191,457
  27,191,589
  27,191,971
  27,192,900
  27,193,358
  27,193,441
  27,193,458
  27,193,574
  27,193,632
  27,193,808
  27,193,840
  27,194,194
  27,194,378
  27,194,385
  27,194,519
  27,194,723
  27,194,813
  27,194,876
  27,195,172
  27,195,202
  27,195,446
  27,195,473
  27,195,536
  27,195,915
  27,196,081
  27,196,223
  27,196,242
  27,197,627
  27,198,488
  27,198,740
  27,199,371
  27,199,387
  27,199,405
  27,199,419
  27,199,512
  27,199,517
  27,199,606
  27,199,671
  27,199,731
  27,199,732
  27,200,511
  27,200,724
  27,200,730
  27,200,962
  27,201,121
  27,202,347
  27,202,385
  27,204,822
  27,205,103
  27,205,786
  27,206,451
  27,206,641
  27,208,004
  27,208,648
  27,208,860
  27,208,944
  27,209,028
  27,209,073
  27,209,179
  27,209,190
  27,209,783
  27,209,892
  27,210,380
  27,210,411
  27,210,837
  27,210,884
  27,211,063
  27,212,914
  27,212,926
  27,213,250
  27,213,509
  27,213,894
  27,213,966
  27,213,994
  27,214,033
  27,214,517
  27,214,566
  27,214,680
  27,214,707
  27,214,709
  27,214,920
  27,214,939
  27,214,984
  27,215,172
  27,215,610
  27,215,883
  27,216,043
  27,216,364
  27,216,438
  27,216,487
  27,216,521
  27,216,843
  27,216,848
  27,216,980
  27,217,003
  27,217,089
  27,217,172
  27,217,193
  27,217,446
  27,217,740
  27,217,887
  27,218,241
  27,218,348
  27,218,459
  27,218,583
  27,218,599
  27,218,737
  27,218,743
  27,218,794
  27,218,846
  27,218,852
  27,218,943
  27,218,967
  27,219,071
  27,219,194
  27,219,505
  27,220,140
  27,220,349
  27,220,514
  27,220,532
  27,221,815
  27,222,744
  27,222,751
  27,223,962
  27,224,267
  27,224,755
  27,225,281
  27,227,257
  27,227,424
  27,228,329
  27,228,931
  27,229,082
  27,229,372
  27,229,373
  27,230,843
  27,230,950
  27,231,205
  27,231,722
  27,231,882
2/-
G
T
-
T
A
T
T
-
6
-
G
G
2
A
A/-
3
A
C
-
A
T
G
T
T
-
C
A
A
A
T/3
17
C
-
G
C
A
13
-
-
A
-
11
A
A
T
2
2
G
G
C
T
G
C
2/-
C/3
A
2
A
G
T
G
2
G
A
A
G
A
-
C
T
5
3
G
G
A
-
2
G
C
T
T
T
C
T
A
T
T
A
T
C
A
G
C
A
G
44
A
T
A
T
2
A
A
T
G
2
-
T
A
T
-
C
C
G
A
G
T
A
A
5
2/-
G
T
A
G
G
T
C
-
C
C
C
C
G
A
G
A
C
G
C
-
T/26
-
A
T
-
A
T
C
C
-
A
A
A
C
-
T
A
-
T
G
G
T
C
A
G
C
T
G
T
G
G
G
G
-
A
C
T
T
T
-
-
A
G
G
A
C
T
C
T
T
A
G
C
T
T/-
C
C
G
T
G
C
C
2
A
C
T
G
G
C
G
T
A
G
T
G
T
A
-
G
C/2
G
A
A
A
T/-
C
A
A
T
3
A
A
-
-
A
5
A
A
-
G
-
-
T
A
G
G
C
A
C
C
T
-
-
7
2
-
G
G
G
T
5
G
-
T
C
2
T
C
6
T
2
T
A
T
2
A
2
A
T
T
C
A
G
C
C
A
A
A
-
T
-
3
A
-
-
2
G
G
T
G
T
T
T
G