Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 305,413 (bp)   Positions: 460
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.0
.001
.0
.694
.001
.053
.029
.254
--
.726
.007
.018
.001
.556
.054
--
.024
.119
.028
.065
.006
.647
.005
.008
.005
.371
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.588
.005
.097
.01
.074
.413
.031
.005
.082
.274
.006
.024
.03
.116
.0
.0
.201
.282
.015
.252
.118
.126
.142
.717
--
--
.314
.114
.023
.442
.129
.217
.001
.054
.001
.018
.035
.032
.042
.024
.032
.081
.012
.0
.032
.176
.193
.04
.203
.277
.246
.016
.119
.79
.179
.0
.225
.391
.077
.016
.009
.004
.003
.002
.009
.008
.015
.02
.016
.022
--
.022
.007
.0
.003
.202
.217
.04
.008
.001
.076
.012
.017
.008
.422
.001
.003
.272
.816
--
.115
.012
.016
.0
.091
.017
.514
.002
.008
.004
.017
.02
.002
.031
.004
.001
.001
.001
.157
.035
.011
--
--
--
.766
.005
.092
.163
.002
.001
.021
.031
.006
.078
.0
.001
.0
.016
.041
.007
--
.691
.0
.008
.006
.001
.001
.067
.167
.754
.041
.031
.972
.0
.026
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.006
.006
.0
.0
.001
.013
.319
.003
.027
--
.465
.011
.018
.0
.053
--
.003
.005
.0
.225
.085
.0
--
.002
.0
.017
.003
.003
.0
.033
.052
.018
.015
.01
.013
.264
.06
.022
--
.42
.311
.009
.02
.13
.122
.017
.391
.0
.389
.446
.002
.0
.001
.02
.002
.018
.067
.114
.003
.011
.001
.002
.001
.001
.077
.006
.005
.001
.088
.005
.035
.017
.001
.045
.0
.002
.009
.0
.002
.004
.001
.053
.015
.031
.09
.674
.0
.187
.187
--
.003
.306
.003
.002
.007
.124
.003
.0
.002
.012
.042
.005
.0
.027
.004
.637
.029
.0
.98
.0
.0
--
--
--
--
.01
.906
.0
.004
.005
--
.078
.242
--
--
.003
.001
.342
.238
.003
.016
.0
.147
--
.079
.088
.002
.75
.003
.001
.896
.0
--
.0
.009
.876
.286
.005
.043
.076
.294
.18
.085
.095
.002
.539
.026
.0
.0
.032
.044
.021
.02
.01
.153
.013
--
--
--
--
--
.009
.012
.0
.001
.003
.0
.001
.961
.001
.0
.002
.002
.001
.052
.003
.003
.0
.174
.001
.055
--
--
--
--
--
.022
.002
.004
.022
--
--
.015
.127
.105
.01
.139
.031
.001
.297
.023
.001
.003
.283
.005
.996
.015
.004
.003
.019
.013
.003
.998
.303
.403
.0
.001
.05
.005
.001
.109
.0
.002
.001
.0
.019
.003
--
.002
.0
.001
.18
.021
.004
.085
.029
.427
.0
.0
.001
.0
.002
.003
.007
.013
.011
.0
.001
.001
.921
.007
.001
.007
.449
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
Akap13
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
T
C
T
G
A
C
2
T
G
G
C
C
A
C
A
C
C
2
G
A
A
G
C
T
T
T
T
C
C
G
C
C
C
C
C
G
A
G
T
C
G
A
T
G
A
2
T
C
C
A
G
A
T
T
A
C
A
A
T
C
T
A
A
G
G
A
T
T
C
A
G
C
T
G
A
A
A
G
C
T
C
A
A
C
G
G
A
C
C
A
G
G
A
A
G
G
C
T
C
G
C
A
C
G
G
A
8
A
C
T
A
A
C
A
C
C
G
G
T
T
3
C
G
14
G
6
3
A
13
T
T
G
T
2
G
G
T
A
C
A
T
G
A
6
A
C
A
A
G
A
A
A
A
C
A
T
C
A
C
26
C
G
5
T
G
C
G
G
G
C
A
C
A
C
A
G
T
T
A
A
T
T
C
A
T
C
C
A
T
A
A
G
G
C
G
G
G
3
T
T
C
9
G
C
C
C
C
T
T
G
G
T
A
G
A
A
3
G
T
C
T
C
A
A
C
G
G
C
T
T
A
T
A
C
C
3
A
2
G
C
C
C
12
G
3
A
C
C
A
A
T
2
T
T
C
A
C
2
C
T
T
C
G
A
C
G
T
A
G
A
A
C
A
A
G
C
G
G
G
A
T
2
T
A
A
G
A
A
C
A
T
C
G
A
A
C
G
G
T
T
C
C
C
C
C
T
G
C
G
G
C
G
T
A
C
T
T
A
G
4
T
A
A
A
A
C
T
T
3
4
A
A
A
T
C
G
2
C
G
T
T
T
16
T
A
G
A
A
T
C
C
G
A
G
C
T
C
G
G
T
T
A
T
C
T
4
T
T
A
T
T
A
A
G
A
A
5
C
G
C
G
G
T
T
T
C
A
C
C
6
T
G
C
A
T
A
A
G
A
G
C
A
A
C
A
2
G
G
C
24
T
C
T
C
T
A
A
G
A
T
A
A
C
T
A
20
G
G
T
C
T
G
T
A
A
G
C
G
G
A
A
A
5
T
G
G
A
A
G
C
G
A
T
G
G
G
G
G
G
C
  138,008,638
  138,008,797
  138,008,798
  138,009,152
  138,009,236
  138,010,053
  138,010,056
  138,010,241
  138,010,661
  138,012,777
  138,013,680
  138,013,826
  138,013,939
  138,014,869
  138,015,060
  138,015,211
  138,015,632
  138,016,085
  138,018,909
  138,018,976
  138,022,040
  138,022,341
  138,023,228
  138,024,221
  138,024,259
  138,024,380
  138,025,680
  138,026,292
  138,026,297
  138,026,299
  138,026,303
  138,026,305
  138,026,308
  138,026,310
  138,026,313
  138,026,336
  138,026,886
  138,027,302
  138,029,295
  138,031,587
  138,032,033
  138,033,835
  138,036,014
  138,037,979
  138,038,024
  138,038,502
  138,038,513
  138,038,633
  138,038,643
  138,038,961
  138,039,576
  138,040,284
  138,040,369
  138,043,334
  138,043,343
  138,044,731
  138,045,887
  138,045,888
  138,047,035
  138,047,621
  138,047,905
  138,048,005
  138,050,818
  138,050,831
  138,051,285
  138,053,028
  138,053,355
  138,055,700
  138,056,150
  138,056,862
  138,056,873
  138,057,542
  138,058,122
  138,058,123
  138,058,937
  138,059,385
  138,059,979
  138,060,777
  138,062,837
  138,065,592
  138,065,674
  138,065,684
  138,067,008
  138,067,152
  138,068,135
  138,068,829
  138,069,275
  138,070,091
  138,070,101
  138,070,280
  138,070,403
  138,070,589
  138,071,619
  138,071,908
  138,073,371
  138,073,374
  138,073,383
  138,073,404
  138,073,413
  138,073,415
  138,073,434
  138,073,446
  138,073,450
  138,073,451
  138,073,855
  138,074,007
  138,074,126
  138,074,640
  138,076,569
  138,078,991
  138,079,178
  138,079,928
  138,080,562
  138,081,064
  138,081,235
  138,081,252
  138,081,638
  138,081,937
  138,081,941
  138,082,139
  138,082,677
  138,083,019
  138,083,158
  138,084,440
  138,087,422
  138,087,824
  138,087,947
  138,088,667
  138,089,062
  138,089,184
  138,089,232
  138,089,428
  138,089,653
  138,091,121
  138,091,553
  138,091,887
  138,092,804
  138,094,193
  138,094,431
  138,097,616
  138,097,646
  138,097,676
  138,098,084
  138,098,814
  138,099,800
  138,100,364
  138,101,817
  138,103,774
  138,104,321
  138,104,513
  138,104,793
  138,105,189
  138,106,620
  138,106,827
  138,108,304
  138,108,351
  138,109,520
  138,109,819
  138,110,722
  138,112,261
  138,112,399
  138,112,646
  138,112,746
  138,113,565
  138,114,050
  138,114,476
  138,114,493
  138,117,060
  138,117,305
  138,121,402
  138,121,900
  138,121,924
  138,122,129
  138,122,181
  138,122,223
  138,122,321
  138,128,505
  138,128,935
  138,129,921
  138,130,333
  138,130,835
  138,131,189
  138,132,206
  138,132,385
  138,132,776
  138,133,026
  138,134,135
  138,134,364
  138,134,865
  138,135,032
  138,135,260
  138,137,108
  138,137,430
  138,137,905
  138,137,917
  138,137,996
  138,139,126
  138,139,635
  138,140,032
  138,140,756
  138,141,135
  138,142,582
  138,144,385
  138,146,591
  138,146,617
  138,148,109
  138,148,183
  138,148,765
  138,150,742
  138,153,043
  138,154,013
  138,154,410
  138,156,739
  138,157,771
  138,158,250
  138,158,327
  138,158,503
  138,158,652
  138,159,948
  138,160,774
  138,160,913
  138,161,106
  138,162,040
  138,163,874
  138,163,992
  138,164,790
  138,165,177
  138,165,295
  138,165,314
  138,165,341
  138,165,595
  138,165,682
  138,166,188
  138,166,412
  138,166,419
  138,167,317
  138,168,206
  138,168,249
  138,168,521
  138,168,537
  138,168,592
  138,168,759
  138,169,478
  138,171,165
  138,171,301
  138,172,573
  138,172,681
  138,172,703
  138,173,036
  138,174,424
  138,174,491
  138,174,705
  138,174,708
  138,174,710
  138,175,171
  138,175,652
  138,175,900
  138,176,242
  138,176,322
  138,176,340
  138,177,027
  138,177,138
  138,177,739
  138,178,064
  138,178,240
  138,179,327
  138,179,416
  138,179,968
  138,182,328
  138,182,422
  138,182,989
  138,183,007
  138,183,022
  138,183,033
  138,183,036
  138,183,039
  138,183,059
  138,183,080
  138,183,084
  138,184,789
  138,185,338
  138,190,478
  138,191,058
  138,191,307
  138,191,308
  138,192,739
  138,197,156
  138,197,360
  138,197,686
  138,199,038
  138,200,648
  138,200,751
  138,201,874
  138,203,684
  138,204,741
  138,205,035
  138,207,496
  138,208,081
  138,208,548
  138,209,057
  138,209,253
  138,210,184
  138,211,682
  138,212,793
  138,213,094
  138,213,777
  138,214,296
  138,214,561
  138,214,938
  138,214,972
  138,215,302
  138,216,774
  138,217,879
  138,218,241
  138,218,937
  138,218,939
  138,219,156
  138,219,388
  138,219,748
  138,223,762
  138,223,766
  138,224,765
  138,225,207
  138,225,770
  138,226,109
  138,229,688
  138,231,747
  138,234,121
  138,235,008
  138,235,643
  138,237,231
  138,237,232
  138,240,241
  138,241,232
  138,241,395
  138,242,202
  138,242,443
  138,244,188
  138,245,234
  138,246,608
  138,247,983
  138,248,359
  138,248,409
  138,248,763
  138,248,833
  138,249,201
  138,250,214
  138,250,515
  138,250,734
  138,251,756
  138,252,093
  138,253,840
  138,254,397
  138,254,460
  138,254,726
  138,254,949
  138,255,065
  138,255,755
  138,255,756
  138,255,770
  138,256,137
  138,256,174
  138,256,473
  138,256,487
  138,256,517
  138,256,552
  138,256,566
  138,256,751
  138,257,086
  138,257,364
  138,258,349
  138,258,369
  138,258,534
  138,258,568
  138,259,314
  138,259,562
  138,259,735
  138,260,023
  138,260,112
  138,260,510
  138,260,542
  138,260,957
  138,261,138
  138,261,997
  138,263,597
  138,263,659
  138,264,780
  138,264,843
  138,264,964
  138,265,309
  138,265,635
  138,265,842
  138,265,940
  138,266,851
  138,267,172
  138,267,206
  138,267,474
  138,267,642
  138,267,954
  138,268,541
  138,268,547
  138,268,714
  138,269,966
  138,270,992
  138,275,079
  138,275,456
  138,276,178
  138,276,774
  138,277,856
  138,278,338
  138,280,793
  138,282,933
  138,287,370
  138,289,982
  138,290,088
  138,290,458
  138,292,797
  138,294,294
  138,294,358
  138,296,027
  138,296,268
  138,296,915
  138,297,339
  138,297,481
  138,298,629
  138,298,958
  138,298,983
  138,299,202
  138,299,654
  138,299,925
  138,299,993
  138,300,062
  138,300,593
  138,301,365
  138,301,976
  138,302,146
  138,302,592
  138,302,654
  138,302,790
  138,303,131
  138,304,712
  138,306,329
  138,306,570
  138,306,759
  138,306,978
  138,308,277
  138,308,519
  138,309,112
  138,309,155
  138,309,157
  138,309,159
  138,309,161
  138,310,074
  138,310,515
  138,310,591
  138,311,192
  138,311,259
  138,311,261
  138,311,283
  138,311,880
C
G
3
3/GT
2
T
-
3
3
C
T
T
C
T
G
A
T
-
A
G
2
A
T
C
C
C
5
-
-
T
-
T
-
G
-
2
3
A
-
T
G/9
3
C
A
G
-
C
-
A
G
5
C
C
C
C
G
-
C
7
2
3
-
C
A
2
2
A
C
T
G
T
T
G
C
2
G
-
A
5
C
2
T
C
T
A
A
G
-
-
13
A
A
C
4
-
T
-
C
A
C
T
2
-
T
A
G
-
G
T
T/-
T
T
-
2
-
-
T
-
-
C
-
T
A
-
A
-
-
G
-
C
-
A
A
-
C
A
C
G
T
T
A
T
G
-
G
T
4
A/5
A
G
-
G
T
T
T
C
T
G
9
-
A
C
-
G
T
2
-
T
A
T
G
G
G
2
G
A
A
-
G
G
C
A
T
G
C
2
T
G
A
G
C
A
A
T
A
C
C
-
C
-
A
-
C
3
C/-
T
T
-
C
T
2
G
G
A
T
G
-
A
C
T
-
T
T
G
T
T
A
T
-
G
T
C
G
5
5
-
T
-
A
10
G
T
12/-
A
-
G
T
A
G
2
4
-
C
A
A
2
G
-
6
-
C
5
A
G
A
A
A
T
A
G
-
-
-
-
-
-
-
-
-
C
C
-
5
T
T
9
T
G
3
G
C
A
G/2
C
G
3
A
A
3
C
T
10
CT/5
T
A
C
A
T
A
5
T
A
C
A/2
A
C
C
G
A
-
A
T
2
G
G
T
11
25
-
-
-
T
T
2
T
A
-
T
A
-
C
A
-
C
3
2
T
T
G
T
A
A
G
A
T
G
G
2
T
6
C
G
-
9
-
4/-
C
-
3
C
C
G
C
A
G
2
-
T
C
T
A
A
-
C
C
T
T
T
T
-
C
A
T
5
C
6
G
T
G
A
T
T
T
2
G
-
A
9
T
-
T/C
T
C
A
C
G
13
T
G
C
-
G
T
C
G
-
C
A
2
T
C
A
C
4
G
2
9
A
A
27
G
G
-
C
A
A
G
G
3
7
4
7
-
C
C
A
2
2
3
T