Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 239,189 (bp)   Positions: 351
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.001
.004
.0
.0
.0
.496
.001
.001
.095
.008
.0
.0
.01
.033
.01
--
.002
.003
.086
--
.0
.002
.007
.014
.012
.107
.052
.003
.008
--
.457
.031
.011
.172
.325
.001
.999
.065
.069
--
.063
.0
--
--
.877
.084
.004
.007
.027
.003
.0
.434
.334
.045
.027
.027
.018
.0
.0
.032
.0
.01
--
.0
.02
.964
.003
.039
.089
.011
.0
.001
.086
.093
.1
--
.49
.498
.0
.04
.005
.0
--
--
--
--
.001
.017
.014
.0
.0
.004
.0
.0
.051
.107
.002
.01
.001
.005
.0
.076
.001
--
--
--
--
--
.0
.349
.0
.026
.0
.001
.025
.012
.354
.001
.011
.02
.002
.003
.016
.005
.004
.004
.0
.85
.061
.001
.001
.001
.0
.003
.001
.035
.0
.023
.016
--
.007
.067
.044
.049
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.005
.004
.094
.077
.021
.672
.273
.007
.01
.568
.006
.0
.712
.954
.136
.888
.004
.022
.003
.003
.001
.007
.098
.052
.084
.004
.019
.006
.014
.13
.046
--
.001
.183
.064
.012
.296
.019
.0
.004
.001
.0
.001
.032
.005
--
.007
.005
.038
.009
.0
.0
.034
.0
.065
.159
.006
.001
.004
.001
.001
.008
.005
.048
.272
.196
.182
.038
.001
.054
.001
.0
.111
.004
.002
.004
.009
.001
.022
.001
.0
.0
.004
.0
.002
.001
.005
.005
.067
.01
.003
.0
.031
.047
.03
.537
--
--
.099
.002
.001
.004
.19
.145
.16
.033
.005
.001
.001
.0
.009
.008
.002
.001
.634
.049
.026
.044
.0
--
.001
.016
.349
.009
.1
.024
.002
.012
.011
.002
.227
--
--
--
.0
.032
.01
.971
.006
.001
.002
.005
.03
.027
.0
.015
.039
.0
.0
.184
.029
.244
.001
.001
.002
.028
.003
.008
.009
.01
.056
.005
.027
.023
.004
.004
.0
.001
.01
.071
.309
.03
.026
.999
.889
.002
.005
.012
.003
.015
.014
.007
.001
.001
.001
.01
.152
.006
.0
.0
.0
.256
.281
.004
.643
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
Adcy8
G
C
C
A
A
G
A
T
4
C
C
G
C
T
T
T
A
4
T
C
T
A
A
G
T
G
G
T
A
C
G
C
G
4
6
G
A
C
A
C
G
C
A
6
A
C
A
T
G
C
C
G
T
T
G
C
A
6
10
C
A
A
4
A
G
12
A
T
A
2
T
G
8
7
6
8
12
10
4
A
T
A
T
C
2
A
4
G
G
C
T
G
C
T
39
33
T
T
T
4
G
32
T
T
C
2
T
C
T
T
T
T
G
T
6
4
C
T
G
A
T
A
A
T
T
A
T
T
G
A
4
2
G
A
C
C
T
G
G
A
4
G
T
A
A
A
C
A
G
T
C
A
T
A
A
G
A
T
C
C
G
C
A
T
G
A
T
T
T
A
T
A
T
T
A
A
C
T
T
A
A
A
A
A
C
A
A
T
T
C
C
G
T
T
T
A
T
13
T
A
T
G
G
A
A
C
G
G
G
C
G
C
A
T
A
G
T
A
G
C
A
C
A
G
T
C
T
A
T
6
G
T
A
G
T
C
C
C
C
G
A
G
T
C
T
G
G
A
G
C
8
C
2
T
G
A
G
T
4
C
A
T
T
A
C
G
C
A
A
C
A
G
C
C
T
T
G
A
A
T
G
C
G
A
G
A
C
T
G
G
A
G
G
A
G
C
C
T
C
C
C
A
C
A
C
G
A
C
A
C
C
T
T
C
G
C
A
G
G
T
C
G
T
G
4
C
A
G
A
T
T
5
3
G
C
G
C
T
A
A
C
A
C
4
C
T
C
A
G
G
C
  105,302,544
  105,303,506
  105,303,897
  105,304,008
  105,304,009
  105,304,796
  105,306,096
  105,307,454
  105,307,482
  105,308,878
  105,309,188
  105,309,246
  105,309,395
  105,310,494
  105,310,530
  105,312,006
  105,312,551
  105,312,627
  105,313,414
  105,317,660
  105,324,063
  105,324,157
  105,327,253
  105,327,335
  105,327,382
  105,327,518
  105,329,137
  105,331,749
  105,332,480
  105,335,578
  105,335,985
  105,336,637
  105,344,909
  105,348,104
  105,348,138
  105,351,196
  105,352,718
  105,354,182
  105,355,021
  105,355,204
  105,364,842
  105,365,747
  105,367,859
  105,379,729
  105,384,474
  105,384,921
  105,385,406
  105,386,514
  105,386,903
  105,387,100
  105,387,103
  105,387,216
  105,387,425
  105,388,624
  105,389,416
  105,390,039
  105,392,799
  105,392,861
  105,393,123
  105,394,216
  105,395,103
  105,395,115
  105,395,170
  105,395,208
  105,397,385
  105,399,791
  105,401,212
  105,401,714
  105,402,483
  105,403,508
  105,403,967
  105,403,973
  105,404,435
  105,404,436
  105,404,437
  105,406,133
  105,407,316
  105,407,318
  105,408,110
  105,408,395
  105,408,699
  105,410,371
  105,416,438
  105,416,617
  105,422,981
  105,423,444
  105,426,674
  105,427,132
  105,427,134
  105,433,202
  105,433,206
  105,433,362
  105,433,415
  105,433,630
  105,434,123
  105,434,129
  105,434,553
  105,434,669
  105,434,685
  105,434,719
  105,434,810
  105,435,831
  105,436,028
  105,438,025
  105,438,150
  105,438,285
  105,438,286
  105,438,471
  105,439,472
  105,440,553
  105,440,780
  105,440,810
  105,442,898
  105,443,072
  105,443,450
  105,443,452
  105,443,528
  105,443,682
  105,444,973
  105,445,025
  105,445,484
  105,445,765
  105,446,489
  105,447,672
  105,447,913
  105,449,195
  105,449,354
  105,451,774
  105,451,930
  105,452,706
  105,454,285
  105,454,287
  105,454,733
  105,455,974
  105,456,375
  105,457,201
  105,457,524
  105,458,109
  105,461,308
  105,463,721
  105,463,907
  105,464,012
  105,464,498
  105,465,516
  105,466,257
  105,470,464
  105,470,466
  105,470,575
  105,470,664
  105,470,854
  105,472,221
  105,473,777
  105,474,504
  105,474,761
  105,474,809
  105,476,565
  105,478,025
  105,478,042
  105,479,116
  105,480,070
  105,481,324
  105,481,466
  105,483,581
  105,486,272
  105,486,473
  105,486,692
  105,486,891
  105,487,666
  105,490,056
  105,490,213
  105,491,286
  105,492,057
  105,492,305
  105,492,558
  105,492,716
  105,492,749
  105,492,837
  105,493,015
  105,493,653
  105,493,844
  105,493,979
  105,494,301
  105,494,501
  105,494,521
  105,494,810
  105,495,159
  105,495,195
  105,495,342
  105,495,914
  105,496,067
  105,496,217
  105,496,322
  105,496,437
  105,496,676
  105,496,780
  105,496,804
  105,496,834
  105,497,196
  105,497,240
  105,497,403
  105,497,534
  105,498,157
  105,498,507
  105,498,861
  105,499,185
  105,499,267
  105,499,387
  105,499,440
  105,499,894
  105,499,974
  105,500,216
  105,500,319
  105,500,570
  105,500,861
  105,500,881
  105,500,897
  105,500,909
  105,500,982
  105,500,989
  105,501,654
  105,501,719
  105,501,769
  105,502,225
  105,502,566
  105,502,716
  105,502,741
  105,502,764
  105,502,987
  105,503,133
  105,503,193
  105,503,894
  105,504,009
  105,504,112
  105,504,329
  105,504,835
  105,505,014
  105,505,063
  105,505,164
  105,505,232
  105,505,276
  105,505,288
  105,505,391
  105,505,526
  105,505,531
  105,505,632
  105,505,742
  105,505,773
  105,505,814
  105,505,923
  105,505,965
  105,505,971
  105,506,024
  105,506,207
  105,507,542
  105,511,560
  105,511,693
  105,511,972
  105,512,782
  105,513,122
  105,513,405
  105,513,547
  105,513,648
  105,513,788
  105,513,971
  105,514,601
  105,514,621
  105,515,169
  105,515,220
  105,515,239
  105,515,684
  105,516,272
  105,516,321
  105,516,484
  105,516,891
  105,517,031
  105,517,949
  105,518,495
  105,518,945
  105,519,475
  105,520,431
  105,520,482
  105,520,838
  105,521,127
  105,521,136
  105,521,304
  105,521,473
  105,521,965
  105,522,164
  105,522,787
  105,522,884
  105,522,957
  105,522,962
  105,523,091
  105,523,295
  105,523,307
  105,523,622
  105,523,913
  105,524,130
  105,524,135
  105,524,136
  105,524,496
  105,524,641
  105,525,030
  105,526,410
  105,526,689
  105,526,954
  105,526,998
  105,527,284
  105,527,913
  105,528,184
  105,528,244
  105,528,279
  105,529,050
  105,529,361
  105,529,611
  105,529,725
  105,529,755
  105,529,856
  105,529,964
  105,529,968
  105,530,124
  105,530,239
  105,530,477
  105,530,632
  105,531,048
  105,531,171
  105,531,299
  105,531,442
  105,531,725
  105,531,967
  105,532,779
  105,533,452
  105,533,454
  105,533,470
  105,533,644
  105,534,407
  105,535,312
  105,535,992
  105,536,171
  105,536,414
  105,536,416
  105,536,552
  105,536,587
  105,537,148
  105,537,743
  105,538,587
  105,538,695
  105,540,350
  105,540,351
  105,540,419
  105,540,992
T
T
T
C
T
12
G
C
-
G
T
C
T
A
2
31
G
-
C
C/-
C
G
C
A
C
C
A
C
9
5/7
T
9
A
-
6/-
A
-
T
G
5/13
A
T
C
-
-
T
G
C
A
T
-
A
A
C
2
T
-
-
-
A
C
C
-
G
A
-
-
-
G
-
C
T
8/-
7/-
6/-
-
12/-
10/-
-
2
C
G
2
A
-
T
-
-
T
T
G
T
A
C
39/-
33/-
5
3
8
-
A
-
C
7/5
T
2/-
-
T
G
2
C
C
A
C
6/-
-
8
C
A
C
C
G
G
2
5
3
C
-
A
C
-
2/-
A
G
A
T
C
A
2
G
-
3/11
3/TG
G
T
13
A
T
A
A
G
C
C
-
-
A
-
C
T
5
4
5
-
C
3
5
C
A
17
-
C
G
C
2
T
G
T
C
C
G
C
T
G
G
T
G
3
C
C
16
A
-
C
C
C
C
A
-
C
G
C
15
T
G
C
T
A
A
A
T
A
A
G
C
T
A
C
G
A
G
2
T
G
A
C
A
C
T
2
-
A
C
G
A
9/11
A
A
A
A
A
G
A
C
A
-
A
A
T
C
G
-
3
-
G
A
C
A
C
-
T
C
C
C
G
T
T
A
G
G
T
C
A
-
A
C
5
2
G
5
4
A
T
2
T
A
G
T
A
26
2
2
?
A
G
A
A
4
C
T
A
A
G
T
G
T
11
G
6
T
T
A
C
C
C/46
A
T
G
A
A
-
T
3
C
A
-
T
2
A
G
C
2
5/-
3/-
3
T
T
A
A
G
C
-
G
A
-
T
C
A
C
A
T
A