Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 86,531 (bp)   Positions: 305
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.0
.0
.395
.03
--
.029
.08
.075
.009
.026
.212
.107
.011
.002
.094
.076
.028
.05
.003
.001
.001
.005
.009
.006
.001
.002
.08
.126
.211
.059
.124
.686
.0
.0
.0
.035
.026
.0
.001
.002
.0
.719
1.0
--
--
--
.011
.091
.055
.006
--
--
--
.002
.001
.0
.006
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.004
.007
.017
.009
.013
.154
.099
.024
.022
.001
.0
.0
.974
.002
.01
.0
.0
.0
.009
.009
.001
.006
.0
.001
.008
.003
.002
.004
.982
.002
.084
.158
.001
.002
.001
.001
.005
.005
.001
.0
.001
.914
.107
.028
.002
.032
.001
--
.028
.094
.826
.018
.145
.032
.002
--
--
.026
.144
.0
1.0
.083
.001
--
.0
.001
--
.063
.001
--
.003
.032
.008
.001
--
--
--
.007
--
.004
.0
--
--
.007
.0
.055
.988
.01
.012
.003
.001
.038
.049
.017
.089
.0
.11
.003
.001
.001
.004
.019
.028
.002
.007
.019
.094
.047
.018
--
--
.01
.149
.443
.459
.281
.307
.046
--
--
--
--
--
--
.06
.053
.877
.0
.004
.027
.019
.019
.572
.001
.04
.014
.024
.012
--
--
--
.38
.495
--
--
--
--
--
--
--
--
.035
--
.135
.676
.077
.014
--
--
--
--
--
--
--
--
.0
.001
.011
--
--
--
.019
.004
--
.119
--
.003
.02
.001
.221
.035
.002
.001
.013
.027
.029
--
--
--
--
--
--
--
--
.004
.0
.0
.998
.017
.005
.014
.396
--
--
--
.003
.006
.003
--
--
--
.018
.002
--
.001
.011
.96
.028
.006
--
.012
--
.076
.125
.01
.017
.027
.001
.003
.004
.001
.001
.041
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Acacb
Acacb
Acacb
Acacb
Acacb
Acacb
Acacb
Acacb
Acacb
Acacb
Acacb
Acacb
Acacb
Acacb
Acacb
Acacb
Acacb
Acacb
Acacb
Acacb
Acacb
Acacb
Acacb
Acacb
Acacb
Acacb
Acacb
Acacb
Acacb
Acacb
Acacb
A
C
G
A
G
A
3
2
A
T
C
A
8
4
C
T
C
A
C
C
C
G
C
T
9
A
G
6
4
A
T
G
T
G
T
C
C
T
G
G
A
G
A
A
G
C
A
C
A
T
A
C
G
T
G
T
G
9
T
A
C
G
C
G
4
2
C
2
T
4
T
T
A
A
A
C
A
C
G
G
T
3
T
A
A
G
A
C
G
7
A
A
G
T
A
G
A
G
T
T
C
5
G
T
C
A
T
C
C
T
T
C
C
T
C
G
T
C
C
G
A
A
G
A
T
G
C
T
3
T
8
G
G
A
A
G
C
T
A
C
C
2
C
G
A
A
2
A
T
C
C
G
A
A
2
T
T
T
G
G
2
A
G
4
2
G
G
G
2
10
8
G
G
G
T
C
A
A
C
G
C
A
A
C
A
C
A
T
A
T
C
G
G
A
C
3
T
C
T
G
G
G
A
G
A
A
C
G
T
A
A
C
C
8
C
C
C
T
T
T
C
T
G
G
G
G
C
8
A
C
T
G
G
G
G
8
G
G
C
G
T
T
3
T
T
G
4
C
14
C
G
10
C
T
C
G
G
C
G
T
A
T
C
C
C
2
C
C
T
G
G
A
3
T
T
T
G
C
G
G
A
25
A
A
A
T
C
C
A
A
G
2
T
T
A
T
A
A
G
A
C
T
C
T
T
  49,914,860
  49,914,916
  49,915,283
  49,915,399
  49,915,524
  49,915,667
  49,916,081
  49,916,082
  49,916,306
  49,916,500
  49,916,529
  49,916,751
  49,916,892
  49,916,896
  49,916,992
  49,917,083
  49,917,133
  49,917,156
  49,917,333
  49,917,423
  49,917,458
  49,917,464
  49,917,496
  49,917,643
  49,917,761
  49,917,778
  49,917,924
  49,917,989
  49,917,991
  49,918,186
  49,918,223
  49,918,396
  49,918,527
  49,918,650
  49,918,684
  49,918,852
  49,918,911
  49,918,992
  49,918,993
  49,919,006
  49,919,056
  49,919,085
  49,919,106
  49,919,487
  49,919,505
  49,919,583
  49,919,614
  49,919,658
  49,919,666
  49,919,843
  49,919,881
  49,919,948
  49,920,018
  49,920,132
  49,920,186
  49,920,480
  49,920,587
  49,920,624
  49,920,648
  49,920,649
  49,920,774
  49,920,779
  49,920,819
  49,920,852
  49,920,870
  49,920,872
  49,920,878
  49,920,888
  49,920,890
  49,920,898
  49,920,905
  49,920,914
  49,920,976
  49,921,022
  49,921,044
  49,921,045
  49,921,070
  49,921,150
  49,921,160
  49,921,301
  49,921,302
  49,921,452
  49,921,483
  49,921,485
  49,921,562
  49,921,712
  49,921,810
  49,921,886
  49,921,907
  49,921,925
  49,921,984
  49,922,032
  49,922,035
  49,922,075
  49,922,115
  49,922,128
  49,922,205
  49,922,218
  49,922,329
  49,922,397
  49,922,777
  49,923,019
  49,923,114
  49,923,118
  49,923,243
  49,923,404
  49,923,406
  49,923,435
  49,923,437
  49,923,762
  49,923,822
  49,923,981
  49,924,027
  49,924,463
  49,924,480
  49,924,514
  49,924,531
  49,924,667
  49,924,684
  49,925,963
  49,926,986
  49,927,056
  49,927,734
  49,927,960
  49,929,159
  49,930,095
  49,930,282
  49,931,154
  49,931,169
  49,932,547
  49,933,003
  49,933,592
  49,935,538
  49,935,982
  49,936,038
  49,936,628
  49,936,640
  49,936,653
  49,937,886
  49,938,334
  49,938,414
  49,940,122
  49,943,010
  49,944,262
  49,944,285
  49,944,528
  49,944,795
  49,944,822
  49,945,456
  49,945,721
  49,945,746
  49,947,778
  49,948,325
  49,949,202
  49,949,213
  49,952,614
  49,953,329
  49,955,259
  49,956,229
  49,956,824
  49,956,825
  49,958,547
  49,959,008
  49,959,029
  49,959,031
  49,959,080
  49,959,755
  49,959,794
  49,960,285
  49,960,309
  49,960,311
  49,960,312
  49,960,383
  49,960,681
  49,961,060
  49,961,072
  49,961,202
  49,961,242
  49,961,316
  49,961,397
  49,961,489
  49,961,970
  49,962,038
  49,962,104
  49,962,134
  49,962,138
  49,962,143
  49,962,301
  49,962,352
  49,962,994
  49,963,077
  49,963,106
  49,963,150
  49,963,315
  49,963,323
  49,963,387
  49,963,766
  49,963,947
  49,964,260
  49,964,585
  49,964,692
  49,964,909
  49,964,950
  49,965,018
  49,965,396
  49,965,654
  49,965,955
  49,966,025
  49,966,084
  49,966,430
  49,966,939
  49,967,129
  49,967,526
  49,967,615
  49,967,640
  49,970,013
  49,970,426
  49,970,427
  49,970,428
  49,970,972
  49,971,147
  49,971,447
  49,971,581
  49,972,883
  49,973,492
  49,973,883
  49,973,997
  49,974,567
  49,974,733
  49,975,020
  49,975,079
  49,975,166
  49,975,179
  49,975,376
  49,975,506
  49,975,509
  49,977,182
  49,978,383
  49,978,603
  49,978,637
  49,978,925
  49,978,934
  49,979,452
  49,980,818
  49,980,889
  49,981,058
  49,981,292
  49,981,960
  49,982,116
  49,982,623
  49,982,789
  49,983,226
  49,983,611
  49,983,844
  49,984,006
  49,984,226
  49,984,251
  49,984,265
  49,984,316
  49,984,334
  49,984,358
  49,984,389
  49,984,427
  49,984,432
  49,984,591
  49,984,592
  49,984,739
  49,984,913
  49,984,965
  49,985,105
  49,985,321
  49,985,326
  49,985,378
  49,985,389
  49,986,401
  49,986,425
  49,987,917
  49,989,390
  49,989,498
  49,989,591
  49,989,789
  49,990,037
  49,990,618
  49,990,973
  49,991,010
  49,991,663
  49,993,118
  49,993,753
  49,994,087
  49,994,692
  49,996,402
  49,997,118
  49,997,322
  49,997,708
  49,997,926
  49,998,503
  49,998,675
  49,999,063
  49,999,184
  49,999,845
  49,999,886
  49,999,887
  50,000,014
  50,000,040
  50,000,612
G
T
A
G
T
G
-
-
G
G
T
5
-
-
5
9
T
G
A
T
G
A
T
C
9/-
-
C
-
4/-
G
C
A
C
A
C
T
T
C
A
T
C
A
G
G
G/A
T
G
T
G
C
2
T
A
C
A
C
A
-
C
G
G
T
A
T
4/-
-
3/4
-
5
-
A
C
G
G
G
T
G
T
A
A
C
-
G
G
G
A
G
T
A
-
G
2
3
2
G
A
G
A
C
T/C
A
-
A
C
T
G
C
G
T
C
C
T
T
T/C
C/G
G/T
T/G
C/T
C/T
C
C
G
-
-
G
A
A
T/C
-
C
-
A
A
2
C
G/3
-
6/6
2
T
-
-
A
G/2
A/2
G
2/-
A/G
G
C/2
C/T
A
G
A/G
2/-
C
C
A
3
3
2/-
G
C
4/-
2/-
5
-
A
-
-
-
G/3
T
T
C
G
T
G
T
A
T
G
-
A
A/T
C/T
A/G
C
C
A
-
A
A
G
T
-
A
T
C
A
A
A
G
A
C
C
G
2
G
G
G
G
-
-
T
T
C/2
G
3
C
G
G
2
A
A
G/2
-
-
G
T
C
2
2
A
G/A
8/-
2
A
T
A
C
2
3/-
C
2
9
-
3
-
T
5/7
-
T
C
G
C
4
A
A
C
G
C
A
T
C/2
2/-
T
T
C
A
A
G
3/-
T/-
9
T/C
A
7/5
T
A
C
-
2
G
G
C
G
T
-
17
A
-
3
4
G
C
3
9
A
A/C
C/A
T/G
C/A
T/C
C