Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly Rnor_5.0
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 107,882 (bp)   Positions: 313
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.167
.009
.001
.002
.99
.168
.011
.009
.011
.011
.02
.007
.017
.049
--
--
.194
.005
.006
.001
.214
--
--
--
--
.312
.019
.066
.231
.093
.165
.011
.0
--
.025
.551
.46
.643
.008
.002
.615
--
--
.134
.32
--
--
.008
.0
.0
.081
.035
.115
.344
.025
.118
.996
--
--
--
--
--
.004
.0
.005
.002
.007
.003
.356
.166
.01
.025
.287
.254
.05
.039
.009
.025
.087
.121
.001
.002
.2
.003
.001
.021
.047
.001
.045
.019
--
--
.007
.0
.001
.002
.001
.022
.022
.022
.021
.032
.133
.007
.034
.169
.086
.036
.011
.725
.05
.006
.034
.03
.038
.04
.011
.993
.027
.0
.022
.055
.005
--
.001
.004
.002
.0
.0
.0
.0
.128
.116
.047
.008
.332
.987
.01
.003
.003
--
--
--
--
1.0
.99
.132
.005
.866
--
--
--
--
--
.154
.093
.348
--
.45
--
.049
.029
.468
.019
.021
.714
.899
.001
.003
.005
.002
.171
.049
.02
.034
.019
.001
.005
.051
.044
.007
.02
.002
--
--
--
--
--
.08
.083
.128
.187
.11
.0
.016
.328
.004
.027
.052
.062
--
.044
.3
.223
.031
.017
.022
.546
.126
.024
.003
.018
.038
--
--
--
.437
.457
.034
.15
.344
.004
.301
--
--
--
.007
.002
.001
.012
.103
.0
.004
.0
.06
.075
.002
.002
.066
.021
--
--
--
--
.0
.049
1.0
.001
--
.03
.113
--
--
--
.078
.528
.143
.731
.023
.002
.002
.276
.067
.072
.002
.003
.249
.0
--
--
.839
.072
.001
--
.003
.004
.067
--
.052
.008
.237
.063
.331
.161
.037
.001
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
.035
.047
.001
.132
.831
.001
.002
.003
.002
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
Abat
A
T
G
A
A
C
C
T
G
T
G
C
C
G
A
C
A
A
C
G
A
T
C
G
T
G
A
T
T
A
C
A
T
C
T
G
C
G
A
G
T
A
G
A
A
G
G
T
C
A
G
G
A
C
A
C
12
156
2
A
8
T
A
C
T
C
A
T
A
G
C
G
4
G
G
2
8
6
G
G
4
T
A
T
T
T
A
T
G
A
G
A
T
A
C
A
A
C
A
A
T
A
G
C
G
G
T
G
C
T
T
G
C
G
A
G
G
A
G
G
A
C
A
T
T
12
8
G
G
A
C
T
A
T
C
C
A
C
A
A
C
T
T
C
C
A
T
G
A
2
T
C
G
T
G
C
G
G
G
C
T
C
18
C
A
T
C
C
C
A
T
G
C
T
T
3
5
G
A
T
C
C
A
G
T
T
T
T
A
T
G
C
2
C
G
A
T
G
G
G
C
C
G
C
T
G
C
T
A
C
T
G
11
C
2
T
18
G
T
G
G
T
T
A
A
G
C
T
C
T
C
G
T
C
30
A
T
A
6
12
C
C
C
C
C
C
G
G
3
G
G
A
T
G
C
131
G
T
T
G
T
T
T
T
C
2
C
G
C
A
A
T
C
2
G
A
A
A
C
T
T
T
T
G
T
G
C
G
C
G
C
10
A
6
G
10
31
16
7
2
3
G
17
6
C
G
A
G
4
5
T
T
C
  5,894,323
  5,894,515
  5,894,562
  5,895,383
  5,895,641
  5,896,052
  5,896,129
  5,896,147
  5,896,149
  5,896,158
  5,896,160
  5,896,180
  5,896,219
  5,896,544
  5,896,722
  5,897,042
  5,897,309
  5,897,576
  5,897,709
  5,898,403
  5,898,723
  5,898,926
  5,899,045
  5,899,088
  5,899,315
  5,899,704
  5,899,897
  5,900,081
  5,901,705
  5,901,917
  5,902,285
  5,902,315
  5,903,119
  5,903,648
  5,904,264
  5,904,834
  5,904,842
  5,905,059
  5,905,254
  5,905,638
  5,905,968
  5,906,680
  5,906,713
  5,907,467
  5,907,533
  5,907,856
  5,907,964
  5,908,185
  5,908,500
  5,908,781
  5,909,019
  5,909,098
  5,909,264
  5,909,390
  5,909,533
  5,909,825
  5,910,322
  5,910,480
  5,910,766
  5,910,774
  5,910,787
  5,910,819
  5,911,036
  5,911,082
  5,911,087
  5,911,220
  5,911,687
  5,911,689
  5,912,084
  5,912,140
  5,912,178
  5,912,185
  5,912,209
  5,912,241
  5,912,259
  5,912,262
  5,912,274
  5,912,326
  5,912,335
  5,912,347
  5,912,831
  5,912,834
  5,912,909
  5,912,991
  5,912,993
  5,913,864
  5,914,248
  5,914,707
  5,914,803
  5,914,944
  5,915,606
  5,915,618
  5,915,819
  5,915,827
  5,915,834
  5,915,838
  5,915,846
  5,915,853
  5,915,860
  5,915,867
  5,915,871
  5,915,874
  5,915,932
  5,916,017
  5,916,375
  5,918,300
  5,918,805
  5,918,980
  5,919,206
  5,919,467
  5,919,702
  5,920,147
  5,920,357
  5,920,363
  5,920,658
  5,920,724
  5,921,322
  5,922,137
  5,922,534
  5,922,713
  5,923,421
  5,923,452
  5,924,292
  5,924,446
  5,925,343
  5,926,127
  5,926,131
  5,926,293
  5,926,430
  5,926,461
  5,926,612
  5,926,907
  5,927,235
  5,927,315
  5,927,384
  5,927,731
  5,928,121
  5,928,592
  5,928,801
  5,929,130
  5,929,286
  5,929,483
  5,929,706
  5,929,707
  5,930,354
  5,930,467
  5,930,850
  5,931,218
  5,931,906
  5,932,666
  5,932,721
  5,933,055
  5,933,087
  5,933,140
  5,933,465
  5,933,641
  5,933,956
  5,934,297
  5,937,871
  5,938,007
  5,938,330
  5,939,928
  5,940,023
  5,940,457
  5,940,481
  5,940,491
  5,940,669
  5,940,829
  5,941,003
  5,941,004
  5,941,049
  5,941,085
  5,941,656
  5,941,780
  5,941,784
  5,941,806
  5,941,813
  5,942,416
  5,942,672
  5,942,944
  5,942,953
  5,943,538
  5,943,665
  5,943,980
  5,943,998
  5,944,055
  5,944,056
  5,944,057
  5,944,165
  5,944,754
  5,944,759
  5,944,999
  5,945,289
  5,945,542
  5,946,781
  5,948,719
  5,948,999
  5,949,009
  5,949,011
  5,949,322
  5,949,398
  5,949,731
  5,949,848
  5,950,066
  5,950,099
  5,950,114
  5,950,161
  5,950,233
  5,950,368
  5,950,682
  5,951,054
  5,951,269
  5,951,392
  5,952,533
  5,952,739
  5,954,083
  5,954,817
  5,954,896
  5,955,744
  5,955,835
  5,956,445
  5,956,654
  5,956,739
  5,957,363
  5,957,372
  5,957,570
  5,957,977
  5,958,010
  5,958,035
  5,958,390
  5,959,171
  5,959,281
  5,959,410
  5,959,419
  5,959,591
  5,959,742
  5,959,774
  5,959,775
  5,959,801
  5,959,827
  5,959,860
  5,959,873
  5,959,901
  5,960,034
  5,960,980
  5,961,245
  5,961,340
  5,962,614
  5,962,962
  5,963,078
  5,963,229
  5,963,247
  5,963,367
  5,963,387
  5,963,492
  5,963,848
  5,964,261
  5,964,535
  5,965,628
  5,965,818
  5,965,820
  5,967,665
  5,967,959
  5,967,998
  5,968,360
  5,968,863
  5,969,092
  5,969,244
  5,969,722
  5,969,760
  5,970,636
  5,970,773
  5,987,912
  5,989,268
  5,989,824
  5,991,883
  5,992,751
  5,992,834
  5,992,931
  5,992,979
  5,993,817
  5,995,026
  5,995,116
  5,995,196
  5,995,469
  5,996,273
  5,997,144
  5,997,146
  5,997,149
  5,997,155
  5,997,160
  5,997,162
  5,997,174
  5,997,179
  5,997,186
  5,997,189
  5,997,201
  5,997,296
  5,997,315
  5,997,328
  5,997,331
  5,997,334
  5,997,338
  5,997,357
  5,997,420
  5,997,421
  5,997,503
  5,998,490
  5,998,796
  6,000,088
  6,001,475
  6,001,483
  6,001,488
G
A
-
G
G
T
T
2
C
2
A
-
2
T
G
T
-
C
20
C
G
2
T
A
2
T
A/5
C
C
A/3
T
T
C
A
C
3
T
A
C
T
C
G
3
G
G
A
A
C
T
G
A
A
G
5
G
T
-
156/-
-
G
-
A
A/2
C/T
T/3
T
G
C
G
T
G
A
-
A
C
-
-
-
A
A
-
5
G
2
28
C
-
C
A
G
2
A/4
-
-
-
-
-
-
-
-
C
C
A
T
C
A
2
A
T
C
C
T
G
C
G
C
A
G
2
C
T
9
A/G
9
C
12/-
8/-
A
2
G
T
C
G
C
T
T
G
G
C
G
T
2
-
C/4
T
T
A
T
G
-
19
A
A
C
-
T
13
G/2
2
3
3
-
-
T
G
C
2
T
T
G
G
A
T
-
-
-
-
A
G
C
4
G
T
A
C
A
A
A
G
A
G/3
T
-
A
A
G
A
T
A
-
T
4/3
A
T
C
A
T
-
G
A
C
T
-
-
-
C
-
T
C
A
5
C
C
T
9
A
T
C
T
C
T
A
19
-
-
C
A
T
-
-
A
G
5
T
A
T
A
T
3/-
A
C
A/5
G
A
T
-
A
A
C
4
39
C
7
A
T
2/-
T
A
C/233
28
15
C
G
-
A
G
5
4
T
5
C
C
A
A
C
A
11
2
A
A
-
-
G
-
-
-
-
-
-
-
-
12
-
-
G
C
G
3
-
-
-
-
-