Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly RGSC_v3.4
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 77,536 (bp)   Positions: 278
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.018
.0
.0
.009
.989
.002
.005
.001
.01
.219
.098
.011
.021
.002
.091
--
.058
.021
.246
.028
--
--
--
--
--
--
--
.02
.036
.003
.041
.241
.008
.006
.225
.028
--
.006
.005
.038
.948
.903
.004
--
.498
.018
.451
.035
.0
.005
.025
.098
.12
.112
.937
.011
.0
.0
.003
.15
.009
.005
.001
.033
.001
.059
.003
.072
--
--
.003
.05
.068
.014
.004
.665
--
--
--
.053
.008
.013
.001
.011
.002
--
.009
--
--
--
--
.013
.019
.992
.001
.02
.112
.012
.054
.035
.003
.0
.0
.813
.0
.005
.211
.0
.002
.01
.008
.004
.005
.003
.017
.1
--
--
--
--
--
--
--
.028
.001
.003
.001
.027
.08
.124
.103
.101
.087
.009
.071
.001
.002
.209
.019
.062
.006
.0
.966
.273
.094
.102
.081
.004
.0
.005
.048
1.0
.009
.821
.014
.034
.0
.001
.015
.052
.713
.066
.037
.01
.011
.02
.017
.0
.001
.006
.011
.079
.003
.029
.039
.025
.003
.006
.282
.291
.0
.013
.006
.002
.001
.042
.092
.376
.221
.003
.002
.0
.0
.008
.015
.011
.157
.081
.001
.001
.001
.006
.001
.0
.008
.009
.0
.0
.004
.0
.0
.001
.002
.021
.005
.098
.096
.001
.097
.005
.063
.0
.001
.0
.001
.028
--
--
--
.002
.012
.005
.041
.013
.007
.001
.003
.027
.014
.002
.976
.97
.001
.0
.013
.189
.502
.482
.116
.017
.013
.0
.653
.021
.13
.131
.064
.002
--
--
.002
.0
.008
.973
.148
.019
.0
.0
.001
.0
.0
.0
.047
.001
.165
.034
.001
.005
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Trpc3
Trpc3
Trpc3
Trpc3
Trpc3
Trpc3
Trpc3
Trpc3
Trpc3
Trpc3
Trpc3
Trpc3
Trpc3
Trpc3
Trpc3
Trpc3
Trpc3
Trpc3
Trpc3
Trpc3
Trpc3
Trpc3
Trpc3
Trpc3
Trpc3
Trpc3
Trpc3
Trpc3
A
A
A
C
A
T
A
2
G
T
A
A
G
A
C
G
A
A
18
A
T
T
A
G
T
2
4
T
T
A
T
G
C
A
17
C
4
2
A
C
C
C
T
G
T
A
C
A
G
A
T
4
C
C
3
A
G
T
A
C
A
C
3
A
G
A
A
A
A
A
G
C
G
A
G
T
7
4
6
G
A
A
C
G
T
C
A
T
C
C
T
T
T
C
G
2
T
T
T
8
A
G
A
C
T
A
A
T
4
T
G
A
A
A
C
T
G
A
G
G
A
T
T
G
C
T
A
C
A
G
T
A
C
A
A
G
T
A
C
C
T
A
T
T
T
A
A
G
T
A
G
T
C
A
G
C
C
A
C
A
A
A
A
2
4
3
7
G
A
T
G
A
A
A
C
G
A
G
T
G
C
A
C
A
A
C
T
C
C
T
G
A
G
A
A
2
C
C
C
G
G
3
A
C
C
T
G
C
G
C
C
T
T
T
C
C
C
T
C
C
T
A
C
A
A
T
C
8
24
C
T
C
A
A
2
G
34
63
C
G
T
A
C
C
G
14
T
C
T
A
A
G
A
C
T
2
C
C
T
C
C
C
C
C
T
C
T
A
2
T
T
C
C
C
A
6
C
C
  142,945,805
  142,946,331
  142,946,590
  142,946,631
  142,946,796
  142,947,743
  142,948,379
  142,949,664
  142,949,844
  142,949,961
  142,950,323
  142,950,487
  142,950,880
  142,951,276
  142,951,770
  142,953,102
  142,953,802
  142,953,841
  142,954,357
  142,954,439
  142,954,618
  142,954,649
  142,954,658
  142,954,680
  142,954,683
  142,954,839
  142,954,842
  142,954,974
  142,955,414
  142,955,694
  142,955,864
  142,956,110
  142,956,657
  142,956,658
  142,956,734
  142,957,583
  142,958,293
  142,958,531
  142,958,532
  142,959,128
  142,959,543
  142,959,551
  142,959,629
  142,959,712
  142,959,889
  142,959,985
  142,960,140
  142,961,126
  142,961,361
  142,961,454
  142,962,161
  142,962,214
  142,962,217
  142,962,501
  142,962,583
  142,962,675
  142,962,791
  142,963,081
  142,963,304
  142,963,453
  142,963,509
  142,963,550
  142,964,226
  142,964,636
  142,964,743
  142,965,706
  142,966,586
  142,966,803
  142,966,859
  142,966,860
  142,967,469
  142,967,518
  142,967,652
  142,968,410
  142,968,790
  142,969,047
  142,969,157
  142,969,164
  142,969,171
  142,970,455
  142,970,621
  142,970,804
  142,970,852
  142,971,378
  142,971,607
  142,971,887
  142,971,968
  142,972,363
  142,972,485
  142,972,506
  142,972,518
  142,972,693
  142,972,694
  142,972,911
  142,973,121
  142,973,358
  142,974,760
  142,975,227
  142,975,641
  142,975,857
  142,976,062
  142,976,314
  142,976,343
  142,976,686
  142,976,935
  142,977,071
  142,978,056
  142,978,178
  142,978,291
  142,978,305
  142,979,119
  142,979,455
  142,979,529
  142,979,637
  142,979,810
  142,979,862
  142,980,197
  142,980,206
  142,980,242
  142,980,253
  142,980,275
  142,980,287
  142,980,305
  142,980,437
  142,980,454
  142,980,480
  142,981,074
  142,981,283
  142,981,478
  142,981,832
  142,981,859
  142,982,312
  142,982,325
  142,982,414
  142,982,507
  142,982,702
  142,982,738
  142,982,814
  142,982,990
  142,983,000
  142,983,038
  142,983,075
  142,983,147
  142,983,280
  142,983,293
  142,983,334
  142,983,343
  142,983,486
  142,983,682
  142,984,047
  142,984,190
  142,984,908
  142,985,346
  142,985,469
  142,985,763
  142,985,810
  142,986,920
  142,988,076
  142,988,665
  142,989,819
  142,989,977
  142,991,353
  142,991,771
  142,992,483
  142,992,486
  142,992,493
  142,993,934
  142,994,112
  142,994,288
  142,994,360
  142,994,690
  142,994,856
  142,994,903
  142,995,102
  142,995,130
  142,995,140
  142,995,162
  142,995,166
  142,995,223
  142,995,224
  142,995,270
  142,995,350
  142,995,551
  142,995,739
  142,995,990
  142,996,191
  142,996,793
  142,997,159
  142,997,455
  142,997,499
  142,997,961
  142,998,405
  142,999,367
  142,999,383
  142,999,396
  142,999,792
  142,999,832
  143,000,008
  143,000,130
  143,000,134
  143,000,138
  143,000,143
  143,000,148
  143,000,152
  143,000,160
  143,000,162
  143,000,169
  143,000,175
  143,000,183
  143,000,231
  143,000,351
  143,001,126
  143,001,477
  143,001,934
  143,002,570
  143,002,721
  143,002,789
  143,002,978
  143,003,238
  143,003,483
  143,003,874
  143,004,139
  143,004,359
  143,005,261
  143,005,377
  143,005,749
  143,006,347
  143,006,468
  143,006,480
  143,007,191
  143,007,206
  143,007,231
  143,007,759
  143,008,042
  143,008,165
  143,008,718
  143,009,272
  143,009,344
  143,009,924
  143,010,085
  143,010,377
  143,010,387
  143,010,753
  143,011,085
  143,011,272
  143,011,777
  143,012,311
  143,012,378
  143,012,508
  143,012,755
  143,012,782
  143,012,881
  143,013,058
  143,013,354
  143,015,339
  143,015,343
  143,015,425
  143,016,303
  143,016,574
  143,016,770
  143,017,681
  143,017,991
  143,018,162
  143,018,308
  143,018,418
  143,018,797
  143,018,849
  143,019,457
  143,019,598
  143,019,816
  143,019,817
  143,020,549
  143,020,682
  143,021,009
  143,022,019
  143,022,237
  143,022,657
  143,022,787
A/-
T
G
C/A
-
2
4
-
G/3
-
G
G
A
-
A
A
5
G
-
G
C
C
3
A
C
-
-
13
C
G
5
T
T
G
-
T
-
2/-
A/-
T
T
A
2
T
3/TA
G
CT/3
T
C
G
C
4/-
C/16
T
-
G
G/13
G
G
T
G
T
-
G
A
G
-
C
2
T
A
A
T
2
T
A
7/-
4/-
6/-
2
2
G
T
A
C
T
G
2
T
2
9
G
G
T
-
-
8
C
C
8/12
T
A
2
T
G
-
G
C
-
A
A
G
C
G
19
C
T
13
A
A
C
2
C
A
T
C
G
T
G
A
C
-
A
G
G
A
2
G
9
T
C
G
A
C
C
G
T
47
C
G
3
C
T
G
-
9/11
14/--
G
T
-
C
-
C
-
-
-
-
C
C
A
A
C
C
G
A
A
C
A
C
A
T
2
T
G
-
T
C
A
7
C
A
G
C
T
T
-
T
T
-
T
T
-
G
-
G
-
-
-
-
T
A
A
A
C
T
T
T
C
G
-
C
4
T
G
T
5
-
-
-
-
C
A
C
G
-
C
-
-
G
A
C
G
A
T
T
-
C
G
C
G
G
C
C
T
A
2/-
-
T
C
3
T
T
T
T
2
T
G
G
2/-
A
C
A
T
G
-
-
T
T