Send us a Message



Submit Data |  Help |  Video Tutorials |  News |  Publications |  Download |  REST API |  Citing RGD |  Contact   
  Home     Edit Strains     Edit Gene List     Sequence Annotation
 Assembly RGSC_v3.4
   

Chromosome Start Position Stop Position
Region Size: 203,236 (bp)   Positions: 297
Conservation 
Genes ( + ) 
Genes ( - ) 
Rnor 5.0  
.016
.027
.001
.001
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.004
.004
.018
.017
.0
.001
.0
.0
.002
.002
.001
.001
.001
.001
.0
.001
.002
.004
.01
.002
.001
.001
.001
.0
.048
.003
.035
.002
.0
.039
.028
.001
.0
.002
.473
.15
.079
.002
.0
.071
.0
.627
.294
.881
.002
.494
.002
.001
.001
.002
.605
.068
.0
.001
.102
.093
.83
.843
.146
.094
.005
.039
.0
.042
.001
.259
.263
.0
.003
.012
.034
.003
.004
.0
.0
.001
.002
.0
.001
.032
.028
.002
.039
.016
.012
--
.03
.573
.001
.016
.017
.006
.006
.002
.005
.0
.0
.018
.002
.0
.0
.001
.0
.0
.0
.001
.899
.002
.098
.121
.402
.346
.32
.011
.001
.02
.242
.006
.002
--
--
--
.135
.0
.0
.02
.066
.079
.045
.026
.002
.005
.002
.244
.001
.046
.017
.008
.216
.147
.001
.0
.144
--
.002
.003
.01
.001
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.0
.002
.001
.002
.0
.034
.011
.027
.077
.006
.001
.0
.002
.022
.027
.268
.001
.0
.0
.129
.0
.042
.001
.003
.002
.001
.004
.001
.0
.0
.003
--
.008
.005
.0
.001
.001
.0
.003
.006
.013
.002
.003
.0
.119
.0
--
--
--
--
.009
--
--
--
.001
.0
.338
.344
.001
.0
.001
.001
.001
.988
.089
.001
.009
.001
.0
.017
.978
.995
.182
.032
--
.019
.05
.0
.003
.004
.015
.0
.001
.003
.04
.005
.006
.093
.0
.282
.009
.08
.001
.04
.179
.004
.004
.016
.103
.0
.0
.001
.0
.0
.0
.03
--
--
.0
.0
.0
.01
.0
.013
.038
.138
.003
.072
.001
.092
.105
.0
.997
.002
.001
.001
.039
.003
--
--
--
Tg
Tg
Tg
Tg
Tg
Tg
Tg
Tg
Tg
Tg
Tg
Tg
Tg
Tg
Tg
Tg
Tg
Tg
Tg
Tg
Tg
Tg
Tg
Tg
Tg
Tg
Tg
Tg
Tg
Tg
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
Sla
Sla
Sla
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
--
C
G
C
C
C
A
C
C
T
A
A
C
C
T
A
A
A
3
C
C
C
C
T
T
G
T
T
T
G
8
C
C
C
C
A
T
A
G
2
A
3
G
A
C
T
A
A
G
A
C
T
8
12
C
C
4
T
8
4
T
A
C
G
G
4
2
C
A
T
T
G
G
G
T
G
T
T
G
C
T
A
A
A
G
T
C
T
4
12
G
A
6
G
G
T
40
G
C
C
2
2
G
C
A
G
G
T
C
C
C
T
A
C
T
A
A
G
T
A
T
C
C
A
T
C
C
G
T
T
T
C
C
C
C
A
G
34
T
T
T
C
T
T
G
T
T
A
A
8
T
C
A
T
T
T
G
4
2
G
A
G
A
A
T
C
A
G
C
C
C
G
17
T
A
G
A
A
T
A
C
C
10
T
T
18
T
T
T
A
G
A
A
A
T
C
A
C
T
T
G
G
G
G
G
A
T
G
T
G
C
G
A
C
C
5
C
A
T
7
C
A
G
A
A
C
T
A
T
A
A
A
T
A
3
G
C
4
T
G
3
C
C
4
3
3
A
A
T
A
T
A
A
A
2
C
2
A
A
A
C
C
C
A
C
A
G
G
T
A
A
T
C
C
T
C
7
G
C
G
G
A
A
4
9
A
G
C
T
G
A
G
A
C
2
A
4
T
  107,402,827
  107,402,896
  107,403,545
  107,403,550
  107,403,552
  107,403,553
  107,403,556
  107,403,560
  107,403,565
  107,403,572
  107,403,574
  107,403,575
  107,403,599
  107,403,600
  107,403,611
  107,403,623
  107,403,625
  107,403,627
  107,403,642
  107,403,644
  107,403,646
  107,403,648
  107,403,651
  107,403,653
  107,403,654
  107,403,657
  107,403,660
  107,403,664
  107,403,667
  107,403,669
  107,403,680
  107,403,681
  107,403,683
  107,403,685
  107,403,928
  107,404,094
  107,405,486
  107,405,559
  107,405,687
  107,406,030
  107,406,080
  107,408,508
  107,409,823
  107,410,803
  107,410,852
  107,411,754
  107,411,819
  107,411,851
  107,412,868
  107,412,958
  107,412,979
  107,414,247
  107,414,265
  107,415,903
  107,417,232
  107,418,281
  107,421,020
  107,421,819
  107,421,823
  107,421,865
  107,422,015
  107,422,647
  107,422,850
  107,422,906
  107,425,538
  107,425,540
  107,427,279
  107,427,280
  107,427,706
  107,427,910
  107,427,974
  107,428,225
  107,428,447
  107,428,636
  107,428,991
  107,430,934
  107,430,936
  107,431,826
  107,431,847
  107,432,050
  107,432,053
  107,432,897
  107,434,131
  107,434,810
  107,434,878
  107,434,892
  107,435,034
  107,435,583
  107,435,787
  107,435,844
  107,436,284
  107,436,570
  107,436,684
  107,437,042
  107,437,206
  107,437,444
  107,437,960
  107,439,353
  107,439,769
  107,441,228
  107,441,235
  107,441,888
  107,441,910
  107,442,393
  107,442,467
  107,443,687
  107,446,064
  107,446,174
  107,447,436
  107,449,071
  107,449,095
  107,449,127
  107,449,269
  107,449,279
  107,449,374
  107,450,128
  107,451,918
  107,452,055
  107,452,222
  107,452,563
  107,453,427
  107,453,431
  107,453,433
  107,453,876
  107,454,868
  107,456,558
  107,458,288
  107,458,743
  107,458,744
  107,459,079
  107,459,397
  107,459,595
  107,460,121
  107,460,252
  107,461,823
  107,461,899
  107,462,718
  107,462,769
  107,462,771
  107,462,773
  107,463,129
  107,463,688
  107,464,071
  107,464,211
  107,464,405
  107,464,790
  107,466,102
  107,466,294
  107,466,474
  107,466,516
  107,467,445
  107,467,782
  107,469,008
  107,470,139
  107,470,204
  107,470,403
  107,470,515
  107,470,643
  107,470,894
  107,473,278
  107,473,414
  107,473,415
  107,473,861
  107,473,918
  107,474,151
  107,475,544
  107,476,137
  107,476,721
  107,477,750
  107,477,825
  107,477,986
  107,478,622
  107,478,867
  107,479,025
  107,480,315
  107,480,378
  107,480,991
  107,481,374
  107,481,438
  107,481,826
  107,482,020
  107,482,111
  107,482,548
  107,483,183
  107,483,346
  107,486,975
  107,487,772
  107,487,934
  107,488,096
  107,488,663
  107,488,772
  107,490,296
  107,490,520
  107,491,480
  107,491,927
  107,492,266
  107,493,187
  107,493,886
  107,494,670
  107,495,085
  107,496,601
  107,496,665
  107,496,802
  107,496,878
  107,497,376
  107,498,021
  107,499,712
  107,499,978
  107,501,502
  107,501,612
  107,503,483
  107,504,066
  107,504,870
  107,504,878
  107,505,358
  107,505,362
  107,505,498
  107,506,584
  107,506,605
  107,507,016
  107,511,532
  107,511,738
  107,512,596
  107,512,598
  107,513,630
  107,514,214
  107,514,872
  107,515,282
  107,515,825
  107,516,490
  107,516,554
  107,517,744
  107,519,512
  107,520,602
  107,521,713
  107,521,993
  107,522,670
  107,522,676
  107,522,715
  107,522,900
  107,522,924
  107,524,500
  107,525,589
  107,526,142
  107,526,146
  107,526,409
  107,527,599
  107,527,657
  107,528,773
  107,529,071
  107,529,814
  107,530,151
  107,530,972
  107,531,298
  107,531,982
  107,532,794
  107,534,933
  107,535,055
  107,535,250
  107,535,755
  107,536,634
  107,538,241
  107,538,242
  107,538,908
  107,539,363
  107,540,908
  107,541,196
  107,541,947
  107,542,071
  107,542,170
  107,542,333
  107,542,663
  107,542,679
  107,542,732
  107,544,593
  107,545,244
  107,553,938
  107,554,330
  107,554,374
  107,554,484
  107,555,112
  107,555,898
  107,556,810
  107,559,877
  107,560,169
  107,560,336
  107,560,351
  107,560,444
  107,563,517
  107,563,723
  107,564,281
  107,564,986
  107,565,307
  107,567,083
  107,570,088
  107,570,102
  107,570,107
T
3
-
-
G
2
G
G
G
-
T
2
-
G
2
3
C
-
T
G
T
T
G
A
C
G
A
A
T
-
A
9
A
A
G
C
C
A
-
9
-
A
G
-
C
G
4
C
G
T
G
-
-
T
T
-
A
8/-
4/-
C
G
A
A
T
4/-
-
G
G
C
A
C
A
T
C
T
T/G
T/G
A
T
4
G
G
G
A
C
T
C
-
-
9/11
G
-
2
A
G
40/-
T
T
12
-
-
A
T
T
C
5
G
T
T
A
G
-
G
C
?
G
T
-
G
A
3
3
C
C
2
T
T
2
A
A
-
2
2
T
G
4
-
C
C
C
T
C
A
A
5
T/6
-
C
-
T/3
T
G
C
2
G
A
-
-
A
G
T
T
G
C
G
G
T
T
T
T
C
-
-
G
A
C
G
G
C
A
T
-
C
G
-
2
C
2
G
A
G
G
G
G
A
C
T
T/13
?
A
A
A
G/5
A
G
C
A
2
A
A
A
2
-
T
-
5
13
C
-
A
G
2
2
8
A
C
T
G
T
G
13
C
G
-
A
T
-
C
A
-
2
T
-
-
-
G
G
C
G
C
-
9/13
G
2/-
T
2/-
G
G
G
T
C/3
-
G
T
2
T
A
C
G
G
C
2
2
C
A
-
C
T
C
-
G
G
-
-
-
2
4
C
A
G
C
C
T
-
A/4
4/-
T/3